cluster # 6226

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Schistosoma mansoni
cluster # 6226 cluster # 6226 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6226#0 length = 710 sequences # 4

consensusID : consensus_6226#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 710
fasta sequence

                              [GATAAATATGGCTTGACTCCACTATATTATAATATACTTTATGATCCGGATACAAAAATATGCCATAGCTTACTGTATGAACATTCAAAAATCGGCATCAGTGATAAAGATGGTTTACAAGAAATACACCAGGCTACACGTTTAAATCGCGTTGAGCAAATAAATTTATTGTTAATGTATGGAGCTGATGTAAATGCACGATGTAAACGTCCAAAAGAAACTGTTAAAAACAACTTAACTCTTTCTATACGTCCACAGTCAGTCGATGGTGATACACCATTACATGTTGCAGCAAATCACAATCAGCGTGCAGCTGTTCTACGTTTGTTATCTTGGGGAGCTGATCCAACCCTAGTCAATGCTGAAAGTATGACACCTATACAAGTAGCACAGAATAATGGAAATTTAGAATTA-GCTGATTTAATTAAGTTATTTAGAGGTAGAAAAGAATCTAGTGATATATTCCTTCCAACACCCACGTATAATCCCCATAGACGTGTGAGACAACCTCCACCAAATTCTTACATTACTGAACCATCAATTTTACAAAATTATACTCCGAATGATATAAATGAAATTCACTTAAATGATCAGCAGTTAAATAGCACTAACAACAATACTAACGATTTATTAAGAGACTCAAATAAAGGTTCAACTAATTTTAATATCACTGAAAAAAGTGCTACGTGTACATGTTCGTATACGACAAC]

[+] EMBL CD187463             [GATAAATATGGCTTGACTCCACTATATTATAATATACTTTATGATCCGGATACAAAAATATGCCATAGCTTACTGTATGAACATTCAAAAATCGGCATCAGTGATAAAGATGGTTTACAAGAAATACACCAGGCTACACGTTTAAATCGCGTTGAGCAAATNAATTTATTGTTAATGTATGGAGCTGATGTAAATGCACGATGTAAACGTCCAAAAGAAACTGTTAAAAACAACTTAACTCTTTCTATACGTCCACAGTCAGTCGATGGTGATACACCATTACATGTTGCAGCAAATCACAACCAGCGTGCAGCTGTTCTACGTTTGTTATCTTGGGGAGCTGATCCAACCCTAGTCAATGCTGAAAGTATGACACCTATTCCAGTAGCACAGAATTATGGAAATTTAGAACTAGGCTGA TTAATTAAGTTA TTAGAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD122388             [                                                                        CTGTATGAACATTCAAAAATCGGCATCAGTGATAAAGATGGTTTACAAGAAATACACCAGGTTACACGTTTAAATCGCGTTGAGCAAATAAATTTATTGTTAATGTATGGAGCTGATGTAAATGCACGATGTAAACGTCCAAAAGAAACTGTTAAAAACAACTTAACTCTTTCTATACGTCCACAGTCAGTCGATGGTGATACACCATTACATGTTGCAGCAAATCACAATCAGCGTGCAGCTGTTTTACGTTTGTTATCTTGGGGAGCTGATCCAACCCTAGTCAATGCTGAAAGTATGACACCTATACAAGTAGCACAGAATAATGGAAATTTAGAATTA GCTGATTTAATTAAGTTATTTAGAGGTAGAAAAGAATCTAG                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD117241             [                                                                                                                  TTACAAGAAATACACCAGGCTACACGTTTAAATCGCGTTGAGCAAATAAATTTATTGTTAATGTATGGAACTGATGTAAATGCACGATGTAAACGTCCAAAAGAAACTGTTAAAAACAACTTAACTCTTTCTATACGTCCACAGTCAGTCGATGGTGATACACCATTACATGTTGCAGCAAATCACAATCAGTGTGCAGCTGTTCTACGTTTGTTATCTTGGGGAGCTGATCCAACCCTAGTCAATGCTGAAAATATGACACCTATACAAGTAGCACAGAATAATGGAAATTTAGAATTA GCTGATTTAATTAAGTTATTTAGAGGTAGAAAAGAATCTAGTGATATATTCCTTCCAACACCCACGTATAATCCCCATAGACGTGTGA                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD119313             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATA TCCTTCCAACACCCACGTATAATCCCCATAGACGTGTGAGACAACCTCCACCAAATTCTTACATTACTGAACCATCAATTTTACAAAATTATACTCCGAATGATATAAATGAAATTCACTTAAATGATCAGCAGTTAAATAGCACTAACAACAATACTAACGATTTATTAAGAGACTCAAATAAAGGTTCAACTAATTTTAATATCACTGAAAAAAGTGCTACGTGTACATGTTCGTATACGACAAC]




>consensus_6226#0
GATAAATATGGCTTGACTCCACTATATTATAATATACTTTATGATCCGGATACAAAAATA
TGCCATAGCTTACTGTATGAACATTCAAAAATCGGCATCAGTGATAAAGATGGTTTACAA
GAAATACACCAGGCTACACGTTTAAATCGCGTTGAGCAAATAAATTTATTGTTAATGTAT
GGAGCTGATGTAAATGCACGATGTAAACGTCCAAAAGAAACTGTTAAAAACAACTTAACT
CTTTCTATACGTCCACAGTCAGTCGATGGTGATACACCATTACATGTTGCAGCAAATCAC
AATCAGCGTGCAGCTGTTCTACGTTTGTTATCTTGGGGAGCTGATCCAACCCTAGTCAAT
GCTGAAAGTATGACACCTATACAAGTAGCACAGAATAATGGAAATTTAGAATTAGCTGAT
TTAATTAAGTTATTTAGAGGTAGAAAAGAATCTAGTGATATATTCCTTCCAACACCCACG
TATAATCCCCATAGACGTGTGAGACAACCTCCACCAAATTCTTACATTACTGAACCATCA
ATTTTACAAAATTATACTCCGAATGATATAAATGAAATTCACTTAAATGATCAGCAGTTA
AATAGCACTAACAACAATACTAACGATTTATTAAGAGACTCAAATAAAGGTTCAACTAAT
TTTAATATCACTGAAAAAAGTGCTACGTGTACATGTTCGTATACGACAAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case