cluster # 2279

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Anopheles gambiae
cluster # 2279 cluster # 2279 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2279#0 length = 1003 sequences # 2

consensusID : consensus_2279#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1003
fasta sequence

                              [CTCATTCCGTAGAATTACATGTTTGGTTTTAAGCATTAAGTTTAATCATGAAAGCTGTTCCTCCTGTACATTACTTGTTTAATTGAAATATTCTCAGGGAAAAAGTAGAAATAAATCCTGATTGTTTACAGGAGAGAAAAGCTTTAACGCTTTAAATATGTTCATTTTGAATCTACAGCCCAGGAGCTACTTTTCCCATCCGAATGACTGCGTTACAGATAATAATTGAAATTTCTTTTCCTATATTGCTATCGCACACCTTACCTTAACCTATACGGTTCTCCTTTATGGTGAATTAAAACTATCCTGCGCTGCCGGGAATGCTTACAAAGGTTCCATTGTCAAGTCCGTTATGGGATCGAGATCAGTTCAATTATCAGCCTGGTGTCAGGATATCTTCCAGGAGATGTTTGTCAGAAATAATCCCGAGGCTAGTAGGGGTTGAGGATGATTTTCAGGATCAGTATAATATTAGGACCAGTTCAAGGATCATTATAGATTCAGAAGCAATCCTTAGAACAGGATGAGTTCATAAACATTTTCAGGACCAACATAGGTTGTGAATCAGTTTATAGAATAGGTAAAGGATCAGAATCAGTTCCATATGGGTTCAGGATCATTTCCAAGAGCGGGATGGGTTCAGCAACAGGAGATGGATTCCAGGACCGATATCGGTTGTGGATCAGTTCCAGAATTGGTCAAAGTCAGTTACAGAACCTATACAGATTTAGGATCGATTCCAGGCTCTGAAAGGACTTGGTATTATTCCCACGATCGGCATATGGTTGGGAACAGTTCTATGGCCTGTATGGGTTCAGGGGCAATTCCAATACCGGGATACGTTCACGAATTCTTCAATTTCTAAGATCGCTATGCTCGTTATTAATAATCAGTTCCAGAAGCAATATGGGCTTAGGCTTAGTTCCAGGATCGGTATAAGGTCAAAATAAGTTTCAGGTCTTAAATGAGTTCAGCATCAATTACAAAAACCGGTTTGTCTATA]

