cluster # 11

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Apis mellifera
cluster # 11 cluster # 11 Sequences # 18 consensus # 2

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consensus_11#0 length = 1801 sequences # 17

consensus_11#1 length = 559 sequences # 1

consensusID : consensus_11#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 17
consensus length = 1801
fasta sequence

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[+] EMBL BI513797             [                                                                                                                                                                                        AAGAGATGCTGCGATTAAATCTGGCGAATTTGATCACACAAAAAATTATCCTTTCGATGTGGACAGATGGCGTGATAAGACATTTGTCACCATAGAAAGATACAATGGTGTACCTTCTTCTTTGAACGTGGTAACTAATAAAAAGGGCAAAGGTGGACCTCTTCTACGACCATATCCTGATTGGTCGTTTGCCAAATACAAAGATTGCTCTGGAATTGTGAGCGCTTTCAAAATTGCGGTCGACAAATTCGACAGATTATGGGTTCTGGACTCAGGTCTTGTCAATAATAATCAACCTATGTGCTCTCCAAAATTGTTAACCTTTGATCTGAAAACCTCAAAATTGGTTAAGCAAGTCGAGATACCACATAATATTGCCGTAAACGCCACTACAGGAATGGGAGAATTAGTATCACTAGCTGTTCAAGCTATAGATCGTACGAATACTATGGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI511972             [                                                                                                                                                                                                                                 AAAATTATCCTTTCGATGTGGACAGATGGCGTGATAAGACATTTGTCACCATAGAAAGGAACAATGGTGTACCTTCTTCTTTGAACGTGGTAACTAATAAAAAGGGCAAAGGTGGACCTCTTCTACGACCATATCCTGATTGGTCGTTTGCCAAATACGAAGATTGCTCTGGAATTGTGAGCGCTTTCAAAATTGCGGTCGACAAATTTGACAGATTATGGGTTCTGGACTCAGGTCTTGTCAATAATAATCAACCTATGTGCTCTCCAAAATTGTTAACCTTTGATCTGAAAACCTCAAAATTGGTTAAGCAAGTCGAGATACCACATAATATTGCCGTAAACGCCACCACAGGAATGGGAGAATTAGTTTCACTAGCTGTTCAAGCTATAGATCGTACGAATACTATGGTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI511830             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGGTTAAGCAAGTCGAGATACCACATAATATTGCCGTAAACGCCACTACAGGAATGGGAGAATTAGTATCACTAGCTGTTCAAGCTATAGATCGTACGAATACTATGGTGTACATAGCAGACGAAAAAGGCGAAGGTTTAATCATGTATCAAAACTCCGACGATTCCTTCCATCGATTGACTTCCAATACTTTCGATTACGATCCCAGATATACCAAATTGACAGTCGCTGGAGAAAGTTTCACAGTGAAAAATGGAATTTGTGGAATTGCACTTAGTCCCGTGACGAACAATCTTTATTACAGCCCTCTCTCTTCTCACGGTTTGTATTATGTTGATACGGAACAATTCAGGAATCCACAATATGAAGAAAATAACGTGCAATATGAAGGATCTCAAGATATTTTGAACACTCAATCATTCGGTAAAGTAGTATCGAAAAATGGCGTCCTTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGAATGAACATCAAGTACTTCAGNGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACACTTCAAATGATCGTTAGTATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI513165             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGACTTCCAATACTTTCGATTACGATCCCAGATATACCAAATTGACAGTCGCTGGAGAAAGTTTCACAGTGAAAAATGGAATTTGTGGAATTGCACTTAGTCCCGTGACGAACAATCTTTATTACAGCCCTCTCTCTTCTCACGGTTTGTATTATGTTGATACGGAACAATTCAGGAATCCACAATATGAAGAAAATAACGTGCAATATGAAGGATCTCAAGATATTTTGAACACTCAATCATTCGGTAAAGTAGTATCGAAAAATGGCGTCCTTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGAATGAACATCAAGTACTTCAGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACACTTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATGATCCTGAAGGCAATGAATATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAATAATAAACAATGATTTTAATTTCAACGACGTAAATTTCCGAATTTTGGGTGCGAATGTAGATGACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI516812             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTCGATTACGATCCCAGATATACCAAATTGACAGTCGCTGGAGAAAGTTTCACAGTGAAAAATGGAATTTGTGGAATTGCACTTAGTCCCGTGACGAACAATCTTTATTACAGCCCTCTCTCTTCTCACGGTTTGTATTATGTTGATACGGAACAATTCAGGAATCCACAATATGAAGAAAATAACGTGCAATATGAAGGATCTCAAGATATTTTGAACACTCAATCATTCGGTAAAGTAGTATCGAAAAATGGCGTCCTTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGAATGAACATCAAGTACTTCAGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACACTTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATGATCCTGANNNCAATGAATATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAATAATAAACAATGATTTTAATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI504729             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CGATTACGATCCCAGATATACCAAATTGACAGTCGCTGGAGAAAGTTTCACAGTGAAAAATGGAATTTGTGGAATTGCACTTAGTCCCGTGACGAACAATCTTTATTACAGCCCTCTCTCTTCTCACGGTTTGTATTATGTTGATACGGAACAATTCAGGAATCCACAATATGAAGAAAATAACGTNNNNNNNGAAGGATCTCAAGATATTTTGAACACTCAATCATTCGGTAAAGTAGTATCGAAAAATGGCGTCCTTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGAATGAACATCAAGTACTTCAGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACACTTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATGATCCTGAAGGCAATGAATATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI504633             