These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2386#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 813 fasta sequence [AGGAGCTTCTTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG-CTCC--CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGAGTTCTTTACAAGTTCACCCAGTTCCTGATTACGTCCTTCAACATCCAGAGTGGCGAGGATGCCCCGGACCTGCTGAACGTCATCACGGACCCTCTCACCGACTCTATCATTCAGGTGGATAAATCGGTCATCAATGACCTCGCTACG] [+] EMBL CA589861 [AGAAGCTTCTTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG CTCC CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTG ] [+] EMBL CA588156 [ GGTGATGCCCGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATCG TAC AGGACCTGAAGNAGAGNCTGGCTCCCCCGCCGCTCTCAGGGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCCCCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGGTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGAACGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGGCCACGACTTCCTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGGAGTCTTAACAAGTTCACCCAGGTCCTGATTACCGCCTTCAACATCCAGAGGGGGGAGGAAGGCCCGGACCGGCTGAACGTCATCACGGGACCCCTCACCGACTCTATC ] [+] EMBL CA588286 [ ccATCAAATTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG NCCCTTTCGAACTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGAGTTCTTTACAAGTTCACCCAGTTCCTGATTACGTCCTTCCACATCCAGAGTGGCGAGGATGCCCCGGACCTGCTGAACGTCATCACGGACCCTCTCACCGACTCTATCATTCAGGTGGATAAATCGGTCATCAATGACCTCGCTACG] [+] EMBL CA588344 [ ATCTTCTTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGGCCTCC CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGAGTTCTTTACAAGTTCACCCAGTTCCTGATTACGTCCTTCAACATCCAGAGTGGCGAGGATGCCCCGGACCTGCTGAACGTCATCACGGACCCTCTCACCGACTCTATCATTCAGTTGGAT ] [+] EMBL CA589871 [ CGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG CTCC CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCT CATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGT ] [+] EMBL FR0059893 [ GTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCACTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGTTGGGCTGGTGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
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