cluster # 9617

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Anopheles gambiae
cluster # 9617 cluster # 9617 Sequences # 18 consensus # 3

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consensus_9617#0 length = 964 sequences # 16

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consensusID : consensus_9617#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 964
fasta sequence

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[+] EMBL BM594917             [                ccgAAGATCACTTAAATTATACTAGGTAGATAGCTGTTTTGGACATTGTTA CTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAATATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAAGCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATTGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCAGGAAGTTGCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGTGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGATGGTGGTGCAAGTTTAACCCAAAAGACATGCGCTCTAAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGGAATGTTGTTCAGGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATGTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCAACACCCCAGATCTCAATGGTAAACTTTACGAATCGAATAGGCGATGAAACTTCATCTATTTTAACAACAACACATACTTCAGTTCCAAAAATGTGTGCTAAAATTGGTGAATATTGTTTAACATCTTCGGAATGCTGCTCCAAAAGTTG TTTAAGCTTTGCGTATAAATGCGTCAACAGATATGACCTTTCAGTAGTGGCAGATCCA                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BM657298             [                  ccgGATCACTTAAATTATACTAGGTAGATAGCTGTTTTGGACATTGTTA CTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAATTTAATTGAAGATAAAATATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAAGCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATTGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCAGGAAGTTGCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGTGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGATGGTGGTGCAAGTTTAACCCAAAAGACATGCGCTCTAAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGGAATGTTGTTCAGGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATGTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCAACACCCCAGATCTCAATGGTAAACTTTACGAATCGAATAGGCGATGAAACTTCATCTATTTTAACAACAACACATACTTCAGTTCCAAAAATGTGTGCTAAAATTGGTGAATATTGTTTAACATCTTCGGAATGCTGCTCCAAAAGTTG TTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BX629053             [                      ATCACTTAAATTATACTAGGTAGATAGCTGTTTTGGACATTGTTA CTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAATATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAAGCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATTGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCAGGAAGTTGCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGTGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGATGGTGGTGCAATTTTAACCCAAAAGACATGCGCTCTGAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGGAATGTTGTTCAGGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATGTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BX619861             [                         ACTTACATTATACTAGGTAGATAGCTGTTTTGGACATTGTTAGCTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAATATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAAGCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATTGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCAGGAAGTTGCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGTGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGATGGTGGTGCAAGTNTAACCCAAAAGACATGCGCTCTGAACGGAGAATATNGTTTGACGCATATGGAATGTTGTNCAGGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATGTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCANNACCCCAGATCTCAATGGTAAACTTTACGANTCGAATAGGCGATGAAACTTCATCTATTTTAACAACAACACATACTNCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BX627342             [                                           AGATAGCTGTTTTGGACATTGTTA CTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAATATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAAGCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATTGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCAGGAAGTTGCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGTGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGATGGTGGTGCAAGTTTAACCCAAAAGACATGCGCTCTGAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGGAATGTTGTTCAGGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATGTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCAACACCCCAGATCTCAATGGTAAACTTTACGAATCGAATAGGCGATGAAACTTCATCTATTTTAACAACAACACATACTTCAGTTCCAAAAATGTGTGCTAAAATTGGTGAATATTGTTTAACATCTTCGGAATGCTGCTCCAAAAGTTG TTTAAGCTTTGCGTATAAATGCGTCAACAGATATGACCTTTCAGTAGTGGCAGATCCAAATCTACCTGTAACATCAACTTATACTTCCAATCGT TTTGGGGGTACAGTAGACG                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX619316             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATATGGAATGTTGTTCAGGC ATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATGTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCAACACCCCAGATCTCAATGGTAAACTTTACGAATCGAATAGGCGATGAAACTTCATCTATTTTAACAACAACACATACTTCAGTTCCAAAAATGTGTGCTAAAATTGGTGAATATTGTTTAACATCTTCGGAATGCTGCTCCAAAAGTTG TTTAAGCTTTGCGTATAAATGCGTCAACAGATATGACCTTTCAGTAGTGGCAGATCCAAATCTACCTGTAACATCAACTTATACTTCCAATCGTNNTTGGGGGT                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BX612093             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGTAATGGCAGATCCTAATCTACCTGTAACATCAACTTATACTTCCAATCGT TTTGGGGGTACAGTAGACGAAACAAGCTCAGGAACACCCAATTGCACATCGAACGGATTATATTGTGTCCACAACAAAGATTGCTGTTCCGGAGCATGTTATAAATCTGTATGTTCAACAGAGATCCGTGTTGGTGTGCTGGAATCAGAGTTAACTCATCCGTCGGTTATTAATGGACCATATATTCAAGTACAAAAT]




