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Oryza sativa
cluster # 2299 cluster # 2299       Sequences # 2       consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2299#0 length = 2407 sequences # 1  
 consensus_2299#1 length = 1790 sequences # 1  
consensusID : consensus_2299#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 2407
fasta sequence 
                              [TAACTATTTAATCCCTTGGCTATGTTATTTTGGCAGCAGCCAACACCATCGCATGAGTCATTTGTAGGGGCTTTTGCGCAGACTGATGCACATGCTGTCGTATACTCTCCATTGTAGATGTATGAAAGAGTGTTGCAACCAATGACTACAAACTTATTGTGCAGATTAGAGAACCGGTATGGCCATGTTGAAAAGTCAAGTGACCATCGGCTAGATTCCATTGACTTTGTTACATCATTGTAGCAATATGTCGACAGGGCATTTAGTGCCCTAGTTTGACCATGGAGCAACGAAATATTTAGGACCTCAACATTAATAAGGAATGGTTTCATAGATCCATCAGCAGTCTTGTTGCAATAGATTACGAAGCCCGGTTCGATAGCACACTCTGTGCCAATGCCAAATGGGTATGGGATTTCCATATCACCGCAATGGGACTGGCATCCAGGAGCCGGCTGAGCTGATATAGATGATAGTTGTGCCATGATTGCAATACTGAGCAGTATCGCTGATGCCATATCAACTCTCTGAAAATGATGTTTGTAGAGAAATTTATTTATAAGTGGCGCTTAAAGGCAAGAAAATGAAACAGAGCAAACAAACTTAATGGCTTGTTAGTTCCAAAACTTCCAAAGCAGCATGTTGCCTATTAACCTTACAACTCACCAGTTCTTTTTACTTGGCATTAATGCCATTGATGCAATCTTCAATGCTCATGTTTGATCATTGATTTTTTTTCTCATTAAAATCATTAAGAATATAGCTACGCAAAAGTATTTTCATGATGAATCATAACATTTTTGCACATACTAGTGAGATAACTTTTAATATTTGACTGCAAGAATGTTATAAGGGAAAGCCATCTCTACCGAGAGCATTAGGTTCAGAATCTAGAGTAACGTGGCTTCAATGGTGATGAAGAGCTGCAACAACATGACCAGAAATTTTTCATGGTGTTCTCTAAAGCTAAACGAGTAAACTTTCAGTGGTATCAAACTATCTTTTACCAACTGTGGCATTTATTCCGAAAACCATGTGTTATGTACAACCATAGTTAGTTCATTTTGCATATAAGGCCAAACAACAATAGATATTCATATCTTGGTTGTCTGTCAGAAAAAGAAAATACAATAGTGAACAAATGTTTGCTTACTTTCATATTGTCTGTACTGAATCGTAGTTGTATGTCTTTTTTTTGGCAATTAATTACGGTCAGGGCCGCAAAATGGCTCTTACTGCAAATATCAATTCAAATTTAAATAATAACTGTTGTACAGGATTAATTATGGTGCACTAAGTTATTATTAAACAAAATTAACTGACAGTGAAACATTTATCCAATTTAATTGCTCTATTTTTTTTCTGATCCTTATCAAGTACTAGCATTGACAGTGAGTTGAATTAAGCAATCCTCTGTCTCTGCCTCAACTGCTATGGGATTAGGACAGTACTTGCCAAGTTTTGGCCATATACCATCAGTTTTCTTGGGTGCTACCTTTTGTTTTGTGGCAGGCTTAGCGCTACTTGGCAGTGTTCTAAAAATCACCATTAGAGGCGGCACCTCGGTGCCAAGCACCAGCTCAGCGCTGCGAATAGCACATTGGTCCACGTCAGCGCGATGGTCAACATCGGTCCACGTTGGCGCCTAGGTGCAGCAGCGATTAGTCAACTAGGCGGCTGACTGGTGGTGGTGGTGGTCTGGTTCTGGCGGCTGCTTGGATAGTTGGATGCATGTTGCTGCTGTGGTGTAAGTTGCCGATTTCAGCCTTTGGCATGTTGGCAACTATCAAACAAATGGTAGAATCAAATATTCAAATCCTAAACACATGTATTTTCTACAAGTTGGATGTTGGCATGCTGCAATTTGTTATGTTGTATACTTAACTCACTATCTAGGACCTGGTCAATTCTCCCTCCCAAGTTGGCTCTAGGCGCTACGCATCACCCTGGTGCCAGACTAGCGCCTAGCACCTTCTTGAACACTGCTACTTGGTCATGGTTTCATGGTCAGAGATGATCAGGTAATACGTTTCTTGTTTGTATAACTTGTATAGGAGTAATGTCACCTCCTGGGTTATCTTACAATGAACCTCATGGTTTAAGCGAACATTGTGGTTGTTCCTTGCAGGTACAGTAAAAAAAAAACTGGCAAGAATCTGTGGGATCTGGCTAAGGCGAAGACCAGGGATATTGGAAGTGTACAAATGGTCAGTGAGTTTCTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTGGTGATCTCGTCAAGTAGATATTGAGTTGCAAATACCTAGTACTAGTATCTGGGCTGTCTGAACACAACAATGTTGAACGATGATCACATGATATATTTCAGCTGATGTATAAATCAAGAGAATTATTCATGTATTCCGAACAAGGTCATATCAATACTATA]

