cluster # 9525

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Anopheles gambiae
cluster # 9525 cluster # 9525 Sequences # 17 consensus # 3

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_9525#0 length = 476 sequences # 4

consensus_9525#1 length = 451 sequences # 2
consensus_9525#2 length = 384 sequences # 11

consensusID : consensus_9525#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 476
fasta sequence

                              [CTAAAAGCTGCGGAATTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTGGAGGTGCAGTACGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGGTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGTCCACCGCATGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGTTAGTAAAATTATTGTAAAACAAACCAAACATTTCATAAATGGCTAAGATTGGAGGCATTCCGAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCTGC]

[-] EMBL CNS08YV3             [CTAAAAGCTGCGGAATTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTGGAGGTGCAGTACGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGGTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGTCCACCGCATGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGTTAGTAAAATTATTGTAAAACAAACCAAACATTTCATAAATGGCTA                                                                   ]
[-] EMBL CNS08RCP             [         GCGGAATTCCTCGAGAACTGTTGGCCCACTGGAGGTGCAGTACGGAACGGTACGTCTTTGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTTTCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGGTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGTCCACCGCATGACGATCCAGGGCTTCCGCCCGTGGTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGTTCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTTTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATTACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAG                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CNS08RLT             [                                               ttTACGGAA GGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGGTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGTCCACCGCATGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGTTAGTAAAATTATTGTAAAACAAACCAAACATTTCATAAATGGCTAAGATTGGAGGCATTCCGAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCTGC]
[+] EMBL BM609659             [                                                  cCGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAACTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGTCCACCGCATGACGATCCGGAGCTTCCACCCGTGCTAATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTAATTAGTAAAATTATTGT                                                                                                 ]




>consensus_9525#0
CTAAAAGCTGCGGAATTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTGGAGGTGCAGTACGGAACGGT
ACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTAT
GCGCAGTGGTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGTCCACCGCATGACG
ATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCT
GCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCC
GGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGT
TTGTTAGTAAAATTATTGTAAAACAAACCAAACATTTCATAAATGGCTAAGATTGGAGGC
ATTCCGAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCTGC

consensusID : consensus_9525#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 451
fasta sequence

                              [GAGGCCAAGAATCGGCACNAGGCGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGGTACAAACGAGAATTAAATCAAACGGGTTTCCAGTGTGTCTAAAGATCGTACTTTATTCTTGTTG-----TTTCTGTCTTTTCAAATAATAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGAGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGTACGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGATAGTAAAATTATTGTAAAACAAACCAAAC]

[+] EMBL BX468302             [GAGGCCAAGAATCGGCACNAGGCGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGGTACAAACGAGAATTAAATCAAACGGGTTTCCAGTGTGTCTAAAGATCGTACTTTATTCTTGTTG     TTTCTGTCTTTTCAAATAATAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGAGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGTACGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGATAGTAAAATTATTGTAAAACAAACCAAAC]
[+] EMBL BM655581             [                   ccGCGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAACTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGGTACAAACGAGAACTAAATCAAACGGCTTTCCAGTGTGTCTAAAGATCGTACTTTAATCTTGTTGTTTCCTTTCTGTCTTTTCAAATAATAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGTCCACCGCATGACGATCCGGAGCTTCCACCCGTGCTAATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTAATTAGTAAAAT                    ]




>consensus_9525#1
GAGGCCAAGAATCGGCACNAGGCGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAG
TTAAACACTATCAGCATGAAAGGTACAAACGAGAATTAAATCAAACGGGTTTCCAGTGTG
TCTAAAGATCGTACTTTATTCTTGTTGTTTCTGTCTTTTCAAATAATAGTTGTGCTATGC
GCAGTGTTGCTTTTGGTGAGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGTACGACGAT
CCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGC
AGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGG
AAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTT
GATAGTAAAATTATTGTAAAACAAACCAAAC

consensusID : consensus_9525#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 384
fasta sequence

                              [CCGGTACGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGCACGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGTTAGTAAAATTATTGTAAAAC------AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCTGCCC]

