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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8161#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1459 fasta sequence
[CCGGGATTTGCTGCGAGAGGATGCCGTCGACGAAGTCGTGGTGGGTGATGATTTGATCAATAGCGCTTCCGGTACTTCCGCTGCTGGTGGTGTTGATTCGAGCGATACACTTAAGCGGGCCAAACCGAAGCAAGCTTTCTTCAGAGCGAACAGCGATCTGGAGTTTCTCGAGAACAACTGATCCGTGTGTGCGTGTTGGTTTGTGCTCTTTGTGATGCAAAAAAAAACGACCGTTACACCGGCACCGAGGGGGACGATCGACGATTTCGCTTCCCGCCAGAAGTGCAATACGCTTCGAGTGCACAAAGGAATGCGATGCGGAGTGGG-GA-TATCCTTCCCCCTTCGTGCGG---TGTAACGATGAATCG-AAAACGCGATAAAGAGAGGAGGTATAGAGTTAAGAAACATTAAATTTC-TTTTTTTTTGTTATTGAATTAAAATATGCACTCATAGAGGTTTAAATTGTAAGTTTGATGATTTATACTCA-TCATTCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTAGTGAAGCGTGTTACAGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCATCATCATC----TCCCGGAGCTCATCGCACGATTTATTTATGCGTGATATTGTCACGTTTACGTTATTTCATCAAATCTTCACTAAACTCTGCACTGATTTTATTCAGCTAGTCGAACACACTTACAATAGTCGTAATTCCGGGGGATGTGTAGGGGAAGAAACTAAGCAAAAAAAACGAAAATATTAGCAAAGAAGGGACCGAGTGAGAGCCGCATTGAACTGGAATTACAACCAAATGAACTCTCAATCTCTCATCAAAGAACAATTAGTAGACCCATTTTATGCTAACGTATGCAAATTATTGTTTTTCACGAATATAACGCCTTAAACTATTAAACGAATGATTTGAAAAATGTGCCTTCCATTAAAAAAAAAACTTCCATCCAGAGCGCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCTAAAACACTGAAGCAAAGTAAGTGCCTTACATTACATTGTGATTGTTGTTTCGTTATAAAGGAAAATCTCCAGTGAGTGCAGTCCTCGCAAAAATGAATCCAAAAACAGAAGCTGAAAATGCAAAGGGCTCTCCATTATCTGGCGTGCAGCTATAATAACATTGTACAAAATCCCTTTCGTTATGCGACATGAGAATAGTGTGAGTGAGGCACAACAATCAAACAAATATGTTTGGTACAACGACCAA-CCGTCGCGAAATTCAAACAGC-GTTAAACGCACCAACAAAATGAAGGAAACAAAACTAAAAAGGGTTTATCAATCCCAGATTGTTACTATTTATAACTATTACTCAGCACTGTTGTTGTTGTTACTAAAACACATCCCGAAGAACTTAAATAAAGGGCTATCGTACGCGAATGTGT]
[+] EMBL BM603417 [CCGGGATTTGCTGCGAGAGGATGCCGTCGACGAAGTCGTGGTGGGTGATGATTTGATCAATAGCGCTTCCGGTACTTCCGCTGCTGGTGGTGTTGATTCGAGCGATACACTTAAGCGGGCCAAACCGAAGCAAGCTTTCTTCAGAGCGAACAGCGATCTGGAGTTTCTCGAGAACAACTGATCCGTGTGTGCGTGTTGGTTTGTGCTCTTTGTGATGCAAAAAAAAACGACCGTTACACCGGCACCGAGGGGGACGATCGACGATTTCGCTTCCCGCCAGAAGTGCAATACGCTTCGAGTGCACAAAGGAATGCGATGCGGAGTGGGAGA TATCCTTCCCCCTTCGTGCGG TGTAACGATGAATCG AAAACGCGATAAAGAGAGGAGGTATAGAGTTAAGAAACATTAAATTTCTTTTTTTTTTGTTATTGAATTAAAATATGCACTCATAGAGGTTTAAATTGTAAGTTTGATGATTTATAC TCATTCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTCTTTTAGTGAAGCGTGTTACCGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCATCATCATCATCATCCCGGAGCTCATCGCACGATTTATTTATGCGTGGTATTGTC ]
