Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Takifugu rubripes
cluster # 1913 cluster # 1913       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1913#0 length = 978 sequences # 3  
consensusID : consensus_1913#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 978
fasta sequence 
                              [AAAAAAAAAAAGTAAATGTTGGTGTGAAACATGAGCGGTGGAATTTTCATTTTAAAATACTTATTAACAGATAGAACAACTTGGAAACACATCTCCAGCTCATCAGAAAAGTCTTATTACAATAACACGAGCTAGTTAGCTTTAGACTAAACTGCAGCGCCATACTCTAAATCCAGATATTTCATCAAAATGATTATATCTTAAAGTAAATAACTTCCATTAGTTTGTCATTGCTGTGGGAGTAATTCAGAAAGCAAATGTGTTTTTTTAGCTTCCATTTTCTCCCAGTTGCTCTTTTATTAGATTGTGTTAGCTTGTGCATGAGAAGGTGCCAAACAAAAGCGGGCAAGGTTCACATTTCATTTGGTTTGTCATCCCAAGTTTAATAACATGCTTTGTGCGTACAAAAATGTACTCAGGAGTCACTTTTAGAGGCAACAGGAAAACTTTCGTACAATATGCGAGTATTCAAAATGGCTGCCACATTAGTGAGTTGGATCAGATAACAATACTTGGGCCCCCAGTTTAGCCCACAGGACAAAAGAGGTGTTATTTTAAAAGTTACTTCACTGTTCAGTAAATGTAGTAAATCCATTTGTTTTAATGCCATCGTTGCAGAATTATCCGTGATATAACCAACAGTTACCTTAGTGACCAGCCACTGTCCAATCAGAAGTCTGAGCAGCTTGAGGAGAAAAGTGTGTGTGGTTGTTTTCATCTCTTGCCTGAAGCTGATGGTGATGAGTTTGTCCAATGTCCCCATACATGCCCATTTGCCCTCTTTACCACATTGTACTGAATCTAACCTAATCCAGTTTGAACCTGAGCTGTCCACCTTTCAGGATGTGTATAATACTACTGCTGTCTGAGAGTTAATATATGAGCGTTACGGGATAATAGAGACAGCCGCTGTTAATTATTAATGTAGAGGATGATGTCTGTTGTTGTCTTTCAATGTTCTGAATAAACTTCAGTTGG]

[+] EMBL CA589362             [AAAAAAAAAAAGTAAATGTTGGTGTGAAACATGAGCGGTGGAATTTTCATTTTAAAATACTTATTAACAGATAGAACAACTTGGAAACACATCTCCAGCTCATCAGAAAAGTCTTATTACAATAACACGAGCTAGTTAGCTTTAGACTAAACTGCAGCGCCATACTCTAAATCCAGATATTTCATCAAAATGATTATATCTTAAAGTAAATAACTTCCATTAGTTTGTCATTGCTGTGGGAGTAATTCAGAAAGCAAATGTGTTTTTTTAGCTTCCATTTTCTCCCAGTTGCTCTTTTATTAGATTGTGTTAGCTTGTGCATGAGAAGGTGCCAAACAAAAGCGGGCAAGGTTCACATTTCATTTGGTTTGTCATCCCAAGTTTAATAACATGCTTTGTGCGTACAAAAATGTACTCAGGAGTCACTTTTAGAGGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CA333123             [                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCATTTTCTCCCAGTTGCTCTTTTATTAGATTGTGTTAGCTTGTGCATGAGAAGGTGCCAAACAAAAGCGGGCAAGGTTCACATTTCATTTGGTTTGTCATCCCAAGTTTAATAACATGCTTTGTGCGTACAAAAATGTACTCAGGAGTCACTTTTAGAGGCAACAGGAAAACTTTCGTACAATATGCGAGTATTCAAAATGGCTGCCACATTAGT  GTTGGATCATATAACAATACTTGGGCCCCCAGTTTAGCCCACAGGACAAAAGAGGTGTTATTTTAAAAGTTACTTCACTGTTCAGTAAATGTAGTAAATCCATTTGTTTTAATGCCATCGTTGCAGAATTATCCGTGATATAACCAACAGTTACCTTAGTGACCAGCCACTGTCCAATCAGAAGTCTGAGCAGCTTGAGGAGAAAAGTGTGTGTGGTTGTTTTCATCTCTT                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CA332586             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCGAGTATTCAAAATGGCTGCCACATTAGTGAGTTGGATCAGATAACAATACTTGGGCCCCCAGTTTAGCCCACAGGACAAAAGAGGTGTTATTTTAAAAGTTACTTCACTGTTCAGTAAATGTAGTAAATCCATTTGTTTTAATGCCATCGTTGCAGAATTATCCGTGATATAACCAACAGTTACCTTAGTGACCAGCCACTGTCCAATCAGAAGTCTGAGCAGCTTGAGGAGAAAAGTGTGTGTGGTTGTTTTCATCTCTTGCCTGAAGCTGATGGTGATGAGTTTGTCCAATGTCCCCATACATGCCCATTTGCCCTCTTTACCACATTGTACTGAATCTAACCTAATCCAGTTTGAACCTGAGCTGTCCACCTTTCAGGATGTGTATAATACTACTGCTGTCTGAGAGTTAATATATGAGCGTTACGGGATAATAGAGACAGCCGCTGTTAATTATTAATGTAGAGGATGATGTCTGTTGTTGTCTTTCAATGTTCTGAATAAACTTCAGTTGG]




>consensus_1913#0
AAAAAAAAAAAGTAAATGTTGGTGTGAAACATGAGCGGTGGAATTTTCATTTTAAAATAC
TTATTAACAGATAGAACAACTTGGAAACACATCTCCAGCTCATCAGAAAAGTCTTATTAC
AATAACACGAGCTAGTTAGCTTTAGACTAAACTGCAGCGCCATACTCTAAATCCAGATAT
TTCATCAAAATGATTATATCTTAAAGTAAATAACTTCCATTAGTTTGTCATTGCTGTGGG
AGTAATTCAGAAAGCAAATGTGTTTTTTTAGCTTCCATTTTCTCCCAGTTGCTCTTTTAT
TAGATTGTGTTAGCTTGTGCATGAGAAGGTGCCAAACAAAAGCGGGCAAGGTTCACATTT
CATTTGGTTTGTCATCCCAAGTTTAATAACATGCTTTGTGCGTACAAAAATGTACTCAGG
AGTCACTTTTAGAGGCAACAGGAAAACTTTCGTACAATATGCGAGTATTCAAAATGGCTG
CCACATTAGTGAGTTGGATCAGATAACAATACTTGGGCCCCCAGTTTAGCCCACAGGACA
AAAGAGGTGTTATTTTAAAAGTTACTTCACTGTTCAGTAAATGTAGTAAATCCATTTGTT
TTAATGCCATCGTTGCAGAATTATCCGTGATATAACCAACAGTTACCTTAGTGACCAGCC
ACTGTCCAATCAGAAGTCTGAGCAGCTTGAGGAGAAAAGTGTGTGTGGTTGTTTTCATCT
CTTGCCTGAAGCTGATGGTGATGAGTTTGTCCAATGTCCCCATACATGCCCATTTGCCCT
CTTTACCACATTGTACTGAATCTAACCTAATCCAGTTTGAACCTGAGCTGTCCACCTTTC
AGGATGTGTATAATACTACTGCTGTCTGAGAGTTAATATATGAGCGTTACGGGATAATAG
AGACAGCCGCTGTTAATTATTAATGTAGAGGATGATGTCTGTTGTTGTCTTTCAATGTTC
TGAATAAACTTCAGTTGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)