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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9085#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 1322 fasta sequence
[GCATTAAAACAAAATT-GACTTACGGTGTTTATTTTCCATTAAATGTTCCACAATAAACAGGCGAATTATCATTCGTTACGCAAACCCCCCCGCCAATCAAACCGCCTAAG-CACTCGCCACCACCGTATCGGTCACAATCAGATGCACGGTAAGCCAGAACGCCAGCACCGGCTGCAGCCCGGTCACGAGAAACAGAAAATAGAGCTTACGCTTGCGTCCTAGGTTGTGGTCGGTGTGCTGCTGGTGCTGCTGCTGCTGCCCGTACGGATCGTACCCGACCGCGCTTTGCGTTTGATCCTGCCCGGACAGTACCTTTGCCTTCATCGTCCGCAGCAGAAACAGTGCCAACATAGCGGAGGAATAAGACAGTGCCAAATAGTAGCCGGTGCGTTTGAGCAGTATCGTACCGACGACGGTTACCACGATCGCCGCATACTTGTACCCGCTCAGTGCCAGCAGATCCAACGTGCTCAGTGACGTTGATATGTTCCCTATGTACAGTGTCAGGGTGTAGATGACGATCTCGAAAATGCTGTACGCCAGCGCACTGGACGCCTGGATGCCAAGTTGCTCCGACGAGAATCTGTTCTGCATGCCCAGT-GCAATGCCCGCTAACACG-ACGTACGTTATGTAGCTCATCGCTGGAATATACATGTCCGGTGCGTTGATGTCGTACCGGGGCTGAACCGGATTATCGTGATCGTACTTCAT-CCCCCAGTCCTTATGCAAGAACGGAAAGAAAATAATTTTCAGCTTGTTCACCACGTAGCTGTTGTCGACCGAGAAATAGTACTTCAGCTTCGACATTGGCAAGTACTTCTCGATGTGGCTGTGCACAATCTCCTTG-CCCTGGTCGGCCAGCTTCTGACCGTACTGCATGGCCATATC-CTGGACGATGGGCTGCTGGAACATGGTGAATTGCCCGCCGCCCATCCCCGGCATTGACGCTGGCTGGCCGGGT-TGCCTTGGGCCACCGGTTGGCTGTG-GCTGCTGTGGTTGAGGGATGTAGTAGTTTGGCTGCT-GCTGCTGCTGGTCCATCGGGAACTGTTGCGGTGC-ATA-CTGTGGCTGTCCGTACAGATTGTTA-GGATCAGCGGGCATGTACTGGTTGGTCGGCAT-TTGTGATGTCATCTGTTGGTACGGA-ATGGTGGAACCAATAGCATTCACATCGCTGACTCGTTTTGGCTTCTTCGAAACGGACCGGTGGGCCCGTCCATCGGCACCAGCTTGAGCGTTGAAATTCATGATTGCAACCACAGAATTCCCTCCGGATAAGACGATACTTTGGCCACAATCAAGC-AGGGCCAAACTTGCCAGTTTTTCGG]
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[+] EMBL CNS090EO [ TAAAACAAAATT GACTTACGGTGTTTATTTTCCATTAAATGTTCCACAATAAACAGGCGAATTATCATTCGTTACGCAAA CCCCCCGCCTATCAAACCGCCTAAG CACTCGCCACCACCGTATCGGTCACAATCAGATGCACGGTAAGCCAGAACGCCAGCACCGGCTGCAGCCCGGTCACAAGAAACAGAAAATAGAGCTTACGCTTGCGTCCTAGGTTGTGGTCGGTGTGCTGCTGGTGCTGCTGCTGCTGCCCGTACGGATCGTACTCGACCGCGCTTTGCGTTTGATCCTGCCCGGACAGTACCTTTGCCTTCATCGTCCGCAGCAGAAACAGTGCCAACATAGCGGAGGAATAAGACAGTGCCAAATAGTAGCCGGTGCGTTTGAGCAGTATCGTACCGGCGACGGTTACCACGATCGCCGCATACTTGTACCCGCTCAGTGCCAGCAGATCCAACGTGCTCAGTGACGTTGATATGTTCCCTATGTACAGTGTCAGGGTGTAGATGACGATCTCGAAAATGCTGTACGCCAGCGCACTGGACGCCTGGATGCCAAGCTGCTCCGACGAGAATCTGTTCTGCATGCCCAGTAGCAATGCCCGCTAACACG ACGTACGTAATGTAGCTCATCGCTGGAATATACATGTCCGGTGCGTTGATGTCGTACCGGGGCTGAACCGGATTATCGTGATCGTACTTCAT CCCCCAATCCTTATGCAAAAACGGAAAGAAAATAATTTTCAGCTTGTTCACCACGTAGCTGTTGTCGACCGAGAAATAGTACTTCAGCTTCGACATTGGCAAGTACTTCTCGATGTGGCTGTGCACAATCTCCTTG CCCTGGTCGGCCAGCTTCTGACCGTACTGCATGGCCATATC CTGGACGATGGGCTGCTGGAACATGGTGAATTGCCCGCCGCCCATCCCCGGCATCGACGCTGGCTGGCCGGGT TGCCTTGGGCCAACG ]
