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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_212#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 736 fasta sequence
[TTTTATAATAAAATGAATAACTTAATGTTTGATCAAACACTTGAAGATATTTTGGAAAAAAATCTTCCAGAAAAGGAGCTAGCTGAAGTAAAACGCCTTTTATATGGCCGCGAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCCCTGGTGTGAATTAGCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAATCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGGTCATTCTGTCTTTGATACATGTTTTGGACGTATAGCANTTAATATTTGTTATGGTCGACATCATCCCCAAAATTGGATGA]
[+] EMBL BI506189 [TTTTATAATAAAATGAATAACTTAATGTTTGATCAAACACTTGAAGATATTTTGGAAAAAAATCTTCCAGAAAAGGAGCTAGCTGAAGTAAAACGCCTTTTATATGGCCGCGAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCCCTGGTGTGAATTAGCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTA ]
[+] EMBL BI507877 [ TATATGGCCGCGAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCCCTGGTGTGAATTAGCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAATCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGGTCATTCTGTCTTTGATACATGT ]
[+] EMBL BI508827 [ GAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCCCTGGTGTGAATTAGCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAATCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGGTCATTCTGTCTTTGATACATGTTTTGGACGTATAGCANTTAATATTTGTTA ]
[+] EMBL BI508607 [ ATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCTCTGGTGTGAATTAGCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAATCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGGTCATTCTGTCTTTGATACATGTTTTGGACGTATAGCANTTAATATTTGTTATGGTCGACATCATCCCCAAAATTGGATGA]
[+] EMBL BI508874 [ ATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCTCTGGTGTGAATTAGNTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAATCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGGTCATTCTGTCTTTGATACATGTTTTGGACGTATAGCAATTAATATTTGTTATGGTCGACATCATCCCCAAAATTGG ]
consensusID : consensus_212#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 556 fasta sequence
[TATATGGCCGCGAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGGTATGTTTCAAAATTTATAAAATAAAAAAAATTATAATAATAAAAAAATATACTTATATGATTTGATAGTTTACATTAAATACAAATGAAATTGAAAGTTTAATTTTATATTCTGAATGAATTTATTATGTGCTTCTTTAATATCTATTTAATTTGATGATAATTTTGCATATATTGTATAATTCAAATCTTAAATTAGTTCAAAAAGATTAGATAAGAATCTTCTTTTAATAATTTTCATTTTTCTTATAATTTAATAGTTTATTTAATAATTTTTTATAAAATT]
[+] EMBL BI506066 [TATATGGCCGCGAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGGTATGTTTCAAAATTTATAAAATAAAAAAAATTATAATAATAAAAAAATATACTTATATGATTTGATAGTTTACATTAAATACAAATGAAATTGAAAGTTTAATTTTATATTCTGAATGAATTTATTATGTGCTTCTTTAATATCTATTTAATTTGATGATAATTTTGCATATATTGTATAATTCAAATCTTAAATTAGTTCAAAAAGATTAGATAAGAATCTTCTTTTAATAATTTTCATTTTTCTTATAATTTAATAGTTTATTTAATAATTTTTTATAAAATT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_212#0 TTTTATAATAAAATGAATAACTTAATGTTTGATCAAACACTTGAAGATATTTTGGAAAAA 60
consensus_212#1 ------------------------------------------------------------
consensus_212#0 AATCTTCCAGAAAAGGAGCTAGCTGAAGTAAAACGCCTTTTATATGGCCGCGAATTACAA 120
consensus_212#1 ----------------------------------------TATATGGCCGCGAATTACAA 20
********************
consensus_212#0 TCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATG 180
consensus_212#1 TCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATG 80
************************************************************
consensus_212#0 GGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAA 240
consensus_212#1 GGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAA 140
************************************************************
consensus_212#0 CATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAA 300
consensus_212#1 CATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAA 200
************************************************************
consensus_212#0 AAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAA 360
consensus_212#1 AAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAA 260
************************************************************
consensus_212#0 GAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCCCTGGTGTGAATTA 420
consensus_212#1 GAAGCTTGGGGTATGTTTCAAAATTTATAAAATAAAAAAAATTATAATAATAAAAAAATA 320
********** **** *** * * * * * ** ** ** **
consensus_212#0 GCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATG----TGTGAGCTTGCTCAACG 476
consensus_212#1 TACTTATATGATTTGA-TAGTTTACATTAAATACAAATGAAATTGAAAGTTTAATTTTAT 379
* *** * * * * * ***** *** ** ** ** *
consensus_212#0 ACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTT 536
consensus_212#1 ATTCTGAATGAATTTATTATGTGC--TTCTTTA-ATATCTATTTAATTTGATGATAATTT 436
* ***** * * **** * ***** * * * ** * * *** * ***
consensus_212#0 ATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAA 596
consensus_212#1 ------TGCATATATTGT-ATAATTCAAATCTTAAATTAGTTCAAAAAGATTAGATAAGA 489
* * * * **** ** * * **** * * ***** **** ** *
consensus_212#0 TCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGG 656
consensus_212#1 --ATCTTCTTTTAATA----ATTTTCAT---TTTTCTTATAATTTAATAGTTTATTTAA- 539
** *** * ** ***** ** * * **** * * ** ** *
consensus_212#0 TCATTCTGTCTTTGATACATGTTTTGGACGTATAGCANTTAATATTTGTTATGGTCGACA 716
consensus_212#1 TAATTTTTTATAAAATT------------------------------------------- 556
* *** * * * **
consensus_212#0 TCATCCCCAAAATTGGATGA 736
consensus_212#1 --------------------
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| Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |