|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9435#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1501 fasta sequence
[ACTTTAATGAACCATTGTCTTCTCTTCAAAAGTGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCCAATTTACTGGATCGTGCATATGAATATGGTTCAAGGGGAAACGGGCTGATGAGAATTCTTTATGTTGCTGCATTTGCTGTCTCTGGATATGCTTCCACGGATTCTCGCCCCTGCAAACCTTTCAATCCATTGTTGGGGGAAACATACGAAGCTGATTATCCTGAAAAAGGGATCCGTTTCTTCTCTGAAAAGGTTAGTCATCATCCGATGGTCATGGCATGCCATTGTGAAGGGAAAGGTTGGAAATTTTGGGGTGACAGCAATCTAAAGAGCAAATTTTGGGGGCAGTCCATTCAACTCGACCTAGCGGTGTGCTAACTCTACAGTTTGATGATGGAGAAACTTTCCAGTGGAGTAAGGTTACGACAACAATTAATAACCTTATCATTGGCCGAGTCTATTGCCATCACCATGGCACGATGAACATAAGTGGAAACAGGCAATATTCATGTAAGCTGACTTTCAAAGAGCAATCCTTCCTCGATCGTAATCCTCGCCAGGTTCAAGGACTTGTTACGGATGCTAATGGGACCAAAGTTGCATTCTTGATGGGAAAGTGGGACGAGAGCATGTCTTGCATCATTGGTGATGATGCTTCTAAAGTGAACTCCCGTAATGCAAATCAGAGTACGGGTGCCACTTTATTGTGGGAGAAAAATGTGCCTCCAGCCAATCCCACTCGATATAACCTGTCATCATTTGCAATCACTTTGAACGAGTTGACACCAGGTCTTAAGGAGAAGCTTCCACCAACGGATTCAAGACTCAGGCCAGATCAGCGGCATCTAGAGAATGGGGAGTACGAAAAGGCTAACTCTGAAAAATTGCGCCTGGAGACGAGGCAGAGGATGGCAAGGAAGATGCAGGAGAGTGGTTGGAAGCCAAGATGGTTCCAAAGGGACACAGAGGATGGAACATTCCGTTATGTCGGA-GGTTACTGGGAGGCAAGGGAGCAGAGGAAATGGGTTGGTTGC-AATGACATATTCGGCAATAATGTGTCCACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTGTTTAGTAGTCGTTGACACCCCATTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA-CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTTTTTGACCTCTGTGCCAAGCCAGGCGAGTAATCTTGTCCTGTATAGAAATGCCAAATTAATATATTCAATTTCCTGTTAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AK071048 [ACTTTAATGAACCATTGTCTTCTCTTCAAAAGTGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCCAATTTACTGGATCGTGCATATGAATATGGTTCAAGGGGAAACGGGCTGATGAGAATTCTTTATGTTGCTGCATTTGCTGTCTCTGGATATGCTTCCACGGATTCTCGCCCCTGCAAACCTTTCAATCCATTGTTGGGGGAAACATACGAAGCTGATTATCCTGAAAAAGGGATCCGTTTCTTCTCTGAAAAGGTTAGTCATCATCCGATGGTCATGGCATGCCATTGTGAAGGGAAAGGTTGGAAATTTTGGGGTGACAGCAATCTAAAGAGCAAATTTTGGGGGCAGTCCATTCAACTCGACCTAGCGGTGTGCTAACTCTACAGTTTGATGATGGAGAAACTTTCCAGTGGAGTAAGGTTACGACAACAATTAATAACCTTATCATTGGCCGAGTCTATTGCCATCACCATGGCACGATGAACATAAGTGGAAACAGGCAATATTCATGTAAGCTGACTTTCAAAGAGCAATCCTTCCTCGATCGTAATCCTCGCCAGGTTCAAGGACTTGTTACGGATGCTAATGGGACCAAAGTTGCATTCTTGATGGGAAAGTGGGACGAGAGCATGTCTTGCATCATTGGTGATGATGCTTCTAAAGTGAACTCCCGTAATGCAAATCAGAGTACGGGTGCCACTTTATTGTGGGAGAAAAATGTGCCTCCAGCCAATCCCACTCGATATAACCTGTCATCATTTGCAATCACTTTGAACGAGTTGACACCAGGTCTTAAGGAGAAGCTTCCACCAACGGATTCAAGACTCAGGCCAGATCAGCGGCATCTAGAGAATGGGGAGTACGAAAAGGCTAACTCTGAAAAATTGCGCCTGGAGACGAGGCAGAGGATGGCAAGGAAGATGCAGGAGAGTGGTTGGAAGCCAAGATGGTTCCAAAGGGACACAGAGGATGGAACATTCCGTTATGTCGGA GGTTACTGGGAGGCAAGGGAGCAGAGGAAATGGGTTGGTTGC AATGACATATTCGGCAATAATGTGTCCACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTGTTTAGTAGTCGTTGACACCCCATTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTTTTTGACCTCTGTGCCAAGCCAGGCGAGTAATCTTGTCCTGTATAGAAATGCCAAATTAATATATTCA ]
[+] EMBL CA765121 [ GAAGATGCAGGAGAGTGGTTGGAAGCCAAGATGGTTCCAAAGGGACACAGAGGATGGAACATTCCGTTATGTCGGA GGTTACTGGGAGGCAAGGGAGCAGAGGAAATGGGTTGGTTGC AATGACATATTCGGCAATAATGTGTCCACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTGTTTAGTAGTCGTTGACACCCCATTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTC ]
[+] EMBL BI804892 [ ATCCA GAGA TTGTT GAAACCAAGATGGTTCCAAAGGGACACAGAGGATGGAACATTCCGTTATGTCGGA G TACT GGA GCAA GGA CAGAGGAAAT GGTTGGTTGC AATGACATATTC GCAATAATGTGTCCACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTGTTTAGTAGTCGTTGACACCCCATTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACACCTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTTTTTGACCTCTGTGCCAAGCCAGGCGAGTAATCTTGTCCTGTATAGAAATGCCAAATTAATATATTCAATTTCCTGTTAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI807265 [ GAGGATGGAACATTCCGTTATGTCGGA GGTTACTGGGA GCAAGGGAGCAGAGGAAATGGGTT GTT C AATGACATATTCGGCAATAATGTGTCCACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTGTTTAGTAGTCGTTGACACCCC TTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTTTTTaaaaaa ]
[-] EMBL AU063435 [ GTCGGAGGGTTACTGGGAGGCAAGGNAGCAGAGGAAAT GGNTGGTTGCAAATGACATATTCGGCAATAATGTGTCNACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGANACTTCTGTTTAGTAGTCG TGACACCCCATTAATTATTGAANACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTTTTaaaaanacg ]
[-] EMBL C97667 [ nTGG TGC ATGACATATTCGGCAATAATGTGCCNACTC TTGGACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTG TTAGTAGTCG TGACACCCCATTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||