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consensusID : consensus_14141#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 707 fasta sequence
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[+] EMBL CF299420 [ gagtAGAAAAAG CTTACCATTGCTCATCACCTCTCCATCTTTAGTTTGAAGTATCTCAGTTTTGCGATTCTCCTCGCTGTTCACCGCGAATAATCAAGCATCGATTGACGACGACGATGGACGAACCATCGCAGGGCGGTGACCAGAAGCTGCCGGCCATGGAGCATGTCAAGAAACGCCATGAAGAGAAGGGCTTCCTCTATGCCTGCTTGTTCATGCTGTGCTGCTGCTTCTGCTGCTACGAAACCTGCGAGCACTGCCTCGAGTGCTT CTGCTGCTGCT GCAAG AAGG ACAACTGATAGAGATCAAGATCGATTTCCTGGATTTGTTAGCGAATTGTTCG TCGAAATAATAAAAGGCTAGCTTGGTG TGATTCTTCTCGGTTTTAATTTGTGTGTTAACTATGCGTTAACCGTGGTGAGCTAGCTAATAGTTATGTACTCCATGCTGTGACTATGAGTGAGCGAGTGAAT ]
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[+] EMBL CF299814 [ ACCATTGCTCATCACCTCTCCATCTTTAGTTTGAAGTATCTCAGTTTTGCGATTCTCCTCGCTGTTCACCGCGAATAATCAAGCATCGATTGACGACGACGATGGACGAACCATCGCAGGGCGGTGACCAGAAGCTGTCGGCCATGGAGCATGTCAAGAAACGCCATGAAGAGAAGGGCTTCCTCTATGCCTGCTTGTTCATGCTGTGCTGCTGCTTCTGCTGCTACGAAACCTGCGAGCACTGCCTCGAGTGCTT CTGCTGCTGCT GCAAG AAGG ACAACTGATAGAGATCAAGATCGATTTCCTGGATTTGTTAGCGAATTGTTCG TCGAAATAATAAAAGGCTAGCTTGGTG TGATTCTTCTCGGTTTTAATTTGTGTGTTAACTATGCGTTAACCGTGGTGAGCTAGCTAATAGTTATGTACTCCATGCTGTGACTATGAGTGAGCGAGTGAATTG ]
[+] EMBL CF299302 [ CCTCTCCATCTTTAGTTTGAAGTATCTCAGTTTTGCGATTCTCCTCGCTGTTCACCGCGAATAATCAAGCATCGATTGACGACGACGATGGACGAACCATCGCAGGGCGGTGACCAGAAGCTGTCGGCCATGGAGCATGTCAAGAAACGCCATGAAGAGAAGGGCTTCCTCTATGCCTGCTTGTTCATGCTGTGCTGCTGCTTCTGCTGCTACGAAACCTGCGAGCACTGCCTCGAGTGCTT CTGCTGCTGCT GCAAG AAGG ACAACTGATAGAGATCAAGATCGATTTCCTGGATTTGTTAGCGAATTGTTCG TCGAAATAATAAAAGGCTAGCTTGGTG TGATTCTTCTCGGTTTTAATTTGTGTGTTAACTATGCGTTAACCGTGGTGAGCTAGCTAATAGTTATGTACTCCATGCTGTGACTATGAGTGAGCG ]
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[-] EMBL CF299301 [ TTGAAGTATCTCAGTTTTGCGATTCTCCTCGCTGTTCACCGCGAATAATCAAGCATCGATTGACGACGACGAT GACGAACCATCGCAGGGCGGTGACCAGAAGCTGTCGGCCATGGAGCATGTCAAGAAACGCCATGAAGAGAAGGGCTTCCTCTATGCCTGCTTGTTCATGCTGTGCTGCTGCTTCTGCTGCTACGAAACCTGCGAGCACTGCCTCGAGTGCTT CTGCTGCTGCT GCAAG AAGG ACAACTGATAGAGATCAAGATCGATTTCCTGGATTTGTTAGCGAATTGTTCG TCGAAATAATAAAAGGCTAGCTTGGTG TGATTCTTCTCGGTTTTAATTTGTGTGTTAACTATGCGTTAACCGTGGTGAGCTAGCTAATAGTTATGTACTCCATGCTGTGACTATGAGTGAGCGAGTGAATTGCAGGT GGATTGT GGTTGTAAGTTTGTAAGCT GGATTTCTGATTTTTC ATGTCAGTTCATTGTTGTAGTACAAATTCTTGTGTAAACATAGGTGTAGGTGATTCATGTTGCAGTTATCCAGTTATTTCTTCTGCTTGCAAAA ]
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[+] EMBL CA999953 [ TTCTGCTGCTACGAAACCTGCGAGCACTGCCTCGATTGCTT CTGCTGCTGCT GCAAG AAGG ACAACTGATAGAGATCAAGATCGATTTCCTGGATTTGTTAGCGAATTGTTCG TCGAAATAATAAAAGGCTAGCTTGGTG TGATTCTTCTCGGTTTTAATTTGTGTGTTAACTATGCGTTAACCGTGGTGAGCTAGCTAATAGTTATGTACTCCATGCTGTGACTATGAGTGAGCGAGTGAATTGCAGGT GGATTGT GGTTGTAAGTTTGTAAGCT GGATTTCTGATTTTTC ATGTCAGTTCATTGTTGTAGTACAAATTCTTGTGTAAACATAAGTGTAGGTGATTCATGTTGCAGTTATCCAGTTATTTCTTCTGCTTGCATAAACTGATACACAGAAGTTCAGATTAAAAAAAAA ]
