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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8057#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1133 fasta sequence
[GTGGCACCAAGCAAAAGCCATGATAATGTGCGAACTCTTTCAACCATGATAAGAAAATCTTTTGGTCCTAATTGAGATGAAGGTGGAGTGGATTTTAACCAAGGTAAATACTGTAATATAATTGCTTCTGAATGAGCCGTATGTGAAAATGTTGAAGCGAGCATCACATGTGCATAGTTTGGGTGTCGAGAATTAGCTGAACTAGGACTAGAGATTGTTTGTGGCGTGGTAGATGTAGATGAGACAAAATTTGGCGAAGTCAAATTTGAAACAGATGTAGTCGTAGTGGAAGTTGTAACATTAGTAGAAGAAATCTGATCATGTGAAATTGCTGGAGATGGGATAGGAATCGCGGAAGAAATTAGTTTTGTGTTAGTAGCTTCTTGCTTTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGGGCTGGTAATCCAGGTGCTAAATTTTTACCGTTCCTCGTCGTTTTTACATCGGCTAGTAGTCCGGGTGCAAGTAAAGGTAAGACATCGTGGTCACTTCCACTGTTAGATCTAGATAGCTCCAATGAAACATACTGAGATAAACCTGATTTTAAATGTGCACCTAAAACATCTTCATGCAAGCTTGGAATATTTGTACCTAACCCAACGTTAGAATTAACACCCGTAGCTCCTGTTGCAGAGTTTGATACTCCTGATGAATTAAAACCTCCACCAAATAAACTACTACCTATATTTCCAGATGTTGCTCCTCCACCGCCTGTCAGTGTGTTTGAATCAAGATTACCAGTACCACATGGATTTGATCCGGACATCATAGATGAAGAACCAAGTCCATATCCGACGCTGTTCAACTGAACTGCTGATTTTTGAGACTGTTTAATCTTATTCAC]
[-] EMBL CD180527 [GTGGCACCAAGCAAAAGCCATGATAATGTGCGAACTCTTTCAACCATGATAAGAAAATCTTTTGGTCCTAATTGAGATGAAGGTGGAGTGGATTTTAACCAAGGTAAATACTGTAATATAATTGCTTCTGAATGAGCCGTATGTGAAAATGTTGAAGCGAGC ]
[+] EMBL CD178231 [ TTTTAACCAAGGTAAATACTGTAATATAATTGCTTCTGAATGAGCCGTATGTGAAAATGTTGAAGCGAGCATCACATGTGCATAGTTTGGGTGTCGAGAATTAGCTGAACTAGGACTAGAGATTGTTTGTGGCGTGGTAGATGTAGATGAGACAAAATTTGGCGAAGTCAAATTTGAAACAGATGTAGTCGTAGTGGAAGTTGTAACATTAGTAGAAGAAATCTGATCATGTGAAATTGCTGGAGATGGGATAGGAATCGCGGAAGAAATTAGTTTTGTGTTAGTAGCTTCTTGCTTTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGG ]
[+] EMBL CD195521 [ ACTAGAGATTGTTTGTGGCGTGGTAGATGTAGATGAGACAAAATTTGGCGAAGTCAAATTTGAAACAGATGTAGTCATAGTGGAAGTTGTAACATTAGTAGAAGAAATCTGATCATGTGAAATTGCTGGAGATGGGATAGGAATCGCGGAAGAAATTAGTTTT ]
[-] EMBL CD127817 [ TCGCGGAAGAAATTAGTTTTGTGTTAGTAGCTTCTTGCTTTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGGGCTGGTAATCCAGGTGCTAAATTTTTACCGTTCCTCGTCGTTTTTACATCGGCTAGTAGTCCGGGTGCAAGTAAAGGTAAGACATCGTGGTCACTTCCACTGTTAGATCTAGATAGCTCCAATGAAACATACTGAGATAAACCTGATTTTAAATGTGCACCTAAAACATCTTCATGCAAGCTTGGAATATTTGTACCTAACCCAACGTTAGAATTAACACCCGTAGCTCCTGTTGCAGAGTTTGATACT ]
[+] EMBL CD094395 [ TTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGGGCTGGTAATCCAGGTGCTAAATTTTTACCGTTCCTCGTCGTT ]
[-] EMBL CD192758 [ CCACTGTTAGATCTAGATAGCTCCAATGAAACATACTGAGATAAACCTGATTTTAAATGTGCACCTAAAACATCTTCATGCAAGCTTGGAATATTTGTACCTAACCCAACGTTAGAATTAACACCCGTAGCTCCTGTTGCAGAGTTTGATACTCCTGATGAATTAAAACCTCCACCAAATAAACTACTACCTATATTTCCAGATGTTGCTCCTCCACCGCCTGTCAGTGTGTTTGAATCAAGATTACCAGTACCACATGGATTTGATCCGGACATCATAGATGAAGAACCAAGTCCATATCCGACGCTGTTCAACTGAACTGCTGATTTTTGAGACTGTTTAATCTTATTCAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||