Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 112 cluster # 112       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_112#0 length = 744 sequences # 7  
consensusID : consensus_112#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 744
fasta sequence 
                              [TTTTTTTTTGGATCCAGTCGAAACAAGCTTTCACAATGTTGTGAATCGAAGAGGGTGATATTAAAGCAATACGAAAATTACGTTTCGATAATAAATGCACAAAACCTAAAGACCTATTGATTCTGAAGTATAAGCTTCTTCGAATGGATAGTGCCCTTCGGTGCACTATAAGTCTACCTCGTTCGTTTTTGCATTTTTTTTTAATTTCTAAATCGTCGTTCGTTTTTAAAGCAGACCAAAGTTTCGCGGAACAATGCTCTGTACAGCGATGCTTGATGTAAAAATATAAGCTTATAAAATGAGAGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAATAACAAAAGTAAGAGAAACCATTCGAAGAAGAAATGCCACGTGGTTTGTAGGACGATAGATAGACGGAGGAGAAACATCTGCGCGTGACAGGAAAGTCATATTCTTAAGATCGTTTTGATATAAATATATATATATATATCTAATTTACAATTTTTTTTTTTCCGATCCGAAGTACTAGTCTCCAAAATTTTTAAGTAAAAATTAAAATAGTCAATCTATCATCCTTCCTTTAAAATCTTTCATTCACTTGTAAATTTTACTCGGAAGNNNATAGAGGGACTAATATATTTAATTTGTACAATTATATGATATGTACAGCTGAGTAAAAAACTCAGATATAAAAGCAGCTCTTTCATTTATATTAAATTATAAATTTGCACTTAAATTTGATTTTTACGATGCACTAAAAATTATATTT]

[+] EMBL BI515365             [TTTTTTTTTGGATCCAGTCGAAACAAGCTTTCACAATGTTGTGAATCGAAGAGGGTGATATTAAAGCAATACGAAAATTACGTTTCGATAATAAATGCACAAAACCTAAAGACCTATTGATTCTGAAGTATAAGCTTCTTCGAATGGATAGTGCCCTTCGGTGCACTATAAGTCTACCTCGTTCGTTTTTGCATTTTTTTTTAATTTCTAAATCGTCGTTCGTTTTTAAAGCAGACCAAAGTTTCGCGGAACAATGCTCTGTACAGCGATGCTTGATGTAAAAATATAAGCTTATAAAATGAGAGAGAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI515627             [                                       TGTGAATCGAAGAGGGTGATATTAAAGCAATACGAAAATTACGTTTCGATAATAAATGCACAAAACCTAAAGACCTATTGATTCTGAAGTATAAGCTTCTTCGAATGGATAGTGCCCTTCGGTGCACTATAAGTCTACCTCGTTCGTTTTTGCATTTTTTTTTAATTTCTAAATCGTCGTTCGTTTTTAAAGCAGACCAAAGTTTCGCGGAACAATGCTCTGTACAGCGATGCTTGATGTAAAAATATAAGCTTATAAAATGAGAGAGAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI512404             [                                        GTGAATCGAAGAGGGTGATATTAAAGCAATACGAAAATTACGTTTCGATAATAAATGCACAAAACCTAAAGACCTATTGATTCTGAAGTATAAGCTTCTTCGAATGGATAGTGCCCTTCGGTGCACTATAAGTCTACCTCGTTCGTTTTTGCATTTTTTTTTAATTTCTAAATCGTCGTTCGTTTTTAAAGCAGACCAAAGTTTCGCGGAACAATGCTCTGTACAGCGATGCTTGATGTAAAAATATAAGCTTATAAAATGAGAGAGAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI512062             [                                                             TAAAGCAATACGAAAATTACGTTTCGATAATAAATGCACAAAACCTAAAGACCTATTGATTCTGAAGTATAAGCTTCTTCGAATGGATAGTGCCCTTCGGTGCACTATAAGTCTACCTCGTTCGTTTTTGCATTTTTTTTTAATTTCTAAATCGTCGTTCGTTTTTAAAGCAGACCAAAGTTTCGCGGAACAATGCTCTGTACAGCGATGCTTTATGTAAAAAAAa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI507732             [                                                                                        TAATAAATGCACAAAACCTAAAGACCTATTGATTCTGAAGTATAAGCTTCTTCGAATGGATAGTGCCCTTCGGTGCACTATAAGTCTACCTCGTTCGTTTTTGCATTTTTTTTTAATTTCTAAATCGTCGTTCGTTTTTAAAGCAGACCAAAGTTTCGCGGAACAATGCTCTGTACAGCGATGCTTGATGTAAAAATATAAGCTTATAAAATGAGAGAGAAAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI503982             [                                                                                                   acAAAACGAAAGACCTATTGATTCTGAAGTATAAGCTTCTTCGAATGGATAGTGCCCTTCGGTGCACTATAAGTCTACCTCGTTCGTTTTTGCATTTTTTTTTAATTTCTAAATCGTCGTTCGTTTTTAAAGCAGACCAAAGTTTCGCGGAACAATGCTCTGTACAGCGATGCTTGATGTAAAAATATAAGCTTATAAAATGAGAGAGAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI510407             [                                                                                                             AGACCTATTGATTCTGAAGTATAAGCTTCTTCGAATGGATAGTGCCCTTCGGTGCACTATAAGTCTACCTCGTTCGTTTTTGCATTTTTTTTTAATTTCTAAATCGTCGTTCGTTTTTAAAGCAGACCAAAGTTTCGCGGAACAATGCTCTGTACAGCGATGCTTGATGTAAAAATATAAGCTTATAAAATGAGAGAGAAAAAAAAGAAAAAAAAATAACAAAAGTAAGAGAAACCATTCGAAGAAGAAATGCCACGTGGTTTGTAGGACGATAGATAGACGGAGGAGAAACATCTGCGCGTGACAGGAAAGTCATATTCTTAAGATCGTTTTGATATAAATATATATATATATATCTAATTTACAATTTTTTTTTTTCCGATCCGAAGTACTAGTCTCCAAAATTTTTAAGTAAAAATTAAAATAGTCAATCTATCATCCTTCCTTTAAAATCTTTCATTCACTTGTAAATTTTACTCGGAAGNNNATAGAGGGACTAATATATTTAATTTGTACAATTATATGATATGTACAGCTGAGTAAAAAACTCAGATATAAAAGCAGCTCTTTCATTTATATTAAATTATAAATTTGCACTTAAATTTGATTTTTACGATGCACTAAAAATTATATTT]




>consensus_112#0
TTTTTTTTTGGATCCAGTCGAAACAAGCTTTCACAATGTTGTGAATCGAAGAGGGTGATA
TTAAAGCAATACGAAAATTACGTTTCGATAATAAATGCACAAAACCTAAAGACCTATTGA
TTCTGAAGTATAAGCTTCTTCGAATGGATAGTGCCCTTCGGTGCACTATAAGTCTACCTC
GTTCGTTTTTGCATTTTTTTTTAATTTCTAAATCGTCGTTCGTTTTTAAAGCAGACCAAA
GTTTCGCGGAACAATGCTCTGTACAGCGATGCTTGATGTAAAAATATAAGCTTATAAAAT
GAGAGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAATAACAAAAGTAAGAGAAACCATTCGAAGAAGAAAT
GCCACGTGGTTTGTAGGACGATAGATAGACGGAGGAGAAACATCTGCGCGTGACAGGAAA
GTCATATTCTTAAGATCGTTTTGATATAAATATATATATATATATCTAATTTACAATTTT
TTTTTTTCCGATCCGAAGTACTAGTCTCCAAAATTTTTAAGTAAAAATTAAAATAGTCAA
TCTATCATCCTTCCTTTAAAATCTTTCATTCACTTGTAAATTTTACTCGGAAGNNNATAG
AGGGACTAATATATTTAATTTGTACAATTATATGATATGTACAGCTGAGTAAAAAACTCA
GATATAAAAGCAGCTCTTTCATTTATATTAAATTATAAATTTGCACTTAAATTTGATTTT
TACGATGCACTAAAAATTATATTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)