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Apis mellifera
cluster # 202 cluster # 202       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_202#0 length = 1123 sequences # 6  
consensusID : consensus_202#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1123
fasta sequence 
                              [GCAACCCATTCTCGAACCAGCTTCTCACTTCGATGCGCAATCTTTTCCCCTTGAACATATCGTCCAAACTTCATCAACTGGATTCTAGAAATAAAAGATGAAAGAGAGAAATGAAAAATAATTCCTGTTA---CGTCGTTGAAGTTTCTCAA-TTTTTTTTTAAAACAAAGATATA-AAAAAAATAAATAATTGTTCAAATTAAATGGTCCAA-GGAATAATAATTTATGAAAAATGCCACGAGATTATTTTTTCAAATGCGAGATAATAGATTTGTGACGATGGAAAATGTGATGCATAATCGATTCGACGATGAGAATTTCGGCTTGTTCGAGATGTGTAAAGAGGATGAAAAGGGTGTCTGTCGTGGAACGATGCATAAACTCGATATCAGGAAGTATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGTGGAGAATGGTTAAGGCAAGAGATAATGAATATTCGTGTGACGTTGTCATTCGACATTGAAAATCGCATTTTTTAAACGAGGCTTACCATCGAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGTTCAACACTGTTCGATTACACTGATTACACTCAACATTTTATTGGATACACAAGTTCTTTCTTGATCTTAAAATTCTCTTCAAAAACTGTCGCTAAAGTTTCTTCTCAATTGTTGAAAATTTTGAACGTATCATCAGTTTTTCCAAGAAAACTGCGTTCACTTCCTTTTTATGATGGCTTTCCTCTCTCTCTATGATAAAGAGAAATAAGATCCAGAGAAAAAGAGTCAGTAGATATAGAGCTTAATAGATTTTTAGAAGATATTGCTATAGATTCTTTTTTAAATATAATTATAATATTTAATTCAAAATATATAATTTAAAAAGGAGAAAAAAAATTAAGAAGTTAGTAAATTCTTTATTAAAATTACGTGTGTGATATGTTAGAGTATGTTTCATAAAAATTAATAATATAGACAATATAGATTAAAAAGTATGAAAAGTATTAAGTAGTAACGAGCTAATAAAATTAACACAATAATATAAATATTTTAAGAAAATTGCTTATAGATTATTAGATAC]

[+] EMBL BI511040             [GCAACCCATTCTCGAACCAGCTTCTCACTTCGATGCGCAATCTTTTCCCCTTGAACATATCGTCCAAACTTCATCAACTGGATTCTAGAAATAAAAGATGAAAGAGAGAAATGAAAAATAATTCCTGTTATATCGTCGTTAAAGTTTCTCAATTTTTTTTTTACAACAAAGTTATA TAAAAAATAAATAATTGTTCAAATTAAATGGTCCAA GGAATAATAATTTATGAAAAATGCCACGAGATTATTTTTTCAAATGCGAGATAATAGATTTGTGACGATGGAAAATGTGATGCATAATCGATTCGACGATGAGAATTTCGGCTTGTTCGAGATGTGTAAAGAGGATGAAAAGGGTGTCTGTCGTGGAACGATGCATAAACTCGATATCAGGAAGTATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGTGGAGAATGGTTAANNCAAGAGATAATGAATATTCGTGTGACGTTGTCATTCGACATTGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI508268             [                                                              TCCAAACTTCATCAACTGGATTCTAGAAATAAAAGATGAAAGAGAGAAATGAAAAATAATTCCTGTTA     TCGTTGAAGTTTCTCAA TTTTTTTTTAAAACAAAAATATAGAAAAAAATAAATAATTGTTCAAATTAAATGGTCCAAGGGAATAATAATTTATGAAAAATGCCACGAGATTATTTTTTCAAATGCCAGATAATAGATTTGTGACAATGGAAAATGTGATGCATAATCGATTCGATGATGAGAATTTCGGCTTGTTCGAGATGTGTAAAGA GATTGAAAGGGTGTCTGTCGTGGAACGATGCATAAACTCGATATCAGGAAGTATTGAA    AGAGAGAGAGAGAGGGAATGGAGAATGGTTAAGGCAAGAGATAATGAATATTCGTGTGACGTTGTCATTCGACATTGAAAATCGCATTTTTTAAACGAGGCTTACCATCAAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGATCAACACTGTCCGATTACAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI505424             [                                                                                                                                                                                                                                                  AGATTATTTTTTCAAATGCGAGATAATAGATTTGTGACGATGGAAAATGTGATGCATAATCGATTCGACGATGAGAATTTCGGCTTGTTCGAGATGTGTAAAGAGGATGAAAAGGGTGTCTGTCTTGGAACGATGCATAAACTCGATATCAGGAAGTATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGTGGAGAATGGTTAAGGCAAGAGATAATGAATATTCGTGTGACGTTGTCATTCGACATTGAAAATCGCATTTTTTAAACGAGGCTTACCATCGAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGTTCAACACTGTTCGATTACACTGATTACACTCAACATTTTATTGGATACACAAGTTCTTTCTTGATCTTAAAATTCTCTTCAAAAACTGTCGCTAAAGTTTCTTCTCAATTGTTGAAAATTTTGAACGTATCATCAGTTTTTCCAAGAAAACTGCGTTCACTTCCTTTTTATGATGGCTTTCCTCTCTCTCTATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI510261             