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[+] EMBL CNS08FXY [ AATCAGATGCACGGTAAGCCAGAACGCCAGCCCCGGCTGCAGCCCGGTCACGAGAAACAGAAAATAGAGCTTACGCTTGCGTCCCAGGTTGTGGTCGGTGTGCTGCTGGTGCTGCTGCTGCTGCCCGTACGGATCGTACCCGACCGCGCTTTGCGTTTGATCCTGC ]
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[-] EMBL BM656730 [ ATGCCCAGT GCAATGCCCGCTAACACG ACGTACGTTATGTAGCTCATCGCTGGAATATACATGTCCGGTGCGTTGATGTCGTACCGGGGCTGAACCGGATTATCGTGATCGTACTTCAT CCCCCAGTCCTTATGCAAGAACGGAAAGAAAATAATTTTCAGCTTGTTCACCACGTAGCTGTTGTCGACCGAGAAATAGTACTTCAGCTTCGACATTGGCAAGTACTTCTCGATGTGGCTGTGCACAATCTCCTTG CCCTGGTCGGCCAGCTTCTGACCGTACTGCATGGCCATATC CTGGACGATGGGCTGCTGGAACATGGTGAATTGTCCGCTGCCCATCCCCGGCATTGACGCTGGCTGGCCGGGT TGCCTTGGGCCACCGGTCGGCTGTG GCTGCTGTGGTTGAGGGATGTAGTAGTTTGGCTGCT GCTGCTGCTGGTCCATCGGGAACTGTTGCGGTGC ATA CTGTGGCTGTCCGTACAGATTGTTA GGATCAGCGGGCATGTACTGGTTGGTCGGCAT TTGTGATGTCATCTGTTGGTACGGA ATGGTGGAACCAATAGCATTCACATCGCTGACTCGTTTTGGCTTCTTCGAAACGGACCGGTGGGCCCGTCCATCGGCACCAGCTTGAGCGTTGAAATTCATGATTGCAACCACAGAATTCCgg ]
[-] EMBL BM611862 [ T GCAATGCCCGCTAACACGAACGTACGTTATGTAGCTCATCGCTGGAATATACATGTCCGGTGCGTTGATGTCGTACCGGGGCTGAACCGGATTATCGTGATCGTACTTCATCCCCCCAGTCCTTATGCAAGAACGGAAAGAAAATAATTTTCAGCTTGTTCACCACGTAGCTGTTGTCGACCGAGAAATAGTACTTCAGCTTCGACATTGGCAAGTACTTCTCGATGTGGCTGTGCACAATCTCCTTG CCCTGGTCGGCCAGCTTCTGACCGTACTGCATGGCCATATC CTGGACGATGGGCTGCTGGAACATGGTGAATTGCCCGCCGCCCATCCCCGGCATCGACGCTGGCTGGCCGGGT TGCCTTGGGCCACCGGTTGGCTGTG GCTGCTGTGGTTGAGGGATGTAGTAGTTTGGCTGCT GCTGCTGCTGGTCCATCGAGAACTGTTGCGGTGC ATA CTGTGGCTGTCCGTACAGATTGTTA GGATCAGCGGGCATGTACTGATTGGTCGGCAT TTGTGATGTCATCTGTTGGTACGGA ATGGTGGAACCAATAGCATTCACATCGCTGACTCGTTTTGGCTTCTTCGAAACGGACCGGTGGGCCCGTCCATCGGCACCAGCTTGAGCGTTGAAATTCATGATTGCAACCACAGAATTCCCTCCGGATAAGACGATACTTTGGCgg ]
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[-] EMBL BM611441 [ TGTAGCTCATCGCTGGAATATACATGTCCGGTGCGTTGATGTCGTACCGGGGCTGAACCGGATTATCGTGATCGTACTTCAT CCCCCAGTCCTTATGCAAGAACGGAAAGAAAATAATTTTCAGCTTGTTCACCACGTAGCTGTTGTCGACCGAGAAATAGTACTTCAGCTTCGACATTGGCAAGTACTTCTCGATGTGGCTGTGCACAATCTCCTTG CCCTGGTCGGCCAGCTTCTGACCGTACTGCATGGCCATATC CTGGACGATGGGCTGCTGGAACATGGTGAATTGTCCGCTGCCCATCCCCGGCATTGACGCTGGCTGGCCGGGT TGCCTTGGGCCACCGGTCGGCTGTG GCTGCTGTGGTTGAGGGATGTAGTAGTTTGGCTGCT GCTGCTGCTGGTCCATCGGGAACTGTTGCGGTGC ATA CTGTGGCTGTCCGTACAGATTGTTA GGATCAGCGGGCATGTACTGGTTGGTCGGCAT TTGTGATGTCATCTGTTGGTACGGA ATGGTGGAACCAATAGCATTCACATCGCTGACTCGTTTTGGCTTCTTCGAAACGGACCGGTGGGCCCGTCCATCGGCACCAGCTTGAGCGTTGAAATTCATGATTGCAACCACAGAATTCCCTCCGGATAAGACGATACTTTGcgg ]
