cluster # 1719

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Anopheles gambiae
cluster # 1719 cluster # 1719 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1719#0 length = 493 sequences # 2

consensusID : consensus_1719#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 493
fasta sequence

                              [ATAGTTGGCGTAATTCATAAATACAACTTTATTCTGTAACAATG-AAAAATTAAAAATGAAAAAAAAACACTGC-AATACCGACGCACAACATAATTAACATGAATATCAAAAGCGCCTTGCGCCGGATTTAAGAGACGTTAAAATTTGTTCGATTTCATCCCTCACACGGCCCCGCCCCGTGGCGGGGAAGCGGGTTTAAGTATTGAACGATTCATGTTATGGCGCATTTTTATGTTTTGTTTTGTTTACGGACGAGATAATACACACGATAACAACGTGGATGGGAGCGTGCACGTTTCCCTAAAAGTGATTTTGTTATGTGTTAGACACTTAAATTTTGTGTGTTGTTTAAGAGGAAGTTCTAAAATTTTAAGAAGCGGCATTTTCGTAGCCGCATGCATACTTTCCTTAACAGTTAACAGCAAACTAACATATTTATAGTCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGAATTCCGCAGCTTTTAGAAAAAATTTT]

[-] EMBL BM606034             [ATAGTTGGCGTAATTCATAAATACAACTTTATTCTGTAACAATG AAAAATTAAAAATGAAAAAAAAACACTGC AATACCGACGCACAACATAATTAACATGAATATCAAAAGCGCCTTGCGCCGGATTTAAGAGACGTTAAAATTTGTTCGATTTCATCCCTCACACGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CNS08ISK             [                          CTTTATTCTGTAACAATGAAAAAATTAAAACTG  AAAAAAACACTGCAAAAAACGACGCACAAGATAATTAACATGAATATCAAAAGCGCCTTGCGCCGGATTTAAGAGACGTTAAAATTTGTTCGATTTCATCCCTCACAACACCCCGCCCCGTGGCGGGGAAGCGGGTTTAAGTATTGAACGATTCATGTTATGGCGCATTTTTATGTTTTGTTTTGTTTACGGACGAGATAATACACACGATAACAACGTGGATGGGAGCGTGCACGTTTCCCTAAAAGTGATTTTGTTATGTGTTAGACACTTAAATTTTGTGTGTTGTTTAAGAGGAAGTTCTAAAATTTTAAGAAGCGGCATTTTCGTAGCCGCATGCATACTTTCCTTAACAGTTAACAGCAAACTAACATATTTATAGTCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGAATTCCGCAGCTTTTAGAAAAAATTTT]




>consensus_1719#0
ATAGTTGGCGTAATTCATAAATACAACTTTATTCTGTAACAATGAAAAATTAAAAATGAA
AAAAAAACACTGCAATACCGACGCACAACATAATTAACATGAATATCAAAAGCGCCTTGC
GCCGGATTTAAGAGACGTTAAAATTTGTTCGATTTCATCCCTCACACGGCCCCGCCCCGT
GGCGGGGAAGCGGGTTTAAGTATTGAACGATTCATGTTATGGCGCATTTTTATGTTTTGT
TTTGTTTACGGACGAGATAATACACACGATAACAACGTGGATGGGAGCGTGCACGTTTCC
CTAAAAGTGATTTTGTTATGTGTTAGACACTTAAATTTTGTGTGTTGTTTAAGAGGAAGT
TCTAAAATTTTAAGAAGCGGCATTTTCGTAGCCGCATGCATACTTTCCTTAACAGTTAAC
AGCAAACTAACATATTTATAGTCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGAATTCCGCAGCTTT
TAGAAAAAATTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case