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Anopheles gambiae
cluster # 3579 cluster # 3579       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3579#0 length = 646 sequences # 3  

consensusID : consensus_3579#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 646
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGTTCCGTTAAGTCTTAATTAAACGTGTATTTGTTTTTTAGTTAATTTTCTCGTAAGTCGTTGCGATTTGTTGTTGTTGATTTTTTCTACAAAGTTTCTTTTATAAAGGCATTATTTGACTTATCGTTTAGAACGTATCGGTTTACATTTGTGCATGCTTGAACGTGGTACGAATGGTAAGTAAGAAACTATGATTGGCAATCGATATTGCAGCAAAACGATTAATGCGTATCGAATGAGACAAATTATCTTTCTTCGCCCTATAAACTAATACACTCATACACACGCATACGCACACATACAATTGATACAAAATACTCGTTTGTCTCTCGTTCTCTCTCCCTCGCGTATCTTCGCACGTACGTTTTTGTGTTATGAACAATGCTAAAAACAAACAGTAAAGCTACTAAATTGCGCAATTTACTAGACCCTTTATGGCGTGCTCACAACATTCCTATTGGGACATGAATGCTGAGTTTAAATTTTAAAACACACAAATTAATTACTGGGGGACATAGTTATTAAGTAATGCAAGAGGAGAAGACAAAATGCACAACTTCCTCCTCACTGGTTCTTGTTTCGTGAAAGGAATTATGTATTGTGTAACACATGAT-CACAAAAAAAAA]

[+] EMBL AGA285161            [TTTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGTTCCGTTAAGTCTTAATTAAACGTGTATTTGTTTTTTAGTTAATTTTCTCGTAAGTCGTTGCGATTTGTTGTTGTTGATTTTTTCTACAAAGTTTCTTTTATAAAGGCATTATTTGACTTATCGTTTAGAACGTATCGGTTTACATTTGTGCATGCTTGAACGTGGTACGAATGGTAAGTAAGAAACTATGATTGGCAATCGATATTGCAGCAAAACGATTAATGCGTATCGAATGAGACAAATTATCTTTCTTCGCCCTATAAACTAATACACTCATACACACGCATACGCACACATACAATTGATACAAAATACTCGTTTGTCTCTCGTTCTCTCTCCCTCGCGTATCTTCGCACGTACGTTTTTGTG                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL AGA284345            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TACTCGTTTGTCTCTCGTTTTCTCTCCCTCGCGTATCTTCGCACGTACGTTTTTGTGTTATGAACAATGCTAAAAACAAACAGTAAAGCTACTAAATTGCGCAATTTACTAGACCCTTTATGGCGTGCTCACAACATTCCTATTGGGACATGAATGCTGAGTTTAAATTTTAAAACACACAAATTAATTACTGGGGGACATAGTTATTAAGTAATGCAAGAGGAGAAGACAAAATGCACAACTTCCTCCTCACTGGTTCTTGTTTCGTGAAAGGAATTATGTATTGTGTAACACATGAT CACAAAAAA   ]
[-] EMBL AGA283868            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGGCGTGCTCACAACATTCCTATTGGGACATGAATGCTGAGTTTAAATTTTAAAACACACAAATTAATTACTGGGGGACATAGTTATTAAGTAATGCAAGAGGAGAAGACAAAATGCACAACTTCCTCCTCACTGGTTCTTGTTTCGTGAAAGGAATTATGTATTGTGTAACACATGATCCTCGAAAAAAAA]


>consensus_3579#0 TTTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGTTCCGTTAAGTCTTAATTAAACGTGTATTTGTTTTTTA GTTAATTTTCTCGTAAGTCGTTGCGATTTGTTGTTGTTGATTTTTTCTACAAAGTTTCTT TTATAAAGGCATTATTTGACTTATCGTTTAGAACGTATCGGTTTACATTTGTGCATGCTT GAACGTGGTACGAATGGTAAGTAAGAAACTATGATTGGCAATCGATATTGCAGCAAAACG ATTAATGCGTATCGAATGAGACAAATTATCTTTCTTCGCCCTATAAACTAATACACTCAT ACACACGCATACGCACACATACAATTGATACAAAATACTCGTTTGTCTCTCGTTCTCTCT CCCTCGCGTATCTTCGCACGTACGTTTTTGTGTTATGAACAATGCTAAAAACAAACAGTA AAGCTACTAAATTGCGCAATTTACTAGACCCTTTATGGCGTGCTCACAACATTCCTATTG GGACATGAATGCTGAGTTTAAATTTTAAAACACACAAATTAATTACTGGGGGACATAGTT ATTAAGTAATGCAAGAGGAGAAGACAAAATGCACAACTTCCTCCTCACTGGTTCTTGTTT CGTGAAAGGAATTATGTATTGTGTAACACATGATCACAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)