Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6633 cluster # 6633       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6633#0 length = 950 sequences # 4  
consensusID : consensus_6633#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 950
fasta sequence 
                              [TTATCAGTACTGGTCGTCTAGTTGTTTGTGGGCATGAATTATCC-GGTGACGACTTATCAGTAGTATATTCGACTGGTGTTAGTAGTAGCAGTGGATGTAGTGATACACAGTCATCTACATCCAAATCGAAACGTAAATCTGAACAACCGCCGTCATCATCCTCCACATTGAACGGGAATCATCAAATAGACTCATCCAAATATGAAACAGCTTCAGATGCTAAAGGTCTATTGGTAATATTAGATACAACTCCAGATGAGGAACTGGAAAATGAACGTTTAGCTAGAGAACTTGTTAATCGTATACAACGAACACGCAAAAAGGCTGAATTGCTTCCTGAAAATCCAATTGTTATATTAGCAATCACTGATTTAGACAGTTATTACAATATTGCTGGACCAAATGGCAACTATTTAAATTTTATTCAATCTACTATTAAACAACCTTTCAGTGTTATAAGACAATCATCAATAAATAATATTGTAGATATTAGACAATGTGCTAAATCTATTCTACCTGATGGTTGGGAATTAACTACTGAAGTGATACGTGATACAGTTTCAATTCCACCGGATAACATTGATCTAATTATCTTTTCAAGAATACCAACTTATGAAGTTAATAATCAAATTAAAATTAATATAAAGATTAATACAGTTGAAACAAAACACCGACCAATATTTATTAATGGTATANATTATACTAACAATACACAAACTATTAAAGTACAATTATGTGATTCAAATAATCAATGGTTTGTCCATAGTGTAGATGATTTATTACGAAAGGTGAAGTGTGCTTTTGGTTGGTCGACTAATATCAATTTACAATTGTACACTGCATTAAATACTGATAATATGAATGATTTAAAACTACTTGCACATGTTACACCTAATCAATTGATCAATTTAGACGGTATCACTTTGTATGCTTCTGTTTAATAAGACAAT]

[+] EMBL CD191709             [TTATCAGTACTGGTCGTCTAGTTGTTTGTGGGCATGAATTATCC GGTGACGACTTATCAGTAGTATATTCGACTGGTGTTAGTAGTAGCAGTGGATGTAGTGATACACAGTCATCTACATCCAAATCGAAACGTAAATCTGAACGACCGCCGTCATCATCCTCCACATTGAACGGGAATCATCAAATAGACTCATCCAAATATGAAACAGCTTCAGATGCTAAAGGTCTATTGGTAATATTAGATACAACTCCAGATGAGGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD157439             [                              GGCATGAATTATCCGGGTGACGACTTATCAGTAGTATATTCGACTGGTGTTAGTAGTAGCAGTGGATGTAGTGATACACAGTCATCTACATCCAAATCGAAACGTAAATCTGAACAACCGCCGTCATCATCCTCCACATTGAACGGGAATCATCAAATAGACTCATCCAAATATGAAACAGATTCAGATGCTAAAGGTCTATTGGTAATATTAGATACAACTCCAGATGAGGAACTGGAAAATGAACGTTTAGCTAGAGAACTTGTTAATCGTATACAACGAACACGCAAAAAGGCTGAATTGCTTCCTGAAAATCCAATTGTTATATTAGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD078584             [                                                                                                                CATCTACATCCAAATCGAAACGTAAATCTGAACAACCGCCGTCATCATCCTCCACATTGAACGGGAATCATCAAATAGACTCATCCAAATATGAAACAGCTTCAGATGCTAAAGGTCTATTGGTAATATTAGATACAACTCCAGATGAGGAACTGGAAAATGAACGTTTAGCTAGAGAACTTGTTAATCGTATACAACGAACACGCAAAAAGGCTGAATTGCTTCCTGAAAATCCAATTGTTATATTAGCAATCACTGATTTAGACAGTTATTACAATATTGCTGGACCAAATGGCAACTATTTAAATTTTATTCAATCTACTATTAAACAACCTTTCAGTGTTATAAGACAATCATCAATAAATAATATTGTAGATATTAGACAATGTGCTAAATCTATTCTACCTGATGGTTGGGAATTAACTACTGAAGTGATACGTGATACAGTTTCAATTCCACCGGATAACATTGATCTAATTATCTTTTCAAGAATACCAACTTATGAAGTTAATAATCAAATTAAAATTAATATAAAGATTAATACAGTTGAAACAAAACACCGACCAATATTTATTAATGGTATANATTATACT                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD073049             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAATATTGTAGATATTAGACAATGTGCTAAATCTATTCTACCTGATGGTTGGGAATTAACTACTGAAGTGATACGTGATACAGTTTCAATTCCACCGGATAACATTGATTTAATTATCTTTTCAAGAATACCAACTTATGAAGTTAATAATCAAATTAAAATTAATATAAAGATTAATACAGTTGAAACAAAACACCGACCAATATTTATTAATGTTATAAATTATACTAACAATACACAAACTATTAAAGTACAATTATGTGATTCAAATAATCAATGGTTTGTCCATAGTGTAGATGATTTATTACGAAAGGTGAAGTGTGCTTTTGGTTGGTCGACTAATATCAATTTACAATTGTACACTGCATTAAATACTGATAATATGAATGATTTAAAACTACTTGCACATGTTACACCTAATCAATTGATCAATTTAGACGGTATCACTTTGTATGCTTCTGTTTAATAAGACAAT]




>consensus_6633#0
TTATCAGTACTGGTCGTCTAGTTGTTTGTGGGCATGAATTATCCGGTGACGACTTATCAG
TAGTATATTCGACTGGTGTTAGTAGTAGCAGTGGATGTAGTGATACACAGTCATCTACAT
CCAAATCGAAACGTAAATCTGAACAACCGCCGTCATCATCCTCCACATTGAACGGGAATC
ATCAAATAGACTCATCCAAATATGAAACAGCTTCAGATGCTAAAGGTCTATTGGTAATAT
TAGATACAACTCCAGATGAGGAACTGGAAAATGAACGTTTAGCTAGAGAACTTGTTAATC
GTATACAACGAACACGCAAAAAGGCTGAATTGCTTCCTGAAAATCCAATTGTTATATTAG
CAATCACTGATTTAGACAGTTATTACAATATTGCTGGACCAAATGGCAACTATTTAAATT
TTATTCAATCTACTATTAAACAACCTTTCAGTGTTATAAGACAATCATCAATAAATAATA
TTGTAGATATTAGACAATGTGCTAAATCTATTCTACCTGATGGTTGGGAATTAACTACTG
AAGTGATACGTGATACAGTTTCAATTCCACCGGATAACATTGATCTAATTATCTTTTCAA
GAATACCAACTTATGAAGTTAATAATCAAATTAAAATTAATATAAAGATTAATACAGTTG
AAACAAAACACCGACCAATATTTATTAATGGTATANATTATACTAACAATACACAAACTA
TTAAAGTACAATTATGTGATTCAAATAATCAATGGTTTGTCCATAGTGTAGATGATTTAT
TACGAAAGGTGAAGTGTGCTTTTGGTTGGTCGACTAATATCAATTTACAATTGTACACTG
CATTAAATACTGATAATATGAATGATTTAAAACTACTTGCACATGTTACACCTAATCAAT
TGATCAATTTAGACGGTATCACTTTGTATGCTTCTGTTTAATAAGACAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)