[+] EMBL AK073809             [TAACTATTTAATCCCTTGGCTATGTTATTTTGGCAGCAGCCAACACCATCGCATGAGTCATTTGTAGGGGCTTTTGCGCAGACTGATGCACATGCTGTCGTATACTCTCCATTGTAGATGTATGAAAGAGTGTTGCAACCAATGACTACAAACTTATTGTGCAGATTAGAGAACCGGTATGGCCATGTTGAAAAGTCAAGTGACCATCGGCTAGATTCCATTGACTTTGTTACATCATTGTAGCAATATGTCGACAGGGCATTTAGTGCCCTAGTTTGACCATGGAGCAACGAAATATTTAGGACCTCAACATTAATAAGGAATGGTTTCATAGATCCATCAGCAGTCTTGTTGCAATAGATTACGAAGCCCGGTTCGATAGCACACTCTGTGCCAATGCCAAATGGGTATGGGATTTCCATATCACCGCAATGGGACTGGCATCCAGGAGCCGGCTGAGCTGATATAGATGATAGTTGTGCCATGATTGCAATACTGAGCAGTATCGCTGATGCCATATCAACTCTCTGAAAATGATGTTTGTAGAGAAATTTATTTATAAGTGGCGCTTAAAGGCAAGAAAATGAAACAGAGCAAACAAACTTAATGGCTTGTTAGTTCCAAAACTTCCAAAGCAGCATGTTGCCTATTAACCTTACAACTCACCAGTTCTTTTTACTTGGCATTAATGCCATTGATGCAATCTTCAATGCTCATGTTTGATCATTGATTTTTTTTCTCATTAAAATCATTAAGAATATAGCTACGCAAAAGTATTTTCATGATGAATCATAACATTTTTGCACATACTAGTGAGATAACTTTTAATATTTGACTGCAAGAATGTTATAAGGGAAAGCCATCTCTACCGAGAGCATTAGGTTCAGAATCTAGAGTAACGTGGCTTCAATGGTGATGAAGAGCTGCAACAACATGACCAGAAATTTTTCATGGTGTTCTCTAAAGCTAAACGAGTAAACTTTCAGTGGTATCAAACTATCTTTTACCAACTGTGGCATTTATTCCGAAAACCATGTGTTATGTACAACCATAGTTAGTTCATTTTGCATATAAGGCCAAACAACAATAGATATTCATATCTTGGTTGTCTGTCAGAAAAAGAAAATACAATAGTGAACAAATGTTTGCTTACTTTCATATTGTCTGTACTGAATCGTAGTTGTATGTCTTTTTTTTGGCAATTAATTACGGTCAGGGCCGCAAAATGGCTCTTACTGCAAATATCAATTCAAATTTAAATAATAACTGTTGTACAGGATTAATTATGGTGCACTAAGTTATTATTAAACAAAATTAACTGACAGTGAAACATTTATCCAATTTAATTGCTCTATTTTTTTTCTGATCCTTATCAAGTACTAGCATTGACAGTGAGTTGAATTAAGCAATCCTCTGTCTCTGCCTCAACTGCTATGGGATTAGGACAGTACTTGCCAAGTTTTGGCCATATACCATCAGTTTTCTTGGGTGCTACCTTTTGTTTTGTGGCAGGCTTAGCGCTACTTGGCAGTGTTCTAAAAATCACCATTAGAGGCGGCACCTCGGTGCCAAGCACCAGCTCAGCGCTGCGAATAGCACATTGGTCCACGTCAGCGCGATGGTCAACATCGGTCCACGTTGGCGCCTAGGTGCAGCAGCGATTAGTCAACTAGGCGGCTGACTGGTGGTGGTGGTGGTCTGGTTCTGGCGGCTGCTTGGATAGTTGGATGCATGTTGCTGCTGTGGTGTAAGTTGCCGATTTCAGCCTTTGGCATGTTGGCAACTATCAAACAAATGGTAGAATCAAATATTCAAATCCTAAACACATGTATTTTCTACAAGTTGGATGTTGGCATGCTGCAATTTGTTATGTTGTATACTTAACTCACTATCTAGGACCTGGTCAATTCTCCCTCCCAAGTTGGCTCTAGGCGCTACGCATCACCCTGGTGCCAGACTAGCGCCTAGCACCTTCTTGAACACTGCTACTTGGTCATGGTTTCATGGTCAGAGATGATCAGGTAATACGTTTCTTGTTTGTATAACTTGTATAGGAGTAATGTCACCTCCTGGGTTATCTTACAATGAACCTCATGGTTTAAGCGAACATTGTGGTTGTTCCTTGCAGGTACAGTAAAAAAAAAACTGGCAAGAATCTGTGGGATCTGGCTAAGGCGAAGACCAGGGATATTGGAAGTGTACAAATGGTCAGTGAGTTTCTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTGGTGATCTCGTCAAGTAGATATTGAGTTGCAAATACCTAGTACTAGTATCTGGGCTGTCTGAACACAACAATGTTGAACGATGATCACATGATATATTTCAGCTGATGTATAAATCAAGAGAATTATTCATGTATTCCGAACAAGGTCATATCAATACTATA]




>consensus_2299#0
TAACTATTTAATCCCTTGGCTATGTTATTTTGGCAGCAGCCAACACCATCGCATGAGTCA
TTTGTAGGGGCTTTTGCGCAGACTGATGCACATGCTGTCGTATACTCTCCATTGTAGATG
TATGAAAGAGTGTTGCAACCAATGACTACAAACTTATTGTGCAGATTAGAGAACCGGTAT
GGCCATGTTGAAAAGTCAAGTGACCATCGGCTAGATTCCATTGACTTTGTTACATCATTG
TAGCAATATGTCGACAGGGCATTTAGTGCCCTAGTTTGACCATGGAGCAACGAAATATTT
AGGACCTCAACATTAATAAGGAATGGTTTCATAGATCCATCAGCAGTCTTGTTGCAATAG
ATTACGAAGCCCGGTTCGATAGCACACTCTGTGCCAATGCCAAATGGGTATGGGATTTCC
ATATCACCGCAATGGGACTGGCATCCAGGAGCCGGCTGAGCTGATATAGATGATAGTTGT
GCCATGATTGCAATACTGAGCAGTATCGCTGATGCCATATCAACTCTCTGAAAATGATGT
TTGTAGAGAAATTTATTTATAAGTGGCGCTTAAAGGCAAGAAAATGAAACAGAGCAAACA
AACTTAATGGCTTGTTAGTTCCAAAACTTCCAAAGCAGCATGTTGCCTATTAACCTTACA
ACTCACCAGTTCTTTTTACTTGGCATTAATGCCATTGATGCAATCTTCAATGCTCATGTT
TGATCATTGATTTTTTTTCTCATTAAAATCATTAAGAATATAGCTACGCAAAAGTATTTT
CATGATGAATCATAACATTTTTGCACATACTAGTGAGATAACTTTTAATATTTGACTGCA
AGAATGTTATAAGGGAAAGCCATCTCTACCGAGAGCATTAGGTTCAGAATCTAGAGTAAC
GTGGCTTCAATGGTGATGAAGAGCTGCAACAACATGACCAGAAATTTTTCATGGTGTTCT
CTAAAGCTAAACGAGTAAACTTTCAGTGGTATCAAACTATCTTTTACCAACTGTGGCATT
TATTCCGAAAACCATGTGTTATGTACAACCATAGTTAGTTCATTTTGCATATAAGGCCAA
ACAACAATAGATATTCATATCTTGGTTGTCTGTCAGAAAAAGAAAATACAATAGTGAACA
AATGTTTGCTTACTTTCATATTGTCTGTACTGAATCGTAGTTGTATGTCTTTTTTTTGGC
AATTAATTACGGTCAGGGCCGCAAAATGGCTCTTACTGCAAATATCAATTCAAATTTAAA
TAATAACTGTTGTACAGGATTAATTATGGTGCACTAAGTTATTATTAAACAAAATTAACT
GACAGTGAAACATTTATCCAATTTAATTGCTCTATTTTTTTTCTGATCCTTATCAAGTAC
TAGCATTGACAGTGAGTTGAATTAAGCAATCCTCTGTCTCTGCCTCAACTGCTATGGGAT
TAGGACAGTACTTGCCAAGTTTTGGCCATATACCATCAGTTTTCTTGGGTGCTACCTTTT
GTTTTGTGGCAGGCTTAGCGCTACTTGGCAGTGTTCTAAAAATCACCATTAGAGGCGGCA
CCTCGGTGCCAAGCACCAGCTCAGCGCTGCGAATAGCACATTGGTCCACGTCAGCGCGAT
GGTCAACATCGGTCCACGTTGGCGCCTAGGTGCAGCAGCGATTAGTCAACTAGGCGGCTG
ACTGGTGGTGGTGGTGGTCTGGTTCTGGCGGCTGCTTGGATAGTTGGATGCATGTTGCTG
CTGTGGTGTAAGTTGCCGATTTCAGCCTTTGGCATGTTGGCAACTATCAAACAAATGGTA
GAATCAAATATTCAAATCCTAAACACATGTATTTTCTACAAGTTGGATGTTGGCATGCTG
CAATTTGTTATGTTGTATACTTAACTCACTATCTAGGACCTGGTCAATTCTCCCTCCCAA
GTTGGCTCTAGGCGCTACGCATCACCCTGGTGCCAGACTAGCGCCTAGCACCTTCTTGAA
CACTGCTACTTGGTCATGGTTTCATGGTCAGAGATGATCAGGTAATACGTTTCTTGTTTG
TATAACTTGTATAGGAGTAATGTCACCTCCTGGGTTATCTTACAATGAACCTCATGGTTT
AAGCGAACATTGTGGTTGTTCCTTGCAGGTACAGTAAAAAAAAAACTGGCAAGAATCTGT
GGGATCTGGCTAAGGCGAAGACCAGGGATATTGGAAGTGTACAAATGGTCAGTGAGTTTC
TTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTGGTGATCTCGTCAAGTAGATATTGAGTTGCAAATA
CCTAGTACTAGTATCTGGGCTGTCTGAACACAACAATGTTGAACGATGATCACATGATAT
ATTTCAGCTGATGTATAAATCAAGAGAATTATTCATGTATTCCGAACAAGGTCATATCAA
TACTATA

