|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_27#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 729 fasta sequence
[TTACTCATGTTATAAGAAATTTTTCAGTCATAACTATGAGTGGAAACGACAACTATAAGGAAGCGAAATCAATTTATGATTTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG-AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTATTTATACATTTTTTATTTAATAGAAATTTATTTTTAAAATTATCGAATATTCAATATTTTTTAACATTAAAAGCAA]
[+] EMBL BI514694 [TTACTCATGTTATAAGAAATTTTTCAGTCATAACTATGAGTGGAAACGACAACTATAAGGAAGCGAAATCAATTTATGATTTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAA ]
[+] EMBL BI514703 [TTACTCATGTTATAAGAAATTTTTCAGTCATAACTATGAGTGGAAACGACAACTATAAGGAAGCGAAATCAATTTATGATTTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAA ]
[+] EMBL BI503691 [ CAATTTATGATTTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAAT ]
[+] EMBL BI506036 [ TTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTATTTATACATTTTTTATTTAATAGAAATTTATTTTTAAAATTATCGAATATTCAATATTTT ]
[+] EMBL BI508187 [ TTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTATT ]
[+] EMBL BI508285 [ TTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTAT ]
[+] EMBL BI508779 [ TTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGT ]
[+] EMBL BI508555 [ GCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTATTTATACATTTTTTATTTAATAGAAATTTATTTTTAAAATTATCGAATATTCAATATTTTTTAACATTAAAAGCAA]
[+] EMBL BI516401 [ TCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTANNAATATTTGCACTAATAGTAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTA ]
[+] EMBL BI512436 [ GAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTNNNATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTATTTATACATTTTTTATTTAATAGAAATTTATTTT ]
[+] EMBL BI508780 [ CTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAGTAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTAT ]
[+] EMBL BI516017 [ TATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTGAAAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAGTAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTAT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
|||||||
| Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |