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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7866#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1544 fasta sequence
[GTTGAAGTAACTAATTGATTTCTATGTTGCCGTTTATGTTGTCAGGTGGAGCATAAACGGGTTTTCAAGCATTTAGTTTTTGAAGTGCTACACCATGTTTCTTCGTACTTATTTGTGCCATGGCGCAATAGCTAACGAGACAGAGAGAGCGAGAGAGAGCGCGAGTTTCCGTTTCGTTGTTTTTGAATTGTGTAATTTTGTGTTGCAAATTGTGAAACCACAACAACAACAACAAGAACAACAATAATAAGCAAAATAATTATAACCGAATGATGAAGTATTGAACTGGTTTCAGTGCTCAGTGCAGTAAAAAGGGCGTTTTAATTAAAGAAGAAGNAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAACGGAGGAAGGAAGCAACACGAAATACCCGCGTTGGAGGTTGGTTGAAACGGAAGAAGAAAAAAATCAACACTATAACAAGCTATAGGACATAGCTCTAACTAGGACAGTTTATTATTATTAGGTAACAAGATCGATGATCTCTCTTTCTCTCATTCGCGATACGAAGGGCAATTGAGGGCAAAAAAAACAACACAAGTAAACACATACACAAGTAAACACATATTCACAGGGACACAGGTTGGCCGGCAAGGTTGTGGGAGAGGCTTCTTTGGAACACACAAGCAGACAGGCAGGCAGTCAAAGCATGCGGCGAAACAAAAAATGCAAACGTAGAGTAAT--ACACACACATCTTAGTCGCTGGCGAAACATTAAGAAAACCCAC--ACACACACAACTACAC-AAC-TACACACATACAGACACAGATCGTTTAATCGCGTAACTTGTACATATTCCTTGTTCTCATATGATTTCTAT---AACAAGTATAGAGAAAGCAGTACCGACATACACATACATTCCATTAGCTTCTAGTTTATATCGAGTAAGGTTTAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAAC---AAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAGAAAAAAAAAATACAAAAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGGTGCGCATAATAATGATTCATTGTTGTTGATTGCGTTCATG-TTTTTGCTTCTTGCCACCACAGGGCACGTTTCATTTTTTTTATTCAAGGAAATTAGCTTGAAGTTGATATTATTTTATTTTTATATTGCTTAAATACAAAACGAGATTCCGTTGTTCGATGCAAACGAACAAACTTACAAACAAACAAACAGTGCAAATCAGTTGTAAACCGGTGCGCGTTAAATGCACCCATGCTTTTAAGTTTAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGGTGGAAGAAGAGCAAATTAATTTATTTTTTGCGGCGCATTTATTTATTGATAAAAACTGAGTGTGTGTGTCTTAGGTTTACTTATTTTTTTATTTTTCGTACTGTGTAACTCCCTATAGATTGTATGATTTCTAAAGAAAAATAAATAAATCTAAAAGTAA]
[+] EMBL BX620731 [GTTGAAGTAACTAATTGATTTCTATGTTGCCGTTTATGTTGTCAGGTGGAGCATAAACGGGTTTTCAAGCATTTAGTTTTTGAAGTGCTACACCATGTTTCTTCGTACTTATTTGTGCCATGGCGCAATAGCTAACGAGACAGAGAGAGCGAGAGAGAGCGCGAGTTTCCGTTTCGTTGTTTTTGAATTGTGTAATTTTGTGTTGCAAATTGTGAAACCACAACAACAACAACAAGAACAACAATAATAAGCAAAATAATTATAACCGAATGATGAAGTATTGAACTGGTTTCAGTGCTCAGTGCAGTAAAAAGGGCGTTTTAATTAAAGAAGAAGNAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAACGGAGGAAGGAAGCAACACGAAATACCCGCGTTGGAGGTTGGTTGAAACGGAAGAAGAAAAAAATCAACACTATAACAAGCTATAGGACATAGCTCTAACTAGGACAGTTTATTATTATTAGGTAACAAGATCGATGATCTCTCTTTCTCTCATTCGCGATACGAAGGGCAATTGAGGGCAAAAAAAACAACACAAGTAAACACATACACAAGTAAACACATATTCACAGGGACACAGGTTGGCCGGCAAGGTTGTGGGAGAGGCTTCTTTGGAAC CACAAGCAGACAGGCAGGCAGTC AAGCATGCGGCG AACCAAAAATGCAA ]
[+] EMBL BX609333 [ TTCACAGGGACACAGGTTGGCCGGCAAGGTTGTGGGAGAGGCTTCTTTGGAACACACAAGCAGACAGGCAGGCAGTCAAAGCATGCGGCGAAACAAAAAATGCAAACGTAGAGTAAT ACACACACATCTTAGTCGCTGGCGAAACATTAAGAAAACCCAC ACACACACAACTACAC AAC TACACACATACAGACACAGATCGTTTAATCGCGTAACTTGTACATATTCCTTGTTCTCATATGATTTCTAT AACAAGTATATAGAAAGCAGTACCGACATACACATACATTCCATTAGCTTCTAGTTTATATCGAGTAAGGTTTAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAACA AAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAGAAAAAAAAAATACAAAAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGGTGCGCATAATAATGATTCATTGTTGTTGATTGCGTTCATG TTTTTGCTTCTTGCCACCACAGGGCACGTTTCATTTTTTTTATTCAAGGAAATTAGCTTGAAGTTGATATTATTTTATTTTTATATTGCTTAAATACAAAACGAGAT ]
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[+] EMBL BX612153 [ ACACAGATCGTTTAATCTTGTAACTTGTACATATTCCTTGTTCTCATATGATTTCTAT AACAAGTATAGAGAAAGCAGTACCGACATACACATACATTCCATTAGCTTCTAGTTTATATCGAGTAAGGTTTAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAAC AAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAGAAAAAAAAAATACAAAAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGG ]
[+] EMBL BX608761 [ TAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAAC AAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAGAAAAAAAAAATACAAAAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGGTGCGCATAATAATGATTCATTGTTGTTGATTGCGTTCATG TTTTTGCTTCTTGCCACCACAGGGCACGTTTCATTTTTTTTATTCAAGGAAATTA ]
[-] EMBL BX611090 [ ACGAGATTCCGTTGTTCGATGCAAACGAACAAACTTACAAACAAACAAACAGTGCAAATCAGTTGTAAACCGGTGCGCGTTAAATGCACCCATGCTTTTAAGTTTAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGGTGGAAGAAGAGCAAATTAATTTATTTTTTGCGGCGCATTTATTTATTGATAAAAACTGAGTGTGTGTGTCTTAGGTTTACTTATTTTTTTATTTTTCGTACTGTGTAACTCCCTATAGATTGTATGATTTCTAAAGAAAAATAAATAAATCTAAAAGTAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||