cluster # 8576

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 8576 cluster # 8576 Sequences # 11 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8576#0 length = 1134 sequences # 11
consensusID : consensus_8576#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1134
fasta sequence
                              [ATATTTTGTGTGTTTGTTTGCAGTCGCTTCGGTTCATTTGGAATAAATATTCGTAAATTCGGAAATAATCAGTGTG-AA-CCTAAACATGAATCAGTATCGAAGCGAGAAGCAGCTCGCTTATCTGTATCCGATTATTGCGACCTTATCTTTCGTGTGCTGTATATCGACAACCGTAGCATGGCAGCACTGGCGATATGTGTTGGATACTTGTGTTGAAACTAACTGCGGATGTATTTTGCATGGCCGGTCAACTGCTACGTTTTTCACCGGAGGCCATGTCGCCTATTGTCACTGGGCAGCGTACGGATTGGTGTTACCCATAATATTCTGCTTTATCTTTGGAATATTCCATGTCTTCCGGGTATGCTTCGGACGCCGTCGTCGCTACCCGGGTACAGCCACCGTTA-GCAAAGATCTGGAGATGTAATTTTAATGACGACCAAAACTGATGTGGAAGAGGACGACATCAGTCCTTACTACTGGATACCGGCTAGCGTCATTGGAAGTTTGATGGCGGTTCTTACGCTTGTACATGCTGCGATGTATTTGGACGGATTCTTGACTACCTGCAAGCAGCAACGCAACGAACTTATCAAGTATATGCAGGCAAACGGCAGCTTAG-TACCCATCATTCAAAGCCGCATTTCATGTTCATCGGTATTTGATTTTATGGATTATTTACATTTGGACGTTTCGTTCGACAGACACCGAGAGGGAAGAATTAATACAGCAGCTGCATTGATCATAGGTTTAGTTTGTTCGTGGATTTGTGTTGGTTTGTGGATTTGGACGGTGGTAATCAATGCTAAACGAGCACGCGCCAGTAAAGACTTGCGCATTTAATACTGTTACGAGGGCAATCACGATCGTTTAAAGTGATAGTATTAGGCAGCTTTTAAGATGCATTCCTTACAT-GCCATGCATA-CCGATTGTGCCTTCATTTTAAAGAATGTAAGATCTACACATTTTTACAAATTTTCATATTTTATCAAGCACACGAGTAGAGTAGACATTCCGAAGAAAAGCG--AAAAAAAAAACAACGATTTGCACGAATCGGTGT-TTTACCAACGTATTTTTTTTAAATAAAACTTAAATGAATGGTACTAAATCGTAAATACCATATGACAAACAAAA]

[+] EMBL CNS08ZUY             [ATATTTTGTGTGTTTGTTTGCAGTCGCTTCGGTTCATTTGGAATAAATATTCGTAAATTCGGAAATAATCAGTGTGAAA CCTAAACATGAATCAGTATCGAAGCGAGAAGCAGCTCGCTTATCTGTATCCGATTATTGCGACCTTATCTTTCGTGTGCTGTATATCGACAACCGTAGCATGGCAGCACTGGCGATATGTGTTGGATACTTGTGTTGAAACTAACTGCGGATGTATTTTGCATGGCCGGTCAACTGCTACGTTTTTCACCGGAGGCCATGTCGCCTATTGTCACTGGGCAGCGTACGGATTGGTGTTACCCATAATATTCTGCTTTATCTTTGGAATATTCCATGTCTTCCGGGTATGCTTCGGACGCCGTCGTCGCTACCCGGGTACAGCCACCGTTA GCAAAGATCTGGAGATGTAATTTTAATGACGACCAAAACTGATGTGGAAGAGGACGACATCAGTCCTTACTACTGGATACCGGCTAGCGTCATTGGAAGTTTGATGGCGGTTCTTACGCTTGTACATGCTGCGATGTATTTGGACGGATTCTTGACTACCTGCAAGCAGCAACGCAACGAACTTATCAAGTATATGCAGGCAAACGGCAGCTTAGATACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CNS09Q61             [   TTGTGTGTGTTTGTTTGCAGTCGCTTCGGTTCATTTGGAATAAATATTCGTAAATTCGGAAATAATCAGTGTG AA CCTAAACATGAATCAGTATCGAAGCGAGAAGCAGCTCGCTTATCTGTATCCGATTATTGCGACCTTATCTTTCGTGTGCTGTATATCGACAACCGTAGCATGGCAGCACTGGCGATATGTGTTGGATACTTGTGTTGAAACTAACTGCGGATGTATTTTGCATGGCCGGTCAACTGCTACGTTTTTCACCGGAGGCCATGTCGCCTATTGTCACTGGGCAGCGTACGGATTGGTGTTACCCATAATATTCTGCTTTATCTTTGGAATATTCCATGTCTTCCGGGTATGCTTCGGACGCCGTCGTCGCTACCCGGGTACAGCCACCGTTA GCAAAGATCTGGAGATGTAATTTTAATGACGACCAAAACTGATGTGGAAGAGGACGACATCAGTCCTTACTACTGGATACCGGCTAGCGTCATTGGAAGTTTGATGGCGGTTCTTACGCTTGTACATGCTGCGATGTATTTGGACGGATTCTTGACTACCTGCAAGCAGCAACGCAACGAACTTATCAAGTATATGCAGGCAAACGGCAGCTTAG TACCCATCATTCAAAGCCGCATTTCATTTTCATCGGTATTTGATTTTATGGATTATTTACATTTGGACGTTTCGTTCGACAGACACCGAGAGGGAAGAATTAATACAGCAGCTGCATTGATCATAGGTTTAGTTTGTTCGTGGATTTGTGTTGGTTTGTGGATTTGGACGGTGGTAATCAATGCTAAACGAGCACGCGCCAGTTAAGACTTGCGCATTTAATACTGTTACGAGGGCAATCACGATCGTTTAAAGTGATAGTATTAGGCAGCTTTTAAGATGCATTCCTTACAT GCCATGCATA Ca                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CNS08LDV             [      TGTGTGTTTGTTTGCAGTCGCTTCGGTTCATTTGGAATAAATATTCGTAAATTCGGAAATAATCAGTGTG AA ACTAAACATGAATCAGTATCGAAGCGAGAAGCAGCTCGCTTATCTGTATCCGATTATTGCGACCTTATCTTTCGTGTGCTGTATATCGACAACCGTAGCATGGCAGCACTGGCGATATGTGTTGGATACTTGTGTTGAAACTAACTGCGGATGTATTTTGCATGGCCGGTCAACTGCTACGTTTTTCACCGGAGGCCATGTCGCCTATTGTCACTGGGCAGCGTACGGATTGGTGTTACCCATAATATTCTGCTTTATCTTTGGAATATTCCATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BM647583             [        ccgGTTTGTTTGCAGTCGCTTCGGTTCATTTGGAATAAATATTCGTAAATTTGGAAATAATCTGTGTGAAA CCTAAACATGAATCAGTATCGAAGCGAGAAGCAGCTCGCTTATCTGTATCCGATTATTGCGACCTTATCTTTCGTGTGCTGTATATCGACAACCGTAGCATGGCAGCACTGGCGATATGTGTTGGATACTTGTGTTGAAACTAACTGCGGATGTATTTTGCATGGCCGATCTACTGCTACGTTTTTCACCGGAGGCCATGTCGCCTATTGTCACTGGGCAGCGTACGGATTGGTGTTACCCATAATATTCTGCTTTATCTTTGGAATATTCCATGTCTTCCGGGTATGCTTCGGACGCCGTCGTCGCTACCCGGGTACAGCCACCGTTAGGCAAAGATCTGGAGATGTAATTTTAATGACGACCAAAACTGATGTGGAAGAGGACGACATCAGTCCTTACTACTGGATACCGGCTAGCGTCATTGGAAGTTTGATGGCGGTTCTTACGCTTGTACATGCTGCGATGTATTTGGACGGATTCTTGACTACCTGCAAGCAGCAACGCAACGAACTTATCAAGTATATGCAGGCAAACTGCAGCTTAG TACCCATCATTCAACGCCGCATTTCATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CNS08Y48             [               GTTTGCAGTCGCTTCGGTTCATTTGGAATAAATATTCGTAAATTCGGAAATAATCAGTGTG AA CCTAAACATGAATCAGTATCGAAGCGAGAAGCAGCTCGCTTATCTGTATCCGATTATTGCGACCTTATCTTTCGTGTGCTGTATATCGACAACCGTAGCATGGCAGCACTGGCGATATGTGTTGGATACTTGTGTTGAAACTAACTGCGGATGTATTTTGCATGGCCGGTCAACTGCTACGTTTTTCACCGGAGGCCATGTCGCCTATTGTCACTGGGCAGCGTACGGATTGGTGTTACCCATAATATTCTGCTTTATCTTTGGAATATTCCATGTCTTCCGGGTATGCTTCGGACGCCGTCGTCGCTACCCGGGTACAGCCACCGTTA GCAAAGATCTGGAGATGTAATTTTAATGACGACCAAAACTGATGTGGAAGAGGACGACATCAGTCCTTACTACTGGATACCGGCTAGCGTCATTGGAAGTTTGATGGCGGTTCTTACGCTTGTACATGCTGCGATGTATTTGGACGGATTCTTGACTACCTGCAAGCAGCAACGCAACGAACTTATCAAGTATATGCAGGCAAACGGCAGCTTAG TACCCATCATTCAAAGCCGCATTTCATGTTCATCGGTATTTGATTTTATGGATTATTTACATTTGGACGTTTCGTTCGACAGACACCGAGAGGGAAGAATTAATACAGCAGCTGCATTGATCATAGGTTTAGTTTGTTCGTGGATTTGTGTTGGTTTGTGGATTTGGACGGTGGTAATCAATGCTAAACGAGCACGCGCCAGTAAAGACTTGCGCATTTAATACTGTTACGAGGGCAATCACGATCGTTTAAAGTGATAGTATTAGGCAGCTTTTAAGATGCATTCCTTACAT GCCATGCATA CCGATTGTGCCTTCATTTTAAAGA                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BM612130             [                     ccgCGCTTCGGTTCATTTGGAATAAATATTCGTAAATTTGGAAATAATCTGTGTGAAA CCTAAACATGAATCAGTATCGAAGCGAGAAGCAGCTCGCTTATCTGTATCCGATTATTGCGACCTTATCTTTCGTGTGCTGTATATCGACAACCGTAGCATGGCAGCACTGGCGATATGTGTTGGATACTTGTGTTGAAACTAACTGCGGATGTATTTTGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BX618232             [                                                              AAATAATCTGTGTG AACCCTAAACATGAATCAGTATCGAAGCGAGAAGCAGCTCGCTTATCTGTATCCGATTATTGCGACCTTATCTTTCGTGTGCTGTATATCGACAACCGTAGCATGGCAGCACTGGCGATATGTGTTGGATACTTGTGTTGAAACTAACTGCGGATGTATTTTGCATGGCCGATCTACTGCTACGTTTTTCACCGGAGGCCATGTCGCCTATTGTCACTGGGCAGCGTACGGATTGGTGTTACCCATAATATTCTGCTTTATCTTTGGAATATTCCATGTCTTCCGGGTATGCTTCGGACGCCGTCGTCGCTACCCGGGTACAGCCACCGTTAGGCAAAGATCTGGAGATGTAATTTTAATGACGACCAAAACTGATGTGGAAGAGGACGACATCAGTCCTTACTACTGGATACCGGCTAGCGTCATTGGAAGTTTGATGGCGGTTCTTACGCTTGTACATGCTGCGATGTATTTGGACGGATTCTTGACTACCTGCAAGCAGCAACGCAACGAACTTATCAAGTATATGCAGGCAAACGGCAGCTTAG