[+] EMBL BM650198             [CCGGTACGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAACTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGCACGACGATCCGGAGCTTCCACCCGTGCTAATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTAATTAGTAAAATTATTGTAAAAC                                                   ]
[+] EMBL BM649481             [    ccgGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGAGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGTACGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGATAGTAAAATTATTGT                                                        ]
[+] EMBL CNS08RCO             [        GAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGGTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGTCCACCGCATGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGTTAGTAAAATTATTGTAAAAC      AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCTGCCC]
[+] EMBL BM614910             [       ccgACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAACTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGCACGACGATCCGGAGCTTCCACCCGTGCTAATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTAATTAGTAAAATTATTGTAAAAC                                                   ]
[+] EMBL BM648390             [        ccgCGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGAGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGTACGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGATAGTAAAATTATTGT                                                        ]
[+] EMBL CNS08M7Q             [          aaGGTA GTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGGTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGTCCACCGCATGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCG CGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGTTAGTAAAATTATTGTAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCAAATGTGCg          ]
[+] EMBL BM604031             [         ccgGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGAGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGTACGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGATAGTAAAATTATTGT                                                        ]
[+] EMBL BM629134             [         ccgGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGAGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGTACGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGATAGTAAAATTATTGT                                                        ]
[+] EMBL BM602114             [              ccgGTCTTAGCAGGAGCCAACTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGCACGACGATCCGGAGCTTCCACCCGTGCTAATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTAATTAGTAAAATTATTGTAAAAC                                                   ]
[+] EMBL BM581509             [                    ccgGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGAGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGTACGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTTGATAGTAAAAT                                                              ]
[+] EMBL BM611346             [                                        ccgGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGCACGACGATCCGGAGCTTCCACCCGTGCTAATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTTAATTAGTAAAATTATTGTAAAAC      AAAcct                                       ]




>consensus_9525#2
CCGGTACGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCA
TGAAAGTTGTGCTATGCGCAGTGTTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCT
GCCCACCGCACGACGATCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTG
ATAAGTTCCTGATCTGCAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGC
ATTGGAATGACTCCCGGAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTT
TTTAATGCTTAATGTTTGTTAGTAAAATTATTGTAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AGGCCACATGTGCCCGAGCTGCCC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9525#0      --------------------------------------------------CTAAAAGCTG 10
consensus_9525#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9525#1      GAGGCCAAGAATCGGCACNAGGCGGAACGGTACGTCTTAGCAGGAGCCAATTCGAGACAG 60
                                                                                  

consensus_9525#0      CGGAATTCCTCGAGCACTGTTGGC-CTACTGGAGGTGCAGT---ACGGAA---CGGTACG 63
consensus_9525#2      ------------------------------------CCGGT---ACGGAA---CGGTACG 18
consensus_9525#1      TTAAACACTATCAGCATGAAAGGTACAAACGAGAATTAAATCAAACGGGTTTCCAGTGTG 120
                                                              *   ****     * **  *

consensus_9525#0      TCTTAGCA--GGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATG 121
consensus_9525#2      TCTTAGCA--GGAGCCAATTCGAGACAGTTAAACACTATCAGCATGAAAGTTGTGCTATG 76
consensus_9525#1      TCTAAAGATCGTACTTTATTCTTGTTGTTTCTGTCTTTTCAA-ATAATAGTTGTGCTATG 179
                      *** *  *  * *    ****  *    **      * ***  ** * ************

consensus_9525#0      CGCAGTGGTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGTCCACCGCATGACGA 181
consensus_9525#2      CGCAGTGTTGCTTTTGGTGGGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGCACGACGA 136
consensus_9525#1      CGCAGTGTTGCTTTTGGTGAGTTCAGTGCTAGCTGACGATCGCTGCCCACCGTACGACGA 239
                      ******* *********** ************************* ****** * *****

consensus_9525#0      TCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTG 241
consensus_9525#2      TCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTG 196
consensus_9525#1      TCCAGAGCTTCCGCCCGTGCTGATGCCACATCCCACCGATTGTGATAAGTTCCTGATCTG 299
                      ************************************************************

consensus_9525#0      CAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCG 301
consensus_9525#2      CAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCG 256
consensus_9525#1      CAGCCATGGCGTCGCCGTTGTTAGCAAGTGTCCGCCCGGGTTGCATTGGAATGACTCCCG 359
                      ************************************************************

consensus_9525#0      GAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTT 361
consensus_9525#2      GAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTT 316
consensus_9525#1      GAAGCTGTGTGACTATCCATACGAGGCACAATGTGTACCGTCTTTTTAATGCTTAATGTT 419
                      ************************************************************

consensus_9525#0      TGTTAGTAAAATTATTGTAAAACAAACCAAACATTTCATAAATGGCTAAGATTGGAGGCA 421
consensus_9525#2      TGTTAGTAAAATTATTGTAAAACAAA---------------------------------- 342
consensus_9525#1      TGATAGTAAAATTATTGTAAAACAAACCAAAC---------------------------- 451
                      ** ***********************                                  

consensus_9525#0      TTCCGAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCTGC-- 476
consensus_9525#2      ---------------AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCTGCCC 384
consensus_9525#1      ---------------------------------------------------------