Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 207 cluster # 207       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_207#0 length = 722 sequences # 6  
consensusID : consensus_207#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 722
fasta sequence 
                              [TAAAACACGAAAAACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACATTACATATTCATTATAAGTTTTAAAACCAAATATTTAAATTAAAATGCCGGCCGTACCAGGCATGTATCAACAAGCTCCTTCATGCTGGGATAGGGTAAAACTTGGTTTTATGATTGGATTTTGTGTCGGAATGGCATCTGGTGTTCTATTTGGGGGATATTCTATTGTTAGATATGGATTAAGAGGAAGGGAATTGATAAACAACGTTGGAAAAGCAATGCTTCAAGGTGGTGGAACATTTGGAACATTCATGGCCATTGGAAGTGGAATAAGATGCTAGTAATTGAAGAGTGTTACGTTTCACATTTAGGATACAAAAAATTGTAGTATC-AAAAAAATATTCTATTAATTTCTTAATAAAATATTTCTACGGAGCAAGGGCATACCTTCCATTGCAACTACAGTGGTATCATCCATAGGATTTGTTTTTCCTGGAATATTTAGTCCAAAACTTAAGTGGCGAATCTTGTGAGTCATATTAAATTGTGTTGATGTGTATGGTTGGACATCATGTACTGTAAGCAAAATGAAAAATATTATAATATTACAATAATTTAATTTATCTTTTTCTGGCAATAGTAATATATTTGTTTACCATGTACATGATTTACAGAGAAGCTATCTCCTGGTGCAATATGAAAACTTCNACCTACTCTATTTACTTCCATAACCATAAA]

[+] EMBL BI515947             [TAAAACACGAAAAACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACATTACATATTCATTATAAGTTTTAAAACCAAATATTTAAATTAAAATGCCGGCCGTACCAGGCATGTATCAACAAGCTCCTTCATGCTGGGATAGGGTAAAACTTGGTTTTATGATTGGATTTTGTGTCGGAATGGCATCTGNNNTTCTATTTGGGGGATATTCTATTGTTAGATATGGATTAAGAGGAAGGGAATTGATAAACAACGTTGGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI506108             [                                                                             TTTAAATTAAAATGCCGGCCGTACCAGGCATGTATCAACAAGCTCCTTCATGCTGGGATAGGGTAAAACTTGGTTTTATGATTGGATTTTGTGTCGGAATGGCATCTGGTGTTCTATTTGGGGGATATTCTATTGTTAGATATGGATTAAGAGGAAGGGAATTGATAAACAACGTTGGAAAAGCAATGCTTCAAGGTGGTGGAACATTTGGAACATTCATGGCCATTGGAAGTGGAATAAGATGCTAGTAATTGAAGAGTGTTACGTTTCACATTTAGGATACAAAAAATTGTAGTATC AAAAAAATATTCTATTAATTTCTTAATAAAATATTTCTACGGAGCAAGGGCATACCTTCCATTGCAACTACAGTGGTATCATCCATAGGATTTGTTTTTCCTGGAATATTTAGTCCAAAACTTAAGTGGCGAATCTTGTGAGTCATATTAAATTGTGTTGATGTGTATGGTTGGACATCATGTACTGTAAGCAAAATGAAAAATATTATAATATTACAATAATTTAATTTATCTTTTTCTGGCAATAGTAATATATTTGTTTACCATGTACATGATTTACAGAGAAGCTATCTCCTGG                                                ]
[+] EMBL BI506977             [                                                                                                            GTATCAACAAGCTCCTTCATGCTGGGATAGGGTAAAACTTGGTTTTATGATTGGATTTTGTGTCGGAATGGCATCTGGTGTTCTATTTGGGGGATATTCTATTGTTAGATATGGATTAAGAGGAAGGGAATTGATAAACAACGTTGGAAAAGCAATGCTTCAAGGTGGTGGAACATTTGGAACATTCATGGCCATTGGAAGTGGAATAAGATGCTAGTAATTGAAGAGTGTTACGTTTCACATTTAGGATACAAAAAATTGTAGTATC AAAAAAATATTCTATTAATTTCTTAATAAAATATTTCTACGGAGCAAGGGCATACCTTCCATTGCAACTACAGTGGTATCATCCATAGGATTTGTTTTTCCTGGAATATTTAGTCCAAAACTTAAGTGGCGAATCTTGTGAGTCATATTAAATTGTGTTGATGTGTATGGTTGGACATCATGTACTGTAAGCAAAATGAAAAATATTATAATATTACAATAATTTAATTTATCTTTTTCTGGCAATAGTAATATATTTGTTTACCATGTACATGATTTACAGAGAAGCTATCTCCTGGTGCAATATGAAAACTTCNACCTACTCTATTTACTTCCATAACCATAAA]
