Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Takifugu rubripes
cluster # 2456 cluster # 2456       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2456#0 length = 735 sequences # 6  
consensusID : consensus_2456#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 735
fasta sequence 
                              [AGCAGTTGACAGGAGTCAAGGACAGGCCGAGTTGGGTAAACAAAATAAACATATGATCAAAGAGCCAAAATTGCTTAAACGTTTTGTCTAACTTCATGTGTGTAGTATGTTTAACAATGTTTTAGTGCGACCGTATGCTCGCTGATGTGAAAAAAATCCGTAGTAACTACACGGTGTAATTGTCAAAAATAAGTAGGTTAAGAAGCTAACGTGTGCTAACGCGTTAGCGGACTAGCTGGCTCGTTAAACCCGTTGAGGTTAGCTAGCTAACTGCGTTAGCAGCCATGTCGTCCCCCTCCTCCTCCAGACGCCAATGGTGCTACTTGTGCGACTTGCCAAAGATGCCGTGGACAGTAGTATGGGACTTTAGCGAGGTCGTATGTCGTGGTTGTGTGAACTACGAGGGGTCAAATCAGATCGAATTCCTCATAGCGAGCGCGCGGCAGCTGAAACGAACTCATGGGATACAGGATGGTAACGTCAGATCACCTGGTCCTTCTCCAAATAAGCACGGCTCATCTGGCAGGGAACCTGTAGCAGAGAGTACCAGGTCACATCCCGAACGGTTTGAGAGGGGAGGAAGAGGAGAAAGTACTGGGTCCGTTCGAGTTCCTCCGAACGGGTTGCACCGCGACGGTCAGACGCCACAAGAAGTGAACCGCCAGAGTCCCAGTGGCAGTCGCAGACCCATGCTAGGTGCTGCTATCCCACCCAGTCTTGTAACTCAAAGTATTG]

[+] EMBL BU806255             [AGCAGTTGACAGGAGTCAAGAACAGGCCGAGTTGGGTAAACAAAATAAACATATGATCAAAGAGCCAAAATTGCTTAAACGTTTTGTCTAACTTCATGTGTGTAGTATGTTTAACAATGTTTTAGTGCGACCGTATGCTCGCTGATGTGAAAAAAATCCGTAGTAACTACACGGTGTAATTGTCAAAAATAAGTAGGTTAAGAAGCTAACGTGTGCTAACGCGTTAGCGGACTAGCTGGCTCGTTAAACCCGTTGAGGTTAGCTAGCTAACTGCGTTAGCAGCCATGTCGTCCCCCTCCTCCTCCAGACGCCAATGGTGCTACTTGTGCGACTTGCCAAAGATGCCGTGGACAGTAGTATGGGACTTTAGCGAGGTCGTATGTCGTGGTTGTGTGAACTACGAGGGGTCAAATCAGATCGAATTCCTCATAGCGAGCGCGCGGCAGCTGAAACGAACTCATGGGATACAGGATGGTAACGTCAGATCACCTGGTCCTTCTCCAAATAAGCACGGCTCATCTGGCAGGGAACCTGTAGCAGAGAG                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BU806112             [   AGTTGACAGGAGTCAAGGACAGGCCGAGTTGGGTAAACAAAATAAACATATGATCAAAGAGCCAAAATTGCTTAAACGTTTTGTCTAACTTCATGTGTGTAGTATGTTTAACAATGTTTTAGTGCGACCGTATGCTCGCTGATGTGAAAAAAATCCGTAGTAACTACACGGTGTAATTGTCAAAAATAAGTAGGTTAAGAAGCTAACGTGTGCTAACGCGCTAGCGGACTAGCTGGCTCGTTAAACCCGTTGAGGTTAGCTAGCTAACTGCGTTAGCAGCCATGTCGTCCCCCTCCTCCTCCAGACGCCAATGGTGCTACTTGTGCGACTTGCCAAAGATGCCGTGGACAGTAGTATGGGACTTTAGCGAGGTCGTATGTCGTGGTTGTGTGAACTACGAGGGGTCAAATCAGATCGAATTCCTCATAGCGAGCGCGCGGCAGCTGAAACGAACTCATGGGATACAGGATGGTAACGTCAGATCACCTGGTCCTTCTCCAAATAAGCACGGCTCATCTGGCAGGGAACCTGTAGCAGAGAG                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CA588101             [                  AGCATTAGACGAGTTGGGTAAACGAAATAAACATATGATCAAAG CCTTAAATTGCTTAAACGTTTTGTCTAACTTCATGTGTGTAGTATGTTTAACAATGTTTTAGTGCGACCGTATGCTCGCTGATGTGAAAAAAATCCGTAGTAACTACACGGTGTAATTGTCAAAAATAAGTAGGTTAAGAAGCTAACGTGTGCTAACGCGTTAGCGGACTAGCTGGCTCGTTAAACCCGTTGAGGTTAGCTAGCTAACTGCGTTAGCAGCCATGTCGTCCCCCTCCTCCTCCAGACGCCAATGGTGCTACTTGTGCGACTTGCCAAAGATGCCGTGGACAGTAGTATGGGACTTTAGCGAGGTCGTATGTCGTGGTGGTGTGAACTACGAGGGGTCAAATCAGATCGAATTCCTCATAGCGAGCGCGCGGCAGCTGAAACGAACTCATGGGATACAGGATGGTAACGTCAGATCACCTGGTCCTTCTCCAAATAAGCACGGCTCATCTGGCAGGGAACCTGTAGCAGAGAGTACCAGGTCACATCCCGAACGGTTTGAGAGGGGAGGAAGAGGAGAAAGTACTGGGTCCGTTCGAGTTCCTCCGAACGGGTTGCACCGCGACGGTCAGACGCCACAAGAAGTGAACCGCCAGAGTCCCAGTGGCAGTCGCAGACCCATGCTAGGTGCTGCTATCCCACCCAGTCTTGTAACTCAAAGTATTG]