consensusID : consensus_2299#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
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                              [CTCTGAAAATGATGTTTGTAGAGAAATTTATTTATAAGTGGCGCTTAAAGGCAAGAAAATGAAACAGAGCAAACAAACTTAATGGCTTGTTAGTTCCAAAACTTCCAAAGCAGCATGTTGCCTATTAACCTTACAACTCACCAGTTCTTTTTACTTGGCATTAATGCCATTGATGCAATCTTCAATGCTCATGTTTGATCATTGATTTTTTTTCTCATTAAAATCATTAAGAATATAGCTACGCAAAAGTATTTTCATGATGAATCATAACATTTTTGCACATACTAGTGAGATAACTTTTAATATTTGACTGCAAGAATGTTATAAGGGAAAGCCATCTCTACCGAGAGCATTAGGTTCAGAATCTAGAGTAACGTGGCTTCAATGGTGATGAAGAGCTGCAACAACATGACCAGAAATTTTTCATGGTGTTTTCTCTAAAGCTAAACGAGTAAACTTTCAGTGGTATCAAACTATCTTTTACCAACTGTGGCATTTATTCCGAAAACCATGTGTTATGTACAACCATAGTTAGTTCATTTTGCATATAAGGCCAAACAACAATAGATATTCATATCTTGGTTGTCTGTCAGAAAAAGAAAATACAATAGTGAACAAATGTTTGCTTACTTTCATATTGTCTGTACTGAATCGTAGTTGTATGTCTTTTTTTTGGCAATTAATTACGGTCAAGGGCCGCAAAATGGCTCTTACTGCAAATATCAATTCAAATTTAAATAATAACTGTTGTACAGGATTAATTATGGTGCACTAAGTTATTATTAAACAAAATTAACTGACAGTGAAACATTTATCCAATTTAATTGCTCTATTTTTTTTCTGATCCTTATCAAGTACTAGCATTGACAGTGAGTTGAATTAAGCAATCCTCTGTCTCTGCCTCAACTGCTATGGGATTAGGACAGTACTTGCCAAGTTTTGGCCATATACCATCAGTTTTCTTGGGTGCTACCTTTTGTTTTGTGGCAGGCTTAGCGCTACTTGGCAGTGTTCTAAAAATCACCATTAGAGGCGGCACCTCGGTGCCAAGCACCAGCTCAGCGCTGCGAATAGCACATTGGTCCACGTCAGCGCGATGGTCAACATCGGTCCACGTTGGCGCCTAGGTGCAGCAGCGATTAGTCAACTAGGCGGCTGACTGGTGGTGGTGGTGGTCTGGTTCTGGCGGCTGCTTGGATAGTTGGATGCATGTTGCTGCTGTGGTGTAAGTTGCCGATTTCAGCCTTTGGCATGTTGGCAACTATCAAACAAATGGTAGAATCAAATATTCAAATCCTAAACACATGTATTTTCTACAAGTTGGATGTTGGCATGCTGCAATTTGTTATGTTGTATACTTAACTCACTATCTAGGACCTGGTCAATTCTCCCTCCCAAGTTGGCTCTAGGCGCTACGCATCACCCTGGTGCCAGACTAGCGCCTAGCACCTTCTTGAACACTGCTACTTGGTCATGGTTTCATGGTCAGAGATGATCAGGTACAGTAAAAAAAAAACTGGCAAGAATCTGTGGGATCTGGCTAAGGCGAAGACCAGGGATATTGGAAGTGTACAAATGGTCAGTGAGTTTCTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTGTGGTGATCTCGTCAAGTAGATATTGAGTTGCAAATACCTAGTACTAGTATCTGGGCTGTCTGAACACAACAATGTTGAACGATGATCACATGATATATTTCAGCTGATGTATAAATCAAGAGAATTATTCATGTATTCCGAACAAGGTCATATCAATACTATATTACAGTACGATC]

