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Apis mellifera
cluster # 38 cluster # 38       Sequences # 11       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_38#0 length = 1866 sequences # 11  
consensusID : consensus_38#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1866
fasta sequence 
                              [CCAGCAATATGTCTCCACTCCACTGATTCGCGAATTGATAGCGAAAAATTAAAAAAAATCAGAACCGAATCTATATCGACTTTCATCATTGGAATCATTCTTCTAATCGTCGCACGAAGAAATAAATTATATGACAAGTCGAATAAAATCCAATAAGATCCAACAAGAATCTTGCAACTCATTCGATACACATGCATGCATCATCATCCCTTAGGGCTTTGCAAGTCTCCGAAATTCAATTTGTGATAAGAAAAAAGGGCTAGTGATCAAGTTGCACGATTTTGTTTTTTCGCATGTTCGTTGAAACATCCGAGAAGATGATTGCCGGGGTAATTTTAACGTGTCTTTTACCAACCTGGAAGTTGTCCTTATTGTCGAGTTGAATCGTGCTGGATCCGCTCGAGGGTTGACCTGTCACGTTACTCCATGGACGGTAATACCTATCGCGAAATATCGAGCGTAGAGGTCTATCGAAGTTGATATCGGAAAACCGTGATAACAAGTCGTCTCGATTCAGTCCTCTGCCGAAGTGTTGGTCCATCAATCGGGACACTGGACGTTCGAAATCGTCCCACCAATCGCGAAATATCAGAGGCACGACCGACATCTGAAACAGTTTAAATATAGATATAAAAAAAAAAAATCGGTGAATATCGGTCAGTTCTTACTTTTTCGATTCTTTTTCGATAAGACGGTAGTATAAATGGATAAAAGTAAACGGAAAAGAATTAAGGAAAAGGAAGATGGAGACGTTATGTTAAGTATTATTACCTAGTTGAACGTGAACTCACCACGATTTATAACACGCGAATGGAAGTTTGACAAATTAAAAGTTA-AGCTGTAAGC-AATTTTTACTTAGGAACGTGCTAAGGAGATTCTTTTGAGCTTAAAATCTT-AATCCAACTAAAATCAA--TTTGC-ACGCCTGTCGTCA--AAGCTATTAAAGAACA-CGATTTAGATTTACTTTGGACAACGGTTGCAATTAGTAATAATCTTGATAATGAAACGCAAAACTTTATACACATGACGTAATTCGAAGATTTTAGGAACTTCACTTTCGTCGCGAGTCTTTTAATAAAATAACGATTCGAGGATAAGCGAAAGAGATGTTCCTCGATAATATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTCGGAGATATCACGAAAATTGTTGCTGTAATCGCGGATTAGTGTAAGATATCTCGATTTGAATAACGACAAATGACAACGTTGTTGTTAGATTTGTTTACGCGTTTCCTCAAGACCATCTTCGCCCACGAATATATTATTGTATAATTAGATCTTACTCGAACGCACAGCAAGTGAGCATATAAGTATAGATTCGTAGCGATTTGATCCGAATTTTCTTCTCGCATGCGATAATCGATAATTCGTATTTTAACACCGAAACGGGATAGGGGATAAACCGGACACAATTATCTCTCGTCGTGCTTGAAAAATCGTGCACGCGTTTGCAATTCAATATTCACATTTAATATTAACATACATTTAACACGTTCGAGCACGAATACAATAAATCACGAGATTAAGATACGTTTGATTGAACAATCAAAATAACAAATTCAAGATAATTTGAAACTTTTCAATCGGATAATCAAGATCGGGAAATTCATTGAGGGAACACATCGCGCATTTAAAAATCATTCTCAAACGAAAAAAATATATGTTCGTGACATCGAAAATGACGAATTTTCTCGGTTTANNACTCTAACAGTAGATTTTATGCGAATACCATCCGTGAATAAGATTTTTTGTTTAGAATTTAATAAAAGATAATTGCGTGATGAATTTTTTTTTTTCTTATGGAAAGAAAAAGACATTGATATATTTCTACAAGGAGAAA]

[-] EMBL BI946434             [CCAGCAATATGTCTCCACTCCACTGATTCGCGAATTGATAGCGAAAAATTAAAAAAAATCAGAACCGAATCTATATCCACTTTCATCATTGGAATCATTCTTCTAATCGTCGCACGAAGAAATAAATTATATGACAAGTCGAATAAAATCCAATAAGATCCAACAAGAATCTTGCAACTCATTCGATACACATGCATGCATCATCATCCCTTAGGGCTTTGCAAGTCTCCGAAATTCAATTTGTGATAAGAAAAAAGGGCTAGTGATCAAGTTGCACGATTTTGTTTTTTCGCATGTTCGTTGAAACATCCGAGAAGATGATTGCCGGGGTAATTTTAACGTGTCTTTTACCAACCTGGAAGTTGTCCTTATTGTCGAGTTGAATCGTGCTGGATCCGCTCGAGGGTTGACCTGTCACGTTACTCCATGGACGGTAATACCTATCGCGAAATATCGAGCGTAGAGGTCTATCGAAGTTGATATCGGAAAACCGTGATAACAAGTCGTCTCGATTCAGTCCTCTGCCGAAGTGTTGGTCCATCAATCGGGACACTGGACGTTCGAAATCGTCCCACCAATCGCGAAATATCAGAGGCACGACCGACATCTGAAACAGTTTAAATATAGATATAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL BI946420             [                                                                   AATCTATATCGACTTTCATCATTGGAATCATTCTTCTAATCGTCGCACGAAGAAATAAATTATATGACAAGTCGAATAAAATCCAATAAGATCCAACAAGAATCTTGCAACTCATTCGATACACATGCATGCATCATCATCCCTTAGGGCTTTGCAAGTCTCCGAAATTCAATTTGTGATAAGAAAAAAGGGCTAGTGATCAAGTTGCACGATTTTGTTTTTTCGCATGTTCGTTGAAACATCCGAGAAGATGATTGCCGGGGTAATTTTAACGTGTCTTTTACCAACCTGGAAGTTGTCCTTATTGTCGAGTTGAATCGTGCTGGATCCGCTCGAGGGTTGACCTGTCACGTTACTCCATGGACGGTAATACCTATCGCGAAATATCGAGCGTAGAGGTCTATCGAAGTTGATATCGGAAAACCGTGATAACAAGTCGTCTCGATTCAGTCCTCTGCCGAAGTGTTGGTCCATCAATCGGGACACTGGACGTTCGAAATCGTCCCACCAATCGCGAAATATCAGAGGCACGACCGACATCTGAAACAGTTTAAATATAGATATAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI510626             [                                                                                                        AATCGTCGCACGAAGAAATAAATTATATGACAAGTCGAATAAAATCCAATAAGATCCAACAAGAATCTTGCAACTCATTCGATACACATGCATGCATCATCATCCCTTAGGGCTTTGCAAGTCTCCGAAATTCAATTTGTGATAAGAAAAAAGGGCTAGTGATCAAGTTGCACGATTTTGTTTTTTCGCATGTTCGTTGAAACATCCGAGAAGATGATTGCCGGGGTAATTTTAACGTGTCTTTTACCAACCTGGAAGTTGTCCTTATTGTCGAGTTGAATCGTGCTGGATCCGCTCGAGGGTTGACATGTCACGTTTCTCCATGGACGGTAATACCTATCGCGAAATATCGAGCGTAGAGGTCTATCGAAGTTGATATCGGAAAACCGTGATAACAAGTCGTCTCGATTCAGTCCTCTGCCGAAGTGTTGGTCCATCAATCGGGATACTGGACGTTCGAAATCGTCCCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI507034             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTGTCACGTTTCTCCATGGACGGTAATACCTATCGCGAAATATCGAGCGTAGAGGTCTATCGAAGTTGATATCGGAAAACCGTGATAACAAGTCGTCTCGATTCAGTCCTCTGCTGAAGTGTTGGTCCATCAATCGGGACACTGGACGTTCGAAATCGTCCCACCAATCGCGAAATATCAGAGGCACGACCGACATCTGAAACAGTTTAAATATAGATATAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BE844429             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GACGGTAATACCTATCGCGAAATATCGAGCGTAGAGGTCTATCGAAGTTGATATCGGAAAACCGTGATAACAAGTCGTCTCGATTCAGTCCTCTGCCGAAGTGTTGGTCCATCAATCGGGACACTGGACGTTCGAAATCGTCCCACCAATCGCGAAATATCAGAGGCACGACCGACATCTGAAACAGTTTAAATATATAAAAAAAAAAAAAAAATCGGTGAATATCGGTCAGTTCTTACTTTTTCGATTCTTTTTCGATAAGACGGTAGTATAAATGGATAAAAGTAAACGGAAAAGAATTAAGGAAAAGGAAGATGGAGACGTTATGTTAAGTATTATTACCTAGTTGAACGTGAACTCACCACGATTTATAACACGCGAATGGAAGTTTGACAAATTAAAAGTTATAGCTGTAAGCAAATTTTTACTTAGGAACGTGCTAAGGAGATTCTTTTGAGCTTAAAATCTTAAATCCAACTAAAATCAAATTTTGCAACGCCTGTCGTCAACAAGCTATTAAAGAACACCGATTTAGATTTACTTTGGACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI514505             