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCCCAGATATACCAAATTGACAGTCGCTGGAGAAAGTTTCACAGTGAAAAATGGAATTTGTGGAATTGCACTTAGTCCCGTGACGAACAATCTTTATTACAGCCCTCTCTCTTCTCACGGTTTGTATTATGTTGATACGGAACAATTCAGGAATCCACAATATGAAGAAAATAACGTGCAATATGAAGGATCTCAAGATATTTTGAACACTCAATCATTCGGTAAAGTAGTATCGAAAAATGGCGTCCTTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGAATGAACATCAAGTACTTCAGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACACTTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATGATCCTGAAGGCAATGAATATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI511277             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAATTGACAGTCGCTGGAGAAAGTTTCACAGTGAAAAATGGAATTTGTGGAATTGCACTTAGTCCCGTGACGAACAATCTTTATTACAGCCCTCTCTCTTCTCACGGTTTGTATTATGTTGATACGGAACAATTCAGGAATCCACAATATGAAGAAAATAACGTGCAATATGAAGGATCTCAAGATATTTTGAACACTCAATCATTCGGTAAAGTAGTATCGAAAAATGGCGTCCTTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGAATGAACATCAAGTACTTCAGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGNGACACTTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATGATCCTGAAGGCAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI516561             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGGAGAAAGTTTCACAGTGAAAAATGGAATTTGTGGAATTGCACTTAGTCCCGTGACGAACAATCTTTATTACAGCCCTCTCTCTTCTCACGGTTTGTATTATGTTGATACGGAACAATTCAGGAATCCACAATATGAAGAAAATAACGTGCAATATGAAGGATCTCAAGATATTTTGAACACTCAATCATTCGGTAAAGTAGTATCGAAAAATGGCGTCCTTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGAATGAACATCAAGTACTTCAGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACACTTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATGATCCTGAAGGCAATGAATATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAATAATAAACAATGATTTTAATTTCAACGACGTAAATTTCCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI514154             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CAGAATGAAGAGACACTTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATGATCCTGAAGGCAATGAATATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAATAATAAACAATGATTTTAATTTCAACGACGTAAATTTCCGAATTTTGGGTGCGAATGTAGATGACTTAATGAGAAACACTCGTTGCGGAAGATATCACAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTAACAATCAGAATGCTGATAATCAGAATGCTAACAAACAAAATGGTAATAGACAAAATGATAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAAAATGGTAACAAACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACA                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI511740             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATAAACAATGATTTTAATTTCAACGACGTAAATTTCCGAATTTTGGGTGCGAATGTAGATGACTTAATGAGAAACACTCGTTGCGGAAGATATCACAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTAACAATCAGAATGCTGATAATCAGAATGCTAACAAACAAAATGGTAATAGACAAAATGATAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAAAATGGTAACAAACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGAGGAATGGTAACAGGCAAAATGATAATCAAAATAATCAGAATGATAATAATCGAAATGATAATCAAGTTCATCATTCTTCAAAATTACATTAAATCAATCAATTATCAATTAAAATCAATTAATTAAGATGTAAATCAAATTATTTTTTAAAATATTTTTTCG                                                                            ]
[+] EMBL BI511842             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTCCGAATTTTGGGTGCGAATGTAGATGACTTAATGAGAAACACTCGTTGCGGAAGATATCACAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTAACAATCAGAATGCTGATAATCAGAATGCTAACAAACAAAATGGTAATAGACAAAATGATAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAAAATGGTAACAAACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGAGGAATGGTAACAGGCAAAATGATAATCAAAATAATCAGAATGATAATAATCGAAATGATAATCAAGTTCATCATTCTTCAAAATTACATTAAATCAATCAATTATCAATTAAAATCAATTAATTAAGATGTAAATCAAATTATTTTTTAAAATATTTTTTCGATGTAAACAAAATTTTGTAAAATCTTTCATTATATTATAAATAAATAAAATAAATATCGTTTTCGCAAAA      ]
[+] EMBL BI513481             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTGGGTGCGAATGTAGATGACTTAATGAGAAACACTCGTTGCGGAAGATATCACAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTAACAATCAGAATGCTGATAATCAGAATGCTAACAAACAAAATGGTAATAGACAAAATGATAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAAAATGGTAACAAACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGAGGAATGGTAACAGGCAAAATGATAATCAAAATAATCAGAATGATAATAATCGAAATGATAATCAAGTTCATCATTCTTCAAAATTACATTAAATCAATCAATTATCAATTAAAATCAATTAATTAAGATGTAAATCAAATTATTTTTTAAAATATTTTTTCGATGTAAACAAAATTTTGTAAAATCTTTCATTATATTATAAATA                                 ]
[+] EMBL BI514450             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATGTAGATGACTTAATGAGAAACACTCGTTGCGGAAGATATCACAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTAACAATCAGAATGCTGATAATCAGAATGCTAACAAACAAAATGGTAATAGACAAAATGATAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAAAATGGTAACAAACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGAGGAATGGTAACAGGCAAAATGATAATCAAAATAATCAGAATGATAATAATCGAAATGATAATCAAGTTCATCATTCTTCAAAATTACATTAAATCAATCAATTATCAATTAAAATCAATTAATTAAGATGTAAATCAAATTATTTTTTAAA                                                                                       ]