[+] EMBL BM625368 [ ccgCCGGTACTTCCGCTGCTGGTGGTGTTGATTCGAGCGATACACTTAAGCGGGCCAAACCGAAGCAAGCTTTCTTCAGAGCGAACAGCGATCTGGAGTTTCTCGAGAACAACTGATCCGTGTGTGCGTGTTGGTTTGTGCTCTTTGTGATGCAAAAAAAAACGACCGTTACACCGGCACCGAGGGGGACGATCGACGATTTCGCTTCCCGCCAGAAGTGCAATACGCTTCGAGTGCACAAAGGAATGCGATGCGGAGTGGGAGA TATCCTTCCCCCTTCGTGCGG TGTAACGATGAATCG AAAACGCGATAAAGAGAGGAGGTATAGAGTTAAGAAACATTAAATTTCTTTTTTTTTTGTTATTGAATTAAAATATGCACTCATAGAGGTTTAAATTGTAAGTTTGATGATTTATAC TCATTCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTAGTGAAGCGTGTTACAGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCATCATCATCATCATCCCGGAGCTCATCGCACGATTTATTTATGCGTGGTATTGTCACGTTTACGTTACTTCATCATATCTTCtgcactgat ]
[+] EMBL BM644776 [ ACGACCGTTACACCGGCACCGAGGGGGACGATCGACGATTTCTCTTCCCGCCAGAAGTGCAATACGCTTCGAGGGCACAAAGGAATGCGATGCGGTGTGGG GAGTATCCTTCCCCCTTCGTGCGGTGTTGTAACGATGAATCGAAAAACGCGATAAAGAGAGGAGGTAAAGAGTTAAGAAACATTAAATTTC TTTTTTTTTGTTATTGAATTAAAATATGCACTCATAGAGGTTTAAATTGTAAGTTTGATGATTTATACTCA C TCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTAGTGAAGCGTGTTACAGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCATCATCATCATCATCCCGGAGCTCATCGCACGATTTATTTATGCGTGATATTGTCACGTTTACGTTATTTCATCATATCTTCACTAAACTCTGCACTGATTTTATCCAGCTAGTCGAACACACTTACA ]
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[+] EMBL CNS09G5H [ GAGATTTAAATTGTAAGTTTGATGATTTATACTCATTCATTCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTAGTGAAGCGTGTAACAGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCGTCATCATC TTCGGAATTTCATTGCACGATTTATTTATGCGTGATATTGTCACGTTTACGTTATTTCATCAAATCTTCACTAAACTCTGCACTGATTTTATTCAGCTAGTCGAACACACTTACAATAGTCGTAATTCCGGGGGATGTGTAGGGGAAGAAACTAAGCAAAAAAAACGAAAATATTAGCAAAGAAGGGACCGAGTTAGAGCCGCATTGAACTGGAATTACAACCAAATGAACTCTCAATCTCTCATCAAAGAACAATTAGTAGACCCATTTTATGCTAACGTATGCAAATTATTGTTTTTCACGAATATAACGCCTTAAACTATTAAACGAATGATTTGAAAAATGTGCCTTCCATTAAAAAAAAAACTTCCATCCAGAGCGCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCT ]