[+] EMBL CNS09MUT             [CTCATTCCGTAGAATTACATGTTTGGTTTTAAGCATTAAGTTTAATCATGAAAGCTGTTCCTCCTGTACATTACTTGTTTAATTGAAATATTCTCAGGGAAAAAGTAGAAATAAATCCTGATTGTTTACAGGAGAGAAAAGCTTTAACGCTTTAAATATGTTCATTTTGAATCTACAGCCCAGGAGCTACTTTTCCCATCCGAATGACTGCGTTACAGATAATAATTGAAATTTCTTTTCCTATATTGCTATCGCACACCTTACCTTAACCTATACGGTTCTCCTTTATGGTGAATTAAAACTATCCTGCGCTGCCGGGAATGCTTACAAAGGTTCCATTGTCAAGTCCGTTATGGGATCGAGATCAGTTCAATTATCAGCCTGGTGTCAGGATATCTTCCAGGAGATGTTTGTCAGAAATAATCCCGAGGCTAGTAGGGGTTGAGGATGATTTTCAGGATCAGTATAATATTAGGACCAGTTCAAGGATCATTATAGATTCAGAAGCAATCCTTAGAACAGGATGAGTTCATAAACATTTTCAGGACCAACATAGGTTGTGAATCAGTTTATAGAATAGGTAAAGGATCAGAATCAGTTCCATATGGGTTCAGGATCATTTCCAAGAGCGGGATGGGTTCAGCAACAGGAGATGGATTCCAGGACCGATATCGGTTGTGGATCAGTTCCAGAATTGGTCAAAGTCAGTTACAGAACCTATACAGATTTAGGATCGATTCCAGGCTCTGAAAGGACTTGGTATTATTCCCACGATCGGCATATGGTTGGGAACAGTTCTATGGCCTGTATGGGTTCAGGGGCAATTCCAATACCGGGATACGTTCACGAATTCTTCAATTTCTAAGATCGCTATGCTCGTTATTAATAATCAGTTCCAGAAGCAATATGGGCTTAG                                                                                       ]
[-] EMBL CNS09MUS             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGTTGAGGATGATTTACAGGATAAGTTTAATATTAGGACCAGTTCAAGGATCATTATAGATTCAGAAGCAATCCTTAGAACAGGATGAGTTCATAAACATTTTCAGGACCAACATAGGTTGTGAATCAGTTTATAGAATAGGTAAAGGATCAGAATCAGTTCCATATGGGTTCAGGATCATTTCCAAGAGCGGGATGGGTTCAGCAACAGGAGATGGATTCCAGGACCGATATCGGTTGTGGATCAGTTCCAGAATTGGTCAAAGTCAGTTACAGAACCTATACAGATTTAGGATCGATTCCAGGCTCTGAAAGGACTTGGTATTATTCCCACGATCGGCATATGGTTGGGAACAGTTCTATGGCCTGTATGGGTTCAGGGGCAATTCCAATACCGGGATACGTTCACGAATTCTTCAATTTCTAAGATCGCTATGCTCGTTATTAATAATCAGTTCCAGAAGCAATATGGGCTTAGGCTTAGTTCCAGGATCGGTATAAGGTCAAAATAAGTTTCAGGTCTTAAATGAGTTCAGCATCAATTACAAAAACCGGTTTGTCTATA]




>consensus_2279#0
CTCATTCCGTAGAATTACATGTTTGGTTTTAAGCATTAAGTTTAATCATGAAAGCTGTTC
CTCCTGTACATTACTTGTTTAATTGAAATATTCTCAGGGAAAAAGTAGAAATAAATCCTG
ATTGTTTACAGGAGAGAAAAGCTTTAACGCTTTAAATATGTTCATTTTGAATCTACAGCC
CAGGAGCTACTTTTCCCATCCGAATGACTGCGTTACAGATAATAATTGAAATTTCTTTTC
CTATATTGCTATCGCACACCTTACCTTAACCTATACGGTTCTCCTTTATGGTGAATTAAA
ACTATCCTGCGCTGCCGGGAATGCTTACAAAGGTTCCATTGTCAAGTCCGTTATGGGATC
GAGATCAGTTCAATTATCAGCCTGGTGTCAGGATATCTTCCAGGAGATGTTTGTCAGAAA
TAATCCCGAGGCTAGTAGGGGTTGAGGATGATTTTCAGGATCAGTATAATATTAGGACCA
GTTCAAGGATCATTATAGATTCAGAAGCAATCCTTAGAACAGGATGAGTTCATAAACATT
TTCAGGACCAACATAGGTTGTGAATCAGTTTATAGAATAGGTAAAGGATCAGAATCAGTT
CCATATGGGTTCAGGATCATTTCCAAGAGCGGGATGGGTTCAGCAACAGGAGATGGATTC
CAGGACCGATATCGGTTGTGGATCAGTTCCAGAATTGGTCAAAGTCAGTTACAGAACCTA
TACAGATTTAGGATCGATTCCAGGCTCTGAAAGGACTTGGTATTATTCCCACGATCGGCA
TATGGTTGGGAACAGTTCTATGGCCTGTATGGGTTCAGGGGCAATTCCAATACCGGGATA
CGTTCACGAATTCTTCAATTTCTAAGATCGCTATGCTCGTTATTAATAATCAGTTCCAGA
AGCAATATGGGCTTAGGCTTAGTTCCAGGATCGGTATAAGGTCAAAATAAGTTTCAGGTC
TTAAATGAGTTCAGCATCAATTACAAAAACCGGTTTGTCTATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case