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consensusID : consensus_8253#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1165 fasta sequence
[CCGGGTTACTCGGCGACCAACGATGTCGATCCGCAGATCCGAACGGATACGGTGTGTAACCCTGCTGGCACCGCTGCTGCTGGCGCTCTTCCTTGCGGCTGTCCCAACTGCCAGTGCCCATCAGTGTTTCTGTGGTGTGCGCCGAGCGCAGAACGAAACGATCTACCCGGACGTACCGATCGAACCGGGCGAGTGGCCATGGCACACGCTCATCTACTACTGGTCCGGCTCGCGGCTTGACCCACCGGCCAAGATCTGCGAGGGTGCACTCATCGACGAGCGGTTCGTGCTGGCCGCGGCCCACTGTCTGACCGTGCGCGGCAGTTCCGATGGCGAGCTGCTGCCCTCGGATCAGCTCGTTGTGCACGTCGGCGTTGTGTCGGTGCAGCAGGATAACGAGCGTTCGCGACGGTTCCAAGTGCGCAATGTCACGGTGGAAGATGAGTCGGACCTGGCACTGATCGAGCTGCAGCTAGGTGAGCCGCGAACCGCCGTACCGAAGCTGATGCCCGATTCGAGTGCCTCCAGCGACGAGGATGGCAGTGGCGGT-GGTGTCGATGTGTCGGAAAATTTGCTGCCAGTGGTGGCTGATAGTGGCGGTTGGAAACCAATTCCAGTGTGTCTGGTCGATGCACTCGATCTGACCACCCTGTATGGCACGGAAATGTACATACTGAACCAGAGCCAGCGGAATCGCCTGGGGGGCTATGAGCCGGTACGGTTAATACTGAACGAATTTCTGCTCTGCTCCGGATCTACGCTCGCCATGAAGTCACGGTCGATCAATGGAACGACCGTTTCCTTCACCATCAAAGATCTCAACCTACCGAGCAACGATAGGGGTACGGCACTATACTTCAAGCACCAGGGCACGTGGAGCCTGCTCGGCTTTACCGTGTCCCGGGCCAGCCGCCAATGGACGCCCGGTTCCGTCTGTCTGCCGAACGATATCATTTCCTTCGATTGTCTCTATCCGGCACTGGACTGGGTGATGGAAAACTTTGGCGACACCAACAGCTAGGGCTACGGATGGTGGAAAAGTGCTATTGTGTGTGGGTTTTGGACCGACCGATCGGTCGGTACTGGTGCTTGCCGCCCAAAGCCTCTGGTGAAACAATAAATAGCGATTGTGCCATGCGGAGGGTAGCTATACCACTCGGTCGCT]
[+] EMBL BM635286 [CCGGGTTACTCGGCGACCAACGATGTCGATCCGCAGATCCGAACGGATACGGTGTGTAACCCTGCTGGCACCGCTGCTGCTGGCGCTCTTCCTTGCGGCTGTCCCAACTGCCAGTGCCCATCAGTGTTTCTGTGGTGTGCGCCGAGCGCAGAACGAAACGATCTACCCGGACGTACCGATCGAACCGGGCGAGTGGCCATGGCACACGCTCATCTACTACTGGTCCGGCTCGCGGCTTGACCCACCGGCCAAGATCTGCGAGGGTGCACTCATCGACGAGCGGTTCGTGCTGGCCGCGGCCCACTGTCTGACCGTGCGCGGCAGTTCCGATGGCGAGCTGCTGCCCTCGGATCAGCTCGTTGTGCACGTCGGCGTTGTGTCGGTGCAGCAGGATAACGAGCGTTCGCGACGGTTCCAAGTGCGCAATGTCACGGTGGAAGATGAGTCGGACCTGGCACTGATCGAGCTGCAGCTAGGTGAGCCGCGAACCGCCGTACCGAAGCTGATGCCCGATTCGAGTGCCTCCAGCGACGAAGATGGCAGTGGCGGTGGGTGTCGATGTGTCGGAAAATTTGCTGCCAGTGGTGGCTGATAGTGGCGGTTGGAAACCAATTCCAGTGTGTCTGGTCGATGCACTCGATCTGACCACCC ]