[-] EMBL CNS0907M [ AATATACATGTCCGGTGCGTTGATGTCGTACCGGGGCTGAACCGGATTATCGTGATCGTACTTCAT CCCCCAGTCCTTATGCAAGAACGGAAAGAAAATAATTTTCAGCTTGTTCACCACGTAGCTGTTGTCGACCGAGAAATAGTACTTCAGCTTCGACATTGGCAAGTACTTCTCGATGTGACTGTGCACAATCTCCTTG CCCTGGTCGGCCAGCTTCTGACCGTACTGCATGGCCATATC CTGGACGATGGGCTGCTGGAACATGGTGAATTGCCCGCCGCCCATCCCCGGCATTGACGCTGGCTGGCCGGGTGTGCCTTGGGCCACCGGTTGGCTGTG GCTGCTGTGGTTGAGGGATGTAGTAGTTTGGCTGCTCGCTGCTGCTGGTCCATCGGGAACTGTTGCGGTGCGATATCTGTGGCTGTCCGTACAGATTGTTAGGGATCAGCGGGCATGTACTGGTTGGTCGGCAT TTGTGATGTCATCTGTTGGTACGGAGATGGTGGAACCTATAGCATTCACATCGCTGACTCGTTTTGGCTT AAAGAAACGGACCGGTGGGCCCGTCCATCGGCACCA ]
[-] EMBL BX610957 [ CACGTAGCTGTTGTCGACCGAGAAATAGTACTTCAGCTTCGACATTGGCAAGTACTTCTCGATGTGGCTGTGCACAATCTCCTTG CCCTGGTCGGCCAGCTTCTGACCGTACTGCATGGCCATATC CTGGACGATGGGCTGCTGGAACATGGTGAATTGCCCGCCGCCCATCCCCGGCATCGACGCTGGCTGGCCGGGT TGCCTTGGGCCACCGGTTGGCTGTG GCTGCTGTGGTTGAGGGATGTAGTAGTTTGGCTGCT GCTGCTGCTGGTCCATCGGGAACTGTTGCGGTGC ATA CTGTGGCTGTCCGTACAGATTGTTA GGATCAGCGGGCATGTACTGATTGGTCGGCAT TTGTGATGTCATCTGTTGGTACGGA ATGGTGGAACCAATAGCATTCACATCGCTGACTCGTTTTGGCTTCTTCGAAACGGACCGGTGGGCCCGTCCATCGGCACCAGCTTGAGCGTTGAAATTCATGATTGCAACCACAGAATTCCCTCCGGATAAGAC ]
[-] EMBL CNS090EN [ TTGGCAAGTACTTCTCGATGTGGCTGTGCACAATCTCCTTG CCCTGGTCGGCCAGCTTCTGACCGTACTGCATGGCCATATCTCTGGACGATGGGCTGCTGGAACATGGTGAATTGCCCGCCGCCCATCCCCGGCATCGACGCTGGCTGGCCGGGT TGCCTTGGGCCACCGGTTGGCTGTGTGCTGCTGTGGTTGAGGGATGTAGTAGTTTGGCTGCT GCTGCTGCTGGTCCATCGAGAACTGTTGCGGTGC ATA CTGTGGCTGTCCGTACAGATTGTTA GGATCAGCGGGCATGTACTGATTGGTCGGCAT TTGTGATGTCATCTGTTGGTACGGA ATGGTGGAACCAATAGCATTCACATCGCTGACTCGTTTTGGCTTCTTCGAAACGGACCGGTGGGCCCGTCCA ]
[-] EMBL BM605784 [ T GCTGCTGCTGGTCCATCGAGAACTGTTGCGGTGC ATA CTGTGGCTGTCCGTACAGATTGTTA GGATCAGCGGGCATGTACTGATTGGTCGGCAT TTGTGATGTCATCTGTTGGTACGGA ATGGTGGAACCAATAGCATTCACATCGCTGACTCGTTTTGGCTTCTTCGAAACGGACCGGTGGGCCCGTCCATCGGCACCAGCTTGAGCGTTGAAATTCATGATTGCAACCACAGAATTCCCTCCGGATAAGACGATACTTTGGTCACAATCAAGCAAAAGCC AACTTGCCAGTTTTTCGG]
[-] EMBL BX623828 [ TCGGGAACTGTTGCGGTGC ATA CTGTGGCTGTCCGTACAGATTGTTA GGATCAGCGGGCATGTACTGATTGGTCGGCATATTGTGATGTCATCNGTTGGTANGGA ATGGTGGAACCAATAGCATTCACATCGCTGACTCGTTTTGGCTTCTTNGAAACGGACCGGTGGGCCCGTCCATCGGCACCAGCTTGAGCGTNGAAATTCATGATTG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||