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTGACGATGGAAAATGTGATGCATAATCGATTCGACGATGAGAATTTCGGCTTGTTCGAGATGTGTAAAGAGGATGAAAAGGGTGTCTGTCGTGGAACGATGCATAAACTCGATATCAGGAAGTATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGTGGAGAATGGTTAAGGCAAGAGATAATGAATATTCGTGTGACGTTGTCATTCGACATTGAAAATCGCATTTTTTAAACGAGGCTTACCATCGAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGTTCAACACTGTTCGATTACACTGATTACACTCAACATTTTATTGGATACACAAGTTCTTTCTTGATCTTAAAATTCTCTTCAAAAACTGTCGCTAAAGTTTCTTCTCAATTGTTGAAAATTTTGAACGTATCATCAGTTTTTCCAAGAAAACTGCGTTCACTTCCTTTTTATGATGGCTTTCCTCTCTCTCTATGATAAAGAGAAATAAGATCCAGAGAAAAAGAGTCAGTAGATATAGAGCTTAATAGATTTTTAGAAGATATTGCTATAGATTCTTTTTTAAATATAATTATAATATTTAATTCAAAA                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI505041             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTTTAAACGAGGCTTACCATCGAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGTTCAACACTGTTCGATTACACTGATTACACTCAACATTTTATTGGATACACAAGTTCTTTCTTGATCTTAAAATTCTCTTCAAAAACTGTCGCTAAAGTTTCTTCTCAATTGTTGAAAATTTTGAACGTATCATCAGTTTTTCCAAGAAAACTGCGTTCACTTCCTTTTTATGATGGCTTTCCTCTCTCTCTATGATAAAGAGAAATAAGATCCAGAGAAAAAGAGTCAGTAGATATAGAGCTTAATAGATTTTTAGAAGATATTGCTATAGATTCTTTTTTAAATATAATTATAATATTTAATTCAAAATATATAATTTAAAAAGGAGAAAAAAAATTAAGAAGTTAGTAAATTCTTTATTAAAATTACGTGTGTGATATGTTAGAGTATGTTTCATAAAAATTAATAATATAGACAATATAGATTAAAAAGTATGAAAAGTATTAAGTAGTAACGAGCTAATAAAATTAACACAATAATATAAATATTTTAAGAAAATTGCTTATAGATTATTAGATAC]
[+] EMBL BI515935             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTTTAAACGAGGCTTACCATCGAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGTTCAACACTGTTCGATTACACTGATTACACTCAACATTTTATTGGATACACAAGTTCTTTCTTGATCTTAAAATTCTCTTCAAAAACTGTCGCTAAAGTTTCTTCTCAATTGTTGAAAATTTTGAACGTATCATCAGTTTTTCCAAGAAAACTGCGTTCACTTCCTTTTTATGATGGCTTTCCTCTCTCTCTATGATAAAGAGAAATAAGATCCAGAGAAAAAGAGTCAGTAGATATAGAGCTTAATAGATTTTTAGAAGATATTGCTATAGATTCTTTTTTAAATATAATTATAATATTTAATTCAAAATATATAATTTAAAAAGGAGAAAAAAAATTAAGAAGTTAGTAAAT                                                                                                                                                                       ]




>consensus_202#0
GCAACCCATTCTCGAACCAGCTTCTCACTTCGATGCGCAATCTTTTCCCCTTGAACATAT
CGTCCAAACTTCATCAACTGGATTCTAGAAATAAAAGATGAAAGAGAGAAATGAAAAATA
ATTCCTGTTACGTCGTTGAAGTTTCTCAATTTTTTTTTAAAACAAAGATATAAAAAAAAT
AAATAATTGTTCAAATTAAATGGTCCAAGGAATAATAATTTATGAAAAATGCCACGAGAT
TATTTTTTCAAATGCGAGATAATAGATTTGTGACGATGGAAAATGTGATGCATAATCGAT
TCGACGATGAGAATTTCGGCTTGTTCGAGATGTGTAAAGAGGATGAAAAGGGTGTCTGTC
GTGGAACGATGCATAAACTCGATATCAGGAAGTATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGA
GTGGAGAATGGTTAAGGCAAGAGATAATGAATATTCGTGTGACGTTGTCATTCGACATTG
AAAATCGCATTTTTTAAACGAGGCTTACCATCGAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATG
TATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAAT
TGTTCAACACTGTTCGATTACACTGATTACACTCAACATTTTATTGGATACACAAGTTCT
TTCTTGATCTTAAAATTCTCTTCAAAAACTGTCGCTAAAGTTTCTTCTCAATTGTTGAAA
ATTTTGAACGTATCATCAGTTTTTCCAAGAAAACTGCGTTCACTTCCTTTTTATGATGGC
TTTCCTCTCTCTCTATGATAAAGAGAAATAAGATCCAGAGAAAAAGAGTCAGTAGATATA
GAGCTTAATAGATTTTTAGAAGATATTGCTATAGATTCTTTTTTAAATATAATTATAATA
TTTAATTCAAAATATATAATTTAAAAAGGAGAAAAAAAATTAAGAAGTTAGTAAATTCTT
TATTAAAATTACGTGTGTGATATGTTAGAGTATGTTTCATAAAAATTAATAATATAGACA
ATATAGATTAAAAAGTATGAAAAGTATTAAGTAGTAACGAGCTAATAAAATTAACACAAT
AATATAAATATTTTAAGAAAATTGCTTATAGATTATTAGATAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)