[+] EMBL BX616688 [ TCGGCGACCAACGATGTCGATCCACAGATCCGAACGGATACGGTGTGTAACCCTGCTGGTGCCGCTGCTGCTGACGCTCTTCCTTGCGGCTGTCCCGACTGCCAGTGCCCATCAGTGTTTCTGTGGTGTGCGCCGAGCGCAGAACGAAACGATCTACCCGGACGTACCGATCGAACCGGGCGAGTGGCCATGGCACACGCTCATCTACTACTGGTCCGGCTCGCGGCTTGACCCACCGGCCAAAATCTGCGAGGGTGCACTCATCGACGAGCGGTTCGTGCTGGCCGCGGCCCACTGTCTGACCGTGCGCGGCAGTTCCGATGGCGAGCTACTGCCCTCGGATCAGCTCGTTGTGCACGTCGGCGTTGTGTCGGTGCAGCAGGATAACGAGCGTTCGCGACGGTTCCAAGTGCGCAATGTCACGGTGGAAGATGAGTCGGACCTGGCACTGATCGAGCTGCAGCTAGGTGAGCCGCGAACCGCCGTACCGAAGCTGATGCCCGATTCGAGTGCCTCCAGCGACGAGGATGGCAGTGGCGGT GGTGTCGATGTCTCGGAAAATTTGCTGCCAGTGGTGGCTGATAGTGGCGGTTGGAAACCAATTCCAGTGTGTCTGGTCGATGCACTCGATCTGACCACCCTGTATGGCACGGAAATGTACATACTGAACCAGAGCCAGCGGAATCGCCTGGGGGGCTATGAGCCGGT ]
[+] EMBL BX616539 [ CGACCAACGATGTCGATCCGCAGATCCGAACGGATACGGTGTGTAACCCTGCTGGCACCGCTGCTGCTGGCGCTCTTCCTTGCGGCTGTCCCAACTGCCAGTGCCCATCAGTGTTTCTGTGGTGTGCGCCGAGCGCAGAACGAAACGATCTACCCGGACGTACCGATCGAACCGGGCGAGTGGCCATGGCACACGCTCATCTACTACTGGTCCGGCTCGCGGCTTGACCCACCGGCCAAGATCTGCGAGGGTGCACTCATCGACGAGCGGTTCGTGCTGGCCGCGGCCCACTGTCTGACCGTGCGCGGCAGTTCCGATGGCGAGCTGCTGCCCTCGGATCAGCTCGTTGTGCACGTCGGCGTTGTGTCGGTGCAGCAGGATAACGAGCGTTCGCGACGGTTCCAAGTGCGCAATGTCACGGTGGAAGATGAGTCGGACCTGGCACTGATCGAGCTGCAGCTAGGTGAGCCGCGAACCGCCGTACCGAAGCTGATGCCCGATTCGAGTGCCTCCAGCGACGAGGATGGCAGTGGCGGT GGTGTCGATGTGTCGGAAAA TTGCTG ]
[+] EMBL BM635593 [ CCGACGATGTCGATCCGCAGATCCGAACGGATACGGTGTGTAACCCTGCTGGCACCGCTGCTGCTGGCGCTCTTCCTTGCGGCTGTCCCAACTGCCAGTGCCCATCAGTGTTTCTGTGGTGTGCGCCGAGCGCAGAACGAAACGATCTACCCGGACGTACCGATCGAACCGGGCGAGTGGCCATGGCACACGCTCATCTACTACTGGTCCGGCTCGCGGCTTGACCCACCGGCCAAGATCTGCGAGGGTGCACTCATCGACGAGCGGTTCGTGCTGGCCGCGGCCCACTGTCTGACCGTGCGCGGCAGTTCCGATGGCGAGCTGCTGCCCTCGGATCAGCTCGTTGTGCACGTCGGCGTTGTGTCGGTGCAGCAGGATAACGAGCGTTCGCGACGGTTCCAAGTGCGCAATGTCACGGTGGAAGATGAGTCGGACCTGGCACTGATCGAGCTGCAGCTAGGTGAGCCGCGAACCGCCGTACCGAAGCTGATGCCCGATTCGAGTGCCTCCAGCGACGAAGATGGCAGTGGCGGT GGTGTCGATGTGTCGGAAAATTTGCTGCCAGTGGTGGCTGATAGTGGCGGTTGGAAACCAATTCCAGTGTGTCTGGTCGATGCACTCGATCTGACCACCCTGTATGGCACGGAAATGT ]
[+] EMBL CNS09BRS [ CGATGTCGATCCGCAGATCCGAACGGATACGGTGTGTAA CCTGCTGGCACCGCTGCTGCTGGCGCTCTTCCTTGCGGCTGTCCCAACTGCCAGTGCCCATCAGTGTTTCTGTGGTGTGCGCCGAGCGCAGAACGAAACGATCTACCCGGACGTACCGATCGAACCGGGCGAGTGGCCATGGCACACGCTCATCTACTACTGGTCCGGCTCGCGGCTTGACCCACCGGCCAAGATCTGCGAGGGTGCACTCATCGACGAGCGGTTCGTGCTGGCCGCGGCCCACTGTCTGACCGTGCGCGGCAGTTCCGATGGCGAGCTGCTGCCCTCGGATCAGCTCGTTGTGCACGTCGGCGTTGTGTCGGTGCAGCAGGATAACGAGCGTTCGCGACGGTTCCAAGTGCGCAATGTCACGGTGGAAGATGAGTCGGACCTGGCACTGATCGAGCTGCAGCTTTGTGAGCCGCGAACCGCCGTACCGAAGCGGATGCCCGAATCGAGTGCCTCCAGCGACGAGGATGGCAGTGGCGGT GGTGTCGATGTGTCGGAAAATTTGCTGCCAGTGGTGGCTGATAGTGGCGGTTGGAAA CAATTCCAGTGTGTCTGGTCGATGCACTCGATCTGACCACCCTGTATGGCACGGAAATGTACATACTGAACCAGAGCCAGCGGAATCGCCTGGGGGGCTATGAGCCGGTACGGTTAATACTGAACGAA ]
[+] EMBL BX612036 [ TGCTGGCACCGCTGCTGCTGGCGCTCTTCCTTGCGGCTGTCCCAACTGCCAGTGCCCATCAGTGTTTCTGTGGTGTGCGCCGAGCGCAGAACGAAACGATCTACCCGGACGTACCGATCGAACCGGGCGAGTGGCCATGGCACACGCTCATCTACTACTGGTCCGGCTCGCGGCTTGACCCACCGGCCAAGATCTGCGAGGGTGCACTCATCGACGAGCGGTTCGTGCTGGCCGCGGCCCACTGTCTGACCGTGCGCGGCAGTTCCGATGGCGAGCTGCTGCCCTCGGATCAGCTCGTTGTGCACGTCGGCGTTGTGTCGGTGCAGCAGGATAACGAGCGTTCGCGACGGTTCCAAGTGCGCAATGTCACGGTGGAAGATGAGTCGGACCTGGCACTGATCGAGCTGCAGCTAGGTGAGCCGCGAACCGCCGTACCGAAGCTGATGCCCGATTCGAGTGCCTCCAGCGACGAGGATGGCAGTGGCGGT GGTGTCGATGTGTCGGAAAATTTGCTGCCAGTGGTGGCTGATAGTGGCGGTTGGAAACCAATTCCAGTGTGTCTGGTCGATGCACTCGATCTGACCACCCTGTATGGCACGGAAATGTACATACTGAACCAGAGCCAGCGGAATCGCCTGGGGGGCTATGAGCCGGTACGGTTAATACTGAACGAATTTCTGCTCTGCTCCGGATCTACG ]
[+] EMBL BM620224 [ ccgcTCGGAAAATTTGCTGCCAGTGGTGGCTGATAGTGGCGGTTGGAAACCAATTCCAGTGTGTCTGGTCGATGCACTCGATCTGACCACCCTGTATGGCACGGAAATGTACATACTGAACCAGAGCCAGCGGAATCGCCTGGGGGGCTATGAGCCGGTACGGTTAATACTGAACGAATTTCTGCTCTGCTCCGGATCTACGCTCGCCATGAAGTCACGGTCGATCAATGGAACGACCGTTTCCTTCACCATCAAAGATCTCAACCTACCGAGCAACGATAGGGGTACGGCACTATACTTCAAGCACCAGGGCACGTGGAGCCTGCTCGGCTTTACCGTGTCCCGGGCCAGCCGCCAATGGACGCCCGGTTCCGTCTGTCTGCCGAACGATATCATTTCCTTCGATTGTCTCTATCCGGCACTGGACTGGGTGATGGAAAACTTTGGCGACACCAACAGCTAGGGCTACGGATGGTGGAAAAGTGCTATTGTGTGTGGGTTTTGGACCGACCGATCGGTCGGTACTGGTGCTTGCCGCCCAAAGCCTCTGGTGAAACAATAAATAGCGATTGT ]
[+] EMBL BM651100 [ ccgGTGGAGCCTGCTCGGCTTTACCGTGTCCCGGGCCAGCCGCCAATGGACGCCCGGTTCCGTCTGTCTGCCGAACGATATCATTTCCTTCGATTGTCTCTATCCGGCACTGGACTGGGTGATGGAAAACTTTGGCGACACCAACAGCTAGGGCTACGGATGGTGGAAAAGTGCTATTGTGTGTGGGTTTTGGACCGACCGATCGGTCGGTACTGGTGCTTGCCGCCCAAAGCCTCTGGTGAAACAATAAATAGCGATTGTGCCATGCGGAGGGTAGCTATACCACTCGGTCGCT]
consensusID : consensus_8253#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 578 fasta sequence
[CCGAGCGTGCGGACGGAATGGTTACTCGGCGACCAACGATGTCGATCCACAGATCCGAACGGATACGGTGTGTAACCCTGCTGGTGCCGCTGCTGCTGACGCTCTTCCTTGCGGCTGTCCCGACTGCCAGTGCCCATCAGTGTTTCTGTGGTGTGCGCCGAGCGCAGAACGAAACGATCTACCCGGACGTACCGATCGAACCGGGCGAGTGGCCATGGCACACGCTCATCTACTACTGGTCCGGCTCGCGGCTTGACCCACCGGCCAAAATCTGCGAGGGTGCACTCATCGACGAGCGGTTCGTGCTGGCCGCGGCCCACTGTCTGACCGTGCGCGGCAGTTCCGATGGCGAGCTACTGCCCTCGGATCAGCTCGTTGTGCACGTCGGCGTTGTGTCGGTGCAGCAGGATAACGAGCGTTCGCGACGGTTCCAAGTGCGCAATGTCACGGTGGAAGATGAGTCGGACCTGGCACTGATCGAGCTGCAGCTAGGTGAGCCGCGAACCGCCGTACCGAAGCTGATGCCCGATTCGAGTGCCTCCAGCGACGAGGATGGCAGTGGTGGCTGATAGTGGCGG]