>consensus_9617#0
CCGCGTCCGGAAATAGCAAGATCACTTAAATTATACTAGGTAGATAGCTGTTTTGGACAT
TGTTACTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAATAT
GCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAAGC
GCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATTGTCTTACTCATCGAGATTG
TTGTTCAGGAAGTTGCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTC
TGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGTGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGG
AGCAGATGATGGTGGTGCAAGTTTAACCCAAAAGACATGCGCTCTAAACGGAGAATATTG
TTTGACGCATATGGAATGTTGTTCAGGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATGTGTGCC
TCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCAACACCCCAGATCTCAAT
GGTAAACTTTACGAATCGAATAGGCGATGAAACTTCATCTATTTTAACAACAACACATAC
TTCAGTTCCAAAAATGTGTGCTAAAATTGGTGAATATTGTTTAACATCTTCGGAATGCTG
CTCCAAAAGTTGTTTAAGCTTTGCGTATAAATGCGTCAACAGATATGACCTTTCAGTAGT
GGCAGATCCAAATCTACCTGTAACATCAACTTATACTTCCAATCGTTTTGGGGGTACAGT
AGACGAAACAAGCTCAGGAACACCCAATTGCACATCGAACGGATTATATTGTGTCCACAA
CAAAGATTGCTGTTCCGGAGCATGTTATAAATCTGTATGTTCAACAGAGATCCGTGTTGG
TGTGCTGGAATCAGAGTTAACTCATCCGTCGGTTATTAATGGACCATATATTCAAGTACA
AAAT

consensusID : consensus_9617#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 838
fasta sequence

                              [AGGCAGAATCGGACGAGGAGAGTCTACTTAAATTATACTAGGTAGACAGCTGTTTGGACATTGTTACTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAATATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAAGCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATTGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCAGGAAGTTGCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGTGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGATAGGTGGTGCAAGTTTAACCCAAAAGACATGCGCTCTGAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGGAATGNTGTTCAGGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATAGTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCAACACCCCAGATCTCAATAGGTAAACTTTACGAATCGAATAGGCGATGAAACTTCATCTATTTTAACAACAACACATACTTCAGGTTCCACAAAATGTGTGCTAAAATTNGGTCGAATAATTGGTTTAAAACATCTTTCGGAATGCTGCGTCCCAAAAGTTGTNTAAAGCTTTGGCGTATAAAATCGCGGTCAACCAGNATTATGACCTTTTCCAGTAAGTGGGCNGAAATCCAAAAACTAGCCTGGGAACGAATCCACCTTAGTACCTTCCCCAGACGGTTTGGGGGGGTACACTCTCNGACGCACAACAGG]

[+] EMBL BX466288             [AGGCAGAATCGGACGAGGAGAGTCTACTTAAATTATACTAGGTAGACAGCTGTTTGGACATTGTTACTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAATATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAAGCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATTGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCAGGAAGTTGCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGTGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGATAGGTGGTGCAAGTTTAACCCAAAAGACATGCGCTCTGAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGGAATGNTGTTCAGGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATAGTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCAACACCCCAGATCTCAATAGGTAAACTTTACGAATCGAATAGGCGATGAAACTTCATCTATTTTAACAACAACACATACTTCAGGTTCCACAAAATGTGTGCTAAAATTNGGTCGAATAATTGGTTTAAAACATCTTTCGGAATGCTGCGTCCCAAAAGTTGTNTAAAGCTTTGGCGTATAAAATCGCGGTCAACCAGNATTATGACCTTTTCCAGTAAGTGGGCNGAAATCCAAAAACTAGCCTGGGAACGAATCCACCTTAGTACCTTCCCCAGACGGTTTGGGGGGGTACACTCTCNGACGCACAACAGG]




>consensus_9617#1
AGGCAGAATCGGACGAGGAGAGTCTACTTAAATTATACTAGGTAGACAGCTGTTTGGACA
TTGTTACTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAATA
TGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAAG
CGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATTGTCTTACTCATCGAGATT
GTTGTTCAGGAAGTTGCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTT
CTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGTGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCG
GAGCAGATGATAGGTGGTGCAAGTTTAACCCAAAAGACATGCGCTCTGAACGGAGAATAT
TGTTTGACGCATATGGAATGNTGTTCAGGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATAGTGT
GCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCAACACCCCAGATCTC
AATAGGTAAACTTTACGAATCGAATAGGCGATGAAACTTCATCTATTTTAACAACAACAC
ATACTTCAGGTTCCACAAAATGTGTGCTAAAATTNGGTCGAATAATTGGTTTAAAACATC
TTTCGGAATGCTGCGTCCCAAAAGTTGTNTAAAGCTTTGGCGTATAAAATCGCGGTCAAC
CAGNATTATGACCTTTTCCAGTAAGTGGGCNGAAATCCAAAAACTAGCCTGGGAACGAAT
CCACCTTAGTACCTTCCCCAGACGGTTTGGGGGGGTACACTCTCNGACGCACAACAGG

consensusID : consensus_9617#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 667
fasta sequence

                              [CTGTTTTGGACATTGTTACTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAATATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAAGCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATGTAAGTCAGAATTGTCATCTTAAAACTGGTTTTACAACTTTTATACCAGCAATAATAATTTTCATTAGCTGTGTTGTGATTTAATGTTAAATTTAATGAATATGAGATTAAGTCTTATGGATTCTTTTACCATACACCCTTTTTATTATGAAGTGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCANGAAGTTGCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGNGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGATGGTGGTGCAAGTTTAACCCAAAAGACATGCGCTCTGAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGGAATGTTGTTCANGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATGTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCNACACCCCAGATCTCAATGGTAAACTTTACGAATCGAAT]

[+] EMBL BX622419             [CTGTTTTGGACATTGTTACTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAATATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAAGCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATGTAAGTCAGAATTGTCATCTTAAAACTGGTTTTACAACTTTTATACCAGCAATAATAATTTTCATTAGCTGTGTTGTGATTTAATGTTAAATTTAATGAATATGAGATTAAGTCTTATGGATTCTTTTACCATACACCCTTTTTATTATGAAGTGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCANGAAGTTGCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGNGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGATGGTGGTGCAAGTTTAACCCAAAAGACATGCGCTCTGAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGGAATGTTGTTCANGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATGTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCNACACCCCAGATCTCAATGGTAAACTTTACGAATCGAAT]




>consensus_9617#2
CTGTTTTGGACATTGTTACTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATT
GAAGATAAAATATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTAT
ATTTCTGTGAAGCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATGTAAGTC
AGAATTGTCATCTTAAAACTGGTTTTACAACTTTTATACCAGCAATAATAATTTTCATTA
GCTGTGTTGTGATTTAATGTTAAATTTAATGAATATGAGATTAAGTCTTATGGATTCTTT
TACCATACACCCTTTTTATTATGAAGTGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCANGAAGTT
GCTTAAGCTTCTCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAA
GCGTTCCAGNGAAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGATGGTG
GTGCAAGTTTAACCCAAAAGACATGCGCTCTGAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGG
AATGTTGTTCANGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATGTGTGCCTCTCAGTCCATCTG
ATTCTGCCATGACTGGGCCACTCTATTCNACACCCCAGATCTCAATGGTAAACTTTACGA
ATCGAAT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9617#0      --CCGCGTCCGGAAATAGCAAGATCACTTAAATTATACTAGGTAGATAGCTGTTTTGGAC 58
consensus_9617#1      AGGCAGAATCGGACGAGGAGAGTCTACTTAAATTATACTAGGTAGACAGCTGTTT-GGAC 59
consensus_9617#2      -------------------------------------------------CTGTTTTGGAC 11
                                                                       ****** ****

consensus_9617#0      ATTGTTACTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAAT 118
consensus_9617#1      ATTGTTACTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAAT 119
consensus_9617#2      ATTGTTACTAACACACATTTCACGAAAGCGAAGTTGTAGCAAGTTAATTGAAGATAAAAT 71
                      ************************************************************

consensus_9617#0      ATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAA 178
consensus_9617#1      ATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAA 179
consensus_9617#2      ATGCATCAGCAGATATTGTTGTTTGTTATAGTGACACTGAGTTGTTTATATTTCTGTGAA 131
                      ************************************************************

consensus_9617#0      GCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATAT------------------ 220
consensus_9617#1      GCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATAT------------------ 221
consensus_9617#2      GCGCAAACAGATAAAAAACAATGTGCAAAAAATAATGAATATGTAAGTCAGAATTGTCAT 191
                      ******************************************                  

consensus_9617#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9617#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9617#2      CTTAAAACTGGTTTTACAACTTTTATACCAGCAATAATAATTTTCATTAGCTGTGTTGTG 251
                                                                                  

consensus_9617#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9617#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9617#2      ATTTAATGTTAAATTTAATGAATATGAGATTAAGTCTTATGGATTCTTTTACCATACACC 311
                                                                                  

consensus_9617#0      ---------------TGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCAGGAAGTTGCTTAAGCTTC 265
consensus_9617#1      ---------------TGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCAGGAAGTTGCTTAAGCTTC 266
consensus_9617#2      CTTTTTATTATGAAGTGTCTTACTCATCGAGATTGTTGTTCANGAAGTTGCTTAAGCTTC 371
                                     *************************** *****************

consensus_9617#0      TCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGTG 325
consensus_9617#1      TCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGTG 326
consensus_9617#2      TCATATAAATGCGTACCTGTGCCAGCAAGTGCTTCTGAAGGATTTATAAGCGTTCCAGNG 431
                      ********************************************************** *

consensus_9617#0      AAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGAT-GGTGGTGCAAGTTT 384
consensus_9617#1      AAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGATAGGTGGTGCAAGTTT 386
consensus_9617#2      AAGCCAGTTCCAATTGATACAGCAAATCGTTTCGGAGCAGATGAT-GGTGGTGCAAGTTT 490
                      ********************************************* **************

consensus_9617#0      AACCCAAAAGACATGCGCTCTAAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGGAATGTTGTTC 444
consensus_9617#1      AACCCAAAAGACATGCGCTCTGAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGGAATGNTGTTC 446
consensus_9617#2      AACCCAAAAGACATGCGCTCTGAACGGAGAATATTGTTTGACGCATATGGAATGTTGTTC 550
                      ********************* ******************************** *****

consensus_9617#0      AGGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAAT-GTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCA 503
consensus_9617#1      AGGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAATAGTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCA 506
consensus_9617#2      ANGCAATTGTTTAACTTTCTCTTATAAAT-GTGTGCCTCTCAGTCCATCTGATTCTGCCA 609
                      * *************************** ******************************

consensus_9617#0      TGACTGGGCCACTCTATTCAACACCCCAGATCTCAAT-GGTAAACTTTACGAATCGAATA 562
consensus_9617#1      TGACTGGGCCACTCTATTCAACACCCCAGATCTCAATAGGTAAACTTTACGAATCGAATA 566
consensus_9617#2      TGACTGGGCCACTCTATTCNACACCCCAGATCTCAAT-GGTAAACTTTACGAATCGAAT- 667
                      ******************* ***************** ********************* 

consensus_9617#0      GGCGATGAAACTTCATCTATTTTAACAACAACACATACTTCAG-TTCCA-AAAATGTGTG 620
consensus_9617#1      GGCGATGAAACTTCATCTATTTTAACAACAACACATACTTCAGGTTCCACAAAATGTGTG 626
consensus_9617#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9617#0      CTAAAATTGG--TGAATA-TTGTTT---AACATCTT-CGGAATGCTGC--TCCAAAAGTT 671
consensus_9617#1      CTAAAATTNGGTCGAATAATTGGTTTAAAACATCTTTCGGAATGCTGCGTCCCAAAAGTT 686
consensus_9617#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9617#0      GTTTAA-GCTTTG-CGTATAAATGCG---TCAAC---AGATATGACCTTTCAGTAGTGGC 723
consensus_9617#1      GTNTAAAGCTTTGGCGTATAAAATCGCGGTCAACCAGNATTATGACCTTTTCCAGTAAGT 746
consensus_9617#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9617#0      AGATCCAAATCTACCTGTAACATCAACTTATACTTCCAATCGTTTTGGGGG-TACAGTAG 782
consensus_9617#1      GGGCNGAAATCCA-----AAAACTAGCCTGGGAACGAATCCACCTTAGTACCTTCCCCAG 801
consensus_9617#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9617#0      ACGAAACAAGCTCAGGAACACCCAATTGCACATCGAACGGATTATATTGTGTCCACAACA 842
consensus_9617#1      ACGGTTTGGGGGGGTACACTCTCNGACGCACAACAGG----------------------- 838
consensus_9617#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9617#0      AAGATTGCTGTTCCGGAGCATGTTATAAATCTGTATGTTCAACAGAGATCCGTGTTGGTG 902
consensus_9617#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9617#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9617#0      TGCTGGAATCAGAGTTAACTCATCCGTCGGTTATTAATGGACCATATATTCAAGTACAAA 962
consensus_9617#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9617#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9617#0      AT 964
consensus_9617#1      --
consensus_9617#2      --