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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7001#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1562 fasta sequence
[GTGATATATTTTTGTTTAATTTCCTACAATCTGTTAGCACATTAGCCACTTTTACACGCTATCGCTCACGTCCGGTTTGTCGGCTTACAGAACTATATTACGAACGCACGTCTATTGTTTTAATGAATAGAAA-AGAGAACACGATATATCATACCGTAACAATTTTGCAAAAATCAGAGCTGTGATGCCGTGCCGTTCCTTTTCTCACTTAACCACTATGTAGCCTTATCGATCTAGCAGAGCGAAGGAAGTAACGTGTTATTTCAAGATCGAAGAGAAATCGTTCTTGGTCCTTCTTGGTTGGATCGTTTCTGTTTTTTGTATGTGTGTGTGGCAGTGTGTTATTAAACAAGATAAGTTTTTGTTGCATTTTTAGTGCTCTTGTTCGTTTTCCTTTGCTGCTCTCGCTCTGGTTGAACAAATACAAATTATAGTGAAAACGATAGATAATATCAACGTAGCTGCTATTTACAAATGTACAATGACGAGTCAGGGCGCGTCTGGACGCCCTTCGCACCAGGGGAAACAACATTGCTATCGGGTTTAGTTTCTTTTTTAATGGTGAAATTTTCACTCAATCTGAAGCTCTCATATCTGTGGTATCCTAAAATGTAGAAGATGATCTTTTTTTTAACCTTATTTTAAGCACACGTGGTTCTCCATCAATAATGTGGATCC-ATTGCATTTGCTGCGTCTCGGAGTTGCGTCCCTGCCCTGGTCATATTTTAGTGCGAAGTATTTTGACTCGGCAGCGGGTGTGTAGTAGAATGATCCGCTATCCATTAACATAGGCTTGTTTCACGATGACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACCTAAGCGAGTTCATCTCGTATCCACCTTTACTTTGCATTTGGTTCTGCAACACAGACAGATGGTTCGTGGTTAGCTCAACGTCGTTCGAGCCAATGTGACCGGTGTGTACAAAGTTGGTCGGGTTGCCGATCATCGATCGATCTATTCGCAGGCGCTGGTGGGTCCTCCGGCGGCGCGGGCTTTGCGGCTGGTGGAAGCAGCAGGAGAACCACTGCAGCCAGATGTCACCCGTGCTGGCCATCTTCTTGCCGGTGGTAATCGTCTGGCCGTGCTTTTGCTCACACGGTGGCAGCTGTGTCCGTTACCGGGATCGAGTACGAATCCGACGGGGGCGTTGTCTGCGCTTTCCGCTAGCGAGTTGATCCACAACACCAAGCGCCAAGTGGGGGACACAGGGGGAAGTCTACAGTCGTGTTGTGATCACTAGCTAGGCCAGAGCATGGAATTCCTCGACGCTTCGTCTACGAGAACCGGACCGGACGCACCCTGGTGGATAAAAGGTGAAATGCTTTTATTAAATTTTCACTTTTTTACTCGTTCGTGTTTTTTTTCAGTTGCAGGATGTTTAAGATGTTCTAAATTCTATTTCACTGCTCGTATAGGCATCACTTTTCGTGAGATGTAGCAAAGAATATACGGCCTTCTAAATAAAATTAACAGTAGCAGCAGCGCCAACGCACACGTCGGTCCGTCCTCACTCGC]
[+] EMBL CNS08M6W [GTGATATATTTTTGTTTAATTTCCTACAATCTGTTAGCACATTAGCCACTTTTACACGCTATCGCTCACGTCCGGTTTGTCGGCTTACAGAACTATATTACGAACGCACGTCTATTGTTTTAATGAATAGAAA AGAGAACACGATATATCATACCGTAACAATTTTGCAAAAATCAGAGCTGTGATGCCGTTTCGTTCCTTTTCTCACTTAACCACTATGTAGCCTTATCGATCTAGCAGAGCGAAGGAAGTAACGTGTTATTTCAAGATCGAAGAGAAATCGTTCTTGGTCCTTCTTGGTTGGATCGTTTCTGTTTTTTGTATGTGTGTGTGGCAGTGTGTTATTAAACAAGATAAGTTTTTGTTGCATTTTTAGTGCTCTTGTTCGTTTTCCTTTGCTGCTCTCGCTCTGGTTGAACAAATACAAATTATAGTGAAAACGATAGATAATATCAACGTAGCTGCTATTTACAAATGTACAATGACGAGTCAGGGCGCGTCTGGACGCCCTTCGCACCAGGGGAAACAACATTGCTATCGGGTTTAGTTTCTTTTTTAATGGTGAAATTTTCACTCAATCTGAAGCTCTCATATCTGTGGTATCCTAAAATGTAGAAGATGATCTTTTTTTTAACCTTATTTTAAGCACACGTGGTTCTCCATCAATAATGTGGATCC