[+] EMBL BM630895 [CCGAGCGTGCGGACGGAATGGTTACTCGGCGACCAACGATGTCGATCCACAGATCCGAACGGATACGGTGTGTAACCCTGCTGGTGCCGCTGCTGCTGACGCTCTTCCTTGCGGCTGTCCCGACTGCCAGTGCCCATCAGTGTTTCTGTGGTGTGCGCCGAGCGCAGAACGAAACGATCTACCCGGACGTACCGATCGAACCGGGCGAGTGGCCATGGCACACGCTCATCTACTACTGGTCCGGCTCGCGGCTTGACCCACCGGCCAAAATCTGCGAGGGTGCACTCATCGACGAGCGGTTCGTGCTGGCCGCGGCCCACTGTCTGACCGTGCGCGGCAGTTCCGATGGCGAGCTACTGCCCTCGGATCAGCTCGTTGTGCACGTCGGCGTTGTGTCGGTGCAGCAGGATAACGAGCGTTCGCGACGGTTCCAAGTGCGCAATGTCACGGTGGAAGATGAGTCGGACCTGGCACTGATCGAGCTGCAGCTAGGTGAGCCGCGAACCGCCGTACCGAAGCTGATGCCCGATTCGAGTGCCTCCAGCGACGAGGATGGCAGTGGTGGCTGATAGTGGCGG]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_8253#0 ----------------CCGGGTTACTCGGCGACCAACGATGTCGATCCGCAGATCCGAAC 44
consensus_8253#1 CCGAGCGTGCGGACGGAATGGTTACTCGGCGACCAACGATGTCGATCCACAGATCCGAAC 60
***************************** ***********
consensus_8253#0 GGATACGGTGTGTAACCCTGCTGGCACCGCTGCTGCTGGCGCTCTTCCTTGCGGCTGTCC 104
consensus_8253#1 GGATACGGTGTGTAACCCTGCTGGTGCCGCTGCTGCTGACGCTCTTCCTTGCGGCTGTCC 120
************************ ************ *********************
consensus_8253#0 CAACTGCCAGTGCCCATCAGTGTTTCTGTGGTGTGCGCCGAGCGCAGAACGAAACGATCT 164
consensus_8253#1 CGACTGCCAGTGCCCATCAGTGTTTCTGTGGTGTGCGCCGAGCGCAGAACGAAACGATCT 180
* **********************************************************
consensus_8253#0 ACCCGGACGTACCGATCGAACCGGGCGAGTGGCCATGGCACACGCTCATCTACTACTGGT 224
consensus_8253#1 ACCCGGACGTACCGATCGAACCGGGCGAGTGGCCATGGCACACGCTCATCTACTACTGGT 240
************************************************************
consensus_8253#0 CCGGCTCGCGGCTTGACCCACCGGCCAAGATCTGCGAGGGTGCACTCATCGACGAGCGGT 284
consensus_8253#1 CCGGCTCGCGGCTTGACCCACCGGCCAAAATCTGCGAGGGTGCACTCATCGACGAGCGGT 300
**************************** *******************************
consensus_8253#0 TCGTGCTGGCCGCGGCCCACTGTCTGACCGTGCGCGGCAGTTCCGATGGCGAGCTGCTGC 344
consensus_8253#1 TCGTGCTGGCCGCGGCCCACTGTCTGACCGTGCGCGGCAGTTCCGATGGCGAGCTACTGC 360
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consensus_8253#0 CCTCGGATCAGCTCGTTGTGCACGTCGGCGTTGTGTCGGTGCAGCAGGATAACGAGCGTT 404
consensus_8253#1 CCTCGGATCAGCTCGTTGTGCACGTCGGCGTTGTGTCGGTGCAGCAGGATAACGAGCGTT 420