[+] EMBL CA999099 [ CTGCTGCTACGAAACCTGCGAGCACTGCCTCGAGTGCTT CTGCTGCTGCT GCAAG AAGG ACAACTGATAGAGATCAAGATCGATTTCCTGGATTTGTTAGCGAATTGTTCG TCGAAATAATAAAAGGCTAGCTTGGTG TGATTCTTCTCGGTTTTAATTTGTGTGTTAACTATGCGTTAACCGTGGTGAGCTAGCTAATAGTTATGTACTCCATGCTGTGACTATGAGTGAGCGAGTGAATTGCAGGT GGATTGT GGTTGTAAGTTTGTAAGCT GGATTTCTGATTTTTC ATGTCAGTTCATTGTTGTAGTACAAATTCTTGTGTAAACATAAGTGTAGGTGATTCATGTTGCAGTTATCCAGTTATTTCTTCTGCTTGCATAAACTGATACACAGAAGTTCAGATTAAAAAAAAA ]
[+] EMBL CA999186 [ CTGCTGCTACGAAACCTGCGAGCACTGCCTCGAGTGCTT CTGCTGCTGCT GCAAG AAGG ACAACTGATAGAGATCAAGATCGATTTCCTGGATTTGTTAGCGAATTGTTCG TCGAAATAATAAAAGGCTAGCTTGGTG TGATTCTTCTCGGTTTTAATTTGTGTGTTAACTATGCGTTAACCGTGGTGAGCTAGCTAATAGTTATGTACTCCATGCTGTGACTATGAGTGAGCGAGTGAATTGCAGGT GGATTGT GGTTGTAAGTTTGTAAGCT GGATTTCTGATTTTTC ATGTCAGTTCATTGTTGTAGTACAAATTCTTGTGTAAACATAAGTGTAGGTGATTCATGTTGCAGTTATCCAGTTATTTCTTCTGCTTGCATAAACTGATACACAGAAGTTCAGATTAAAAAAAAA ]
[+] EMBL AU096923 [ AGTGCTTNCTGCTGCTGCTCGCAAGTNAAGGTACAACTGATAGAGATCAAGATCGATTTCCTGGATTTGTTAGCGAATTGTTCGCNCGAAATAATAAAAGGCTAGCNTGGTGCTGATTCTTCTCGGTTTTAATTTGTGTGTTAACTATGCGTTAACCGTGGTGAGCTAGCTAATAGTTATGTACTCCATGCTGTGACTATGAGTGAGCGAGTGAATTGCAGGT GGATTGT GGTTGTAAGTTTGTAAGCT GGATTTCTGATTTTTC ATGTCAGTTCATTGTTGTAGTACAAATTCTTGTGTAAACATAAGTGTAGGTGATTCATGTTGCAaa ]
consensusID : consensus_14141#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 635 fasta sequence
[CGAGACAAGGGGGAAGCCCACCATTGCTCATCACCTCTCCATCTTTAGTTTGCAGTATCTCAGTTTTGCAATTCTCCTCGCTGTTCACCGCGAATAATCAAGCATCGATTGACGACGACGATGGACGAACCATCGCAGGGCGGTGACCAGAAGCTGTCGGCCATGGAGCATGTCAAGAAACGCCATGAAGAGAAGGGCCTCCTCTATGCCTGCTTGTTCATGCTGTGCTGCTGCTTCTGCTGCTACGAAACCTGCGAGCACTGCCTCGAGTGCTTCTGCTGCTGCTGCAAGAAGGACGACTGATAGAGATCAAGATCGATTTCCTGGATTTGTTAGCGAATTGTTCGTCGAAATAATAAAAGGCTAGCTTGGTGTGATTCTTCTCGGTTTTAATTTGTGTGTTAACTATGCGTTAACCGTGGTGAGCTAGCTAATAGTTATGAACTCCATGCTGTGACTATGAGTGAGCGAGTGAATTGCAGGTGGATTGTGGTTGTAAGTTTGTAAGCTGGATTTCTGATTTTTCATGTCAGTTCATTGTTGTAGTACAAATTCTTGTGTAAACATAATACATATGTGTAGGTGATTCATGTTGCCGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CA764615 [CGAGACAAGGGGGAAGCCCACCATTGCTCATCACCTCTCCATCTTTAGTTTGCAGTATCTCAGTTTTGCAATTCTCCTCGCTGTTCACCGCGAATAATCAAGCATCGATTGACGACGACGATGGACGAACCATCGCAGGGCGGTGACCAGAAGCTGTCGGCCATGGAGCATGTCAAGAAACGCCATGAAGAGAAGGGCCTCCTCTATGCCTGCTTGTTCATGCTGTGCTGCTGCTTCTGCTGCTACGAAACCTGCGAGCACTGCCTCGAGTGCTTCTGCTGCTGCTGCAAGAAGGACGACTGATAGAGATCAAGATCGATTTCCTGGATTTGTTAGCGAATTGTTCGTCGAAATAATAAAAGGCTAGCTTGGTGTGATTCTTCTCGGTTTTAATTTGTGTGTTAACTATGCGTTAACCGTGGTGAGCTAGCTAATAGTTATGAACTCCATGCTGTGACTATGAGTGAGCGAGTGAATTGCAGGTGGATTGTGGTTGTAAGTTTGTAAGCTGGATTTCTGATTTTTCATGTCAGTTCATTGTTGTAGTACAAATTCTTGTGTAAACATAATACATATGTGTAGGTGATTCATGT ]