[+] EMBL AK064031             [CTCTGAAAATGATGTTTGTAGAGAAATTTATTTATAAGTGGCGCTTAAAGGCAAGAAAATGAAACAGAGCAAACAAACTTAATGGCTTGTTAGTTCCAAAACTTCCAAAGCAGCATGTTGCCTATTAACCTTACAACTCACCAGTTCTTTTTACTTGGCATTAATGCCATTGATGCAATCTTCAATGCTCATGTTTGATCATTGATTTTTTTTCTCATTAAAATCATTAAGAATATAGCTACGCAAAAGTATTTTCATGATGAATCATAACATTTTTGCACATACTAGTGAGATAACTTTTAATATTTGACTGCAAGAATGTTATAAGGGAAAGCCATCTCTACCGAGAGCATTAGGTTCAGAATCTAGAGTAACGTGGCTTCAATGGTGATGAAGAGCTGCAACAACATGACCAGAAATTTTTCATGGTGTTTTCTCTAAAGCTAAACGAGTAAACTTTCAGTGGTATCAAACTATCTTTTACCAACTGTGGCATTTATTCCGAAAACCATGTGTTATGTACAACCATAGTTAGTTCATTTTGCATATAAGGCCAAACAACAATAGATATTCATATCTTGGTTGTCTGTCAGAAAAAGAAAATACAATAGTGAACAAATGTTTGCTTACTTTCATATTGTCTGTACTGAATCGTAGTTGTATGTCTTTTTTTTGGCAATTAATTACGGTCAAGGGCCGCAAAATGGCTCTTACTGCAAATATCAATTCAAATTTAAATAATAACTGTTGTACAGGATTAATTATGGTGCACTAAGTTATTATTAAACAAAATTAACTGACAGTGAAACATTTATCCAATTTAATTGCTCTATTTTTTTTCTGATCCTTATCAAGTACTAGCATTGACAGTGAGTTGAATTAAGCAATCCTCTGTCTCTGCCTCAACTGCTATGGGATTAGGACAGTACTTGCCAAGTTTTGGCCATATACCATCAGTTTTCTTGGGTGCTACCTTTTGTTTTGTGGCAGGCTTAGCGCTACTTGGCAGTGTTCTAAAAATCACCATTAGAGGCGGCACCTCGGTGCCAAGCACCAGCTCAGCGCTGCGAATAGCACATTGGTCCACGTCAGCGCGATGGTCAACATCGGTCCACGTTGGCGCCTAGGTGCAGCAGCGATTAGTCAACTAGGCGGCTGACTGGTGGTGGTGGTGGTCTGGTTCTGGCGGCTGCTTGGATAGTTGGATGCATGTTGCTGCTGTGGTGTAAGTTGCCGATTTCAGCCTTTGGCATGTTGGCAACTATCAAACAAATGGTAGAATCAAATATTCAAATCCTAAACACATGTATTTTCTACAAGTTGGATGTTGGCATGCTGCAATTTGTTATGTTGTATACTTAACTCACTATCTAGGACCTGGTCAATTCTCCCTCCCAAGTTGGCTCTAGGCGCTACGCATCACCCTGGTGCCAGACTAGCGCCTAGCACCTTCTTGAACACTGCTACTTGGTCATGGTTTCATGGTCAGAGATGATCAGGTACAGTAAAAAAAAAACTGGCAAGAATCTGTGGGATCTGGCTAAGGCGAAGACCAGGGATATTGGAAGTGTACAAATGGTCAGTGAGTTTCTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTGTGGTGATCTCGTCAAGTAGATATTGAGTTGCAAATACCTAGTACTAGTATCTGGGCTGTCTGAACACAACAATGTTGAACGATGATCACATGATATATTTCAGCTGATGTATAAATCAAGAGAATTATTCATGTATTCCGAACAAGGTCATATCAATACTATATTACAGTACGATC]




