cluster # 13271

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Oryza sativa
cluster # 13271 cluster # 13271 Sequences # 12 consensus # 3

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consensus_13271#0 length = 821 sequences # 7

consensus_13271#1 length = 734 sequences # 4
consensus_13271#2 length = 684 sequences # 1

consensusID : consensus_13271#0
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Sequences nbr = 7
consensus length = 821
fasta sequence

                              [GACACCGCCGAGGACGCGGCGCTCGCCTACGACAAGGCGGCGTTCCGCCTCCGCGGCGACGCCGCGCGCCTCAACTTCCCCACGCTCCGCCGCGGCGGCGCCCACCTCGCCGGCCCGCTCCACGCCTCCATCGACGCCAAGCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGT-TGCAATTCACTCTTTAAAATTTTTGTAATGTATTTACTTTGCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGA]

[+] EMBL CB642288             [GACACCGCCGAGGACGCGGCGCTCGCCTACGACAAGGCGGCGTTCCGCCTCCGCGGCGACGCCGCGCGCCTCAACTTCCCCACGCTCCGCCGCGGCGGCGCCCACCTCGCCGGCCCGCTCCACGCCTCCATCGACGCCAAGCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGT TGCAATTCACTCTTTAAAATTTTT                                      ]
[+] EMBL CB641651             [GACACCGCCGAGGACGCGGCGCTCGCCTACGACAAGGCGGCGTTCCGCCTCCGCGGCGACGCCGCGCGCCTCAACTTCCCCACGCTCCGCCGCGGCGGCGCCCACCTCGCCGGCCCGCTCCACGCCTCCATCGACGCCAAGCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGT TGCAATTCACTCTTTAAAATT                                         ]
[+] EMBL CB642253             [                                            gctCCTCTTCAGACACACCGCTCGCCTCATCTTCCTCACGCTCCGCCGCGGTGGCACCCACCTCACCGGCCCGCTCCACGCCTCCATCGACGCCAAGCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGT TGCAATTCACTCTTTAAAATTTTTGTAA                                  ]
[+] EMBL CB642332             [                                                           CGCCGGACGCCTCAACTTCCCCACGCTCCGCCGCGGCGGCGCCCACCTCGCCGGCCCGCTCCACGCCTCCATCGACGCCAAGCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGGCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGT TGCAATTCACTCTTTAAAATT                                         ]
[-] EMBL CB641652             [                                                                                                                      TCCACGCCTCCATCGACGCCAAGCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGTGTGCAATTCACTCTTTAAAATTT                                        ]
[-] EMBL CB642289             [                                                                                                                                                                                                     CGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTAGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTGGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGAGGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGT TGCAATTCACTCTCTAAAATTTTTGTAATGT                               ]
[-] EMBL CB671940             [                                                                                                                                                                                                                     CACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTTTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGT TGCAATTCACTCTTTAAAATTTTTGTAATGTATTTACTTTGCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGA]




>consensus_13271#0
GACACCGCCGAGGACGCGGCGCTCGCCTACGACAAGGCGGCGTTCCGCCTCCGCGGCGAC
GCCGCGCGCCTCAACTTCCCCACGCTCCGCCGCGGCGGCGCCCACCTCGCCGGCCCGCTC
CACGCCTCCATCGACGCCAAGCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCGCCC
GCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCG
TCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCT
CTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTC
ACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAG
ATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTA
AATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATG
GCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTA
AGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAG
TAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAG
TTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGTTGCAATTCACTCTTTAAAATT
TTTGTAATGTATTTACTTTGCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGA

consensusID : consensus_13271#1
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 734
fasta sequence

                              [GATGTCGGCTCTTCCTATCATTGTGAAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATTGTTCACCCACCTCCACCTCCACCTCCACGCCATTGTTCTACTCCTCTAGCTCCATCTCCACCACCACCACCACTCCCTTCTCCTACTCGTCTCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGTTGCAATTCACTCTTTAAAATTTTTGTAATGTATT]

