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Apis mellifera
cluster # 146 cluster # 146       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_146#0 length = 871 sequences # 6  
consensusID : consensus_146#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 871
fasta sequence 
                              [TTTTTTTTATAATTTAAAAAGTAATAATTTTTCTGCTGATAATTCCGTTCATATTAAATTCTTTATTGTATCATGAATAATAATTTTATTTCTTTAATATCTGGAAAATATAAGGATTAAAGAAAAGTCCTCAAGGAATTCAAAGATGCATAGTATTACCTTGAATCACATATTTGTGTAAAGGCAGAACATTTATGAAATTAATTTATATCAGAAATTTTAATTTTGATGAAACATTATGCTTTTTTAATTTTGTTATACCTTTTTTGTTATACCTTTAAAAATCCTATGTAATATACAACATTATACACGTACATAAACACACATACGCAAGTACACAACAGTAACATATAAAACATTTCACCAAGTGCGTTCTGTATTCAATTTCATTATAATCTCCCGTTTGTATCTTATCTCCACTGAAAAAGCCTTAAAACGCGTGCGCGTTATACAACGTCGACACCACTTTTGTTGAAATATAAATGAAATCACAGGGAAATAGGGATGAGGGATTAAAAAAGGAATCAAGTCACAACAGTGATCGGTGCATTATATTTTCCTTCACCCAGGGGTGCGTGCCAGTCTCGCAAGATGAGCAACTAAAACCGGAAAAACTGGTGTGATTTTGTGCGATTCGTACGATAATGTTACTTAAATATTAAGAACAGACACCGAAGAGTGGAAACACATGCGTGTCGGTGATTCAGTCATAATATATATGTAATATATATTATATATACATATATATAAATATATATACGTGTATATATATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA]

[+] EMBL BI507628             [TTTTTTTTATAATTTAAAAAGTAATAATTTTTCTGCTGATAATTCCGTTCATATTAAATTCTTTATTGTATCATGAATAATAATTTTATTTCTTTAATATCTGGAAAATATAAGGATTAAAGAAAAGTCCTCAAGGAATTCAAAGATGCATAGTATTACCTTGAATCACATATTTGTGTAAAGGCAGAACATTTATGAAATTAATTTATATCAGAAATTTTAATTTTGATGAAACATTATGCTTTTTTAATTTTGTTATACCTTTTTTGTTATACCTTTAAAAATCCTATGTAATATACAACATTATACACGTACATAAACACACATACGCAAATACACAACAGTAACATATAAAACATTTCACCAAGTGCGTTCTGTATTCAATTTCATTATAATCTCCCGTTTGTATCTTATCTCCACTGAAAAAGCCTTAAAACGCGTGCGCGTTATACAACGTCGACACCACTTTTGTTGAAATATAAATGAAATCACAGGGAAATAGGGATGAGGGATTAAAAAAGGAATCAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI505460             [ TTTTTTTATAATTTAAAAAGTAATAATTTTTCTGCTGATAATTCCGTTCATATTAAATTCTTTATTGTATCATGAATAATAATTTTATTTCTTTAATATCTGGAAAATATAAGGATTAAAGAAAAGTCCTCAAGGAATTCAAAGATGCATAGTATTACCTTGAATCACATATTTGTGTAAAGGCAGAACATTTATGAAATTAATTTATATCAGAAATTTTAATTTTGATGAAACATTATGCTTTTTTAATTTTGTTATACCTTTTTTGTTATACCTTTAAAAATCCTATGTAATATACAACATTATACACGTACATAAACACACATACGCAAGTACACAACAGTAACATATAAAACATTTCACCAAGTGCGTTCTGTATTCAATTTCATTATAATCTCCCGTTTGTATCTTATCTCCACTGAAAAAGCCTTAAAACGCGTGCGCGTTATACAACGTCGACACCACTTTTGTTGAAATATAAATGAAATCACAGGGAAATAGGGATGAGGGATTAAAAAAGGAATCAAGTCACAACAGTGATCGGTGCATTATATTTTCCTTCACCCAGGGGTGCGTGCCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL BI507259             [                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTATACCTTTTTTGTTATACCTTTAAAAATCCTATGTAATATACAACATTATACACGTACATAAACACACATACGCAAGTACACAACAGTAACATATAAAACATTTCACCAAGTGCGTTCTGTATTCAATTTCATTATAATCTCCCGTTTGTATCTTATCTCCACTGAAAAAGCCTTAAAACGCGTGCGCGTTATACAACGTCGACACCACTTTTGTTGAAATATAAATGAAATCACAGGGAAATAGGGATGAGGGATTAAAAAAGGAATCAAGTCACAACAGTGATCGGTGCATTATATTTTCCTTCACCCAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI505496             [                                                                                                                                                                                                                                                                  TACCTTTTTTGTTATACCTTTAAAAATCCTATGTAATATACAACATTATACACGTACATAAACACACATACGCAAGTACACAACAGTAACATATAAAACATTTCACCAAGTGCGTTCTGTATTCAATTTCATTATAATCTCCCGTTTGTATCTTATCTCCACTGAAAAAGCCTTAAAACGCGTGCGCGTTATACAACGTCGACACCACTTTTGTTGAAATATAAATGAAATCACAGGGAAATAGGGATGAGGGATTAAAAAAGGAATCAAGTCACAACAGTGATCGGTGCATTATATTTTCCTTCACCCAGGGGTGCGTGCCAGTCTCGCAAGATGAGCAACTAAAACCGGAAAAACTGGTGTGATTTTGTGCGATTCGTACGATAATGTTACTTAAATATTAAGAACAGACACCGAAGAGTGGAAACACATGCGTGTCGGTGATTCAGTCATAATATATATGTAATATATATTATATATACATATATATAAATATATATACGTGTAT                                                                                                         ]
[+] EMBL BI508295             [                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTTTATACCTTTAAAAATCCTATGTAATATACAACATTATACACGTACATAAACACACATACGCAAATACACAACAGTAACATATAAAACATTTCACCAAGTGCGTTCTGTATTCAATTTCATTATAATCTCCCGTTTGTATCTTATCTCCACTGAAAAAGCCTTAAAACGCGTGCGCGTTATACAACGTCGACACCACTTTTGTTGAAATATAAATGAAATCACAGGGAAATAGGGATGAGGGATTAAAAAAGGAATCAAGTCACAACAGTGATCGGTGCATTATATTTTCCTTCACCCAGGGGTGCGTGCCAGTCTCGCAAGATGAGCAACTAAAACCGGAAAAACTGGTGTGATTTTGTGCGATTCGTACGATAATGTTACTTAAATATTAAGAACAGACACCGAAGAGTGG                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI509132             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCGTACGATAATGTTACTTAAATATTAAGAACAGACACCGAAGAGTGGAAACACATGCGTGTCGGTGATTCAGTCATAATATATATGTAATATATATTATATATACATATATATAAATATATATACGTGTATATATATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA]




>consensus_146#0
TTTTTTTTATAATTTAAAAAGTAATAATTTTTCTGCTGATAATTCCGTTCATATTAAATT
CTTTATTGTATCATGAATAATAATTTTATTTCTTTAATATCTGGAAAATATAAGGATTAA
AGAAAAGTCCTCAAGGAATTCAAAGATGCATAGTATTACCTTGAATCACATATTTGTGTA
AAGGCAGAACATTTATGAAATTAATTTATATCAGAAATTTTAATTTTGATGAAACATTAT
GCTTTTTTAATTTTGTTATACCTTTTTTGTTATACCTTTAAAAATCCTATGTAATATACA
ACATTATACACGTACATAAACACACATACGCAAGTACACAACAGTAACATATAAAACATT
TCACCAAGTGCGTTCTGTATTCAATTTCATTATAATCTCCCGTTTGTATCTTATCTCCAC
TGAAAAAGCCTTAAAACGCGTGCGCGTTATACAACGTCGACACCACTTTTGTTGAAATAT
AAATGAAATCACAGGGAAATAGGGATGAGGGATTAAAAAAGGAATCAAGTCACAACAGTG
ATCGGTGCATTATATTTTCCTTCACCCAGGGGTGCGTGCCAGTCTCGCAAGATGAGCAAC
TAAAACCGGAAAAACTGGTGTGATTTTGTGCGATTCGTACGATAATGTTACTTAAATATT
AAGAACAGACACCGAAGAGTGGAAACACATGCGTGTCGGTGATTCAGTCATAATATATAT
GTAATATATATTATATATACATATATATAAATATATATACGTGTATATATATATATATAT
ATATATATATATGTATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)