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Apis mellifera
cluster # 2009 cluster # 2009       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2009#0 length = 645 sequences # 2  
consensusID : consensus_2009#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 645
fasta sequence 
                              [TATAAAATATATGTCATCGATTGCTCGGCGTCGATAAATCTGCTACAATATGTGCAATTTGTATATCTAGNATGCGCGAAATTGGATTTGGCCCGGTTTGATTTTTTTTTTCTTTGTCTTCTTCTTCTTGTTTGTAAGTTGTTTCTTTGTTTTCGTTTAATGATGCACAGTTATGAGACGATCGATCGATCGTAGTCAAAGAGAGNNNTATATCGTGTATTCGAGATCTAGAAGATCGAAACATCGTGTGAAACNNNGGTGCTATGCTGTGGTACAGTGCTTTTTGAACTGTGTTATGTTGATTTGATTCTATTACTTTGTTTTTTAATAGCGATAATCTTAGAATTTATATTATTTTCTGAGAATAGGTAAGAAAAAAAAATGGATGTAAAATTTATAAATTTAAAAAACAAAGTTTTCAAAAAACTTTTATAAAAAATTATATTATTAAGTAATTAGCAATCAGGTAAATTTAAACATGAATAAATTTCAAAATTTTATAAATTGTATATATATATTGATATTTTCTTTCGCAAATTTCTGTGGGGAAAAAAATAAAAATTCTTAAGTTTGTATTAAAAAAAATATCACTAGCATCAAAAAGCTTCGAAAAACACCGTACATAGAAACATGTGTATGTATATG]

[-] EMBL BI504368             [TATAAAATATATGTCATCGATTGCTCGGCGTCGATAAATCTGCTACAATATGTGCAATTTGTATATCTAGAATGCGCGAAATTGGATTTGGCCCGGTTTGATTTTTTTTTTCTTTGTCTTCTTCTTCTTGTTTGTAAGTTGTTTCTTTGTTTTCGTTTAATGATGCACAGTTATGAGACGATCGATCGATCGTAGTCAAAGAGAGNNNTATATCGTGTATTCGAGATCTAGAAGATCGAAACATCGTGTGAAACNNNGGTGCTATGCTGTGGTACAGTGCTTTTTGAACTGTGTTATGTTGATTTGATTCTATTACTTTGTTTTTTAATAGCGATAATCTTAGAATTTATATTATTTTCTGAGAATAGGTAAGAAAAAAAAATGGATGTAAAATTTATAAATTTAAAAAACAAAGTTTTCAAAAAACTTTTATAAAAAATTATATTATTAAGTAATTAGCAATCAGGTAAATTTAAACATGAATAAATTTCAAAATTTTATAAATTGTATATATATATTGATATTTTCTTTCGCAAATTTCTGTGGGGAAAAAAATAAAAATTCTTAAGTTTGTATTAAAAAAAATATCACTAGCATCAAAAAGCTTCGAAAAACACCGTACATAGAAACATGTGTATGTATATG]
[+] EMBL BI510034             [                        TCGGCGTCGATAAATCTGCTACAATATGTGCAATTTGTATATCTAGNATGCGCGAAATTGGATTTGGCCCAGTTTGATTTTTTTTTTCTTTGTCTTCTTCTTCTTGTTTGTAAGTTGTTTCTTTGTTTTCGTTTAATGATGCACAGTTATGAGACGATCGATCGATCGTAGTCAAAGAGAGAGATATATCGTGTATTCGAGATCTAGAAGATCGAAACATCGTGTGAAACAGCGGTGCTATGCTGTGGTACAGTGCTTTTTGAACTGTGTTATGTTGATTTGATTCTATTACTTTGTTTTTTAATAGCGATAATCTTAGAATTTATATTATTTTCTGAGAATAGGTAAGAAAAAAAAATGGATGTAAAATTTATAAATTTAAAAAACAAAGTTTTCAAAAAACTTTTATAAAAAATTATATTATTAAGTAATTAGCAATCAGGTAAATTTAAACATGAATAAATTTCAAAATTTTATAAATTGTATATATATATTGATATTTTCTTTCGCAAATTTCTGTGGGGAAAAAAATAAAAATTCTTAAGTTTGTATTAAAAAAAATATCACTAGCATCAAAAAGCTTCG                                    ]




>consensus_2009#0
TATAAAATATATGTCATCGATTGCTCGGCGTCGATAAATCTGCTACAATATGTGCAATTT
GTATATCTAGNATGCGCGAAATTGGATTTGGCCCGGTTTGATTTTTTTTTTCTTTGTCTT
CTTCTTCTTGTTTGTAAGTTGTTTCTTTGTTTTCGTTTAATGATGCACAGTTATGAGACG
ATCGATCGATCGTAGTCAAAGAGAGNNNTATATCGTGTATTCGAGATCTAGAAGATCGAA
ACATCGTGTGAAACNNNGGTGCTATGCTGTGGTACAGTGCTTTTTGAACTGTGTTATGTT
GATTTGATTCTATTACTTTGTTTTTTAATAGCGATAATCTTAGAATTTATATTATTTTCT
GAGAATAGGTAAGAAAAAAAAATGGATGTAAAATTTATAAATTTAAAAAACAAAGTTTTC
AAAAAACTTTTATAAAAAATTATATTATTAAGTAATTAGCAATCAGGTAAATTTAAACAT
GAATAAATTTCAAAATTTTATAAATTGTATATATATATTGATATTTTCTTTCGCAAATTT
CTGTGGGGAAAAAAATAAAAATTCTTAAGTTTGTATTAAAAAAAATATCACTAGCATCAA
AAAGCTTCGAAAAACACCGTACATAGAAACATGTGTATGTATATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)