TACCCATCATTCAAAGCCGCATTTCATGTTCATCGGTATTTGATTTTATGGATTATTTACATTTAGACGTTTCGTTCGACAGACACCGAGAGGGAAGAATTAATACAGCAGCTGCATTGATCATAGGTTTAGTTTGTTCGTGGATTTGTGTTGGTTTGTGGATTTGGACGGTGGTAATCAATGCTAAACGAGCACGCGCCAGTAAAGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CNS08Y49             [                                                                                                                                                                                                                    TGTTGAAACTAACTGCGGATGTATTTTGCATGGCCGGTCAACTGCTACGTTTTTCACCGGAGGCCATGTCGCCTATTGTAACTGGGCAGCGTACGGATTGGTGTTACCCATAATATTCTGCTTTATCTTTGGAATATTCCATTTCTTCCGGGTATGCTTCGGACGCCGTCGTCGCTACCCGGGTACAGCCACCGTTAGGCAAAGATCTGGAGATGTAATTTTAATGACGACCAAAACTGATGTGGAAGAGGACGACATCAGTCCTTACTACTGGATACCGGCTAGCGTCATTGGAAGTTTGATGGCGGTTCTTACGCTTGTACATGCTGCGATGTATTTGGACGGATTCTTGACTACCTGCAAGCAGCAACGCAACGAACTTATCAAGTATATGCAGGCAAACGGCA TTTAG TACCCATCATTCAAAGCCGCATTTCATGTTCATCGGTATTTGATTTTATGGATTATTTACATTTGGACGTTTCGTTCCACAGACACCGAGAGGGAAGAATTAATACAGCAGCTGCATTGATCATAGGTTTAGTTTGTTCGTGGATTTGTGTTGGTTTGTGGATTTGGACGGTGGTAATCAATGCTAAACGAGCACGCGCCAGTAAAGACTTGCGCATTTAATACTGTTACGAGGGAAATCACGATCGTTTAAAGTGATAGTATTAGGCAGCTTTTAAGATTTATTCCTTACAT GCCATGCATA CCGATTGTGCCTTCATTTTAAAGAATGTAAGATCTACACATTTTTACAAATTTTCATATTTTATAAAGCACACGAGTAGAGTAGACATTCCGAAGAAAAGCG  AAAAAAAAAACAACGATTTGCACGAATCGGTGT TTTACCAACGTATTTTTTTTAAATAAAACTTAAATGAATGGTACTAAATCGTAAt                   ]
[-] EMBL CNS08ZUZ             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGGTTCTTACGCTTGTAAATGCTGCGATGTA TTGGACGGATTCTTGACTACCTGCAAGCAGCAACGCAACGAACTTATCAAGTATATGCAGGCAAACGGCAGCTTAG TACCCATCATTCAAAGCCGCATTTCATGTTCATCGGTATTTGATTTTATGGATTATTTACATTTGGACGTTTCGTTCGACAGACACCGAGAGGGAAGAATTAATACAGCAGCTGCATTGATCATAGGTTTAGTTTGTTCGTGGATTTGTGTTGGTTTGTGGATTTGGACGGTGGTAATCAATGCTAAACGAGCACGCGCCAGTAAAGACTTGCGCATTTAATACTGTTACGAGGGCAATCACGATCGTTTAAAGTGATAGTATTAGGCAGCTTTTAAGATGCATTCCTTACAT GCCATGCATA CCGATTGTGCCTTCATTTTAAAGAATGTAAGATCTACACATTTTTACAAATTTTCATATTTTATCAAGCACACGAGTAGAGTAGACATTCCGAAGAAAAGCGAAAAAAAAAAAACAACGATTTGCACGAATCGGTGTATTTACCAACGTATTTTTTTTAAATAAAACTTAAATGAATGGTAATAAATCGTAAATA                 ]