[-] EMBL CF299813 [ CTGCAAAAAGGACAACTGATAGAGATCAAGATCGATTTCCTGGATTTGTTAGCGAATTGTTTGTCGAAATAATAAAAGGCTAGCTTGGGGGGATTTTTTTCGGTTTTAATTTGTGTGTTAACTATGCGTTAACCGTGGTGAGCTAGGTAATAGTTATGTACTCCATGCTGTGACTATGAGTGAGCGAGTGAATTGCAGGTGGATTGTGGTTGTAAGTTTGTAAGCTGGATTTTTGATTTTTCATGTCAGTTCATTGTTGTAGGACAAATTTTTGTGTAAACATAA GGGTAGGTGATTCATGTTGCCGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
consensusID : consensus_14141#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 417 fasta sequence
[CCANCTCACGGGGCGNGTGAACCAGAAGCTGTCGGCCATGGGAGCATGTCAAGAAACGCCATGAAAANAAAGGCTTCCTCTATGCCTGCTTGTTCATGCTGTGCTGCTGCTTCTGCTGCTACNAAACCTGCGANCACTGCCTCGAGTGCTTCTGCTGCTGCTGCCANAAAGACAACTGATAAAATCAANATCGATTTCCTGGATTTGTTANCGAATTGTTCGTCCAAATAATAAAAGGCTANCTTGGTGTGATTCTCCNCGGTTTAATTGTGTTTTACTATGCGTTAACCGTGGTGANCTACTAATAATTATGTCTCCATGCCGTGACTATNAATNAACGAATNAATTGCNNGTGGATTGTGGTTGTTANTTTGTTANCNGGATTTCTGATTTNCNNGTCNNTCCNTGTTGTTNTCA]
[+] EMBL BE228586 [CCANCTCACGGGGCGNGTGAACCAGAAGCTGTCGGCCATGGGAGCATGTCAAGAAACGCCATGAAAANAAAGGCTTCCTCTATGCCTGCTTGTTCATGCTGTGCTGCTGCTTCTGCTGCTACNAAACCTGCGANCACTGCCTCGAGTGCTTCTGCTGCTGCTGCCANAAAGACAACTGATAAAATCAANATCGATTTCCTGGATTTGTTANCGAATTGTTCGTCCAAATAATAAAAGGCTANCTTGGTGTGATTCTCCNCGGTTTAATTGTGTTTTACTATGCGTTAACCGTGGTGANCTACTAATAATTATGTCTCCATGCCGTGACTATNAATNAACGAATNAATTGCNNGTGGATTGTGGTTGTTANTTTGTTANCNGGATTTCTGATTTNCNNGTCNNTCCNTGTTGTTNTCA]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_14141#0 GAGTAGAAAATATACCACACTAGAACACAGGAGCAAGAACAAGCACACCATTGCTCATCA 60
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consensus_14141#2 ------------------------------------------------------------
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consensus_14141#1 ATAATCAAGCATCGATTGACGACGACGATGGACGAACCATCGCAGGGCGGTGACCAGAAG 153
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* * * ** * * * ********
consensus_14141#0 CTGTCGGCCATGG-AGCATGTCAAGAAACGCCATGAAGAGAAGGGCTTCCTCTATGCCTG 239
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consensus_14141#2 CTGTCGGCCATGGGAGCATGTCAAGAAACGCCATGAAAANAAAGGCTTCCTCTATGCCTG 88
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consensus_14141#0 CTTGTTCATGCTGTGCTGCTGCTTCTGCTGCTACGAAACCTGCGAGCACTGCCTCGAGTG 299
consensus_14141#1 CTTGTTCATGCTGTGCTGCTGCTTCTGCTGCTACGAAACCTGCGAGCACTGCCTCGAGTG 272
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consensus_14141#0 TTAGCGAATTGTTCGTCGAAATAATAAAAGGCTAGCTTGGTGTGATTCTTCTCGGTTTTA 419
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consensus_14141#2 ------------------------------------------------
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| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||