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Apis mellifera
cluster # 221 cluster # 221       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_221#0 length = 878 sequences # 6  
consensusID : consensus_221#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 878
fasta sequence 
                              [CGCGGAAGCGAAAAAACGAGTTAAATATAGAATATTCATTTAGAAAATAGAGAAGACCGTTCGAACAACGTAGCTCCGATACATGGAGTCCCCTGTTTCCCATTACTCTTCCCTTTGGTACTGTTCTATTGTGTAAAGTCGTGTCGATTAAATCGTTTATAAAATTTTTCAATTAGAAAAAATTTAGAAAACTATCGGAAGAAATATTTTCCTTGATATATTAATTATAATTAAAGTCTTACATATATATATATTATAGTGACGATCTGATCATTTAATCTGTTTGACGAATTTATTGTTCAATGTGGTGAATGCAAATAGACATTCGATAAACATTGTTACGCTATAACTATTGCTATTTAATAAGTAAGAATATATATACATATAGATGTCAAATGTCTAAAGTGTCCTAGAAGCAAAAAAAATTATAAAGTGCTTAAATGAACAGCTTAATTTTACATCCAATACCAAACATTTAATTGAGAAACACTTTATTCTCGTTTTATATCGGTTTTTAAACGATTTAATCGAATCGATTGAACACATTTGACGCGAAAAATTTACGAGCACGAAAAACGTGAAATTGAATCGATAAATCTTTTTCTCTTTCATTATGGTTTTTCGTTTTCGCGAGTTATTCACGTCAATTGTACAATCCTCAAATTTTTTAGTTGTGTTCACTATATTGTATACAGTGGGATCAAATTACACGCGTTAGGATCGACTAATCTACGTAAACTGATCGTCTCACGTTTAATATGTCGCCGTGTATTCGCGCATGCGTACATGTCTTTCGTGAGGTGAGATTTGCCTAAAAAATTTAAATAAAAATTATTGAAGTATACTTTCTTTAGAAATAAACAAAAATTAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI509739             [CGCGGAAGCGAAAAAACGAGTTAAATATAGAATATTCATTTAGAAAATAGAGAAGACCGTTCGAACAACGTAGCTCCGATACATGGAGTCCCCTGTTTCCCATTACTCTTCCCTTTGGTACTGTTCTATTGTGTAAAGTCGTGTCGATTAAATCGTTTATAAAATTTTTCAATTAGAAAAAATTTAGAAAACTATCGGAAGAAATATTTTCCTTGATATATTAATTATAATTAAAGTCTTACATATATATATATTATAGTGACGATCTGATCATTTAATCTGTTTGACGAATTTATTGTTCAATGTGGTGAATGCAAATAGACATTCGATAAACATTGTTACGCTATAACTATTGCTATTTAATAAGTAAGAACATATATACATATAGATGTCAAATGTCTAAAGTGTCCTAGAAGCAAAAAAAATTATAAAGTGCTTAAATGAACAGCTTAATTTTACATCCAATACCAAACATTTAATTGAGAAACACTTTATTCTCGTTTTATATCGGTTTTTAAACGATTTAATCGAATCGATTGAACACATTTGACGCGAAAAATTTACGAGCACGAAAAACGTGAAATTGAATCGATAAATCTTTTTCTCTTTCATTATGGTTTTTCGTTTTCGCGAGTTATTCACG                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI507148             [                 GAGTTAAATATAGAATATTCATTTAGAAAATAGAGAAGACCGTTCGAACAACGTAGCTCCGATACATGGAGTCCCCTGTTTCCCATTACTCTTCCCTTTGGTACTGTTCTATTGTGTAAAGTCGTGTCGATTAAATCGTTTATAAAATTTTTCAATTAGAAAAAATTTAGAAAACTATCGGAAGAAATATTTTCCTTGATATATTAATTATAATTAAAGTCTTACATATATATATATTATAGTGACGATCTGATCATTTAATCTGTTTGACGAATTTATTGTTCAATGTGGTGAATGCAAATAGACATTCGATAAACATTGTTACGCTATAACTATTGCTATTTAATAAGTAAGAATATATATACATATAGATGTCAAATGTCTAAAGTGTCCTAGAAGCAAAAAAAATTATAAAGTGCTTAAATGAACAGCTTAATTTTACATCCAATACCAAACATTTAATTGAGAAACACTTTATTCTCGTTTTATATCGGTTTTTAAACGATTTAATCGAATCGATTGAACACATTTGACGCGAAAAATTTACGAGCACGAAAAACGTGAAATTGAATCGATAAATCTTTTTCTCTTTCATTATGGTTTTTCGTTTTCGCGAGTTATTCACGTCAATT                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI502825             [                 GAGTTAAATATAGAATATTCATTTAGAAAATAGAGAAGACCGTTCGAACAACGTAGCTCCGATACATGGAGTCCCCTGTTTCCCATTACTCTTCCCTTTGGTACTGTTCTATTGTGTAAAGTCGTGTCGATTAAATCGTTTATAAAATTTTTCAATTAGAAAAAATTTAGAAAACTATCGGAAGAAATATTTTCCTTGATATATTAATTATAATTAAAGTCTTACATATATATATATTATAGTGACGATCTGATCATTTAATCTGTTTGACGAATTTATTGTTCAATGNNGTGAATGCAAATAGACATTCGATAAACATTGTTACGCTATAACTATTGCTATTTAATAAGTAAGAATATATATACATATAGATGTCAAATGTCTAAAGTGTCCTAGAAGCAAAAAAAATTATAAAGTGCTTAAATGAACAGCTTAATTTTACATCCAATACCAAACATTTAATTGAGAAACACTTTATTCTCGTTTTATATCGGTTTTTAAACGATTTAATCGAATCGATTGAACACATTTGACGCGAGAAATTTACGAGCACGAAAAACGTGAAATTGAATCGATAAATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI502856             [                                                                                                                                                                                                                  CCTTGATATATTAATTATAATTAAAGTCTTACATATATATATATTATAGTGACGATCTGATCATTTAATCTGTTTGACGAATTTATTGTTCAATGTGGTGAATGCAAATAGACATTCGATAAACATTGTTACGCTATAACTATTGCTATTTAATAAGTAAGAATATATATACATATAGATGTCAAATGTCTAAAGTGTCCTAGAAGCAAAAAAAATTATAAAGTGCTTAAATGAACAGCTTAATTTTACATCCAATACCAAACATTTAATTGAGAAACACTTTATTCTCGTTTTATATCGGTTTTTAAACGATTTAATCGAATCGATTGAACACATTTGACGCGAAAAATTTACGAGCACGAAAAACGTGAAATTGAATCGATAAATCTTTTTCTCTTTCATTATGGTTTTTCGTTTTCGCGAGTTATTCACGTCAATTGTACAATCCTCAAATTTTTTAGTTGTGTTCACTATATTGTATACAGTGGGATCAAATTACACGCGTTAGGATCGACTAATCTACGTAAACTGATCGTCTCACGTTTAATATGTCGCCGTGTATTCGCGCATGCGTACATGTCTTTCGTGAGGTGAGATTTGCCTAAAAAATTTAAATAAAAATTATTG                                         ]
[-] EMBL BI507856             [                                                                                                                                                                                                                       ATATATTAATTATAATTAAAGTCTTACATATATATATATTATAGTGACGATCTGATCATTTAATCTGTTTGACGAATTTATTGTTCAATGTGGTGAATGCAAATAGACATTCGATAAACATTGTTACGCTATAACTATTGCTATTTAATAAGTAAGAACATATATACATATAGATGTCAAATGTCTAAAGTGTCCTAGAAGCAAAAAAAATTATAAAGTGCTTAAATGAACAGCTTAATTTTACATCCAATACCAAACATTTAATTGAGAAACACTTTATTCTCGTTTTATATCGGTTTTTAAACGATTTAATCGAATCGATTGAACACATTTGACGCGAAAAATTTACGAGCACGAAAAACGTGAAATTGAATCGATAAATCTTTTTCTCTTTCATTATGGTTTTTCGTTTTCGCGAGTTATTCACGTCAATTGTACAATCCTCAAATTTTTTAGTTGTGTTCACTATATTGTATACAGTGGGATCAAATTACACGCGTTAGGATCGACTAATCTACGTAAATTGATCGTCTCACGTTTAATATGTCGCCGTGTATTCGCGCATGCGTACATGTCTTTCGTGAGGTGAGATTTGCCTAA                                                               ]
[+] EMBL BI507726             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTATACAGTGGGATCAAATTACACGCGTTAGGATCGACTAATCTACGTAAACTGATCGTCTCACGTTTAATATGTCGCCGTGTATTCGCGCATGCGTACATGTCTTTCGTGAGGTGAGATTTGCCTAAAAAATTTAAATAAAAATTATTGAAGTATACTTTCTTTAGAAATAAACAAAAATTAAAAAAAAA]




>consensus_221#0
CGCGGAAGCGAAAAAACGAGTTAAATATAGAATATTCATTTAGAAAATAGAGAAGACCGT
TCGAACAACGTAGCTCCGATACATGGAGTCCCCTGTTTCCCATTACTCTTCCCTTTGGTA
CTGTTCTATTGTGTAAAGTCGTGTCGATTAAATCGTTTATAAAATTTTTCAATTAGAAAA
AATTTAGAAAACTATCGGAAGAAATATTTTCCTTGATATATTAATTATAATTAAAGTCTT
ACATATATATATATTATAGTGACGATCTGATCATTTAATCTGTTTGACGAATTTATTGTT
CAATGTGGTGAATGCAAATAGACATTCGATAAACATTGTTACGCTATAACTATTGCTATT
TAATAAGTAAGAATATATATACATATAGATGTCAAATGTCTAAAGTGTCCTAGAAGCAAA
AAAAATTATAAAGTGCTTAAATGAACAGCTTAATTTTACATCCAATACCAAACATTTAAT
TGAGAAACACTTTATTCTCGTTTTATATCGGTTTTTAAACGATTTAATCGAATCGATTGA
ACACATTTGACGCGAAAAATTTACGAGCACGAAAAACGTGAAATTGAATCGATAAATCTT
TTTCTCTTTCATTATGGTTTTTCGTTTTCGCGAGTTATTCACGTCAATTGTACAATCCTC
AAATTTTTTAGTTGTGTTCACTATATTGTATACAGTGGGATCAAATTACACGCGTTAGGA
TCGACTAATCTACGTAAACTGATCGTCTCACGTTTAATATGTCGCCGTGTATTCGCGCAT
GCGTACATGTCTTTCGTGAGGTGAGATTTGCCTAAAAAATTTAAATAAAAATTATTGAAG
TATACTTTCTTTAGAAATAAACAAAAATTAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)