Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 1869 cluster # 1869       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1869#0 length = 730 sequences # 2  

consensusID : consensus_1869#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 730
fasta sequence
                              [CAATGACAATTCACCTTTCGCAATACTTAATTAAAAATTGCA-TGTTATTTAAGAGATTTGCCATTTGTGGAGATCACAGACAAATCCAATCTGAACAGAAACGCCAAAAAGAAGCTTTATTAGGCCGAAAATACACGAACGGCTACCGCGAATTTCCGCCTGCTGTCAAACCTATGGACTGTCTACTGTAACTTTTCCCAACTGTCACCTGCAGGTTTTAAAGTAAATGTAATTTCTATCCTGCAAAAATCCGGTTCGTGTATGTTTGGCCTTATGTAAATTTGAACCTTTTTTGTAAATAATAGCTGCTTGTAGAGTAAATAAAGATGCTACCGGAAAGGCTTAAACTTATATGACAAGT-AATTTAAAACATGATAGCTAATTGAATGACGTTATGGAATAA-A-AATATACTTCTATGTATTACATATGTCTCCATCAATTT-GAAACTTAACATA-AACCGATCA-AGATGCAGTATTTCAACGAA-CTTATGCATCAATTTTTTTAAATGCTTTTGATTCAGAGTGAATACATCAA-TGTCATCGT-TGCGTCT-T--TTTGGCGCA-AAACTACCAGTTACGAA-ATGTTATTTAAAAAAAGCAACAAAATTTTTACTATTTTGTTCGATTTTTTTTTTTGACTTTATGTTGAACTAAAAAATTGAGGAAGTATGTTGGTACTTGATCGAGAAATGAATATCGCTGAATGGAAAATGTGATAAATATCACTATAGAAT]

[+] EMBL BX608688             [CAATGACAATTCACCTTTCGCAATACTTAATTAAAAATTGCA TGTTATTTAAGAGATTTGCCATTTGTGGAGATCACAGACAAATCCAATCTGAACAGAAACGCCAAAAAGAAGCTTTATTAGGCCGAAAATACACGAACGGCTACCGCGAATTTCCGCCTGCTGTCAAACCTATGGACTGTCTACTGTAACTTTTCCCAACTGTCACCTGCAGGTTTTAAAGTAAATGTAATTTCTATCCTGCAAAAATCCGGTTCGTGTATGTTTGGCCTTATGTAAATTTGAACCTTTTTTGTAAATAATAGCTGCTTGTAGAGTAAATAAAGATGCTACCGGAAAGGCTTAAACTTATATGACAAGT AATTTAAAACATGATAGCTAATTGAATGACGTTATGGAATAA A AATATACTTCTATGTATTACATATGTCTCCATCAATTT GAAACTTAACATA AACCGATCA AGATGCAGTATTTCAACGAA CTTATGCATCAATTTTTTTAAATGCTTTTGATTCAGAGTGAATACATCAA TGTCATCGT TGCGTCT T  TTTGGCGCA AAACTACCAGTTACGAA ATGTTATTTAAAAAAAGCAACAAAATTTTTACTATTTTGTTCGATTTTTTTTTTTGACTTTATGTTGAACTAAAAAATTGAGGAAGTATGTTGGTACTTGATCGAGAAATGAATATCGCTGAATGGAAAATGTGATAAATATCACTATAGAAT]
[+] EMBL AL694486             [            gccgaggttAATACTTAATT AAAATTGCACTGTTATTTAAGAGATTTGCCATTTGTGGAGATCACAGACAAATCCAATCTGAACAGAAACGCCAAAAAGAAGCTTTATTAGGCCGAAAATACACGAACGGCGACCGCGAATTTCCGCCTGCTGTCAAACCTATGGACTGTCTACTGTAACTTTTCCCAACTGTCACCTGCAGGTTTTAAAGTAAATGTAATTTCTATCCTGCAAAAATCCGGTTCGTGTATG TTGGCCTTATGTTAATTTGAACCTTTTTTGTAAATAATAGCTGCTTGTAGAGTAAATAAAGATGCTACCGGAAAGGCTTAAACTTATATGACAAGTAAATTTAAAACATGATAGCTAATTGAATGACGTTATGGAATAACACAATATACTTCTATGTATTACATATGTCTCCATCAATTTNGAAACTTAACATANACCCGATCANAGATGCAGTA TTCAACGAACCTTATGCATCAA  TNCTAACATGCTTNCGATTCAGAGTGAATACATCAATTGTCATCGTANGCGTCTATNATCAGGCGCACAAACTACCAGTTACGAACATGTatnctcaac                                                                                                                                            ]


>consensus_1869#0 CAATGACAATTCACCTTTCGCAATACTTAATTAAAAATTGCATGTTATTTAAGAGATTTG CCATTTGTGGAGATCACAGACAAATCCAATCTGAACAGAAACGCCAAAAAGAAGCTTTAT TAGGCCGAAAATACACGAACGGCTACCGCGAATTTCCGCCTGCTGTCAAACCTATGGACT GTCTACTGTAACTTTTCCCAACTGTCACCTGCAGGTTTTAAAGTAAATGTAATTTCTATC CTGCAAAAATCCGGTTCGTGTATGTTTGGCCTTATGTAAATTTGAACCTTTTTTGTAAAT AATAGCTGCTTGTAGAGTAAATAAAGATGCTACCGGAAAGGCTTAAACTTATATGACAAG TAATTTAAAACATGATAGCTAATTGAATGACGTTATGGAATAAAAATATACTTCTATGTA TTACATATGTCTCCATCAATTTGAAACTTAACATAAACCGATCAAGATGCAGTATTTCAA CGAACTTATGCATCAATTTTTTTAAATGCTTTTGATTCAGAGTGAATACATCAATGTCAT CGTTGCGTCTTTTTGGCGCAAAACTACCAGTTACGAAATGTTATTTAAAAAAAGCAACAA AATTTTTACTATTTTGTTCGATTTTTTTTTTTGACTTTATGTTGAACTAAAAAATTGAGG AAGTATGTTGGTACTTGATCGAGAAATGAATATCGCTGAATGGAAAATGTGATAAATATC ACTATAGAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)