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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9406#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 802 fasta sequence
[GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCAGTCCTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCATATATATATATATATTTGGTGCCTCCCTGTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAAACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGGATAAAAAAAACAGCAATTGTTATTTAGACAGAATCCTTAAAAAAAACTGATTAAAACGACCATTATACCTGATCTGTGACAGTGAGAGTAAAACGTGATTGTTCATTGAGTGTGGACAAACAGATGTTACCCTAACGACTATTAAGTATGTGATTTCCTTTTTTCTCATTAATTTCTACTAAGTGTGATTGCTTGTAGCTGCGTTGAATAAAGCATTATCTAGTGTTATTACGGT]
[+] EMBL CD121211 [GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCAGTCCTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCGTATATATATATATATTTGGTGCCTCCCTGTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAAACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAGTTAAGGTAGGAT AAAAAAACAGCAATTGNTATTT ]
[+] EMBL CD121148 [GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCAGTCCTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCATATATATATATATATTTGGTGCCTCCCTGTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAAACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACGCACATGATTTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTANAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGa ]
[+] EMBL CD121742 [GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCAGTCCTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCATATATATATATATATTTGGTGCCTCCCTGTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAAACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAA ATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGG ]
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[+] EMBL CD121180 [GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCGGTCCTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCATATATATATATATATTTGGTGCCTCCCTGTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAAACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAAAATAGTCAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTANTACANATGAGAACA ]
[-] EMBL CD121217 [ AGGGTTATTTNTTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTNTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTCTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGGATAAAAAAAACAGCAATTGTTATTTAGACAGAATCCTTAAAAAAAACTGATTAAAACGACCATTATACCTGATCTGTGACAGTGAGAGTAAAACGTGATTGTTCATTGAGTGTGGACAAACAGATGTTACCCTAACGACTATTAAGTATGTGATTTCCTTTTTTCTCATTAATTTCTACTAAGTGTGATTGCTTGTAGCTGCGTTGAATAAAGCATTATCTAGTGTTATTACGGT]
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[-] EMBL CD121163 [ TAGTANATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATNTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACATACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGGATAAAACAAACAGCAATTGTTATTTAGACAGAATCCTTAAAAAAAACTGATTAAAACGACCATTATACCTGATCTGTGACAGTGAGAGTAAAACGTGATTGTTCATTGAGTGTGGACAAACAGATGTTACCCTAACGACTATTAAGTATGTGATTTCCTTTTTTCTCATTAATTTCTACTAAGTGTGATTGCTTGTAGCTGCGTTGAATAAAGTATTATCTAGTGTTATTACGGT]
[-] EMBL CD121252 [ AATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATNTGTNTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTCTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGGATAAAAAAAACAGCAATTGTTATTTAGACAGAATCCTTAAAAAAAACTGATTAAAACGACCATTATACCTGATCTGTGACAGTGAGAGTAAAACGTGATTGTTCATTGAGTGTGGACAAACAGATGTTACCCTAACGACTATTAAGTATGTGATTTCCTTTTTTCTCATTAATTTCTACTAAGTGTGATTGCTTGTAGCTGCGTTGAATAAAGCATTATCTAGTGTTATTACGGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||