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAAATATCGAGCGTAGAGGTCTATCGAAGTTGATATCGGAAAACCGTGATAACAAGTCGTCTCGATTCAGTCCTCTGCCGAAGTGTTGGTCCATCAATCGGGACACTGGACGTTCGAAATCGTCCCACCAATCGCGAAATATCAGAGGCACGACCGACATCTGAAACAGTTTAAATATAGATATAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI946463             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGATGGAGACGTTATGTTAAGTATTATTACCTAGTTGAACGTGTACTCACCACGATTTATAACACGCGAATGGAAGTTTGACAAATTAAAAGTTA AGCTGTAAGC AATTTTTACTTAGGAACGTGCTAAGGAGATTCTTTTGAGCTTAAAATCTT AATCCAACTAAAATCAA  TTTGC ACGCCTGTCGTCA  CAGCTATTAAAGAACA CGATTTAGATTTACTTTGGACAACGGTTGCAATTAGTAATAATCTTGATAATGAAACGCAAAACTTTATACACATGACGTAATTCGAAGATTTTAGGAACTTCACTTTCGTCGCGAGTCTTTT     AATAACGATTCAAGGATAAACGAAAGAGATGTTCCTCGATAATATG   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTCGGAGATATCACGAAAATTGTTGCTGTAATCGCGGATTAGTGTAAGATATCTCGATTTGAATAACGACAAATGACAACGTTGTTGTTAGATTTGTTTACGCGTTTCCTCAAGACCATCTTCGCCCACGAATATATTATTGGATAAATAGATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI946501             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGTAATAATCTTGATAATGAAACGCAAAACTTTATACACATGACGTAATTCGAAGATTTTAGGAACTTCACTTTCGTCGCGAGTCTTTTAATAAAATAACGATTCGAGGATAAGCGAAAGAGATGTTCCTCGATAATATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTCGAAGATATCACGAAAATTGTTGCTGTAATCGCGGATTAGTGTAAGATATCTCGATTTGAATAACGACAAATGACAACGTTGTTGTTAGATTTGTTTACGCGTTTCCTCAAGACCATCTTCGCCCACGAATATATTATTGTATAATTAGATCTTACTCGAACGCACAGCAAGTGAGCATATAAGTATAGATTCGTAGCGATTTGATCCGAATTTTCTTCTCGCATGCGATAATCGATAATTCGTATTTTAACACCGAAACGGGATAGGGGATAAACCGGACACAATTATCTCTCGTCGTGCTTGAAAAATCGTGCACGCGTTTGCAATTCAATATTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI514790             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATCTTCGCCCACGAATATATTATTGTATAATTAGATCTTACTCGAACGCACAGCAAGTGAGCATATAAGTATAGATTCGTAGCGATTTGATCCGAATTTTCTTCTCGCATGCGATAATCGATAATTCGTATTTTAACACCGAAACGGGATAGGGGATAAACCGGACACAATTATCTCTCGTCGTGCTTGAAAAATCGTGCACGCGTTTGCAATTCAATATTCACATTTAATATTAACATACATTTAACACGTTCGAGCACGAATACAATAAATCACGAGATTAAGATACGTTTGATTGAACAATCAAAATAACAAATTCAAGATAATTTGAAACTTTTCAATCGGATAATCAAGATCGGGAAATTCATTGAGGGAACACATCGCGCATTTAAAAATCATTCTCAAACGAAAAAAATATATGTTCGTGACATCGAAAATGACGAATTTTCTCGGTTTANNACTCTAACAGTAGATTTTATGCGAATACCATCCGTGAATAAGATTTTTTGTTTAGAATTTAATAAAAGATAATTGCGTGATGAATTTTTTTTTTTCTTATGGAAAGAAAAAGA                          ]
[+] EMBL BI516697             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATCTTCGCCCACGAATATATTATTGTATAATTAGATCTTACTCGAACGCACAGCAAGTGAGCATATAAGTATAGATTCGTAGCGATTTGATCCGAATTTTCTTCTCGCATGCGATAATCGATAATTCGTATTTTAACACCGAAACGGGATAGGGGATAAACCGGACACAATTATCTCTCGTCGTGCTTGAAAAATCGTGCACGCGTTTGCAATTCAATATTCACATTTAATATTAACATACATTTAACACGTTCGAGCACGAATACAATAAATCACGAGATTAAGATACGTTTGATTGAACAATCAAAATAACAAATTCAAGATAATTTGAAACTTTTCAATCGGATAATCAAGATCGGGAAATTCATTGAGGGAACACATCGCGCATTTAAAAATCATTCTCAA                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI503582             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATTTTAACACCGAAACGGGATAGGGGATAAACCGGACACAATTATCTCTCGTCGTGCTTGAAAAATCGTGCACGCGTTTGCAATTCAATATTCACATTTAATATTAACATACATTTAACACGTTCGAGCACGAATACAATAAATCACGAGATTAAGATACGTTTGATTGAACAATCAAAATAACAAATTCAAGATAATTTGAAACTTTTCAATCGGATAATCAAGATCGGGAAATTCATTGAGGGAACACATCGCGCATTTAAAAATCATTCTCAAACGAAAAAAATATATGTTCGTGACATCGAAAATGACGAATTTTCTCGGTTTAGGACTCTAACAGTAGATTTTATGCGAATACCATCCGTGAATAAGATTTTTTGTTTAGAATTTAATAAAAGATAATTGCGTGATGAATTTTTTTTTTTCTTATGGAAAGAAAAAGACATTGATATATTTCTACAAGGAGAAA]




>consensus_38#0
CCAGCAATATGTCTCCACTCCACTGATTCGCGAATTGATAGCGAAAAATTAAAAAAAATC
AGAACCGAATCTATATCGACTTTCATCATTGGAATCATTCTTCTAATCGTCGCACGAAGA
AATAAATTATATGACAAGTCGAATAAAATCCAATAAGATCCAACAAGAATCTTGCAACTC
ATTCGATACACATGCATGCATCATCATCCCTTAGGGCTTTGCAAGTCTCCGAAATTCAAT
TTGTGATAAGAAAAAAGGGCTAGTGATCAAGTTGCACGATTTTGTTTTTTCGCATGTTCG
TTGAAACATCCGAGAAGATGATTGCCGGGGTAATTTTAACGTGTCTTTTACCAACCTGGA
AGTTGTCCTTATTGTCGAGTTGAATCGTGCTGGATCCGCTCGAGGGTTGACCTGTCACGT
TACTCCATGGACGGTAATACCTATCGCGAAATATCGAGCGTAGAGGTCTATCGAAGTTGA
TATCGGAAAACCGTGATAACAAGTCGTCTCGATTCAGTCCTCTGCCGAAGTGTTGGTCCA
TCAATCGGGACACTGGACGTTCGAAATCGTCCCACCAATCGCGAAATATCAGAGGCACGA
CCGACATCTGAAACAGTTTAAATATAGATATAAAAAAAAAAAATCGGTGAATATCGGTCA
GTTCTTACTTTTTCGATTCTTTTTCGATAAGACGGTAGTATAAATGGATAAAAGTAAACG
GAAAAGAATTAAGGAAAAGGAAGATGGAGACGTTATGTTAAGTATTATTACCTAGTTGAA
CGTGAACTCACCACGATTTATAACACGCGAATGGAAGTTTGACAAATTAAAAGTTAAGCT
GTAAGCAATTTTTACTTAGGAACGTGCTAAGGAGATTCTTTTGAGCTTAAAATCTTAATC
CAACTAAAATCAATTTGCACGCCTGTCGTCAAAGCTATTAAAGAACACGATTTAGATTTA
CTTTGGACAACGGTTGCAATTAGTAATAATCTTGATAATGAAACGCAAAACTTTATACAC
ATGACGTAATTCGAAGATTTTAGGAACTTCACTTTCGTCGCGAGTCTTTTAATAAAATAA
CGATTCGAGGATAAGCGAAAGAGATGTTCCTCGATAATATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAATCTCGGAGATATCACGAAAATTGTTGCTGTAATCGCGGATTAGTGTAAGA
TATCTCGATTTGAATAACGACAAATGACAACGTTGTTGTTAGATTTGTTTACGCGTTTCC
TCAAGACCATCTTCGCCCACGAATATATTATTGTATAATTAGATCTTACTCGAACGCACA
GCAAGTGAGCATATAAGTATAGATTCGTAGCGATTTGATCCGAATTTTCTTCTCGCATGC
GATAATCGATAATTCGTATTTTAACACCGAAACGGGATAGGGGATAAACCGGACACAATT
ATCTCTCGTCGTGCTTGAAAAATCGTGCACGCGTTTGCAATTCAATATTCACATTTAATA
TTAACATACATTTAACACGTTCGAGCACGAATACAATAAATCACGAGATTAAGATACGTT
TGATTGAACAATCAAAATAACAAATTCAAGATAATTTGAAACTTTTCAATCGGATAATCA
AGATCGGGAAATTCATTGAGGGAACACATCGCGCATTTAAAAATCATTCTCAAACGAAAA
AAATATATGTTCGTGACATCGAAAATGACGAATTTTCTCGGTTTANNACTCTAACAGTAG
ATTTTATGCGAATACCATCCGTGAATAAGATTTTTTGTTTAGAATTTAATAAAAGATAAT
TGCGTGATGAATTTTTTTTTTTCTTATGGAAAGAAAAAGACATTGATATATTTCTACAAG
GAGAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)