Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1312 cluster # 1312       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1312#0 length = 276 sequences # 2  
consensusID : consensus_1312#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 276
fasta sequence 
                              [TTTTTTTTTTAATTTTAATAATATAATTAAAATTTTAATATTAAAAAAGTTTCTATTATTTCATGAGTAATTATTTAAATTTTATATTATTGTAATATTTTTAGGTATAATAATAATGCCAATAACTACAGAAGGTATTACATNNNTTAAATGTTTTGCATCACAACCTGGACATGAAAAAACTGATTTATTATGTTCTCAATTTGATGGAANNNCTCGATTTCAAGGACATTGTCCTTCATCTACACTTTGTAGAAAAAGAACAATTTATTCCAA]

[+] EMBL BI507815             [TTTTTTTTTTAATTTTAATAATATAATTAAAATTTTAATATTAAAAAAGTTTCTATTATTTCATGAGTAATTATTTAAATTTTATATTATTGTAATATTTTTAGGTATAATAATAATGCCAATAACTACAGAAGGTATTACATGTTTTAAATGTTTTGCATCACAACCTGGACATGAAAAAACTGATTTATTATGTTCTCAATTTGATGGAANNNCTCGATTTCAAGGACATTGTCCTTCATCTACACTTTGTAGAAAAAGAACAATTTATTCCAA]
[+] EMBL BI507342             [  TTTTTTTTAATTTTAATAATATAATTAAAATTTTAATATTAAAAAAGTTTCTATTATTTCATGAGTAATTATTTAAATTTTATATTATT TAATATTTTTAGGTATAATAATAATGCCAATAACTACAGAAGGTATTACATNNNTTAAATGTTTTGCATCACAACCTGGACATGAAAAAACTGATTTATTATGTTCTCAATTTGATGGAAGTTCTCGATTTCAAGTACATTGTCCTTCATCTACACTTTGTAGAAAAAGAACAATTTATTCCAA]




>consensus_1312#0
TTTTTTTTTTAATTTTAATAATATAATTAAAATTTTAATATTAAAAAAGTTTCTATTATT
TCATGAGTAATTATTTAAATTTTATATTATTGTAATATTTTTAGGTATAATAATAATGCC
AATAACTACAGAAGGTATTACATNNNTTAAATGTTTTGCATCACAACCTGGACATGAAAA
AACTGATTTATTATGTTCTCAATTTGATGGAANNNCTCGATTTCAAGGACATTGTCCTTC
ATCTACACTTTGTAGAAAAAGAACAATTTATTCCAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)