>consensus_2299#1
CTCTGAAAATGATGTTTGTAGAGAAATTTATTTATAAGTGGCGCTTAAAGGCAAGAAAAT
GAAACAGAGCAAACAAACTTAATGGCTTGTTAGTTCCAAAACTTCCAAAGCAGCATGTTG
CCTATTAACCTTACAACTCACCAGTTCTTTTTACTTGGCATTAATGCCATTGATGCAATC
TTCAATGCTCATGTTTGATCATTGATTTTTTTTCTCATTAAAATCATTAAGAATATAGCT
ACGCAAAAGTATTTTCATGATGAATCATAACATTTTTGCACATACTAGTGAGATAACTTT
TAATATTTGACTGCAAGAATGTTATAAGGGAAAGCCATCTCTACCGAGAGCATTAGGTTC
AGAATCTAGAGTAACGTGGCTTCAATGGTGATGAAGAGCTGCAACAACATGACCAGAAAT
TTTTCATGGTGTTTTCTCTAAAGCTAAACGAGTAAACTTTCAGTGGTATCAAACTATCTT
TTACCAACTGTGGCATTTATTCCGAAAACCATGTGTTATGTACAACCATAGTTAGTTCAT
TTTGCATATAAGGCCAAACAACAATAGATATTCATATCTTGGTTGTCTGTCAGAAAAAGA
AAATACAATAGTGAACAAATGTTTGCTTACTTTCATATTGTCTGTACTGAATCGTAGTTG
TATGTCTTTTTTTTGGCAATTAATTACGGTCAAGGGCCGCAAAATGGCTCTTACTGCAAA
TATCAATTCAAATTTAAATAATAACTGTTGTACAGGATTAATTATGGTGCACTAAGTTAT
TATTAAACAAAATTAACTGACAGTGAAACATTTATCCAATTTAATTGCTCTATTTTTTTT
CTGATCCTTATCAAGTACTAGCATTGACAGTGAGTTGAATTAAGCAATCCTCTGTCTCTG
CCTCAACTGCTATGGGATTAGGACAGTACTTGCCAAGTTTTGGCCATATACCATCAGTTT
TCTTGGGTGCTACCTTTTGTTTTGTGGCAGGCTTAGCGCTACTTGGCAGTGTTCTAAAAA
TCACCATTAGAGGCGGCACCTCGGTGCCAAGCACCAGCTCAGCGCTGCGAATAGCACATT
GGTCCACGTCAGCGCGATGGTCAACATCGGTCCACGTTGGCGCCTAGGTGCAGCAGCGAT
TAGTCAACTAGGCGGCTGACTGGTGGTGGTGGTGGTCTGGTTCTGGCGGCTGCTTGGATA
GTTGGATGCATGTTGCTGCTGTGGTGTAAGTTGCCGATTTCAGCCTTTGGCATGTTGGCA
ACTATCAAACAAATGGTAGAATCAAATATTCAAATCCTAAACACATGTATTTTCTACAAG
TTGGATGTTGGCATGCTGCAATTTGTTATGTTGTATACTTAACTCACTATCTAGGACCTG
GTCAATTCTCCCTCCCAAGTTGGCTCTAGGCGCTACGCATCACCCTGGTGCCAGACTAGC
GCCTAGCACCTTCTTGAACACTGCTACTTGGTCATGGTTTCATGGTCAGAGATGATCAGG
TACAGTAAAAAAAAAACTGGCAAGAATCTGTGGGATCTGGCTAAGGCGAAGACCAGGGAT
ATTGGAAGTGTACAAATGGTCAGTGAGTTTCTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTGTGGTGA
TCTCGTCAAGTAGATATTGAGTTGCAAATACCTAGTACTAGTATCTGGGCTGTCTGAACA
CAACAATGTTGAACGATGATCACATGATATATTTCAGCTGATGTATAAATCAAGAGAATT
ATTCATGTATTCCGAACAAGGTCATATCAATACTATATTACAGTACGATC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_2299#0      TAACTATTTAATCCCTTGGCTATGTTATTTTGGCAGCAGCCAACACCATCGCATGAGTCA 60
consensus_2299#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2299#0      TTTGTAGGGGCTTTTGCGCAGACTGATGCACATGCTGTCGTATACTCTCCATTGTAGATG 120
consensus_2299#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2299#0      TATGAAAGAGTGTTGCAACCAATGACTACAAACTTATTGTGCAGATTAGAGAACCGGTAT 180
consensus_2299#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2299#0      GGCCATGTTGAAAAGTCAAGTGACCATCGGCTAGATTCCATTGACTTTGTTACATCATTG 240
consensus_2299#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2299#0      TAGCAATATGTCGACAGGGCATTTAGTGCCCTAGTTTGACCATGGAGCAACGAAATATTT 300
consensus_2299#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2299#0      AGGACCTCAACATTAATAAGGAATGGTTTCATAGATCCATCAGCAGTCTTGTTGCAATAG 360
consensus_2299#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2299#0      ATTACGAAGCCCGGTTCGATAGCACACTCTGTGCCAATGCCAAATGGGTATGGGATTTCC 420
consensus_2299#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2299#0      ATATCACCGCAATGGGACTGGCATCCAGGAGCCGGCTGAGCTGATATAGATGATAGTTGT 480
consensus_2299#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2299#0      GCCATGATTGCAATACTGAGCAGTATCGCTGATGCCATATCAACTCTCTGAAAATGATGT 540
consensus_2299#1      ---------------------------------------------CTCTGAAAATGATGT 15
                                                                   ***************

consensus_2299#0      TTGTAGAGAAATTTATTTATAAGTGGCGCTTAAAGGCAAGAAAATGAAACAGAGCAAACA 600
consensus_2299#1      TTGTAGAGAAATTTATTTATAAGTGGCGCTTAAAGGCAAGAAAATGAAACAGAGCAAACA 75
                      ************************************************************

consensus_2299#0      AACTTAATGGCTTGTTAGTTCCAAAACTTCCAAAGCAGCATGTTGCCTATTAACCTTACA 660
consensus_2299#1      AACTTAATGGCTTGTTAGTTCCAAAACTTCCAAAGCAGCATGTTGCCTATTAACCTTACA 135
                      ************************************************************