[+] EMBL CNS0946X [ TTGATGATTTATACTCATTCATTCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTAGTGAAGCGTGTAACAGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCGTCATCATC TTCGGAATTTCATTGCACGATTTATTTATGCGTGATATTGTCACGTTTACGTTATTTCATCAAATCTTCACTAAACTCTGCACTGATTTTATTCAGCTAGTCGAACACACTTACAATAGTCGTAATTCCGGGGGATGTGTAGGGGAAGAAACTAAGCAAAAAAAACGAAAATATTAGCAAAGAAGGGACCGAGTGAGAGCCGCATTGAACTGGAATTACAACCAAATGAACTCTCAATCTCTCATCAAAGAACAATTAGTAGACCCATTTTATGCTAACGTATGCAAATTATTGTTTTTCACGAATATAACGCCTTAAACTATTAAACGAATGATTTGAAAAATGTGCCTTCCATTAAAAAAAAAACTTCCATCCAGTTTTCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCTAAAACACTGAAGCAAAGTAAGTGCCTTACATTACATTGTGATTGTTGTTTCGTTATAAAGGAAAATCTCCAGTGAGTGCAGTCCTCGCAAAAATGAATCCAAAAACAGAAGCTGAAAATGCAAAGGGCTCTCCATTATCTGGCGTGCAGCTATAATAACATTGTACAAAATCCCTTTCGTTATGCGACATGAGAATAGTGTGAGTGAGGCACAACAATCAAAAAAATATGTTTGGTACAACGACCAA CCGTCGCGAAATTCAAACAGC GTTAAACGCACCAAC ]
[-] EMBL CNS092NG [ CGCATTGGACTGGAATTACAACCAAATGGATTTTTAATCTTTCATCAAAGAACAATTAGTAGACCCATTTTATGCTAACGTATGCAAATTATTGTTTTTCACGAATATAACGCCTTAAACTATTAAACGAATGATTTGAAAAATGTGCCTTCCATTAAAAAAAAAACTTCCATCCAGAGGGCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCTAAAAAACTGAAGCAAAGTAAGTGCCTTACATTACATTGTGATTGTTGTTTCGTTATAAAGGAAAATCTCCAGTGAGTGCAGTCCTCGCAAAAATGAATCCAAAAACAGAAGCTGAAAATGCAAAGGGGTCTCCATTATCTGGCGTGCAGCTATAATAACATTGTACAAAATCCCTTTCGTTATGCGACATGAGAATAGTGTGAGTGAGGGACAACAATCAAACAAATATGTTTGGTACAACGACCAA CCGTCGCGAAATTCAAACAGCGGTTAAACGCACCAACAAAATGAAGGAAACAAAACTAAAAAGGGTTTATCAATCCCAGATTGTTACTATTTATAACTATTACTCAGCACTGTTGTTGTTGTTACTAAAACACATCCCGAAGAACTTAAATAAAGGGCTATCGTACGCGAATGTGT]
[-] EMBL CNS0946Y [ GCTAACGTATGCAAATTTTTGTTTTTCCCGAATATAACGCCTTAAACTATTAAAAGAATGATTTGAAAAATGTGCCTTCCATTAAAAAAAAAACTTCCATCCAGAGCGCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCTAAAACACTGAAGCAAAGTAAGTGCCTTACATTACATTGTGATTGTTGTTTCGTTATAAAGGAAAATCTCCAGTGAGTGCAGTCCTCGCAAAAATGAATCCAAAAACAGAAGCTGAAAATGCAAAGGGCTCTCCATTTTCTGGCGTGCAGCTATAATAACATTGTAAAAAATCCCTTTCGTTATGCGACATGAGAATAGTGTGAGTGAGGCACAAAAATCAAACAAATATGTT ]
[-] EMBL CNS09G5I [ TCCATCCAGAGCGCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCTAAAAAACTGAAGCAAAGTAAGTGCCTTACATTACATTGTGATTGTTGTTTCGTTATAAAGGAAAATCTCCAGTGAGTGCAGTCCTCGCAAAAATGAATCCAAAAACAGAAGCTGAAAATGCAAAGGGGTCTCCATTTTCTGGCGTGCAGCTATAATAACATTGTACAAAATCCCTTTCGTTATGCGACATGAGAATAGTGTGAGTGAGGGACAACAATCAAACAAATATGTTTGGTACAACGACCAACCCGTCGCGAAATTCAAACAGC GTTAAACGCACCAACAAAATGAAGGAAACAAAACTAAAAAGGGTTTATCAATCCCAGATTGTTACTATTTATAACTATTACTCAGGACTGTTGTTGTTGTTACTAAAACACATCCCGAAGAACTTAAATAAAGCGCTATCGTACGCGAATGTGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||