Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 36 cluster # 36       Sequences # 11       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_36#0 length = 858 sequences # 11  
consensusID : consensus_36#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 858
fasta sequence 
                              [TGAAACAAGAGTACCATTTTTGAACATTACCAACATTTAAATCATATACTTCAAGGCAATATCGATTGCTTAGTGAAGTGTTATGCATAACGAACAGATTGCTTCAAGTTACTCAATGTTAATTCAAAAATAAACACAATGTCTTTACTGCAATCATTGTCTTCAGGACTTAACAAAACTTCGAAATTAATATCTCGAAGTGTCCCAGCTGTATTTTATCATCCAAATGTGATAGATCACTATGAAAATCCAAGAAATGTAGGTTCTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACATTGTTCAATGCTCGCAGAAGATGCAATTAAGGCTGCTTTGTCAGATTATAATATAAAACAGAAACAAAAATTGAAAAATAATGATAATTATAAGAATAAAAATGAAACATGATTCTGATATATTTCAGATGATAGTAAAAAATATTAGAATTATATATCTTATTTTTTGTTTTTTGTTCATTAATTTTTATATATAACAATATTCATAAATTATGTGTTGTGATTAGAATGAAAAAGTGTATATTAAATTATATATAAAATTTAATGTAATACTTGCATATATTCTTTCATTTTTTCAAAAAAAAAAATAAATATATTTAATTAAACAAAAAAA]

[+] EMBL BI511458             [TGAAACAAGAGTACCATTTTTGAACATTACCAACATTTAAATCATATACTTCAAGGCAATATCGATTGCTTAGTGAAGTGTTATGCATAACGAACAGATTGCTTCAAGTTACTCAATGTTAATTCAAAAATAAACACAATGTCTTTACTGCAATCATTGTCTTCAGGACTTAACAAAACTTCGAAATTAATATCTCGAAGTGTCCCAGCTGTATTTTATCATCCAAATGTGATAGATCACTATGAAAATCCAAGAAATGTAGGTTCTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI507115             [              CATTTTTGAACATTACCAACATTTAAATCATATACTTCAAGGCAATATCGATTGCTTAGTGAAGTGTTATGCATAACGAACAGATTGCTTCAAGTTACTCAATGTTAATTCAAAAATAAACACAATGTCTTTACTNNNNTCATTGTCTTCAGGACTTAACAAAACTTCGAAATTAATATCTCGAAGTGTCCCAGCTGTATTTTATCATCCAAATGTGATAGATCACTATGAAAATCCAAGAAATGTAGGTTCTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI510861             [                                                                     TTAGTGAAGTGTTATGCATAACGAACAGATTGCTTCAAGTTACTCAATGTTAATTCAAAAATAAACACAATGTCTTTACTGCAATCATTGTCTTCAGGACTTAACAAAACTTCGAAATTAATATCTCGAAGTGTCCCAGCTGTATTTTATCATCCAAATGTGATAGATCACTATGAAAATCCAAGAAATGTAGGTTCTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTNNNCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI503069             [                                                                                             ACAGATTGCTTCAAGTTACTCAATGTTAATTCAAAAATAAACACAATGTCTTTACTGCAATCATTGTCTTCAGGACTTAACAAAACTTCGAAATTAATATCTCGAAGTGTCCCAGCTGTATTTTATCATCCAAATGTGATAGATCACTATGAAAATCCAAGAAATGTAGGTTCTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACATTGTTCAATGCTCGCAGAAGATGCAATTAAGGCTGCTTTGTCAGATTATAATATAAAACAGNNNCAAAAATTGAAAAATAATGATAATTATAAGAATAAAAATGAAACATGATTCTGATATATTTCAGA                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI516143             [                                                                                                                                                             TGTCTTCAGGACTTAACAAAACTTCGAAATTAATATCTCGAAGTGTCCCAGCTGTATTTTATCATCCAAATGTGATAGATCACTATGAAAATCCAAGAAATGTAGGTTCTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACATTGTTCAATGCTCGCAGAAGATGCAATTAAGGCTGCTTTGTCAGATTATAATATAAAACAGAAACAAAAATTGAAAAATAATGATAATTATAAGAATAAAAATGAAACATGATTCTGATATATTTCAGATGATAGTAAAAAATATTAGAATTA                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI503446             [                                                                                                                                                                                                                           CATCCAAATGTGATAGATCACTATGAAAATCCAAGAAATGTAGGTTCTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACATTGTTCAATGCTCGCAGAAGATGCAATTAAGGCTGCTTTGTCAGATTATAATATAAAACAGAAACAAAAATTGAAAAATAATGATAATTATAAGAATAAAAATGAAACATGATTCTGATATATTTCAGATGATAGTAAAAAATATTAGAATTATATATCTTATTTTTTGTTTTTTGTTCATTAATTTTTATATATAACAATATTCATAAATTATGTGTTGTGATTAGAATGAAAAAGTGTATATTAAATTATATATAAAATTTAATGTAATACT                                                            ]
