Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 791 cluster # 791       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_791#0 length = 627 sequences # 3  
consensusID : consensus_791#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 627
fasta sequence 
                              [GCGTCCAATGCTACCGACTAAACGAACCAAGTAATCACGATTTATTTATTTTGAAAAGAGAATTAAATAAAATAAAACAATAGCCACGAGATGCCTTCGATCGCAAGCAAGTGTTTGGTGCCCTGGAGCATAAGAATACATTATGCATATAGAGATGCAATGCCGTGAATAAGTTGGGTAAATTATATAATTCAAAGATGAGATTTAGACGAAAATTAACGAAAATACATCGACTCGAAAGAAATCGTCTGATCTTCGATCGAAAGTTCTTAGAATCGAAATAATTCGTACACGCGTGTGTACAAGTTTTTATCAATTTTTTTGTGAACGTATTTAAACAGAA-AAAAAAATAACTTTAATAAATTATGCGATAATCGTCGTCGGTGTATATTGTAAATATATATATTTCGAAAGCACTCGCACGAGTGTCTAGTGCGGATCGAATTGTATGTCGAATAAAAAAAAGAGATGATATGTCGTCAGAATAATTTTACGATGTTTTGATGAGTTACGATTAATTGAATTATCTCTCGTGTCGTTGTAATTCACGTACGACAGTTTTTAATAATAATGACGCGAAGGAACGAGACGAGATGTTTTAAATTCGTAATTGTTTAACAATTGGGT]

[+] EMBL BI505301             [GCGTCCAATGCTACCGACTAAACGAACCAAGTAATCACGATTTATTTATTTTGAAAAGAGAATTAAATAAAATAAAACAATAGCCACGAGATGCCTTCGATCGCAAGCAAGTGTTTGGTGCCCTGGAGCATAAGAATACATTATGCATATAGAGATGCAATGCCGTGAATAAGTTGGGTAAATTATATAATTCAAAGATGAGATTTAGACGAAAATTAACGAAAATACATCGACTCGAAAGAAATCGTCTGATCTTCGATCGAAAGTTCTTAGAATCGAAATAATTCGTACACGNNNGTGTACAAGTTTTTATCAATTTTTTTGTGAACGTATTTAAACAGAAGAAAAAAAAAACTTTAATAAATTATGCGATAATCGTCGTCGGTGTATATTGTAAATATATATATTTCGAAAGCACT    CGAGTGTCTAGTGCGGATCGAATTGTATGTCGAATAAAAAAAAGAGATGATATTTCGTCAGAATAATTTTACGATGTTTTGATGAGTTACGATTAATTGAATTATCTCTCGTGTCGTTGTAATTCACGTACGACAGTTTTT ATAATAAT     GAAGGAACGAGACGAGATGTTTTAAATTCGTAATTGTTTAA         ]
[+] EMBL BI510785             [                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATCGAAATAATTCGTACACGCGTGTGTACAAGTTTTTATCAATTTTTTTGTGAACGTATTTAAACAGAA AAAAAAATAACTTTAATAAATTATGCGATAATCGTCGTCGGTGTATATTGTAAATATATATATTTCGAAAGCACTCGCACGAGTGTCTAGTGCGGATCGAATTGTATGTCGAATAAAAAAAAGAGATGATATGTCGTCAGAATAATTTTACGATGTTTTGATGAGTTACGATTAATTGAATTATCTCTCGTGTCGTTGTAATTCACGTACGACAGTTTTTAATAATAATGACGCGAAGGAACGAGACGAGATGTTTTAAATTCGTAATTGTTTAACAATTGGGT]
[+] EMBL BI510818             [                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATCGAAATAATTCGTACACGCGTGTGTACAAGTTTTTATCAATTTTTTTGTGAACGTATTTAAACAGAA AAAAAAATAACTTTAATAAATTATGCGATAATCGTCGTCGGTGTATATTGTAAATATATATATTTCGAAAGCACTCGCACGAGTGTCTAGTGCGGATCGAATTGTATGTCGAATAAAAAAAAGAGATGATATGTCGTCAGAATAATTTTACGATGTTTTGATGAGTTACGATTAATTGAATTATCTCTCGTGTCGTTGTAATTCACGTACGACAGTTTTTAATAATAATGACGCGAAGGAACGAGACGAGATGTTTTAAATTCGTAATTGTTTAACAATTGGG ]




>consensus_791#0
GCGTCCAATGCTACCGACTAAACGAACCAAGTAATCACGATTTATTTATTTTGAAAAGAG
AATTAAATAAAATAAAACAATAGCCACGAGATGCCTTCGATCGCAAGCAAGTGTTTGGTG
CCCTGGAGCATAAGAATACATTATGCATATAGAGATGCAATGCCGTGAATAAGTTGGGTA
AATTATATAATTCAAAGATGAGATTTAGACGAAAATTAACGAAAATACATCGACTCGAAA
GAAATCGTCTGATCTTCGATCGAAAGTTCTTAGAATCGAAATAATTCGTACACGCGTGTG
TACAAGTTTTTATCAATTTTTTTGTGAACGTATTTAAACAGAAAAAAAAATAACTTTAAT
AAATTATGCGATAATCGTCGTCGGTGTATATTGTAAATATATATATTTCGAAAGCACTCG
CACGAGTGTCTAGTGCGGATCGAATTGTATGTCGAATAAAAAAAAGAGATGATATGTCGT
CAGAATAATTTTACGATGTTTTGATGAGTTACGATTAATTGAATTATCTCTCGTGTCGTT
GTAATTCACGTACGACAGTTTTTAATAATAATGACGCGAAGGAACGAGACGAGATGTTTT
AAATTCGTAATTGTTTAACAATTGGGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)