cluster # 1704

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1704 cluster # 1704 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1704#0 length = 824 sequences # 2

consensusID : consensus_1704#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 824
fasta sequence

                              [CGTATAATACACACGAGAAGCAAAAAGTCGTGCCGATTTACGATAATTAACACGATAAATGGAGAGTGAATAGGGCGGGAGGGAGGGCAGCGAACGAATGAACACTAATTTCCAAGATGAAAAGGAGAGGGCGAGAAATATTTTGTTACGTATAATAATGTGTATACTAGCCATAACGCGCCCGTCAAGCAAATCCCCTTAAATAACATTTTTTATTGGCATGTGTTTATCTTCGAAGTCATCGAAAAAAATGTATTCAACACGCGAGGACGCCATTTTATCCGTTTAGTTTTTCACGCGATCGCAGCGCCAAGAGTTTTAGCAAATCTATTATAGAAGGATTATTCGATGCTTTTAAACGCTAAATTTAGCGGAAAATTTGGTTTAATTCTATATTTAAAGTATGTATACACTTAAAAATATACGTAATTTTGTATTTATATTATATAATATCAAATAATTAATATTAATCTTGCATCAATTTGTGCAATGCTATTAATATATTTTAAAAATATATTCCTGTATTAAAATTGTTGACGCAGAATATCTGCGAAAGAAAAAAAAAATAAATTTAAAAAAAATAATAATTCTATGATCTACATTGGTCATTCGATCGCAGGATTAATATTAATAATTTAATAATGTTAATATATATTGTAATAACATATTGATTTATTATTACGTCTGGAATGTATAAAATCAACTCATTTAATCTCTTCAGGTACAAGTGTTGACATTGATCACAATAGCCATCAAGTGCATATGTACAGATTTATATATATATATTAATTAAGAATTTTTAATTTCTTAATTATAATCATAAA]

[+] EMBL BI511953             [CGTATAATACACACGAGAAGCAAAAAGTCGTGCCGATTTACGATAATTAACACGATAAATGGAGAGTGAATAGGGCGGGAGGGAGGGCAGCGAACGAATGAACACTAATTTCCAAGATGAAAAGGAGAGGGCGAGAAATATTTTGTTACGTATAATAATGTGTATACTAGCCATAACGCGCCCGTCAAGCAAATCCCCTTAAATAACATTTTTTATTGGCATGTGTTTATCTTCGAAGTCATCGAAAAAAATGTATTCAACACGCGAGGACGCCATTTTATCCGTTTAGTTTTTCACGCGATCGCAGCGCCAAGAGTTTTAGCAAATCTATTATAGAAGGATTATTCGATGCTTTTAAACGCTAAATTTAGCGGAAAATTTGATTTAATTCTATATTTAAAGTATATATACACTTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI512657             [                                                                                                                                                                                                                                 TTTATCTTCGAAGTCATCGAAAAAAATGTATTCAACACGCGAGGACGCCATTTTATCCGTTTAGTTTTTCACGCGATCGCAGCGCCAAGAGTTTTAGCAAATCTATTATAGAAGGATTATTCGATGCTTTTAAACGCTAAATTTAGCGGAAAATTTGGTTTAATTCTATATTTAAAATATGTATACACTTAAAAATATACGTAATTTTGTATTTATATTATATAATATCAAATAATTAATATTAATCTTGCATCAATTTGTGCAATGCTATTAATATATTTTAAAAATATATTCCTGTATTAAAATTGTTGACGCAGAATATCTGCGAAAGAAAAAAAAAATAAATTTAAAAAAAATAATAATTCTATGATCTACATTGGTCATTCGATCGCAGGATTAATATTAATAATTTAATAATGTTAATATATATTGTAATAACATATTGATTTATTATTACGTCTGGAATGTATAAAATCAACTCATTTAATCTCTTCAGGTACAAGTGTTGACATTGATCACAATAGCCATCAAGTGCATATGTACAGATTTATATATATATATTAATTAAGAATTTTTAATTTCTTAATTATAATCATAAA]




>consensus_1704#0
CGTATAATACACACGAGAAGCAAAAAGTCGTGCCGATTTACGATAATTAACACGATAAAT
GGAGAGTGAATAGGGCGGGAGGGAGGGCAGCGAACGAATGAACACTAATTTCCAAGATGA
AAAGGAGAGGGCGAGAAATATTTTGTTACGTATAATAATGTGTATACTAGCCATAACGCG
CCCGTCAAGCAAATCCCCTTAAATAACATTTTTTATTGGCATGTGTTTATCTTCGAAGTC
ATCGAAAAAAATGTATTCAACACGCGAGGACGCCATTTTATCCGTTTAGTTTTTCACGCG
ATCGCAGCGCCAAGAGTTTTAGCAAATCTATTATAGAAGGATTATTCGATGCTTTTAAAC
GCTAAATTTAGCGGAAAATTTGGTTTAATTCTATATTTAAAGTATGTATACACTTAAAAA
TATACGTAATTTTGTATTTATATTATATAATATCAAATAATTAATATTAATCTTGCATCA
ATTTGTGCAATGCTATTAATATATTTTAAAAATATATTCCTGTATTAAAATTGTTGACGC
AGAATATCTGCGAAAGAAAAAAAAAATAAATTTAAAAAAAATAATAATTCTATGATCTAC
ATTGGTCATTCGATCGCAGGATTAATATTAATAATTTAATAATGTTAATATATATTGTAA
TAACATATTGATTTATTATTACGTCTGGAATGTATAAAATCAACTCATTTAATCTCTTCA
GGTACAAGTGTTGACATTGATCACAATAGCCATCAAGTGCATATGTACAGATTTATATAT
ATATATTAATTAAGAATTTTTAATTTCTTAATTATAATCATAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case

Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr)