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Apis mellifera
cluster # 127 cluster # 127       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_127#0 length = 747 sequences # 7  
consensusID : consensus_127#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 747
fasta sequence 
                              [AGGTTCGGCTTGTATTTCAAAATTCAAGTCGAAAAGTTGGTGGGTTGGCTGTATTGATATGAAAGCAAATGAACAAGCTGATGCAAATATAATTGTAAAGTCAGACAATAATTGGCAAGAACAGGAAGCTGATATTTTGCAACAAGTTACAAATATTTTAAAAGGAAATAAATTAGATGCAATTATATGTGTGGCTGGTGGATGGGCTGGTGAAAATGCAGCTCATAAGGATTTTGTAAAAAATAGTGAACTTATGTGGAAGCAAAGTGTATGGAGTTCAGTTATTGCTGCTAGCATTGCTGCACATCATTTAAAAGAAGGAGGATTTTTATCATTAACTGGTGCTAAAGCTGCACTTGCAGGAACACCAGGAATGATTGGATATGGAATGGCCAAAGCTGCTGTTCATCAACTTACTAAATCTTTAGCAACTAAAGATAGTGGTTTTCCTAAAGATTCTCTTGTTGTTTCTATCTTACCTGTCACTTTAGATACACCTATGAATAGAAAATGGATGCCTAATGCTGATACATCTAAATGGACCTCACTTGAATTTGTTGCAGATCTCTTTTGGAAATGGTCACAAAATCAAGAACGTCCAACAAATGGAAGTCTTCTGCAATTAATTACCAATAATAACAAAACAGAAATAATTATAGCTTAAAAAGAAAATTGTATATTTAAAAAAGTTATATTTTTTGGACCAAAAACATTTAAGCTTTTTCTCTCTATGACAATATATATACA]

[+] EMBL BI512510             [AGGTTCGGCTTGTATTTCAAAATTCAAGTCGAAAAGTTGGTGGGTTGGCTGTATTGATATGAAAGCAAATGAACAAGCTGATGCAAATATAATTGTAAAGTCAGACAATAATTGGCAAGAACAGGAAGCTGATATTTTGCAACAAGTTACAAATATTTTAAAAGGAAATAAATTAGATGCAATTATATGTGTGGCTGGTGGATGGGCTGGTGGAAATGCAGCTCATAAGGATTTTGTAAAAAATAGTGAACTTATGTGGAAGCAAAGTGTATGGAGTTCAGTTATTGCTGCTAGCATTGCTGCACATCATTTAAAAGAAGGAGGATTTTTATCATTAACTGGTGCTAAAGCTGCACTTGCAGGAACACCAGGAATGATTGGATATGGAATGGCCAAAGCTGCTGTTCATCAACTTACTAAATCTTTAGCAACTAAAGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI504386             [AGGTTCGGCTTGTATTTCAAAATTCAAGTCGAAAAGTTGGTGGGTTGGCTGTATTGATATGAAAGCAAATGAACAAGCTGATGCAAATATAATTGTAAAGTCAGACAATAATTGGCAAGAACAGGAAGCTGATATTTTGCAACAAGTTACAAATATTTTAAAAGGAAATAAATTAGATGCAATTATATGTGTGGCTGGTGGATGGGCTGGTGAAAATGCAGCTCATAAGGATTTTGTAAAAAATAGTGAACTTATGTGGAAGCAAAGTGTATGGAGTTCAGTTATTGCTGCTAGCATTGCTGCACATCATTTAAAAGAAGGAGGATTTTTATCATTAACTGGTGCTAAAGCTGCACTTGCAGGAACACCAGGAATGATTGGATATGGAATGGCCAAAGCTGCTGTTCATCAACTTACTAAATCTTTAGCAACTAAAGATAGTGGTTTTCCTAAAGATTCTCTTGTTGTTTCTATCTTACCTGTCACTTTAGATACACCTATGAATAGAAAATGGATGCCTAATGCTGATACATCTAAATGGACCTCACTTGAATTTGTTGCAGATCTCTTTTGGAAATGGTCA                