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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7696#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1062 fasta sequence
[AGCAAATTATCGATTTTTTTCTGTGAACTTTTAGACGACCTTTCTTAAACTGCCATCTTCATTTTTATCGCAGACTGGGGGCTGTAATTCATGATTTCAAAATCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTGCTCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT-GGCAATGTTAAA-GGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGTTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTATGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACCGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT-CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACCAACACCCGTGCGGTCGAGGCGTTTGCTGCCTTTATTGATAATGTCACGAATTAACTGCAAATATGCTTGTTCCTCTTCATTGCCATTGT-CTTTATTGACGACATTTCCGTTTTCGCCTTCCATTATTACCGGGAAAAACACTGGAATTTAATTATATTTGCGCTGTATCTGGTTTTGTATATTGACAAAAGGCAAACGATGTAATGAATCACAATTGATTTGCGCCATTTTC]
[+] EMBL CNS09IYJ [AGCAAATTATCGATTTTTTTCTGTGAACTTTTAGACGACCTTTCTTAAACTGCCATCTTCATTTTTATCGCAGACTGGGGGCTGTAATTCATGATTTCAAAATCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTGCTCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCTGGGCAATGTTAAAGGGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGCTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTATGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACCGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACC ]
[+] EMBL CNS09G5C [ TCTGTGAA TTTTAGACGA CTTTCTTAAACTGCCATCTTCATTTTTATCGCAGACTGGGGGCTGTAATTCATGATTTCAAAATCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTGCTCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT GGCAATGTTAAA GGGCACGCCCAGACCTACGTC GCCGAACGTTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCTGTAGT CCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTA ]
[+] EMBL CNS09D2D [ TCTTAAACTGCCATCTTCATTTTTATCGCAGACTGGGGGCTGTAATTCATGATTTCAAAATCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTGCTCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT GGCAATGTTAAA GGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGTTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTATGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACCGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACCAACACCCGTGCGGTCGAGGCGTTTGCTGCCTTTATTGATAATGTCACGAATTAACTGCAAATATGCTTGTTCCTCTTCATTGCCATTGT CTTTATTGACGACATTTCCGTTTTCGTCTTCCATTATTACCGGGAAAAACACTGGAATTTAATTATATTT ]
[-] EMBL CNS09D2C [ AAAATCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTG TCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT GGCAATGTTAAA GGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGTTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTATGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACCGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACCAACACCCGTGCGGTCGAGGCGTTTGCTGCCTTTATTGATAATGTCACGAATTAACTGCAAATATGCTTGTTCCTCTTCATTGCCATTGT CTTTATTGACGACATTTCCGTTTTCGCCTTCCATTATTACCGGGAAAAACACTGGAATTTAATTATATTTGCGCTGTATCTGGTTTTGTATATTGACAAAAGGCAAACGATGTAATGAATCA ]
[-] EMBL CNS09IYI [ TCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTGCTCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT GGCAATGTTAAA GGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGCTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTATGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACCGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACCAACACCCGTGCGGTCGAGGCGTTTGCTGCCTTTATTGATAATGTCACGAATTAACTGCAAATATGCTTGTTCCTCTTCATTGCCATTGT CTTTATTGACGACATTTCCGTTTTCGCCTTCCATTATTACCGGGAAAAACACTGGAATTTAATTATATTTGCGCTGTATCTGGTTTT ]
[-] EMBL BX628661 [ TTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT GGCAATGTTAAA GGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGTTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTAGGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACTGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAA ]
[-] EMBL BX605422 [ ACATGATGATTCGACGTTCGTAGGGATTGTTCTTTATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTATTCGTCGTGGCATGTT ]
[-] EMBL CNS09G5B [ CGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCATCCCCAAATGCGTAATCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACCAACACCCGTGCGGTCGAGGCGTTTGCTGCCTTTATTGATAATGTCACGAATTAACTGCAAATATGCTTGTTCCTCTTCATTGCCATTGTCCTTTATTGACGACATTTCCGTTTTCGCCTTCCATTATTACCGGGAAAAACACTGGAATTTAATTATATTTGCGCTGTATCTGGTTTTGTATATTGACAAAAGGCAAACGATGTAATGAATCACAATTGATTTGCGCCATTTTC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||