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Apis mellifera
cluster # 1203 cluster # 1203       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1203#0 length = 708 sequences # 3  
consensusID : consensus_1203#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 708
fasta sequence 
                              [ATTTATTTATTAATTTTTTATTTATTCATTATATTAATTAATTCAATACTAATCAAAACTAAAATCAATAAAGAAACATTGAAAATTAAATTAAAAAAATGAAATTGATTTTGATAATAAATTTATTTGAAATATTTGATCCATCAACTAGAAATAATTTATCAATAAATTGATTATTTATAATATTACCAATTATTATTTTTCCAAGAATTTTTTGATTAATTCAATCACGAATTATATTTATTATAAAAACACTAATAAATTTTATATATAATGAATTTAAAGTTGTTTCAAAATCTAAATATCAATCTAATATTATTATTTTTATTAGATTAATACTTTATATTATAATTACTAACATTTTTAGATTAATTCCTTATGTTTTTACATTAACAAGACATCTAATTTTAAATATAATTTTATCATTAACATTATGATTTAGATTTCTAATTTATTTAATTTATAATAATTATATTATATTCCTTAGTCATTTAGTTCCATTAAATTCACCAGTATTTTTAATAAACTTTATAGTAATTATTGAACTTATTAGATTAA-TATTCGACC-TGGACATTATCAATTCGATTATCAGCAAATTAAATCTGTGGACATTTAATTTTAACATTATTAGGAATTTTTATTAGAAACTTTATTTCAATTTACCAATTAATTTAATAATTCAAAATATCTTTTAACTTTAGAAATTTT]

[+] EMBL BE844346             [ATTTATTTATTAATTTTTTATTTATTCATTATATTAATTAATTCAATACTAATCAAAACTAAAATCAATAAAGAAACATTAAAAATTAAATTAAAAAAATGAAATTGATTTTGATAATAAATTTATTTGAAATATTTGATCCATCAACTAGAAATAATTTATCAATAAATTGATTATTTATAATATTACCAATTATTATTTTTCCAAGAATTTTTTGATTAATTCAATCACGAATTATATTTATTATAAAAACACTAATAAAATTTATATATAATGAATTTAAAGTTGTTTCAAAATCTAAATATCAATCTAATATTATTATTTTTATTAGATTAATACTTTATATTATAATTACTAACATTTTTAGATTAATTCCTTATGTTTTTACATTAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BE844683             [     TTTATTAATTTTTTATTTATTCATTATATTAATTAATTCAATACTAATCAAAACTAAAATCAATAAAGAAACATTGAAAATTAAATTAAAAAAATGAAATTGATTTTGATAATAAATTTATTTGAAATATTTGATCCATCAACTAGAAATAATTTATCAATAAATTGATTATTTATAATATTACCAATTATTATTTTTCCAAGAATTTTTTGATTAATTCAATCACGAATTATATTTATTATAAAAACACTAATAAATTTTATATATAATGAATTTAAAGTTGTTTCAAAATCTAAATATCAATCTAATATTATTATTTTTATTAGATTAATACTTTATATTATAATTACTAACATTTTTAGATTAATTCCTTATGTTTTTACATTAACAAGACATCTACTTTTAAATATAATTTTATCATTAACATTATGATTTAGATTTCTAATTTATTTAATTTATAATAATTATATTATATTCCTTAGTCATTTAGTTCCATTAAATTCACCAGTATTTTTAATAAACTTTATAGTAATTATTGAACTTATTAGATTAATTATTCGACCTTGAACATTATCAATTCGATTATCAGCAAATTTAATTTCTGGACATTTAATTTTAACATTATTAGGAATTTTTATTAGAAACTTTATTTCAATTTACCAATTAATTTAATAATTCAAAATATCTTTTAACTTTAGAAATTTT]
[+] EMBL BI946527             [         TTAATTTTTTATTTATTCATTATATTAATTAATTCAATACTAATCAAAACTAAAATCAATAAAGAAACATTGAAAATTAAATTAAAAAAATGAAATTGATTTTGATAATAAATTTATTTGAAATATTTGATCCATCAACTAGAAATAATTTATCAATAAATTGATTATTTATAATATTACCAATTATTATTTTTCCAAGAATTTTTTGATTAATTCAATCACGAATTATATTTATTATAAAAACACTAATAAATTTTATATATAATGAATTTAAAGTTATTTCAAAATCTAAATATCAATCTAATATTATTATTTTTATTAGATTAATACTTTATATTATAATTACTAACATTTTTAGATTAATTCCTTATGTTTTTACATTAACAAGACATCTAATTTTAAATATAATTTTATCATTAACATTATGATTTAGATTTCTAATTTATTTAATTTATAATAATTATATTATATTCCTTAGTCATTTAGTTCCATTAAATTCACCAGTATTTTTAATAAACTTTATAGTAATTATTG ACTTATTAGATTAA TATTCGACC T GACATTATCAATTCGATTATCAGCAAATTAATTCTG                                                                                                       ]




>consensus_1203#0
ATTTATTTATTAATTTTTTATTTATTCATTATATTAATTAATTCAATACTAATCAAAACT
AAAATCAATAAAGAAACATTGAAAATTAAATTAAAAAAATGAAATTGATTTTGATAATAA
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ATCTGTGGACATTTAATTTTAACATTATTAGGAATTTTTATTAGAAACTTTATTTCAATT
TACCAATTAATTTAATAATTCAAAATATCTTTTAACTTTAGAAATTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)