consensus_2299#0      ACTCACCAGTTCTTTTTACTTGGCATTAATGCCATTGATGCAATCTTCAATGCTCATGTT 720
consensus_2299#1      ACTCACCAGTTCTTTTTACTTGGCATTAATGCCATTGATGCAATCTTCAATGCTCATGTT 195
                      ************************************************************

consensus_2299#0      TGATCATTGATTTTTTTTCTCATTAAAATCATTAAGAATATAGCTACGCAAAAGTATTTT 780
consensus_2299#1      TGATCATTGATTTTTTTTCTCATTAAAATCATTAAGAATATAGCTACGCAAAAGTATTTT 255
                      ************************************************************

consensus_2299#0      CATGATGAATCATAACATTTTTGCACATACTAGTGAGATAACTTTTAATATTTGACTGCA 840
consensus_2299#1      CATGATGAATCATAACATTTTTGCACATACTAGTGAGATAACTTTTAATATTTGACTGCA 315
                      ************************************************************

consensus_2299#0      AGAATGTTATAAGGGAAAGCCATCTCTACCGAGAGCATTAGGTTCAGAATCTAGAGTAAC 900
consensus_2299#1      AGAATGTTATAAGGGAAAGCCATCTCTACCGAGAGCATTAGGTTCAGAATCTAGAGTAAC 375
                      ************************************************************

consensus_2299#0      GTGGCTTCAATGGTGATGAAGAGCTGCAACAACATGACCAGAAATTTTTCATGGTGTT-- 958
consensus_2299#1      GTGGCTTCAATGGTGATGAAGAGCTGCAACAACATGACCAGAAATTTTTCATGGTGTTTT 435
                      **********************************************************  

consensus_2299#0      CTCTAAAGCTAAACGAGTAAACTTTCAGTGGTATCAAACTATCTTTTACCAACTGTGGCA 1018
consensus_2299#1      CTCTAAAGCTAAACGAGTAAACTTTCAGTGGTATCAAACTATCTTTTACCAACTGTGGCA 495
                      ************************************************************

consensus_2299#0      TTTATTCCGAAAACCATGTGTTATGTACAACCATAGTTAGTTCATTTTGCATATAAGGCC 1078
consensus_2299#1      TTTATTCCGAAAACCATGTGTTATGTACAACCATAGTTAGTTCATTTTGCATATAAGGCC 555
                      ************************************************************

consensus_2299#0      AAACAACAATAGATATTCATATCTTGGTTGTCTGTCAGAAAAAGAAAATACAATAGTGAA 1138
consensus_2299#1      AAACAACAATAGATATTCATATCTTGGTTGTCTGTCAGAAAAAGAAAATACAATAGTGAA 615
                      ************************************************************

consensus_2299#0      CAAATGTTTGCTTACTTTCATATTGTCTGTACTGAATCGTAGTTGTATGTCTTTTTTTTG 1198
consensus_2299#1      CAAATGTTTGCTTACTTTCATATTGTCTGTACTGAATCGTAGTTGTATGTCTTTTTTTTG 675
                      ************************************************************

consensus_2299#0      GCAATTAATTACGGTCA-GGGCCGCAAAATGGCTCTTACTGCAAATATCAATTCAAATTT 1257
consensus_2299#1      GCAATTAATTACGGTCAAGGGCCGCAAAATGGCTCTTACTGCAAATATCAATTCAAATTT 735
                      ***************** ******************************************

consensus_2299#0      AAATAATAACTGTTGTACAGGATTAATTATGGTGCACTAAGTTATTATTAAACAAAATTA 1317
consensus_2299#1      AAATAATAACTGTTGTACAGGATTAATTATGGTGCACTAAGTTATTATTAAACAAAATTA 795
                      ************************************************************

consensus_2299#0      ACTGACAGTGAAACATTTATCCAATTTAATTGCTCTATTTTTTTTCTGATCCTTATCAAG 1377
consensus_2299#1      ACTGACAGTGAAACATTTATCCAATTTAATTGCTCTATTTTTTTTCTGATCCTTATCAAG 855
                      ************************************************************

consensus_2299#0      TACTAGCATTGACAGTGAGTTGAATTAAGCAATCCTCTGTCTCTGCCTCAACTGCTATGG 1437
consensus_2299#1      TACTAGCATTGACAGTGAGTTGAATTAAGCAATCCTCTGTCTCTGCCTCAACTGCTATGG 915
                      ************************************************************

consensus_2299#0      GATTAGGACAGTACTTGCCAAGTTTTGGCCATATACCATCAGTTTTCTTGGGTGCTACCT 1497
consensus_2299#1      GATTAGGACAGTACTTGCCAAGTTTTGGCCATATACCATCAGTTTTCTTGGGTGCTACCT 975
                      ************************************************************

