cluster # 7232

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Schistosoma mansoni
cluster # 7232 cluster # 7232 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7232#0 length = 563 sequences # 5

consensusID : consensus_7232#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 563
fasta sequence

                              [ATCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAATTTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCACTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCTTTGGAACGTGCCTAGAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGCCTTGGCACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGTTAGTTTTTGCTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCTGATGAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACATCTTTTTTGAAGTGCACATGTAAAAAGCAGGTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACACGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCG-ATGAATTTCTCTGGATATGCATTCTCATATAGGCGAGTTGTAGTGAAGGAAAATTT]

[+] EMBL CD201944             [ATCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAATTTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCACTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCTTTGGAACGTGCCTAGAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGCCTTGGCACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGTTAGTTTTTGCTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCTGATGAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACATCTTTTTTGAAG GCACATGTAAAAAGCAGGTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACACGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCG ATGAATTTCTCTGGATATGCATTCTCATATAGGCGAGTTGTAGTGAAGGAAAATct]
[+] EMBL CD201873             [ATCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAATTCTGAGGAATTGTGGGATGACAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCACTGTTTAGAGCCGTAGCACCCCTCATTCTAAAATTCTTTGGAACGTGCCTAAAAATCCTAACATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD202144             [ TCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAATTTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCACTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCTTTGGAACGTGCCTACAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGCCTTGGCACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGTTAGTTTTTGCTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCTGATGAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACATCTTTTTTGAAGTGCACATGTAAAAAGCAGCTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACACGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCGCATGAATTTCTCTGGATATGCATTCTCATATAGGCGAGTTGTAGTGAAGGAAAATT ]
[-] EMBL CD145334             [ TCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAATTTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCGCTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCTTTGGGACGTGCCTAGAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGCCTTGGAACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGTTAGTTTTTGTTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCTGATAAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACATCTTTTTTGAAGTGCACATGTAAAAAGCAGGTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACACGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCG ATGAATTTCTCTGGATATGCTTTCTCATATAGGCGAGTTGTAGTGAAGGCAAATT ]
[-] EMBL CD145271             [ TCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTNTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAA TTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCGCTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCTTTGGAACGTGCCTAGAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGCCTTGGAACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGTTAGTTTTTGCTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCTGATGAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACATCTTTTTTGAAGTGCACATGTAAAAAGCAGGTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACACGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCG ATGAATTTCTCTGGATATGCTTTCTCATATAGGCGAGTTGTAGTGAAGGCAAATT ]




>consensus_7232#0
ATCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTC
AAATAATAATAACAGTAGTAATTTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTT
CAATTAAACGCCGAGTTATTGCACTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCT
TTGGAACGTGCCTAGAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGC
CTTGGCACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGT
TAGTTTTTGCTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCT
GATGAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACA
TCTTTTTTGAAGTGCACATGTAAAAAGCAGGTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACA
CGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCGATGAATTTCTCTGGATATGCATTCTCATATAGG
CGAGTTGTAGTGAAGGAAAATTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case