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI504946             [AGGTTCGGCTTGTATTTCAAAATTCAAGTCGAAAAGTTGGTGGGTTGGCTGTATTGATATGAAAGCAAATGAACAAGCTGATGCAAATATAATTGTAAAGTCAGACAATAATTGGCAAGAACAGGAAGCTGATATTTTGCAACAAGTTACAAATATTTTAAAAGGAAATAAATTAGATGCAATTATATGTGTGGCTGGTGGATGGGCTGGTGAAAATGCAGCTCATAAGGATTTTGTAAAAAATAGTGAACTTATGTGGAAGCAAAGTGTATGGAGTTCAGTTATTGCTGCTAGCATTGCTGCACATCATTTAAAAGAAGGAGGATTTTTATCATTAACTGGTGCTAAAGCTGCACTTGCAGGAACACCAGGAATGATTGGATATGGAATGGCCAAAGCTGCTGTTCATCAACTTACTAAATCTTTAGCAACTAAAGATAGTGGTTTTCCTAAAGATTCTCTTGTTGTTTCTATCTTACCTGTCACTTTAGATACACCTATGAATAGAAAATGGATGCCTAATGCTGATACATCTAAATGGACCTCACTTGAATTTGTTGCAGATCTCTTTTGGAAATGG                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI508913             [AGGTTCGGCTTGTATTTCAAAATTCAAGTCGAAAAGTTGGTGGGTTGGCTGTATTGATATGAAAGCAAATGAACAAGCTGATGCAAATATAATTGTAAAGTCAGACAATAATTGGCAAGAACAGGAAGCTGATATTTTGCAACAAGTTACAAATATTTTAAAAGGAAATAAATTAGATGCAATTATATGTGTGGCTGGTGGATGGGCTGGTGGAAATGCAGCTCATAAGGATTTTGTAAAAAATAGTGAACTTATGTGGAAGCAAAGTGTATGGAGTTCAGTTATTGCTGCTAGCATTGCTGCACATCATTTAAAAGAAGGAGGATTTTTATCATTAACTGGTGCTAAAGCTGCACTTGCAGGAACACCAGGAATGATT GATATGGAATGGCCAAAGCTGCTGTTCATCAACTTACTAAATCTTTAGCAACTAAAGATAGTGGTTTTCCTAAAGATTCTCTTGTTGTTTCTATCTTACCTGTCACTTTAGATACACCTATGAATAGAAAATGGATGCCTAATGCTGATACATCTAAATGGACCTCACTTGAATTTGTTGCAGATCTCTTTTGGAAAT                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI514504             [                                            TTGGCTGTATTGATATGAAAGCAAATGAACAAGCTGATGCAAATATAATTGTAAAGTCAGACAATAATTGGCAAGAACAGGAAGCTGATATTTTGCAACAAGTTACAAATATTTTAAAAGGAAATAAATTAGATGCAATTATATGTGTGGCTGGTGGATGGGCTGGTGAAAATGCAGCTCATAAGGATTTTGTAAAAAATAGTGAACTTATGTGGAAGCAAAGTGTATGGAGTTCAGTTATTGCTGCTAGCATTGCTGCACATCATTTAAAAGAAGGAGGATTTTTATCATTAACTGGTGCTAAAGCTGCACTTGCAGGAACACCAGGAATGATTGGATATGGAATGGCCAAAGCTGCTGTTCATCAACTTACTAAATCTTTAGCAACTAAAGATAGTGGTTTTCCTAAAGATTCTCTTGTTGTTTCTATCTTACCTGTCACTTTAGATACACCTATGAATAGAAAATGGATGCCTAATGCTGATACATCTAAATGGACCTCACTTGAATTTGTTGCAGATCTCTTTTGGAA                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI504388             [                                                