Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Takifugu rubripes
cluster # 1989 cluster # 1989       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1989#0 length = 658 sequences # 4  
consensusID : consensus_1989#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 658
fasta sequence 
                              [CCCTCTGTTGCTTCTTCCCTTTCCAACTTCGTGTCTGCGCTCTCTGTACTTGTTGTTTTTCGGTTTTATCCACTAATATCACACATCGTTAGCAGTCATGCCCGATGGCCGCAGTCTTGCGGGCGGTGGGAGTTCGTTGTTCTCTGCTTTTCGGGTTTTGGGGCTTTATTCTAACCACGTGCCCCACGCGGTCAGGTTCCATCAGAAGCACCGGGAGTTTTACCTGGTGACAGCGGTCGGCAAATGTTTCCACACCTACAACGTGAATAGACTGGGGATTGTTGCTGTCAGTAACAGCCTTCCAGAAGACATAAGCTATTTGGCAGCTGATCGGATGTTGGTGTTTGCTGCTGCTGGAAAACTCATCAGCGCTTTTGCCAGAAACAAAGAGGTGGTGATGCGCTACCAAGAACACAAACATGACGTGCGTCTGCTGCTTCCTCTGGGGGATCATTTGGTCTCTGCTGACAGTGGGGGTGATGTCATTGTCTGGGATGTCCAAGGAGGAGACATTTACTTGCGGCTGGAATTTAACCCTTCCTCCTTTGATGTGTCGGCTATGATGCATCCAAGCACCTACCTTAATAAGGTGCTGCTTGGAAGCTCCCAGGGTGCTCTGCAGCTTTGGAACATCAAAACGAGTAAATTGTTGTTTTCG]

[+] EMBL CA589305             [CCCTCTGTTGCTTCTTCCCTTTCCAACTTCGTGTCTGCGCTCTCTGTACTTGTTGTTTTTCGGTTTTATCCACTAATATCACACATCGTTAGCAGTCATGCCCGATGGCCGCAGTCTTGCGGGCGGTGGGAGTTCGTTGTTCTCTGCTTTTCGGGTTTTGGGGCTTTATTCTAACCACGTGCCCCACGCGGTCAGGTTCCATCAGAAGCACCGGGAGTTTTACCTGGTGACAGCGGTCGGCAAATGTTTCCACACCTACAACGTGAATAGACTGGGGATTGTTGCTGTCAGTAACAGCCTTCCAGAAGACATAAGCTATTTGGCAGCTGATCGGATGTTGGTGTTTGCTGCTGCTGGAAAACTCATCAGCGCTTTTGCCAGAAACAAAGAGGTGGTGATGCGCTACCAAGAACACAAACATGACGTGCGTCTGCTGCTTCCTCTGGGGGATCATTTGGTCTCTGCTGACAGTGGGGGTGATGTCATTGTCTGGGATGTCCAAGGAGGAGACATTTACTTGCGGCTGGAATTTAACCCTTCCTCCTTTGATGTGTCGGCTATGATGCATCCAAGCACCTACCTTAATAAAGTGCTGCTTGGAAGCTCCCAGGGTGCTCTGCAG                                    ]
[+] EMBL CA333194             [                      CCAACTTCGTGTCTGCGCTCTCTGTACTTGTTGTTTTTCGGTTTTATCCACTAATATCACACATCGTTAGCAGTCATGCCCGATGGCCGCAGTCTTGCGGGCGGTGGGAGTTCGTTGTTCTCTGCTTTTCGGGTTTTGGGGCTTTATTCTAACCACGTGCCCCACGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BU807623             [                             CGTGTCTGCGCTCTCTGTACTTGTTGTTTTTCGGTTTTATCCACTAATATCACACATCGTTAGCAGTCATGCCCGATGGCCGCAGTCTTGCGGGCGGTGGGAGTTCGTTGTTCTCTGCTTTTCGGGTTTTGGGGCTTTATTCTAACCACGTGCCCCACGCGGTCAGGTTCCATCAGAAGCACCGGGAGTTTTACCTGGTGACAGCGGTCGGCAAATGTTTCCACACCTACAACGTGAATAGACTGGGGATTGTTGCTGTCAGTAACAGCCTTCCAGAAGACATAAGCTATTTGGCAGCTGATCGGATGTTGGTGTTTGCTGCTGCTGGAAAACTCATCAGCGCTTTTGCCAGAAACAAAGAGGTGGTGATGCGCTACCAAGAACACAAACATGACGTGCGTCTGCTGCTTCCTCTGGGGGATCATTTGGTCTCTGCTGACAGTGGGGGTGATGTCATTGTCTGGGATGTCCAAGGAGGAGACATTTACTTGCGGCTGGAATTTAACCCTTCCTCCTTTGATGTGTCGGCTATGATGCATCCAAGCACCTACCTTAATAAGGTGCTGCTTGGAAGCTCCCAGGGTGCTCTGCAGCTTTGGAACATCAAAACGAGTAAATTGTTGTTTTCG]
[+] EMBL FR0059656            [                                                                                                                                                         GCCTTTGGGTCTTTATTCTAACCACGTGCCCCACGCGGTCAGGTTCCATCAGAAGCACCGGGAGTTTTACCTGGGGACAGCGGTCGGCAAATGTTTCCACACCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]




>consensus_1989#0
CCCTCTGTTGCTTCTTCCCTTTCCAACTTCGTGTCTGCGCTCTCTGTACTTGTTGTTTTT
CGGTTTTATCCACTAATATCACACATCGTTAGCAGTCATGCCCGATGGCCGCAGTCTTGC
GGGCGGTGGGAGTTCGTTGTTCTCTGCTTTTCGGGTTTTGGGGCTTTATTCTAACCACGT
GCCCCACGCGGTCAGGTTCCATCAGAAGCACCGGGAGTTTTACCTGGTGACAGCGGTCGG
CAAATGTTTCCACACCTACAACGTGAATAGACTGGGGATTGTTGCTGTCAGTAACAGCCT
TCCAGAAGACATAAGCTATTTGGCAGCTGATCGGATGTTGGTGTTTGCTGCTGCTGGAAA
ACTCATCAGCGCTTTTGCCAGAAACAAAGAGGTGGTGATGCGCTACCAAGAACACAAACA
TGACGTGCGTCTGCTGCTTCCTCTGGGGGATCATTTGGTCTCTGCTGACAGTGGGGGTGA
TGTCATTGTCTGGGATGTCCAAGGAGGAGACATTTACTTGCGGCTGGAATTTAACCCTTC
CTCCTTTGATGTGTCGGCTATGATGCATCCAAGCACCTACCTTAATAAGGTGCTGCTTGG
AAGCTCCCAGGGTGCTCTGCAGCTTTGGAACATCAAAACGAGTAAATTGTTGTTTTCG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)