[+] EMBL BI508620             [                                                                                                            GTATCAACAAGCTCCTTCATGCTGGGATAGGGTAAAACTTGGTTTTATGATTGGATTTTGTGTCGGAATGGCATCTGGTGTTCTATTTGGGGGATATTCTATTGTTAGATATGGATTAAGAGGAAGGGAATTGATAAACAACGTTGGAAAAGCAATGCTTCAAGGTGGTGGAACATTTGGAACATTCATGGCCATTGGAAGTGGAATAAGATGCNNGTAATTGAAGAGTGTTACGTTTCACATTTAGGATACAAAAAATTGTAGTATC AAAAAAATATTCTATTAATTTCTTAATAAAATATTTCTACGGAGCAAGGGCATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI513692             [                                                                                                               TCAACAAGCTCCTTCATGCTGGGATAGGGTAAAACTTGGTTTTATGATTGGATTTTGTGTCGGAATGGCATCTGGTGTTCTATTTGGGGGATATTCTATTGTTAGATATGGATTAAGAGGAAGGGAATTGATAAACAACGTTGGAAAAGCAATGCTTCAAGGTGGTGGAACATTTGGAACATTCATGGCCATTGGAAGTGGAATAAGATGCTAGTAATTGAAGAGTGTTACGTTTCACATTTAGGATACAAAAAATTGTAGTATC AAAAAAATATTCTATTAATTTCTTAATAAAATATTTCTACGGAGCAAGGGCATACCTTCCATTGCAACTACAGTGGTATCATCCATAGGATTTGTTTTTCCTGGAATATTTAGTCCNAAACTTAAGTGGCGAATCTTGTGAGTCATATTAAATTGTGTTGATGTGTATG                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI507948             [                                                                                                                         CCTTCATGCTGGGATAGGGTAAAACTTGGTTTTATGATTGGATTTTGTGTCGGAATGGCATCTGGTGTTCTATTTGGGGGATATTCTATTGTTAGATATGGATTAAGAGGAAGGGAATTGATAAACAACGTTGGAAAAGCAATGCTTCAAGGTGGTGGAACATTTGGAACATTCATGGCCATTGGAAGTGGAATAAGATGCTAGTAATTGAAGAGTGTTACGTTTCACATTTAGGATACAAAAAATTGTAGTATCAAAAAAAATATTCTATTAATTTCTTAATAAAATATTTCTACGGAGCAAGGGCATACCTTCCATTGCAACTACAGTGGTATCATCCATAGGATTTGTTTTTCCTGGAATATTTAGTCCAAAACTTAAGTGGCGAATCTTGTGAGTCATATTAAATTGTGTTGATGTGTATGGTTGGACATCATGTACTGTAAGCAAAATGAAAAATATTATAATATTACAATAATTTAAaaaaaaa                                                                                                                ]




>consensus_207#0
TAAAACACGAAAAACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACATTACATATTCATTATA
AGTTTTAAAACCAAATATTTAAATTAAAATGCCGGCCGTACCAGGCATGTATCAACAAGC
TCCTTCATGCTGGGATAGGGTAAAACTTGGTTTTATGATTGGATTTTGTGTCGGAATGGC
ATCTGGTGTTCTATTTGGGGGATATTCTATTGTTAGATATGGATTAAGAGGAAGGGAATT
GATAAACAACGTTGGAAAAGCAATGCTTCAAGGTGGTGGAACATTTGGAACATTCATGGC
CATTGGAAGTGGAATAAGATGCTAGTAATTGAAGAGTGTTACGTTTCACATTTAGGATAC
AAAAAATTGTAGTATCAAAAAAATATTCTATTAATTTCTTAATAAAATATTTCTACGGAG
CAAGGGCATACCTTCCATTGCAACTACAGTGGTATCATCCATAGGATTTGTTTTTCCTGG
AATATTTAGTCCAAAACTTAAGTGGCGAATCTTGTGAGTCATATTAAATTGTGTTGATGT
GTATGGTTGGACATCATGTACTGTAAGCAAAATGAAAAATATTATAATATTACAATAATT
TAATTTATCTTTTTCTGGCAATAGTAATATATTTGTTTACCATGTACATGATTTACAGAG
AAGCTATCTCCTGGTGCAATATGAAAACTTCNACCTACTCTATTTACTTCCATAACCATA
AA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)