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consensusID : consensus_9131#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1302 fasta sequence
[ATTCGCTTTCCGAAGATTC-GATT-GGCTGGTTTTCTCCGTCAACTTTAAAGGTAGGGCAGGTTTGGCTGCTGTGTATGTATGTGTAATTGTGTGTGTGAGTGTGAGAATGTTGCCGCTTTTGCTGGGTAGTTAATATCTCACATGTCTTGGGCTGGTTTGAGGATTGCTGGCCGCTGTGCTACCGCCGCCGGTGGCCCCTGTCGCCCCGGCCATCCCGCTGGACGCATTGGAGGAGGAAACGTTGGAGGAAGCAGCACCGCCGGTGGCGTTATTATTACTGCTACTGTTACTACTGCCGATCAGCGTGGTCGAGTAGTTGTTGCTGGCTGCCGTCTGCGGACCGCCCTGCAGGCCAATTACCGATTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGC-TGCTGCTGCGCGGCCTGTTGCGTGA-CA-TTTCCTGGTGTAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCCGATTCCAG-CGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCG-GCACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCA-G-ATGCTTCGCCTTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCG-TTTCGCT-CTGCCGCACTA-GGAACACGCCGTGACTAGAGGTGCCCTCGCGCAGCA-CCAGCTGGGCGGCATCGAACCGGGGCAGCGTGCCGTGGAACCACGGGTACTCGTGCATCATCGCGGTCAGGTCGGTGTCGTGCTCGTGCG-ACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCCGGTCGTCCGGCCGGCGGGGAGGCAGCTCCGGTGCGCTGGCAGCCGTAAGGGAGGAGTTG-T-TCGCGTTCGCTGTCTGGCCGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCAGCCGCCGTACCGACGTTCCCACTCTGGGCCGTGAGCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCA---CCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGCCAAACGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCCAGGTTGTTGCCGCCCACGCGTCCGTAGTTCTAGATCGCGATCTAGAACTAGCGGACGCGTGGGCGG]
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[+] EMBL CNS08P15 [ TGGGTAGTTAATATCTCACATGTCTTGGGCTGGTTTGAGGATTGCTGGCCGCTGTGCTACCGCCGCCGGTGGCCCCTGTCGCCCCGGCCATCCCGCTGGACGCATTGGAGGAGGAAACGTTGGAGGAAGCAGCACCGCCGGTGGCGTTATTATTACTGCTACTGTTACTACTGCCGATCAGCGTGGTCGAGTAGTTGTTGCTGGCTGCCGTCTGCGGACCGCCCTGCAGGCCAATCACCGATTGCTGCTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGC TGCTGCTGCGCGGCCTGTTGCGTGA CA TTTCCTGGTGTAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCCGATTCCAG CGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCCCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCGCGCACTGGCCCAGATCGTTCAGCG ]
[-] EMBL CNS08DZ5 [ TGGAGGAAGCAGCACC CCGGTGGCGTTATTATTACTGCTACTGTTACTACTGCCGATCAGCGTGGTCGAGTAGTTGTTGCTGGCTGCCGTCTGCGGACCCGCCTGCAGGCCAATTACCGATTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGCTTGCTG TGCGCGGCCTGTTGCGTGAGCA TTTCCTGAAATAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCCGATTCCAG CGGTATCGGGTGCTTTTGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCG GCACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCACG ATG TTCGCCTTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCG TTTCGCT CTGCCGCACTA GGAACACGCCGTGACTAGAGGTGCCCTCGCGCAGCA CCAGCTGGGCGGCATCGAACCGGGGCAGCGTGCCGTGGAACCACGGGTACTCGTGCATCATCGCGGTCAGGTCGCCCCCGTGCTCGTGCG ACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCCGGTTGTCCGGCCGGCGGGGAGGCAGCTCCGGTGCGCTGGCAGCCGTAAGGGAGGAGTTG TCTCGCGTTCGCTGTCTGGCCGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCAGCCGCCGTACCGACGTTCCCACTCTGGGCCGTGAGCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCA CCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGCta ]
[-] EMBL CNS08V7M [ GTTGCGTGAGCA TTTCCTGGTGTAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCCAAAAAAAG CGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCG GAACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCA GAATG TTCGCCTTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCG TTTCGCT CTGCCGCACTA GGAACACGCCGTGACTAGAGGTGCCCTCGCGCAGCA CCAGCTGGGCGGCATCGAACCGGGGCAGCGTGCCGTGGAACCACGGGTACTCGTGCATCATCGCGGTCAGGTCGGTGTCGTGCTCGTGCG ACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCCGGTCGTCCGGCCGGCGGGGAGGCAGCTCCGGTGCGCTGGCAGCCGTAAGGGAGGAGTTGTT TCGCGTTCGCTGTCTGGCCGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCAGCCGCCGTACCGACGTTCCCACTCTGGGCCGTGAGCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCA CCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCcgcta ]
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[-] EMBL BM645626 [ GGCGGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCTGCCGCCGTACCGACGTTCCCGCTCTGGGCCGTGAGCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGTGCTACGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCCAGGTTGTTGCCGCCCACGCGTCCGTAGTTCTAGATCGCGATCTAGAACTAGCGGACGCGTGGGCGG]
consensusID : consensus_9131#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 670 fasta sequence
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consensusID : consensus_9131#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 500 fasta sequence
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[-] EMBL AL696272 [GATATCCGGTCGTCCGGTCCCGTNCNGGGGAGCCAGTGCTTCNCGTTGGCGCTGTCACGCCGTTTAGGGAGGAGCTTGTTTCGCGTTCGCTGGTCTGCCCGTGCTGTGCTTGNTGNCGTGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCGTGGCCGCCGTACCGACGTTCCCGCTCTGGCCGTGANCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGTGCTACGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCCAGGTTGTTGCCGGCCTTCAGCACGAACGTGTTCTCGTGATCCGGCATCTCGAGCGCCGTAAACCTCGTGCGATCTGC]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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* *
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** ** * * * * * * * * * * *
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* * ** * ** *** ** * * * **
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consensus_9131#1 GCTGGTCGAGGTTTT--CCGGTGACAG--GTAGTTGACGGTGCCCTCCTTCCGGCATT-C 439
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***** * * ** * * *** * ** * ** ** * * * *
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| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||