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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8797#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1072 fasta sequence
[TTTTTTTTTTTTTTTNTGAAAAAAGAAAACTGCAATATTATTACCATAAGCATTTTTGAAATGCGCAAATATCTACGCCAACAAAATTGAATATATGACCAAGATAGGGTTCGGTCCTTTTTTATCTTTTATGTGTTATGTTTTGAAAAAATATCGCTAACTTTCAAAATAGTTTGAACAAATAAACTGACCACATTATCTAAATACTTTCATACTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGAGT-AAAAAAAAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAAGGAAATAAGTTTCCTAGAACAATAATATTAATGATAACAATGACAATAATAATGGGAATGATAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCGATTGAGTTCGAAGGCGATTGTTTAATGAATAGATGAGTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATATAGAATAAACTGGTAATTATATGTCTTATGTTTAGTTTGGAAGTGGATTCCCTTCAATCTGTTGTTGTATAGTGTCAGATAATGCTGCTCTTTGCAAAGCTGCTTCAACAGCTTTTCGTCGAGCGATAATTGACTCGTTTACTTTGTTTCGAGACACTGTATTTTCACGAGTACTGGGTTTACTAATGGTTAGATGCTTAAGATCATCTTCATCGTGGTTTTCATTATTATGTTCTGATGAACGACCTTGCTGATTGGAACTACATTGCGAAATGGAACATTGATTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGTAGCATAAGTTGCAGCAGCTGAAGGTTTAGGTCGACTGCGAGTACTACGATTATTCTGTGTATCTGAAGCAGTCCCAACTACAGAACTCTGAGTGGTTATCTGATTTCTATTGGTTGTTTGTGAACCTTGTCTGGAGTTCGATGGACGATGCTGTTCTTGAACATTTGAAGTTGATGCACCTGGACGTGGACGAACAGCTCGTATAGGCGTCGGTTTCGAAGTCGTCCCACTATTTGATTGAGCTCTCTGTCGCTGACGATTGCGTTCTAACCGAGCCAGTCCAGCACGAAC]
[+] EMBL AI395526 [TTTTTTTTTTTTTTTNTGAAAAAAGAAAACTGCAATATTATTACCATAAGCATTTTTGAAATGCGCAAATATCTACGCCAACAAAATTGAATATATGACCAAGATAGGGTTCGGTCCTTTTTTATCTTTTATGTGTTATGTTTTGAAAAAATATCGCTAACTTTCAAAATAGTTTGAACAAATAAACTGACCACATTATCTAAATACTTTCATACTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGAGT AAAAAAAAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAAGGAAATAAGTTTCCTAGAACAATAATATTAATGATAACAATGACAATAATAATGGGAATGGAAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCCATTGAGTTCCAAGGCGATTGGTTAATGAATAGATGAGTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATAa ]
[+] EMBL SMT14512 [ AGCATTTTTNAAATGCGCAAATATCTACGCCAACAAAATTGAATATATGACCAAGATAGGGTTCGGTCCTTTTTAATCTTTNATGTGTTATGTTTTGAAAAAATATCGCTAACTTTCAAAATAGTTTGANCAAATAANCTGACCACATTATCTAAATNCTTTCATACTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGNGT AAAAAANAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAGGGAAATAGGTTTCCTAGAA ]
[+] EMBL CD077057 [ CTTTCATCCTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGAGTAAAAAAAAAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAAGGAAATAAGTTTCCTAGAACAATAATATTAATGATAACAATGACAATAATAATGGAAATGATAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCGATTGAGTTCGAAGGCGATTGTTTAATGAATAGATGATTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATATAGAATAAACTGGTAATTATATGTCTTATGTTTAGTTTGGAAGTGGATTCCCTTCAATCTGTTGTTGTATAGTGTCAGATAATGCTGCTCTTTGCAAAGCTGCTTCAACAGCTTTTCGTCGAGCGATAATTGACTCGTTTACTTTGTTTCGAGACACTGTATTTTCACGAGTACTGGGTTTACTAATGGTTAGATGCTTAAGATCATCTTCATCGTGGTTTTCATTATTATGTTCTGATGAACGACCTTGCTGATTGGAACTACATTGCGAAATGGAACATTGATTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAAACGTAGCATA ]
[-] EMBL CD084331 [ GATAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCGATTGAGTTCGAAGGCGATTGTTTAATGAATAGATGAGTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATATAGAATAAACTGGTAATTATATGTCTTATGTTTAGTTTGGAAGTGGATTCCCTTCAATCTGTTGTTGTATAGTGTCAGATAATGCTGCTCTTTGCAAAGCTGCTTCAACAGCTTT ]
[+] EMBL CD182796 [ AGCTGCTTCAACAGCTTTTCGTCGAGCGATAATTGACTCGTTTACTTTGTTTCGAGACACTGTATTTTCACGAGTACTGGGTTTACTAATGGTTAGATGCTTAAGATCATCTTCATCGNGGTTTTCATTATCATGTTCTGATGAACGACCTTGCTGATTGGAACTACATTGCGAAATGGAACATTGATTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGT ]
[+] EMBL CD062738 [ TTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGTAGCATAAGTTGCAGCAGCTGAAGGTTTAGGTCGACTGCGAGTACTACGATTATTCTGTGTATCTGAAGCAGTCCCAACTACAGAACTCTGAGTGGTTATCTGATTTCTATTGGTTGTTTGTGAACCTTGTCTGGAGTTCGATGGACGATGCTGTTCTTGAACATTTGAAGTTGATGCACCTGGACGTGGACGAACAGCTCGTATAGGCGTCGGTTTCGAAGTCGTCCCACTATTTGATTGAGCTCTCTGTCGCTGACGATTGCGTTCTAACCGAGCCAGTCCAGCACGAAC]
[-] EMBL CD062742 [ TTCTTTGATTAGCTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGTAGCATAAGTTGCAGCAGCTGAAGGTTTAGGTCGACTGCGAGTAGTACGATTTTTCTGTGTATCTGA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||