consensus_2299#0      TTTGTTTTGTGGCAGGCTTAGCGCTACTTGGCAGTGTTCTAAAAATCACCATTAGAGGCG 1557
consensus_2299#1      TTTGTTTTGTGGCAGGCTTAGCGCTACTTGGCAGTGTTCTAAAAATCACCATTAGAGGCG 1035
                      ************************************************************

consensus_2299#0      GCACCTCGGTGCCAAGCACCAGCTCAGCGCTGCGAATAGCACATTGGTCCACGTCAGCGC 1617
consensus_2299#1      GCACCTCGGTGCCAAGCACCAGCTCAGCGCTGCGAATAGCACATTGGTCCACGTCAGCGC 1095
                      ************************************************************

consensus_2299#0      GATGGTCAACATCGGTCCACGTTGGCGCCTAGGTGCAGCAGCGATTAGTCAACTAGGCGG 1677
consensus_2299#1      GATGGTCAACATCGGTCCACGTTGGCGCCTAGGTGCAGCAGCGATTAGTCAACTAGGCGG 1155
                      ************************************************************

consensus_2299#0      CTGACTGGTGGTGGTGGTGGTCTGGTTCTGGCGGCTGCTTGGATAGTTGGATGCATGTTG 1737
consensus_2299#1      CTGACTGGTGGTGGTGGTGGTCTGGTTCTGGCGGCTGCTTGGATAGTTGGATGCATGTTG 1215
                      ************************************************************

consensus_2299#0      CTGCTGTGGTGTAAGTTGCCGATTTCAGCCTTTGGCATGTTGGCAACTATCAAACAAATG 1797
consensus_2299#1      CTGCTGTGGTGTAAGTTGCCGATTTCAGCCTTTGGCATGTTGGCAACTATCAAACAAATG 1275
                      ************************************************************

consensus_2299#0      GTAGAATCAAATATTCAAATCCTAAACACATGTATTTTCTACAAGTTGGATGTTGGCATG 1857
consensus_2299#1      GTAGAATCAAATATTCAAATCCTAAACACATGTATTTTCTACAAGTTGGATGTTGGCATG 1335
                      ************************************************************

consensus_2299#0      CTGCAATTTGTTATGTTGTATACTTAACTCACTATCTAGGACCTGGTCAATTCTCCCTCC 1917
consensus_2299#1      CTGCAATTTGTTATGTTGTATACTTAACTCACTATCTAGGACCTGGTCAATTCTCCCTCC 1395
                      ************************************************************

consensus_2299#0      CAAGTTGGCTCTAGGCGCTACGCATCACCCTGGTGCCAGACTAGCGCCTAGCACCTTCTT 1977
consensus_2299#1      CAAGTTGGCTCTAGGCGCTACGCATCACCCTGGTGCCAGACTAGCGCCTAGCACCTTCTT 1455
                      ************************************************************

consensus_2299#0      GAACACTGCTACTTGGTCATGGTTTCATGGTCAGAGATGATCAGGTAATACGTTTCTTGT 2037
consensus_2299#1      GAACACTGCTACTTGGTCATGGTTTCATGGTCAGAGATGATCAGGTA------------- 1502
                      ***********************************************             

consensus_2299#0      TTGTATAACTTGTATAGGAGTAATGTCACCTCCTGGGTTATCTTACAATGAACCTCATGG 2097
consensus_2299#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2299#0      TTTAAGCGAACATTGTGGTTGTTCCTTGCAGGTACAGTAAAAAAAAAACTGGCAAGAATC 2157
consensus_2299#1      ----------------------------------CAGTAAAAAAAAAACTGGCAAGAATC 1528
                                                        **************************

consensus_2299#0      TGTGGGATCTGGCTAAGGCGAAGACCAGGGATATTGGAAGTGTACAAATGGTCAGTGAGT 2217
consensus_2299#1      TGTGGGATCTGGCTAAGGCGAAGACCAGGGATATTGGAAGTGTACAAATGGTCAGTGAGT 1588
                      ************************************************************

consensus_2299#0      TTCTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTGGTGATCTCGTCAAGTAGATATTGAGTTGCAA 2277
consensus_2299#1      TTCTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTT-GTGGTGATCTCGTCAAGTAGATATTGAGTTGCAA 1647
                      ************************* **********************************

consensus_2299#0      ATACCTAGTACTAGTATCTGGGCTGTCTGAACACAACAATGTTGAACGATGATCACATGA 2337
consensus_2299#1      ATACCTAGTACTAGTATCTGGGCTGTCTGAACACAACAATGTTGAACGATGATCACATGA 1707
                      ************************************************************

consensus_2299#0      TATATTTCAGCTGATGTATAAATCAAGAGAATTATTCATGTATTCCGAACAAGGTCATAT 2397
consensus_2299#1      TATATTTCAGCTGATGTATAAATCAAGAGAATTATTCATGTATTCCGAACAAGGTCATAT 1767
                      ************************************************************

consensus_2299#0      CAATACTATA------------- 2407
consensus_2299#1      CAATACTATATTACAGTACGATC 1790
                      **********


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)