[-] EMBL CNS08LDW             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAGGGGGAAGAATTAATACAGCAGCTGCATTGATCATAGGTTTAGTTTGTTCGTGGATTTGTGTTGGTTTGTGGATTTGGACGGTGGTAATCAATGCTAAACGAGCACGCGCCAGTAAAGACTTGCGCATTTAATACTGTTACGAGGGCAATCACGATCGTTTAAAGTGATAGTATTAGGCAGCTTTTAAGATGCATTCCTTACAT GCCATGCATACCCGATTGTGCCTTCATTTTAAAGAATGTAAGATCTACACATTTTTACAAATTTTCATATTTTATCAAGCACACGAGTAGAGTAGACATTCCGAAGAAAAGCG  AAAAAAAAAACAACGATTTGCACGAATCGGTGT TTTACCAACGTATTTTTTTTAAATAAAACTTAAATGAATGGTACT AATCGTAA                    ]
[-] EMBL CNS09Q62             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCAGTAAATACTTGCGCATTTAATACTGTTACGAGGGCAATCACGATCGTTTAAAGTGATAGTATTAGGCAGCTTTTAAGATGCATTCCTTACATCGCCATGCATA CCGATTGTGCCTTCATTTTAAAGAATGTAAGATCTACACATTTTTACAAATTTTCATATTTTATCAAGCACACGAGTAGAGTAGACATTCCGAAGAAAAGCG  AAAAAAAAAACAACGATTTGCACGAATCGGTGT TTTACCAACGTATTTTTTTTAAATAAAACTTAAATGAATGGT CTAAATCGTAAATACCATATGACAAACAAAA]




>consensus_8576#0
ATATTTTGTGTGTTTGTTTGCAGTCGCTTCGGTTCATTTGGAATAAATATTCGTAAATTC
GGAAATAATCAGTGTGAACCTAAACATGAATCAGTATCGAAGCGAGAAGCAGCTCGCTTA
TCTGTATCCGATTATTGCGACCTTATCTTTCGTGTGCTGTATATCGACAACCGTAGCATG
GCAGCACTGGCGATATGTGTTGGATACTTGTGTTGAAACTAACTGCGGATGTATTTTGCA
TGGCCGGTCAACTGCTACGTTTTTCACCGGAGGCCATGTCGCCTATTGTCACTGGGCAGC
GTACGGATTGGTGTTACCCATAATATTCTGCTTTATCTTTGGAATATTCCATGTCTTCCG
GGTATGCTTCGGACGCCGTCGTCGCTACCCGGGTACAGCCACCGTTAGCAAAGATCTGGA
GATGTAATTTTAATGACGACCAAAACTGATGTGGAAGAGGACGACATCAGTCCTTACTAC
TGGATACCGGCTAGCGTCATTGGAAGTTTGATGGCGGTTCTTACGCTTGTACATGCTGCG
ATGTATTTGGACGGATTCTTGACTACCTGCAAGCAGCAACGCAACGAACTTATCAAGTAT
ATGCAGGCAAACGGCAGCTTAGTACCCATCATTCAAAGCCGCATTTCATGTTCATCGGTA
TTTGATTTTATGGATTATTTACATTTGGACGTTTCGTTCGACAGACACCGAGAGGGAAGA
ATTAATACAGCAGCTGCATTGATCATAGGTTTAGTTTGTTCGTGGATTTGTGTTGGTTTG
TGGATTTGGACGGTGGTAATCAATGCTAAACGAGCACGCGCCAGTAAAGACTTGCGCATT
TAATACTGTTACGAGGGCAATCACGATCGTTTAAAGTGATAGTATTAGGCAGCTTTTAAG
ATGCATTCCTTACATGCCATGCATACCGATTGTGCCTTCATTTTAAAGAATGTAAGATCT
ACACATTTTTACAAATTTTCATATTTTATCAAGCACACGAGTAGAGTAGACATTCCGAAG
AAAAGCGAAAAAAAAAACAACGATTTGCACGAATCGGTGTTTTACCAACGTATTTTTTTT
AAATAAAACTTAAATGAATGGTACTAAATCGTAAATACCATATGACAAACAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case