[+] EMBL AK063886             [GATGTCGGCTCTTCCTATCATTGTGAAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATTGTTCACCCACCTCCACCTCCACCTCCACGCCATTGTTCTACTCCTCTAGCTCCATCTCCACCACCACCACCACTCCCTTCTCCTACTCGTCTCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGTTGCAATTCACTCTTTAAAATTTTTGTAATGTATT]
[-] EMBL CB651283             [                                                                                                                                                         TCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGTTGCAATTCACTCTTTAAAATTT            ]
[-] EMBL CB658869             [                                                                                                                                                          tcCCCGGA TCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGTTGCAATTCACTCTTTAA                 ]
[-] EMBL CB664337             [                                                                                                                                                                                                                                                                       CGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGTTGCAATTCACTCTTTAAAATTT            ]




>consensus_13271#1
GATGTCGGCTCTTCCTATCATTGTGAAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATTGTTCACCCA
CCTCCACCTCCACCTCCACGCCATTGTTCTACTCCTCTAGCTCCATCTCCACCACCACCA
CCACTCCCTTCTCCTACTCGTCTCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGC
GTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCC
TCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTT
CACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGA
GATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATT
AAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCAT
GGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATT
AAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTA
GTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCA
GTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGTTGCAATTCACTCTTTAAAAT
TTTTGTAATGTATT

consensusID : consensus_13271#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 684
fasta sequence

                              [CTCCACGCCTCCATTGACGCCAAGCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGGGGCAATTCACTCTTTAAAATTTTTGTAATGTAAAAAAAAAGA]

[-] EMBL CB642254             [CTCCACGCCTCCATTGACGCCAAGCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCGCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCTCCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACTTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGGGAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCCATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCATTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACTTAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGCCAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGGGGCAATTCACTCTTTAAAATTTTTGTAATGTAAAAAAAAAGA]




>consensus_13271#2
CTCCACGCCTCCATTGACGCCAAGCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCG
CCCGCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCC
GCGTCGACGACGACCACGACGTCGGAGGGAGACGAGTCGGCGATCTCCGCCTGTTCGCCT
CCTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGAC
TTCACGGAGGCGCCATGGGACGAATCCGACGCCTTCCACCTCTACAAGTGTCCGTCATGG
GAGATCGACTGGGACTCCATCCTCTCGTGATCAAATCAACTTTAATTAATTAAAATTAAA
TTAAATTAAATTAATGTAATCAGTAGCTTCCATGATCCGATGGAATATTAGACATCGGCC
ATGGCTGCTGCAATTAGGGTTTAAGGAGGTCGTCGTCGTCATCGTAGTAGGATTAAGTCA
TTAAGAAGGGTTTAAGATAAGTGTTCTTAGCTTATTATTGCTGTATTAATTTTCTGTACT
TAGTAGTTATTATGATCTCCTGGTTACTTCGCCGGTTGTTTTTTTTTCACTCGGCAAGGC
CAGTTGAGGGTGTAATGTAATGTAACTTTTGGTTACTGCTGGGGCAATTCACTCTTTAAA
ATTTTTGTAATGTAAAAAAAAAGA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_13271#0      GACACCGCCGAGGACGCGGCGCTCGCCTACGACAAGGCGGCGTTCCGCCTCCGCGGCGAC 60
consensus_13271#2      ------------------------------------------------------------
consensus_13271#1      ---------------------------------------------------------GAT 3
                                                                                   

consensus_13271#0      GCCG-CGCGCCTCAACTTCCCCACGCTCCGCCGCGGCGGCGCCCACCTCGCCGGCCCGCT 119
consensus_13271#2      ----------------------------------------------------------CT 2
consensus_13271#1      GTCGGCTCTTCCTATCATTGTGAAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATTGTTCACCCACCT 63
                                                                                 **

consensus_13271#0      CCACGCCTCCATCGACGCCAA-GCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCGC 178
consensus_13271#2      CCACGCCTCCATTGACGCCAA-GCTCACCGCCATCTGCCACAGCCTCGCCGCCGCGCCGC 61
consensus_13271#1      CCACCTCCACCTCCACGCCATTGTTCTACTCCTCTAGCTCCATCTCCACCACCACCACCA 123
                       ****  *  * *  ******  * **  * **    **  ** *  * ** ** *  *  

consensus_13271#0      CCGCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCG 238
consensus_13271#2      CCGCCTCCTCCAAGAAAGCCGCCGCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCG 121
consensus_13271#1      CTCCCTTCTCCTAC----TCGTCTCCGCCGCCGCTCACCCGGACTCGCCCAAAGGCTCCG 179
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consensus_13271#0      CTCTCCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGGCGGCGCTCCCCGAGATGGCAAACCTTGACT 358
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