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Apis mellifera
cluster # 1195 cluster # 1195       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1195#0 length = 1048 sequences # 3  
consensusID : consensus_1195#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1048
fasta sequence 
                              [TTTTTTTTTTTTTTAGAGATTCACAACTTTATTTTTCGTCAGTTCTAAAGAGTCTATCTTTTCTATTCGAATATTAGTTCTATTCGAATGGCAGTACAACACTTATAATTAAAGTTACTTTTATTTATAAAAATATATATAATGGATAAATAAATATATAACTTATGTACCTTGTTTTTAATGATTCGGCGGATGGACGAGGAGAGGTTATGCTATCTTTGGAGGTTGTTTGCGGCGCTTTCGAGGAATCAGCTTGTCGCCATACGCCTTTTTTCGGAACTGGAGCTTTTCCAATTGCCATTCCTGATATTTTCTTTTCTTCTTCAAATTTTCTATTATCCTCAATTTCCTGTTTTGAAAGTACTCCAGTTGGCATTCGACTTTCATATTTAAGTATTGTCTCGTCCAATTTTTTTATAACAATTGTTAATGAATTTAATACATCTCTATCTTTTTCGCTATTTATTAAATGCGTCACCGCCGATTCTAATATAGTTAACAATTTTTTATCAGCCGGTATCCGGAGGAGACTTTTTAATTGAGGCATCAAATTAACTACTTTCATTCTTATGTTAGCTATATTATCTTCAGCCAAACTTAATAAAGTAGTATAAAAATGTTCCTTGAAGTAAGCAGAGGAGAAAATTTCTAAAGCTTTCATCATTATACGAACAAACATCATTCTCGAGTAAGAATTCGCATTATTGGCCAATTCTGAACATAATTTAGTACGAAGTTCTACTCTTTGCGCAGG-TTTATATTATAACGT-AAAATATAAGATATAGATTTCCCGATGAGAGACGAATAGGTATTGCCCTAGCATGTAATATTCTGAAAAAAGCCATTGGCACAAAATATGAATATATAAAATCACTTGGAAAATATTTAGGCAATACTTCAAACTGTGAATGTATTAAAGATACTAATCTCCAATTATGTGTACCTGCTATTTCCGATTCACATTTCAATAAAGCTCTANNTATTTCCATAACAATGGAATCCATTTTATCTATGCCGATAACGTGACTTTCAAGCAAACATTCAAGAA]

[+] EMBL BQ103811             [TTTTTTTTTTTTTTAGAGATTCACAACTTTATTTTTCGTCAGTTCTAAAGAGTCTATCTTTTCTATTCGAATATTAGTTCTATTCGAATGGCAGTACAACACTTATAATTAAAGTTACTTTTATTTATAAAAATATATATAATGGATAAATAAATATATAACTTATGTACCTTGTTTTTAATGATTCGGCGGATGGACGAGGAGAGGTTATGCTATCTTTGGAGGTTGTTTGCGGCGCTTTCGAGGAATCAGCTTGTCGCCATACGCCTTTTTTCGGAACTGGAGCTTTTCCAATTGCCATTCCTGATATTTTCTTTTCTTCTTCAAATTTTCTATTATCCTCAATTTCCTGTTTTGAAAGTACTCCAGTTGGCATTCGACTTTCATATTTAAGTATTGTCTCGTCCAATTTTTTTATAACAATTGTTAATGAATTTAATACATCTCTATCTTTTTCGCTATTTATTAAATGCGTCACCGTTGATTCTAATATAGTTAACAATTTTTTATCAGCCGGTATCCGGAGGAGACTTTTTAATTGAGGCATCAAATTAACTACTTTCATTCTTATGTTAGCTATATTATCTTCAGCCAAACTTAATAAAGTAGTATAAAAATGTTCCTTGAAGTAAGCAGAGGAGAAAATTTCTAAAGCTTTCATCATTATACGAACAAACATCATTCTCGAGTAAGAATTCGCATTATTGGCCAATTCTGAACATAATTTAGTACGAAGTTCTACTCTTTGCGCAGG TTTATATTATAACGT AAAATATAAGATATAGATTTCCCGATGAGAGACGAATAGGTATTGCCCTAGCAT                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BQ103810             [               