ATTGCATTTGCTGCGTCTCGGAGTTGCGTCCCTGCCCTGGTCATATTTTAGTGCGAAGTATTTTGACTCGGCAGCGGGTGTGTAGTAGAATGATCCGCTATCCATTAACATAGGCTTGTATCACGATGACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACCTAAGCGAGTTCATCTCGTATCCACCTTTACTTTGCATTTGGTTCTGCAACACAGACAGATGGTTCGTGG ]
[+] EMBL CNS08F6L [ ttgTTTGTTTAATTTCCTACAATCTGTTAGCACATTAGCCACTTTTACACGCTATCGCTCACGTCCGGTTTGTCGGCTTACAGAACTATATTACGAACGCACGTCTATTGTTTTAATGAATAGAAA AGAGAACACGATATATCATACCGTAACAATTTTGCAAAAATCAGAGCTGTGATGCCGTGCCGTTCCTTTTCTCACTTAACCACTATGTAGCCTTACCGATCTAGCAGAGCGAAGGAAGTAACGTGTTATTTCAAGATCGAAGAGAAATCGTTCTTGGTCCTTCTTGGTTGGATCGTTTCTGTTTTTTGTATGTGTGTGTGGCAGTGTGTTATTAAACAAGATAAGTTTTTGTTGCATTTTTAGTGCTCTTGTTCGTTTTCCTTTGCTGCTCTCGCTCTGGTTGAACAAATACAAATTATAGTGAAAACGATAGATAATATCAACGTAGCTGCTATTTACAAATGTACAATGACGAGTCAGGGCGCGTCTGGACGCCCTTCGCACCAGGGGAAACAACATTGCTATCGGGTTTAGTTTCTTTTTTAATGGTGAAATTTTCACTCAATCTGAAGCTCTCATATCTGTGGTATCCTAAAATGTAGAAGATGATCTTTTTTTTAACCTTATTTTAAGCACACGTGGTTCTCCATCAATAATGTGGATCC ATTGCATTTGCTGCGTCTCGGAGTTGCGTCCCTGCCCTGGTCATATTTTAGTGCGAAGTATTTTGACTCGGCAGCGGGTGTGTAGTAGAATGATCCGCTATCCATTAACATAGGCTTGTTTCACGATGACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACCTAAGCGAGTTCATCTCGTATCCACCTTTACTTTGCATTTGGTTCTGCAACACAGACAGATGGTTCGTGGTTAGCTCAACGTCGTTCGAGCCAATGTGACCGGTGTGTACAAAGTTGGTCGGGTTGCCGATCATCGATCGATCTATT ]
[+] EMBL CNS08RPR [ CTACAATTTGTTAGCACATTAGCCACTTTTACACGCTATCGCTCACGTCCGGTTTGTCGGCTTACAGAACTATATTACGAACGCACGTCTATTGTTTTAATGAATAGAAATAGAGAACACGATATATCATACCGTAACAATTTTGCAAAAATCAGAGCTGTGATGCCGTGCCGTTCCTTTTCTCACTTAACCACTATGTAGCCTTATCGATCTAGCAGAGCGAAGGAAGTAACGTGTTATTTCAAGATCGAAGAGAAATCGTTCTTGGTCCTTCTTGGTTGGATCGTTTCTGTTTTTTGTATGTGTGTGTGGCAGTGTGTTATTAAACAAGATAAGTTTTTGTTGCATTTTTAGTGCTCTTGTTCGTTTTCCTCTGCTGCTCTCGCTCTGGTTGAACAAATACAAATTATAGTGAAAACGATAGATAATATCAACGTAGCTGCTATTTACAAATGTACAATGACGAGTCAGGGCGCGTCTGGACGCCCTTCGCACCAGGGGAAACAACATTGCTATCGGGTTTAGTTTCTTTTTTAATGGTGAAATTTTCACTCAATCTGAAGCTCTCATATCTAAAGTATCCTAAAATGTAGAAGATGATCTTTTTTTTAACCTTATTTTAAGCACACGTGGTTCTCCATCAATAATGTGGATCCTATTGCATTTGCTGCGTCTCGGAGTTGCGTCCCTGCCCTGGTCATATTTTAGTGCGAAGTATTTTGACTCGGCAGCGGGTGTGTAGTAGAATGATCCGCTATCCATTAACATAGGCTTGTTTCACGATGACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACC ]