[+] EMBL CA333222             [                       AGGCCGAGTTGGGTAAACAAAATAAACATATGATCAAAGAGCCAAAATTGCTTAAACGTTTTGTCTAACTTCATGTGTGTAGTATGTTTAACAATGTTTTAGTGCGACCGTATGCTCGCTGATGTGAAAAAAATCCGTAGTAACTACACGGTGTAATTGTCAAAAATAAGTAGGTTAAGAAGCTAACGTGTGCTAACGCGTTAGCGGACTAGCTGGCTCGTTAAACCCGTTGAGGTTAGCTAGCTAACTGCGTTAGCAGCCATGTCGTCCCCCTCCTCCTCCAGACGCCAATGGTGCTACTTGTGCGACTTGCCAAAGATGCCGTGGACAGTAGTATGGGACTTTAGCGAGGTCGTATGTCGTGGTTGTGTGAACTACGAGGGGTCAAATCAGATCGAATTCCTCATAGCGAGCGCGCGGCAGCTGAAACGAACTCATGGGATACAGGATGGTAACGTCAGAT                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL FR0059679            [                                                     TGATCAAAGAGTCAAAATTGCTTAAACGTTTTGTCTAACTTCATGTGTGTAGTATGTTTAACAATGTTTTAGTGCGACCGTATGCTCGCTGATGTGAAAAAAATCCGTAGTAACTACACGGTGTAATTGTCAAAAATAAGTAGGTTAAGAAGCTAACGTGTGCTAACGCGTTAGCGGACTAGCTGGCTCGTTAAACCCGTTGAGGGTAGCTAGCTAACTGCGTTAGCAGCCATGTCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BU804811             [                                                            AGAGCCAAAATTGCTTAAACGTTTTGTCTAACTTCATGTGTGTAGTATGTTTAACAATGTTTTAGTGCGACCGTATGCTCGCTGATGTGAAAAAAATCCGTAGTAACTACACGGTGTAATTGTCAAAAATAAGTAGGTTAAGAAGCTAACGTGTGCTAACGCGTTAGCGGACTAGCTGGCTCGTTAAACCCGTTGAGGTTAGCTAGCTAACTGCGTTAGCAGCCATGTCGTCCCCCTCCTCCTCCAGACGCCAATGGTGCTACTTGTGCGACTTGCCAAAGATGCCGTGGACAGTAGTATGGGACTTTAGCGAGGTCGTATGTCGTGGTTGTGTGAACCACGAGGGGTCAAATCAGATCGAATTCCTCATAGCGAGCGCGCGGCAGCTGAAACGAACTCATGGGATACAGGATGGTAACGTCAGATCACCTGGTCCTTCTCCAAATAAGCACGGCTCATCTGGCAGGGAACCTGTAGCAGAGAGTACCAGGTCACATCCCGAACGGT                                                                                                                                                                        ]




>consensus_2456#0
AGCAGTTGACAGGAGTCAAGGACAGGCCGAGTTGGGTAAACAAAATAAACATATGATCAA
AGAGCCAAAATTGCTTAAACGTTTTGTCTAACTTCATGTGTGTAGTATGTTTAACAATGT
TTTAGTGCGACCGTATGCTCGCTGATGTGAAAAAAATCCGTAGTAACTACACGGTGTAAT
TGTCAAAAATAAGTAGGTTAAGAAGCTAACGTGTGCTAACGCGTTAGCGGACTAGCTGGC
TCGTTAAACCCGTTGAGGTTAGCTAGCTAACTGCGTTAGCAGCCATGTCGTCCCCCTCCT
CCTCCAGACGCCAATGGTGCTACTTGTGCGACTTGCCAAAGATGCCGTGGACAGTAGTAT
GGGACTTTAGCGAGGTCGTATGTCGTGGTTGTGTGAACTACGAGGGGTCAAATCAGATCG
AATTCCTCATAGCGAGCGCGCGGCAGCTGAAACGAACTCATGGGATACAGGATGGTAACG
TCAGATCACCTGGTCCTTCTCCAAATAAGCACGGCTCATCTGGCAGGGAACCTGTAGCAG
AGAGTACCAGGTCACATCCCGAACGGTTTGAGAGGGGAGGAAGAGGAGAAAGTACTGGGT
CCGTTCGAGTTCCTCCGAACGGGTTGCACCGCGACGGTCAGACGCCACAAGAAGTGAACC
GCCAGAGTCCCAGTGGCAGTCGCAGACCCATGCTAGGTGCTGCTATCCCACCCAGTCTTG
TAACTCAAAGTATTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)