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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8036#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1323 fasta sequence
[CCGCGGACGC-TG-GG-TGACATCCACCATCCACCATCCACAGTTGTTCTATGATTTAGTAAAGTGTACTGCCAGTGTCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG-AAAACAAAAG-ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATTACCAACAAGCGCTGGAACACGGAAACGCCCACTGCGTCACAGTCCCTCATCAAAGCCTATCTTCTGGAATGGCCCTTGCAGTGGAGATATTACTAACAGGCATGTTAGTGTGGACGAATTGTGGCGTCTGGGACCCGCGCAATAAGAAGGACAGTGATTCAGTTCCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCCTATTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGACCTACGATTGGTTCCATATTAATGGTTACAATATATCGGTATATTTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTGTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTACGTC-GGTGTAAGCTGTAATAAAGGCAAACCTCTTTCAGGGTAAACAAAAGATTAGGTAAACAAACCTAGCAGCATTCAAAACTGACACGATGTGCTATCAGTATAGGTAAATTAAGCATCGAAAATTACCCCCGTTTGTCAGCAAATTCTTTGATTGGCCTTGTTATCGGTAAAGATAAGTTGATTGTTCAGTACGCCTAGTCTGTGCAATGTCATAGTAGGCCAGTTAGCATTCTGCGTCTTTCCGACTCGGTTATTCCATTTGTGATGTATATAACGTTTCCACTCTCATAACGATTAACGCCAAAGTACCCTTATGAAGCACTGCATCCAATAAAAAAACCAG]
[+] EMBL BM639234 [CCGCGGACGCGTG GGTTGACATCCACCATCCACCATCCACAGTTGTTCTATGATTTAGTAAAGTGTACTGCCAGTGCCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG AAAACAAAAG ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTA ]
[+] EMBL AL934783 [ tCGC CGAGG TTA ATCCA CATCCACCATCCACAGTTGTTCTATGATTTAGTAAAGTGTACTGCCAGTGTCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG AAAACAAAAG ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATT ]
[+] EMBL CNS08JVF [ TGACATCCACCATCCACCATCCACAGTTGTTCTATGATTTAGTAAAGTGTACTGCCAGTGTCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG AAAACAAAAGCATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATTACCAACAAGCGCTGGAACACGGAAACGCCCACTGCGTCACAGTCCCTCATCAAAGCCTATCTTCTGGAATGGCCCTTGCAGTGGAGATATTACTAACAGGCATGTTAGTGTGGACGAATTGTGGCGTCTGGGACCCGCGCAATAAGAAGGACAGTGATTCAGTTCCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCCTATTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGACCTACGATTGGTTCCATATTAATGGTTACAATATATCGGTATATTTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTGTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTACGTCGGGTGTAAGCTGTTATAAAGGCA ]
[+] EMBL CNS09P0F [ ACCATCCACCATCCACAGTTGTTCTATGATTTAGTAAAGTGTACTGCCAGTGTCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG AAAACAAAAG ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATTACCAACAAGCGCTGGAACACGGAAACGCCCACTGCGTCACAGTCCCTCATCAAAGCCTATCTTCTGGAATGGCCCTTGCAGTGGAGATATTACTAACAGGCATGTTAGTGTGGACGAATTGTGGCGTCTGGGACCCGCGCAATAAGAAGGACAGTGATTCAGTTCCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCCTATTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGACCTACGATTGGTTCCATATTAATGGTTACAATATATCGGTATATTTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTGTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTTTTTC GGTGTAAGCTGTAATAAAGGC AACCT ]
[+] EMBL BX628942 [ TAGTAAAGTGTACTGCCAGTGTCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGGCAAAACAAAAG ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGC ]
[+] EMBL BX623197 [ GCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG AAAACAAAAG ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATTACCAACAAGCGCTGGAACACGGAAACGCCCACTGCGTCACAGTCCCTCATCAAAGCCTATCTTCTGGAATGGCCCTTGCAGTGGAGATATTACTAACAGGCATGTTAGTGTGGACGAATTGTGGCGTCTGGGACCCGCGCAATAAGAAGGACAGTGATTCAGTTCCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCCTATTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGAC ]
[-] EMBL CNS08JVG [ TTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATTACCAACAAGCGCTGGAACACGGAAACGCCCCATGCGTCACAGTCCCTCATCAAAGCCTATCTTCTGGAATGGCCCTTGCAGTGGAGATATTACTAACAGGCATGTTAGTGTGGACGAATTGTGGCGTCTGGGACCCGCGCAATAAGAAGGACAGTGATTCAGTTCCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCTTTTTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGACCTACGATTGGTTCCATATTAATGGTTACAATATATCGGTATATTTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTGTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTACGTC GGTGTAAGCTGTAATAAAGGCAAACCTCTTTCAGGGTAAACAAAAGATTAGGTAAACAAACCTAGCAGCATTCAAAACTGACACGATGTGCTATCAGTATAGGTAAATTAAGCATCGAAAATTACCCCCGTTTGTCAGCAAATTCTTTGATTGGCCTTGTTATCGGTAAAGATAAGTTGATTGTTCAGTACGCCTAGTCTGTGCAATGTCATAGTAGGCCAGTTAGCATTCTGCGTCTTTCCGACTCGGTTATTCCATTTGTGATGTATATAACGTTTCCACTCTCATAACGATTAACGCCAAAGTACCCTTATGAAGCACTGCATCCAATAAAAAAACCAG]
[+] EMBL BX627244 [ CCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCCTATTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGACCTACGATTGGTTCCTTATTAATGGTTACAATATATCGGTATATTTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTGTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTACGTC GGTGTAAGCTGTAATAAAGGCAAACCTCTTTCAGGGTAAACAAAAGATTAGGTAAACAAACCTAGCAGCATTCAAAACTGACACGATGTGCTATCAGTATAGGTAAATTAAGCATCGAAAATTACCCCCGTTTGTCAGCAAATTCTTTGATTGGCCTTGTTATCGGTAAAGATAAGTTGATT ]
[-] EMBL CNS09P0G [ TTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTTTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTACGTC GGTGTAAGCTGTAATAAAGGCAAACCTCTTTCAGGGTAAACAAAAGATTAGGTAAACAAACCTAGCAGCATTCAAAACTGACACGATGTGCTATCAGTATAGGTAAATTAAGCATCGAAAATTACCCCCGTTTGTCAGCAAATTCTTTGATTGGCCTTGTTATCGGTAAAGATAAGTTGATTGTTCAGTACGCCTAGTCTGTGAAATGTCATAGTAGGCCAGTTAGCATTCTGCGTCTTTCCCACTCGGTTATTCCATTTGTGATGTATATAACGTTTCCACTCTCATAACGATTAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||