[-] EMBL CNS08F6K [ GAATAGATA AGAGAACACGATATATCATACCGTAACAATTTTGCAAAAATCAGAGCTGTGATGCCGTGCCGTTCCTTTTCTCACTTAACCACTATGTAGCCTTACCGATCTAGCAGAGCGAAGGAAGTAACGTGTTATTTCAAGATCGAAGAGAAATCGTTCTTGGTCCTTCTTGGTTGGATCGTTTCTGTTTTTTGTATGTGTGTGTGGCAGTGTGTTATTAAACAAGATAAGTTTTTGTTGCATTTTTAGTGCTCTTGTTCGTTTTCCTTTGCTGCTCTCGCTCTGGTTGAACAAATACAAATTATAGTGAAAACGATAGATAATATCAACGTAGCTGCTATTTACAAATGTACAATGACGAGTCAGGGCGCGTCTGGACGCCCTTCGCACCAGGGGAAACAACATTGCTATCGGGTTTAGTTTCTTTTTTAATGGTGAAATTTTCACTCAATCTGAAGCTCTCATATCTGTGGTATCCTAAAATGTAGAAGATGATCTTTTTTTTAACCTTATTTTAAGCACACGTGGTTCTCCATCAATAATGTGGATCC ATTGCATTTGCTGCGTCTCGGAGTTGCGTCCCTGCCCTGGTCATATTTTAGTGCGAAGTATTTTGACTCGGCAGCGGGTGTGTAGTAGAATGATCCGCTATCCATTAACAGAGGCTTGTTTCACGATGACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACCTAAGCGAGTTCATCTCGTATCCACCTTTACTTTGCATTTGGTTCTGCAACACAGACAGATGGTTCGTGGTTAGCTCAACGTCGTTCGAGCCAATGTGACCGGTGTGTACAAAGTTGGTCGGGTTGCCGATCATCGATCGATCTATTCGCAGGCGCTGGTGGGTCCTCCGGCGGCGCGGGCTTTGCGGCTGGTGGAAGCAGCAGGAGAACCACTGCAGCCAGATGTCACCCGTGCTG ]
[-] EMBL CNS08M6V [ ACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACCTAAGCGAGTTCATCTCGTATCCACCTTTACTTTGCATTTGGTTCTGCAACACAGACAGATGGTTCGTGGTTAGCTCAACGTCGTTCGAGCCAATGTGACCGGTGTGTACAAAGTTGGTCGGGTTGCCGATCATCGATCGATCTATTTGCAGGCGCTGGTGGGTGGTCCGGCGGCGCGGGCTTTGCGGCT ]
[-] EMBL CNS08RPQ [ GTCGTTCGAGCCAATGTGACCGGTGTGTACAAAGTTGGTCGGGTTTTTTTTCATCGATCGATCTATTCGCAGGCGCTGGT GGTCCTCCGGCGGCGCGGGCTTTGCGGCTGGTGGAAGCAGCAGGAGAACCACTGCAGCCAGATGTCACCCGTGCTGGCCATCTTCTTGCCGGTGGTAATCGTCTGGCCGTGCTTTTGCTCACACGGTGGCAGCTGTGTCCGTTACCGGGATCGAGTACGAATCCGACGGGGGCGTTGTCTGCGCTTTCCGCTAGCGAGTTGATCCACAACACCAAGCGCCAAGTGGGGGACACAGGGGGAAGTCTACAGTCGTGTTGTGATCACTAGCTAGGCCAGAGCATGGAATTCCTCGACGCTTCGTCTACGAGAACCGGACCGGACGCACCCTGGTGGATAAAAGGTGAAATGCTTTTATTAAATTTTCACTTTTTTACTCGTTCGTGTTTTTTTTCAGTTGCAGGATGTTTAAGATGTTCTAAATTCTATTTCACTGCTCGTATAGGCATCACTTTTCGTGAGATGTAGCAAAGAATATACGGCCTTCTAAATAAAATTAACAGTAGCAGCAGCGCCAACGCACACGTCGGTCCGTCCTCACTCGC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||