>consensus_11#0
ATCTGTATTATCCTAGAAAAATGACAAAGTGGTTGTTGCTGGTGGTGTGCCTTGGTATAG
CTTGTCAAGATGTAACAAGCGCAGCTGTGAATCATCAAAGAAAATCTGCAAATAATTTGG
CACATTCTATGAAAGTGATCTACGAATGGAAACACATTGATTTTGATTTCGGTAGCGATG
AAAGAAGAGATGCTGCGATTAAATCTGGCGAATTTGATCACACAAAAAATTATCCTTTCG
ATGTGGACAGATGGCGTGATAAGACATTTGTCACCATAGAAAGGAACAATGGTGTACCTT
CTTCTTTGAACGTGGTAACTAATAAAAAGGGCAAAGGTGGACCTCTTCTACGACCATATC
CTGATTGGTCGTTTGCCAAATACGAAGATTGCTCTGGAATTGTGAGCGCTTTCAAAATTG
CGGTCGACAAATTTGACAGATTATGGGTTCTGGACTCAGGTCTTGTCAATAATAATCAAC
CTATGTGCTCTCCAAAATTGTTAACCTTTGATCTGAAAACCTCAAAATTGGTTAAGCAAG
TCGAGATACCACATAATATTGCCGTAAACGCCACCACAGGAATGGGAGAATTAGTATCAC
TAGCTGTTCAAGCTATAGATCGTACGAATACTATGGTGTACATAGCAGACGAAAAAGGCG
AAGGTTTAATCATGTATCAAAACTCCGACGATTCCTTCCATCGATTGACTTCCAATACTT
TCGATTACGATCCCAGATATACCAAATTGACAGTCGCTGGAGAAAGTTTCACAGTGAAAA
ATGGAATTTGTGGAATTGCACTTAGTCCCGTGACGAACAATCTTTATTACAGCCCTCTCT
CTTCTCACGGTTTGTATTATGTTGATACGGAACAATTCAGGAATCCACAATATGAAGAAA
ATAACGTGCAATATGAAGGATCTCAAGATATTTTGAACACTCAATCATTCGGTAAAGTAG
TATCGAAAAATGGCGTCCTTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGA
ATGAACATCAAGTACTTCAGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACAC
TTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATG
ATCCTGAAGGCAATGAATATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAATAATAAACA
ATGATTTTAATTTCAACGACGTAAATTTCCGAATTTTGGGTGCGAATGTAGATGACTTAA
TGAGAAACACTCGTTGCGGAAGATATCACAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGACA
ATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTAACAATCAGAATGCTGATAATCAGAATGCTAACA
AACAAAATGGTAATAGACAAAATGATAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACA
GACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACA
GACAAAATGGTAACAAACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACA
AGAGGAATGGTAACAGGCAAAATGATAATCAAAATAATCAGAATGATAATAATCGAAATG
ATAATCAAGTTCATCATTCTTCAAAATTACATTAAATCAATCAATTATCAATTAAAATCA
ATTAATTAAGATGTAAATCAAATTATTTTTTAAAATATTTTTTCGATGTAAACAAAATTT
TGTAAAATCTTTCATTATATTATAAATAAATAAAATAAATATCGTTTTCGCAAAAAAAAA
A