CTGTATTGATATGAAAGCAAATGAACAAGCTGATGCAAATATAATTGTAAAGTCAGACAATAATTGGCAAGAACAGGAAGCTGATATTTTGCAACAAGTTACAAATATTTTAAAAGGAAATAAATTAGATGCAATTATATGTGTGGCTGGTGGATGGGCTGGTGGAAATGCAGCTCATAAGGATTTTGTAAAAAATAGTGAACTTATGTGGAAGCAAAGTGTATGGAGTTCAGTTATTGCTGCTAGCATTGCTGCACATCATTTAAAAGAAGGAGGATTTTTATCATTAACTGGTGCTAAAGCTGCACTTGCAGGATCACCAGGAATGATTGGATATGGAATGGCCAAAGCTGCTGTTCATCAACTTACTAAATCTTTAGCAACTAAAGATAGTGGTTTTCCTAAAGATTCTCTTGTTGTTTCTATCTTACCTGTCACTTTAGATACACCTATGAATAGAAAATGGATGCCTAATGCTGATACATCTAAATGGACCTCACTTGAATTTGTTGCAGATCTCTTTTGGAAA                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI510255             [                                                               AGCAAATGAACAAGCTGATGCAAATATAATTGTAAAGTCAGACAATAATTGGCAAGAACAGGAAGCTGATATTTTGCAACAAGTTACAAATATTTTAAAAGGAAATAAATTAGATGCAATTATATGTGTGGCTGGTGGATGGGCTGGTGAAAATGCAGCTCATAAGGATTTTGTAAAAAATAGTGAACTTATGTGGAAGCAAAGTGTATGGAGTTCAGTTATTGCTGCTAGCATTGCTGCACATCATTTAAAAGAAGGAGGATTTTTATCATTAACTGGTGCTAAAGCTGCACTTGCAGGAACACCAGGAATGATTGGATATGGAATGGCCAAAGCTGCTGTTCATCAACTTACTAAATCTTTAGCAACTAAAGATAGTGGTTTTCCTAAAGATTCTCTTGTTGTTTCTATCTTACCTGTCACTTTAGATACACCTATGAATAGAAAATGGATGCCTAATGCTGATACATCTAAATGGACCTCACTTGAATTTGTTGCAGATCTCTTTTGGAAATGGTCACAAAATCAAGAACGTCCAACAAATGGAAGTCTTCTGCAATTAATTACCAATAATAACAAAACAGAAATAATTATAGCTTAAAAAGAAAATTGTATATTTAAAAAAGTTATATTTTTTGGACCAAAAACATTTAAGCTTTTTCTCTCTATGACAATATATATACA]




>consensus_127#0
AGGTTCGGCTTGTATTTCAAAATTCAAGTCGAAAAGTTGGTGGGTTGGCTGTATTGATAT
GAAAGCAAATGAACAAGCTGATGCAAATATAATTGTAAAGTCAGACAATAATTGGCAAGA
ACAGGAAGCTGATATTTTGCAACAAGTTACAAATATTTTAAAAGGAAATAAATTAGATGC
AATTATATGTGTGGCTGGTGGATGGGCTGGTGAAAATGCAGCTCATAAGGATTTTGTAAA
AAATAGTGAACTTATGTGGAAGCAAAGTGTATGGAGTTCAGTTATTGCTGCTAGCATTGC
TGCACATCATTTAAAAGAAGGAGGATTTTTATCATTAACTGGTGCTAAAGCTGCACTTGC
AGGAACACCAGGAATGATTGGATATGGAATGGCCAAAGCTGCTGTTCATCAACTTACTAA
ATCTTTAGCAACTAAAGATAGTGGTTTTCCTAAAGATTCTCTTGTTGTTTCTATCTTACC
TGTCACTTTAGATACACCTATGAATAGAAAATGGATGCCTAATGCTGATACATCTAAATG
GACCTCACTTGAATTTGTTGCAGATCTCTTTTGGAAATGGTCACAAAATCAAGAACGTCC
AACAAATGGAAGTCTTCTGCAATTAATTACCAATAATAACAAAACAGAAATAATTATAGC
TTAAAAAGAAAATTGTATATTTAAAAAAGTTATATTTTTTGGACCAAAAACATTTAAGCT
TTTTCTCTCTATGACAATATATATACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)