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Apis mellifera
cluster # 178 cluster # 178       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_178#0 length = 1054 sequences # 6  
consensusID : consensus_178#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1054
fasta sequence 
                              [TTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCCCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGAAATTT--ATCTTATCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATATT-TATATCA-TTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAAACTT-AATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGACC-AAATTTCATTATTTCCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTCGATCCTATAGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCAT-CCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCT-GGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTCTAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAGGTTTTATTATACTATTTACTATTGGTGGATTAACAGGAATTATATTATCAAATTCTTCTATTGATATTATTCTTCATGATACATATTACGTTGTTGGACATTTTCATTATGTTCTTTCAATA-GGTGCAGTATTTGCAATTATTTCAAGATTTATTCATTGATATCCATTAATTACTGGATTATTATTAAATATTAAAT-GATTAAAAATTCAATTTATTATAAT-ATTTATTGGAGTAAATCTAACTTTCTTTCCTCAACATTTTTTAGGACTAAT]

[+] EMBL BE844451             [TTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCCCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGAAATTT  ATTTTATCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATATT TATATCA TTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAAACTT AATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGACC AAATTTCATTATTTCCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTCGATCCTATAGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCTGGGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL BE844453             [                                                                                           ATTAAGAAATTTTATTCTTATCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATATTCTATATCATTTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAAACTTAAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGACCAAAATTTCATTATTTCCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTCGATCCTATAGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCAT CCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCT GGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTCTAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL BE844371             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTCGATCCTATAGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCAT CCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCT GGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTCTAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAGGTTTTATTATACTATTTACTATTGGTGGATTAACAGGAATTATATTATCAAATTCTTCTATTGATATTATTCTTCATGATACATATTACGTTGTTGGACATTTTCATTATGTTCTTTCAATA GGTGCAGTATTTGCAATTATTTCAAGATTTATTCATTGATATCCATTAATTACTGGATTATTATTAAATATTAAAT GATTAAAAATTCAATTTATTATAAT ATTTATTGGAGTAAATCTAACTTTCTTTCC                     ]
[+] EMBL BI946525             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCAT CCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCT GGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTCTAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAGGTTTTATTATACTATTTACTATTGGTGGATTAACAGGAATTATATTATCAAATTCTTCTATTGATATTATTCTTCATGATACATATTACGTTGGTGGACATTTTCATTATGGTCTTTCAATAGGGTGCAGTATTTGCAATTATTTCAAGATTTATTCATTGATATCCATTAATTACTGGATTATTATTAAATATTAAATGGATTAAAAATTCAATTTATTATAATAATTTAATTGAGTAAATCTAAC TTCTTTCt                     ]
[+] EMBL BE844357             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTCTAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAGGTTTTATTATACTATTTACTATTGGTGGATTAACAGGAATTATATTATCAAATTCTTCTATTGATATTATTCTTCATGATACATATTACGTTGTTGGACATTTTCATTATGTTCTTTCAATA GGTGCAGTATTTGCAATTATTTCAAGATTTATTCATTGATATCCATTAATTACTGGATTATTATTAAATATTAAAT GATTAAAAATTCAATTTATTATAAT ATTTATTGGAGTAAATCTAACTTTCTT                        ]
[-] EMBL BE844455             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAGGTTTTATTATACTATTTACTATTGGTGGATTAACAGGAATTATATTATCAAATTCTTCTATTGATATTATTCTTCATGATACATATTACGTTGTTGGACATTTTCATTATGTTCTTTCAATA GGTGCAGTATTTGCAATTATTTCAAGATTTATTCATTGATATCCATTAATTACTGGATTATTATTAAATATTAAAT GATTAAAAATTCAATTTATTATAAT ATTTATTGGAGTAAATCTAACTTTCTTTCCTCAACATTTTTTAGGACTAAT]




>consensus_178#0
TTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCCCGAATAAATAATATTAGATTTT
GATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGAAATTTATCTTATCCAAGACCAG
GAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATATTTATATCATTCTTCACCTTCAG
TAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAA
ACTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGACCAAATTTCAT
TATTTCCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAG
CTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTCGATCCTA
TAGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCAGAAG
TTTATATTTTAATTTTACCTGGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAG
GAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTC
TAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAG
CATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGAT
GATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAG
GTTTTATTATACTATTTACTATTGGTGGATTAACAGGAATTATATTATCAAATTCTTCTA
TTGATATTATTCTTCATGATACATATTACGTTGTTGGACATTTTCATTATGTTCTTTCAA
TAGGTGCAGTATTTGCAATTATTTCAAGATTTATTCATTGATATCCATTAATTACTGGAT
TATTATTAAATATTAAATGATTAAAAATTCAATTTATTATAATATTTATTGGAGTAAATC
TAACTTTCTTTCCTCAACATTTTTTAGGACTAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)