consensusID : consensus_11#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 559
fasta sequence

                              [TTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGAATGAACATCAAGTACTTCAGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACACTTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATGATCCTGAAGGCAATGAATATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAATAATAAACAATGATTTTAATTTCAACGATGTAAATTTCCGAATTTTGGGTGCGAATGTAGATGACTTAATGAGAAACACTCGTTGCGGAAGATATCACAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGTTGACAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTGATAATCAGAATGCTAACAAACAAAATGGTAATAGACAAAATGATAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAA]

[+] EMBL BI516332             [TTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGAATGAACATCAAGTACTTCAGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACACTTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATGATCCTGAAGGCAATGAATATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAATAATAAACAATGATTTTAATTTCAACGATGTAAATTTCCGAATTTTGGGTGCGAATGTAGATGACTTAATGAGAAACACTCGTTGCGGAAGATATCACAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGTTGACAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTGATAATCAGAATGCTAACAAACAAAATGGTAATAGACAAAATGATAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAA]




>consensus_11#1
TTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGAATGAACATCAAGTACTTC
AGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACACTTCAAATGATCGTTAGTA
TGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATGATCCTGAAGGCAATGAAT
ATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAATAATAAACAATGATTTTAATTTCAACG
ATGTAAATTTCCGAATTTTGGGTGCGAATGTAGATGACTTAATGAGAAACACTCGTTGCG
GAAGATATCACAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGACAATC
AGAATGTTGACAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTGATAATCAGAATGCTAACAAAC
AAAATGGTAATAGACAAAATGATAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGAC
AGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGAC
AGAATGATAACAAGCAAAA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11#0      ATCTGTATTATCCTAGAAAAATGACAAAGTGGTTGTTGCTGGTGGTGTGCCTTGGTATAG 60
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      CTTGTCAAGATGTAACAAGCGCAGCTGTGAATCATCAAAGAAAATCTGCAAATAATTTGG 120
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      CACATTCTATGAAAGTGATCTACGAATGGAAACACATTGATTTTGATTTCGGTAGCGATG 180
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      AAAGAAGAGATGCTGCGATTAAATCTGGCGAATTTGATCACACAAAAAATTATCCTTTCG 240
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      ATGTGGACAGATGGCGTGATAAGACATTTGTCACCATAGAAAGGAACAATGGTGTACCTT 300
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      CTTCTTTGAACGTGGTAACTAATAAAAAGGGCAAAGGTGGACCTCTTCTACGACCATATC 360
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      CTGATTGGTCGTTTGCCAAATACGAAGATTGCTCTGGAATTGTGAGCGCTTTCAAAATTG 420
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      CGGTCGACAAATTTGACAGATTATGGGTTCTGGACTCAGGTCTTGTCAATAATAATCAAC 480
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      CTATGTGCTCTCCAAAATTGTTAACCTTTGATCTGAAAACCTCAAAATTGGTTAAGCAAG 540
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      TCGAGATACCACATAATATTGCCGTAAACGCCACCACAGGAATGGGAGAATTAGTATCAC 600
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      TAGCTGTTCAAGCTATAGATCGTACGAATACTATGGTGTACATAGCAGACGAAAAAGGCG 660
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      AAGGTTTAATCATGTATCAAAACTCCGACGATTCCTTCCATCGATTGACTTCCAATACTT 720
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      TCGATTACGATCCCAGATATACCAAATTGACAGTCGCTGGAGAAAGTTTCACAGTGAAAA 780
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      ATGGAATTTGTGGAATTGCACTTAGTCCCGTGACGAACAATCTTTATTACAGCCCTCTCT 840
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      CTTCTCACGGTTTGTATTATGTTGATACGGAACAATTCAGGAATCCACAATATGAAGAAA 900
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      ATAACGTGCAATATGAAGGATCTCAAGATATTTTGAACACTCAATCATTCGGTAAAGTAG 960
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      TATCGAAAAATGGCGTCCTTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGA 1020
consensus_11#1      ------------------TTTTCTTGGGACTCGTGGGTAATTCAGGTATTGCCTGCGTGA 42
                                      ******************************************