[+] EMBL BI513022             [                                                                                                                                                                                                                                    GTGATAGATCACTATGAAAATCCAAGAAATGTAGGTTCTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACATTGTTCAATGCTCGCAGAAGATGCAATTAAGGCTGCTTTGTCAGATTATAATATAAAACAGAAACAAAAATTGAAAAATAATGATAATTATAAGAATAAAAATGAAACATGATTCTGATATATTTCAGATGATAGTAAAAAATATTAGAATTATATATCTTATTTTTTGTTTTTTGTTCATTAATTTTTATATATAACAAT                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI506694             [                                                                                                                                                                                                                                                                   TAGGTTCTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACATTGTTCAATGCTCGCAGAAGATGCAATTAAGGCTGCTTTGTCAGATTATAATATAAAACAGAAACAAAAATTGAAAAATAATGATAATTATAAGAATAAAAATGAAACATGATTCTGATATATTTCAGATGATAGTAAAAAATATTAGAATTATATATCTTATTTTTTGTTTTTTGTTCATTAATTTTTATATATAACAATATTCATAAATTATGTGTTGTGATTAGAATGAAAAAGTGTATATTAAATTATATATAAAATTTAATGTAATACTTGCATATATTCTTTCATTTTTTCAAAAAAAAAAATAAATATATTTAATTAAACAAAAAAA]
[+] EMBL BI509219             [                                                                                                                                                                                                                                                                   TAGGTTCTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACATTGTTCAATGCTCGCAGAAGATGCAATTAAGGCTGCTTTGTCAGATTATAATATAAAACAGAAACAAAAATTGAAAAATAATGATAATTATAAGAATAAAAATGAAACATGATTCTGATATATTTCAGATGATAGTAAAAAATATTAGAATTATATATCTTATTTTTTGTTTTTTGTTCATTAATTTTTATATATAACAATATTCATAAATTATGTGTTGTGATTAGAATGAAAAAGTGTATATTAAATTATATATAAAATTTAATGTAATACTTGCATATATTCTTTCATTTTTTCAAAAAAAAAAATAAATATATTTAATTAAACAAAAAA ]
[+] EMBL BI516720             [                                                                                                                                                                                                                                                                         CTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACATTGTTCAATGCTCGCAGAAGATGCAATTAAGGCTGCTTTGTCAGATTATAATATAAAACAGAAACAAAAATTGAAAAATAATGATAATTATAAGAATAAAAATGAAACATGATTCTGATATATTTCAGATGATAGTAAAAAATATTAGAATTATATATCTTATTTTTTNNTTTTTGTTCATTAATTTTTATATATAACAATATTCATAAATTATGTGTTGTGATTAGAATGAAAAAGTGTATATTAAAT                                                                                     ]
[+] EMBL BI517264             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTACAGGTATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAAGGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGTTCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAATGGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACATTGTTCAATGCTCGCAGAAGATGCAATTAAGGCTGCTTTGTCAGATTATAATATAAAACAGAAACAAAAATTGAAAAATAATGATAATTATAAGAATAAAAATGAAACATGATTCTGATATATTTCAGATGATAGTAAAAAATATTAGAATTATATATCTTATTTTTTGTTTTTTGTTCATTAATTTTTATATATAACAATATTCATAAATTATGTGTTGTGATTAGAATGAAAAAGTGTATATTAAATTATATATAA                                                                            ]




>consensus_36#0
TGAAACAAGAGTACCATTTTTGAACATTACCAACATTTAAATCATATACTTCAAGGCAAT
ATCGATTGCTTAGTGAAGTGTTATGCATAACGAACAGATTGCTTCAAGTTACTCAATGTT
AATTCAAAAATAAACACAATGTCTTTACTGCAATCATTGTCTTCAGGACTTAACAAAACT
TCGAAATTAATATCTCGAAGTGTCCCAGCTGTATTTTATCATCCAAATGTGATAGATCAC
TATGAAAATCCAAGAAATGTAGGTTCTTTGGATAAAAATGATTCTCAGGTTGGTACAGGT
ATCGTAGGAGCCCCAGCCTGTGGAGATGTAATGAAACTTCAAGTTAAAGTTAATGAGAAA
GGAAAGATTATTGATGCTAAGTTTAAAACTTTTGGTTGTGGTTCTGCTATTGCTTCAAGT
TCCTTAGCCACAGAATGGGTTAAAGGAAAAACTATTGATGAAGCACTGGCTCTTAAGAAT
GGAGATATTGCTAAAGAATTGTGCTTACCACCTGTCAAGTTACATTGTTCAATGCTCGCA
GAAGATGCAATTAAGGCTGCTTTGTCAGATTATAATATAAAACAGAAACAAAAATTGAAA
AATAATGATAATTATAAGAATAAAAATGAAACATGATTCTGATATATTTCAGATGATAGT
AAAAAATATTAGAATTATATATCTTATTTTTTGTTTTTTGTTCATTAATTTTTATATATA
ACAATATTCATAAATTATGTGTTGTGATTAGAATGAAAAAGTGTATATTAAATTATATAT
AAAATTTAATGTAATACTTGCATATATTCTTTCATTTTTTCAAAAAAAAAAATAAATATA
TTTAATTAAACAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)