GAGATTCACAACTTTATTTTTCGTCAGTTCTAAAGAGTCTATCTTTTCTATTCGAATATTAGTTCTATTCGAATGTTAGTACAACACTTATAATTAAAGTTACTTTTATTTATAAAAATATATATAATGGATAAATAAATATATAACTTATGTACCTTGTTTTTAATGATTCGGCGGATGGACGAGGAGAGGTTATGCTATCTTTGGAGGTTGTTTGCGGCGCTTTCGAGGAATCAGCTTGTCGCCATACGCCTTTTTTCGGAACTGGAGCTTTTCCAATTGCCATTCCTGATATTTTCTTTTCTTCTTCAAATTTTCTATTATCCTCAATTTCCTGTTTTGAAAGTACTCCAGTTGGCATTCGACTTTCATATTTAAGTATTGTCTCGTCCAATTTTTTTATAACAATTGTTAATGAATTTAATACATCTCTATCTTTTTCGCTATTTATTAAATGCGTCACCGCCGATTCTAATATAGTTAACAATTTTTTATCAGCCGGTATCCGGAGGAGACTTTTTAATTGAGGCATCAAATTAACTACTTTCATTCTTATGTTAGCTATATTATCTTCAGCCAAACTTAATAAAGTAGTATAAAAATGTTCCTTGAAGTAAGCAGAGGAGAAAATTTCTAAAGCTTTCATCATTATACGAACAAACATCATTCTCGAGTAAGAATTCGCATTATTGGCCAATTCTGAACATAATTTAGTACGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL BI516028             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAAAATTTCTAAAGCTTTCATCATTATACGAACAAACATCATTCTCGAGTAAGAATTCGCATTATTGGCCAATTCTGAACATAATTTAGTACGAAGTTCTACTCTTTGCGCAGGTTTTATATTATAACGTAAAAATATAAGATATAGATTTCCCGATGAGAGACGAATAGGTATTGCCCTAGCATGTAATATTCTGAAAAAAGCCATTGGCACAAAATATGAATATATAAAATCACTTGGAAAATATTTAGGCAATACTTCAAACTGTGAATGTATTAAAGATACTAATCTCCAATTATGTGTACCTGCTATTTCCGATTCACATTTCAATAAAGCTCTANNTATTTCCATAACAATGGAATCCATTTTATCTATGCCGATAACGTGACTTTCAAGCAAACATTCAAGAA]




>consensus_1195#0
TTTTTTTTTTTTTTAGAGATTCACAACTTTATTTTTCGTCAGTTCTAAAGAGTCTATCTT
TTCTATTCGAATATTAGTTCTATTCGAATGGCAGTACAACACTTATAATTAAAGTTACTT
TTATTTATAAAAATATATATAATGGATAAATAAATATATAACTTATGTACCTTGTTTTTA
ATGATTCGGCGGATGGACGAGGAGAGGTTATGCTATCTTTGGAGGTTGTTTGCGGCGCTT
TCGAGGAATCAGCTTGTCGCCATACGCCTTTTTTCGGAACTGGAGCTTTTCCAATTGCCA
TTCCTGATATTTTCTTTTCTTCTTCAAATTTTCTATTATCCTCAATTTCCTGTTTTGAAA
GTACTCCAGTTGGCATTCGACTTTCATATTTAAGTATTGTCTCGTCCAATTTTTTTATAA
CAATTGTTAATGAATTTAATACATCTCTATCTTTTTCGCTATTTATTAAATGCGTCACCG
CCGATTCTAATATAGTTAACAATTTTTTATCAGCCGGTATCCGGAGGAGACTTTTTAATT
GAGGCATCAAATTAACTACTTTCATTCTTATGTTAGCTATATTATCTTCAGCCAAACTTA
ATAAAGTAGTATAAAAATGTTCCTTGAAGTAAGCAGAGGAGAAAATTTCTAAAGCTTTCA
TCATTATACGAACAAACATCATTCTCGAGTAAGAATTCGCATTATTGGCCAATTCTGAAC
ATAATTTAGTACGAAGTTCTACTCTTTGCGCAGGTTTATATTATAACGTAAAATATAAGA
TATAGATTTCCCGATGAGAGACGAATAGGTATTGCCCTAGCATGTAATATTCTGAAAAAA
GCCATTGGCACAAAATATGAATATATAAAATCACTTGGAAAATATTTAGGCAATACTTCA
AACTGTGAATGTATTAAAGATACTAATCTCCAATTATGTGTACCTGCTATTTCCGATTCA
CATTTCAATAAAGCTCTANNTATTTCCATAACAATGGAATCCATTTTATCTATGCCGATA
ACGTGACTTTCAAGCAAACATTCAAGAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)