consensus_11#0      ATGAACATCAAGTACTTCAGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACAC 1080
consensus_11#1      ATGAACATCAAGTACTTCAGAGAGAAAGTTTTGATGTTGTCGCTCAGAATGAAGAGACAC 102
                    ************************************************************

consensus_11#0      TTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATG 1140
consensus_11#1      TTCAAATGATCGTTAGTATGAAAATCATGGAAAATCTTCCACAATCCGGCAGAATTAATG 162
                    ************************************************************

consensus_11#0      ATCCTGAAGGCAATGAATATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAATAATAAACA 1200
consensus_11#1      ATCCTGAAGGCAATGAATATATGTTGGCTTTGAGTAACAGAATGCAAAAAATAATAAACA 222
                    ************************************************************

consensus_11#0      ATGATTTTAATTTCAACGACGTAAATTTCCGAATTTTGGGTGCGAATGTAGATGACTTAA 1260
consensus_11#1      ATGATTTTAATTTCAACGATGTAAATTTCCGAATTTTGGGTGCGAATGTAGATGACTTAA 282
                    ******************* ****************************************

consensus_11#0      TGAGAAACACTCGTTGCGGAAGATATCACAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGACA 1320
consensus_11#1      TGAGAAACACTCGTTGCGGAAGATATCACAATCAGAATGCTGGCAATCAGAATGCTGGCA 342
                    ********************************************************* **

consensus_11#0      ATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTAACAATCAGAATGCTGATAATCAGAATGCTAACA 1380
consensus_11#1      ATCAGAATGCTGACAATCAGAATGTTGACAATCAGAATGCTGACAATCAGAATGCTGATA 402
                    ************************ * **************** ************ * *

consensus_11#0      AACAAAATGGTAATAGACAAAATGATAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACA 1440
consensus_11#1      ATCAGAATGCTAACAAACAAAATGGTAATAGACAAAATGATAACAGACAGAATGATAACA 462
                    * ** **** *** * ******** *** ***** **********  ** **** *****

consensus_11#0      GACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACA 1500
consensus_11#1      AGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACA 522
                      ** **** *****  ** **** *****  ** **** *****  ** **** *****

consensus_11#0      GACAAAATGGTAACAAACAGAATGATAACAAGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACA 1560
consensus_11#1      AGCAAAATGGTAACAGACAGAATGATAACAAGCAAAA----------------------- 559
                      ************* *********************                       

consensus_11#0      AGAGGAATGGTAACAGGCAAAATGATAATCAAAATAATCAGAATGATAATAATCGAAATG 1620
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      ATAATCAAGTTCATCATTCTTCAAAATTACATTAAATCAATCAATTATCAATTAAAATCA 1680
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      ATTAATTAAGATGTAAATCAAATTATTTTTTAAAATATTTTTTCGATGTAAACAAAATTT 1740
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      TGTAAAATCTTTCATTATATTATAAATAAATAAAATAAATATCGTTTTCGCAAAAAAAAA 1800
consensus_11#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                

consensus_11#0      A 1801
consensus_11#1      -

Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr)