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Apis mellifera
cluster # 89 cluster # 89       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_89#0 length = 600 sequences # 8  
consensusID : consensus_89#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 600
fasta sequence 
                              [CAAGCACTTGTCGTTCCGTGTAGTCGAGAAATTTTCGAAGATGACTAAAGCAGTGTGCGTTCTTCAGGGTGAAGTCAAAGGAACTATTTTTTTTGAACAACCGGAGAGTACCAATTCCGTGAAGGTCACCGGTCAAGTAACCGGTTTAAAAAAAGGATTGCATGGTTTTCATGTTCATGAATTTGGCGATAATACCAATGGTTGTACAAGTGCTGGTGCACATTTCAACCCATTAGGAAAGGATCATGGTGGACCTGATTCAGATATACGTCATGTTGGAGATTTGGGAAATATTGAAGCAGATGCAAGTGGTGTTGCTAATGTTAATATAACAGATAAAACTATTCAACTTCAAGGACCACATAGTGTTATTGGCAGAACACTTGTAGTTCATGCTGATCCAGATGATCTTGGTAAAGGTGGTGTTGAATTATCAAAAACTACAGGAAATGCTGGTGCTCGTCTTGCTTGTGGTGTTATTGGAATTACAAAAGTCT-AAAAAATATATTCTTCTGATATAAAATTATTATTATTATTAGAAATTATAAAATATTATAATTATCTCAATTTAAATATGAGTATATCATTCCTAATTTCTTG]

[+] EMBL BI515686             [CAAGCACTTGTCGTTCCGTGTAGTCGAGAAATTTTCGAAGATGACTAAAGCAGTGTGCGTTCTTCAGGGTGAAGTCAAAGGAACTATTTTTTTTGAACAACCGGAGAGTACCAATTCCGTGAAGGTCACCGGTCAAGTAACCGGTTTAAAAAAAGGATTGCATGGTTTTCATGTTCATGAATTTGGCGATAATACCAATGGTTGTACAAGTGCTGGTGCACATTTCAACCCATTAGGAAAGGATCATGGTGGACCTGATTCAGATATACGTCATGTTGGAGATTTGGGAAATATTGAAGCAGATGCAAGTGGTGTTGCTAATGTTAATATAACAGATAAAACTATTCAACTTCAAGGACCACATAGTGTTATTGGCAGAACACTTGTAGTTCATGCTGATCC                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI515703             [    CACTTGTCGTTCCGTGTAGTCGAGAAATTTTCGAAGATGACTAAAGCAGTGTGCGTTCTTCAGGGTGAAGTCAAAGGAACTATTTTTTTTGAACAACCGGAGAGTACCAATTCCGTGAAGGTCACCGGTCAAGTAACCGGTTTAAAAAAAGGATTGCATGGTTTTCATGTTCATGAATTTGGCGATAATACCAATGGTTGTACAAGTGCTGGTGCACATTTCAACCCATTAGGAAAGGATCATGGTGGACCTGATTCAGATATACGTCATGTTGGAGATTTGGGAAATATTGAAGCAGATGCAAGTGGTGTTGCTAATGTTAATATAACAGATAAAACTATTCAACTTCAAGGACCACATAGTGTTATTGGCAGAACACTTGT                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI516231             [                   GTAGTCGAGAAATTTTCGAAGATGACTAAAGCAGTGTGCGTTCTTCAGGGTGAAGTCAAAGGAACTATTTTTTTTGAACAACCGGAGAGTACCAATTCCGTGAAGGTCACCGGTCAAGTAACCGGTTTAAAAAAAGGATTGCATGGTTTTCATGTTCATGAATTTGGCGATAATACCAATGGTTGTACAAGTGCTGGTGCACATTTCAACCCATTAGGAAAGGATCATGGTGGACCTGATTCAGATATACGTCATGTTGGAGATTTGGGAAATATTGAAGCAGATGCAAGTGGTGTTGCTAATGTTAATATAACAGATAAAACTATTCAACTTCAAGGACCACATAGTGTTATTGGCAGAACACTTGTAGTTCATGCTGATCCAGATGATCTTGGTAAAGGTGGTGTTGAATTATCAAAAACTACAGGAAATGCTGGTGCTCGTCTTGCTTGTGNNNTTATTGGAATTACAAAAGTCT AAAAAATATATTCTTCTGATATAAAATTATTATTATTATTAGAAATTATAAAATATTATAATTATCTCAATTTAAAT                          ]
[+] EMBL BI515107             [                     AGTCGAGAAATTTTCGAAGATGACTAAAGCAGTGTGCGTTCTTCAGGGTGAAGTCAAAGGAACTATTTTTTTTGAACAACCGGAGAGTACCAATTCCGTGAAGGTCACCGGTCAAGTAACCGGTTTAAAAAAAGGATTGCATGGTTTTCATGTTCATGAATTTGGCGATAATACCAATGGTTGTACAAGTGCTGGTGCACATTTCAACCCATTAGGAAAGGATCATGGTGGACCTGATTCAGATATACGTCATGTTGGAGATTTGGGAAATATTGAAGCAGATGCAAGTGGTGTTGCTAATGTTAATATAACAGATAAAACTATTCAACTTCAAGGACCACATAGTGTTATTGGCAGAACACTTGTAGTTCATGCTGATCCAGATGATCTTGGTAAAGGTGGTGTTGAATTATCAAAAACTACAGGAAATGCTGGTGCTCGTCTTGCTTGTGGTGTTATTGGAATTACAAAAGTCT AAAAAATATATTCTTCTGATATAAAATTATTATTATTATTAGAAATTATAAAATATTATAATTATCTCAATTTAAATATGAGTAT                  ]
[+] EMBL BI515879             [                     AGTCGAGAAATTTTCGAAGATGACTAAAGCAGTGTGCGTTCTTCAGGGTGAAGTCAAAGGAACTATTTTTTTTGAACAACCGGAGAGTACCAATTCCGTGAAGGTCACCGGTCAAGTAACCGGTTTAAAAAAAGGATTGCATGGTTTTCATGTTCATGAATTTGGCGATAATACCAATGGTTGTACAAGTGCTGGTGCACATTTCAACCCATTAGGAAAGGATCATGGTGGACCTGATTCAGATATACGTCATGTTGGAGATTTGGGAAATATTGAAGCAGATGCAAGTGGTGTTGCTAATGTTAATATAACAGATAAAACTATTCAACTTCAAGGACCACATAGTGTTATTGGCAGAACACTTGTAGTTCATGCTGATCCAGATGATCTTGGTAAAGGTGGTGTTGAATTATCAAAAACTACAGGAAATGCTGGTGCTCGTCTTGCTTGTGNNGTTATTGGAATTACAAAAGTCT AAAAAATATATTCTTCTGATATAAAATTATTATTATTATTAGAAATTATAAAATATTATAATTATCTCAATTTAAA                           ]
[+] EMBL BI515784             [                                                                      GAAGTCAAAGGAACTATTTTTTTTGAACAACCGGAGAGTACCAATTCCGTGAAGGTCACCGGTCAAGTAACCGGTTTAAAAAAAGGATTGCATGGTTTTCATGTTCATGAATTTGGCGATAATACCAATGGTTGTACAAGTGCTGGTGCACATTTCAACCCATTAGGAAAGGATCATGGTGGACCTGATTCAGATATACGTCATGTTGGAGATTTGGGAAATATTGAAGCAGATGCAAGTGGTGTTGCTAATGTTAATATAACAGATAAAACTATTCAACTTCAAGGACCACATAGTGTTATTGGCAGAACACTTGTAGTTCATGCTGATCCAGATGATCTTGGTAAAGGTGGTGTTGAATTATCAAAAACTACAGGAAATGCTGGTGCTCGTCTTGCTTGTGGTGTTATTGGAATTACAAAAGTCTAAAAAAATATATTCTTCTGATATAAAATTATTATTATTATTAGAAATTATAAAATATTATAATTATCTCAATTTAAATATGAGTATATCATTCCTAATT     ]
[+] EMBL BI511643             [                                                                                                                     CGTGAAGGTCACCGGTCAAGTAACCGGTTTAAAAAAAGGATTGCATGGTTTTCATGTTCATGAATTTGGCGATAATACCAATGGTTGTACAAGTGCTGGTGCACATTTCAACCCATTAGGAAAGGATCATGGTGGACCTGATTCAGATATACGTCATGTTGGAGATTTGGGAAATATTGAAGCAGATGCAAGTGGTGTTGCTAATGTTAATATAACAGATAAAACTATTCAACTTCAAGGACCACATAGTGTTATTGGCAGAACACTTGTAGTTCATGCTGATCCAGATGATCTTGGTAAAGGTGGTGTTGAATTATCAAAAACTACAGGAAATGCTGGTGCTCGTCTTGCTTGTGGTGTTATTGGAATTACAAAAGTCT AAAAAATATATTCTTCTGATATAAAATTATTATTATTATTAGAAATTATAAAATATTATAATTATCTCAATTTAAATATGAGTATATCATTCCTAATTTCTTG]
[+] EMBL BI504265             [                                                                                                                                                             TTGCATGGTTTTCATGTTCATGAATTTGGCGATAATACCAATGGTTGTACAAGTGCTGGTGCACATTTCAACCCATTAGGAAAGGATCATGGTGGACCTGATTCAGATATACGTCATGTTGGAGATTTGGGAAATATTGAAGCAGATGCAAGTGGTGTTGCTAATGTTAATATAACAGATAAAACTATTCAACTTCAAGGACCACATAGTGTTATTGGCAGAACACTTGTAGTTCATGCTGATCCAGATGATCTTGGTAAAGGTGGTGTTGAATTATCAAAAACTACAGGAAATGCTGGTGCTCGTCTTGCTTGTGGTGTTATTGGAATTACAAAAGTCT AAAAAATATATTCTTCTGATATAAAATTATTATTATTA                                                                 ]




>consensus_89#0
CAAGCACTTGTCGTTCCGTGTAGTCGAGAAATTTTCGAAGATGACTAAAGCAGTGTGCGT
TCTTCAGGGTGAAGTCAAAGGAACTATTTTTTTTGAACAACCGGAGAGTACCAATTCCGT
GAAGGTCACCGGTCAAGTAACCGGTTTAAAAAAAGGATTGCATGGTTTTCATGTTCATGA
ATTTGGCGATAATACCAATGGTTGTACAAGTGCTGGTGCACATTTCAACCCATTAGGAAA
GGATCATGGTGGACCTGATTCAGATATACGTCATGTTGGAGATTTGGGAAATATTGAAGC
AGATGCAAGTGGTGTTGCTAATGTTAATATAACAGATAAAACTATTCAACTTCAAGGACC
ACATAGTGTTATTGGCAGAACACTTGTAGTTCATGCTGATCCAGATGATCTTGGTAAAGG
TGGTGTTGAATTATCAAAAACTACAGGAAATGCTGGTGCTCGTCTTGCTTGTGGTGTTAT
TGGAATTACAAAAGTCTAAAAAATATATTCTTCTGATATAAAATTATTATTATTATTAGA
AATTATAAAATATTATAATTATCTCAATTTAAATATGAGTATATCATTCCTAATTTCTTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)