************************************************************
consensus_8253#0 CGCGACGGTTCCAAGTGCGCAATGTCACGGTGGAAGATGAGTCGGACCTGGCACTGATCG 464
consensus_8253#1 CGCGACGGTTCCAAGTGCGCAATGTCACGGTGGAAGATGAGTCGGACCTGGCACTGATCG 480
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consensus_8253#0 AGCTGCAGCTAGGTGAGCCGCGAACCGCCGTACCGAAGCTGATGCCCGATTCGAGTGCCT 524
consensus_8253#1 AGCTGCAGCTAGGTGAGCCGCGAACCGCCGTACCGAAGCTGATGCCCGATTCGAGTGCCT 540
************************************************************
consensus_8253#0 CCAGCGACGAGGATGGCAGTGGCGG-TGGTGTCGATGTGTCGGAAAATTTGCTGCCAGTG 583
consensus_8253#1 CCAGCGACGAGGATGGCAGTGGTGGCTGATAGTGGCGG---------------------- 578
********************** ** ** * * *
consensus_8253#0 GTGGCTGATAGTGGCGGTTGGAAACCAATTCCAGTGTGTCTGGTCGATGCACTCGATCTG 643
consensus_8253#1 ------------------------------------------------------------
consensus_8253#0 ACCACCCTGTATGGCACGGAAATGTACATACTGAACCAGAGCCAGCGGAATCGCCTGGGG 703
consensus_8253#1 ------------------------------------------------------------
consensus_8253#0 GGCTATGAGCCGGTACGGTTAATACTGAACGAATTTCTGCTCTGCTCCGGATCTACGCTC 763
consensus_8253#1 ------------------------------------------------------------
consensus_8253#0 GCCATGAAGTCACGGTCGATCAATGGAACGACCGTTTCCTTCACCATCAAAGATCTCAAC 823
consensus_8253#1 ------------------------------------------------------------
consensus_8253#0 CTACCGAGCAACGATAGGGGTACGGCACTATACTTCAAGCACCAGGGCACGTGGAGCCTG 883
consensus_8253#1 ------------------------------------------------------------
consensus_8253#0 CTCGGCTTTACCGTGTCCCGGGCCAGCCGCCAATGGACGCCCGGTTCCGTCTGTCTGCCG 943
consensus_8253#1 ------------------------------------------------------------
consensus_8253#0 AACGATATCATTTCCTTCGATTGTCTCTATCCGGCACTGGACTGGGTGATGGAAAACTTT 1003
consensus_8253#1 ------------------------------------------------------------
consensus_8253#0 GGCGACACCAACAGCTAGGGCTACGGATGGTGGAAAAGTGCTATTGTGTGTGGGTTTTGG 1063
consensus_8253#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_8253#1 ------------------------------------------------------------
consensus_8253#0 GCGATTGTGCCATGCGGAGGGTAGCTATACCACTCGGTCGCT 1165
consensus_8253#1 ------------------------------------------
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| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||