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Anopheles gambiae
cluster # 3743 cluster # 3743       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3743#0 length = 1081 sequences # 3  

consensusID : consensus_3743#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1081
fasta sequence
                              [TACTAATATTTTAACAAGTCAATGCTACAGATCTGCGCTACCTGTGTAGCCAAATTGGTTAGGTATTAGGAACACAAATGCCTTCATAGAGAATAGTGAATGCTTTTACCCGCTACACATTATCGGTTAANTTGAACGATGGTTTAAAATTTTACCTTTACATTGCATAATGTGCATTGAAAAGTTGTTCTTGTCAATGACGTNGTTGCGCCTTAGTCTTCTTTTAGTGACAGAACTCTTACACTCGCAATGGGATCGAGAGGCTTGTAATAGACGTAATGTTTTGAATTAATTTTAAACCAAAGATTGCCATTTTGCTGTATAATCAGATACAATATGTTG-TTTTTTAGAGAAGCACATTGAAATCAGATGTAGGAGAGTAAAATATAATGTTTGGAAGGCAGTTGTTTAAGCGTGACGCTCCGATACATTTGATTTGCTCATCTGATTCTTTGGATTT-TGT-T-TTTTCCTAATAGTGTTGAAGTAACGTCAGAAGTGTTATGGCACATCATGGAACATCGTTCATAGAACATGAAGTGAATAANTGGCTTAACAGGATTTCGGGCAGTTTATTCATAAAACACGATATAGCCTTATTGTAGCAGTATTTGATTCAATTTTATTCAACTTATGCCGCTCAATTTACAAGAATTTCCAAGCTCGCTAAAACACATCCTCTCTTTGCTATATCCTTGCTATGCACTTGGTTCAACAAATGCTAGTNTAGGAATTAGTTTGTTCAAAATCGAATATTTACACATTATAAATTGCAATCACCCAGGATCCAAACATTTGCTAGNTTNAACAAAACTAAAACCATAAATTCCTCTCTTGAATACAGTCAAAGCAAACCATCACCAGCAGTGCTTGCTCGTATGCGTAATGCATACATTTTTAGCTTAAACAAATTTAAAACAAACACTATTCTGCAAGTCGAACTAACCAATTAGGATTCAACAATGACCTTAAATCGAATCATGTAACTCCATGAATTACATAATTACAATAACAACCAACCAATAGCGCGTGATAAGATGACCATGCAACGGGATCGTGTAAACTACATTCAAATGCTGTGTGG]

[+] EMBL BX619597             [TACTAATATTTTAACAAGTCAATGCTACAGATCTGCGCTACCTGTGTAGCCAAATTGGTTAGGTATTAGGAACACAAATGCCTTCATAGAGAATAGTGAATGCTTTTACCCGCTACACATTATCGGTTAANTTGAACGATGGTTTAAAATTTTACCTTTACATTGCATAATGTGCATTGAAAAGTTGTTCTTGTCAATGACGTNGTTGCGCCTTAGTCTTCTTTTAGTGACAGAACTCTTACACTCGCAATGGGATCGAGAGGCTTGTAATAGACGTAATGTTTTGAATTAATTTTAAACCAAAGATTGCCATTTTGCTGTATAATCAGATACAATATGTTG TTTTTTAGAGAAGCACATTGAAATCAGATGTAGGAGAGTAAAATATAATGTTTGGAAGGCAGTTGTTTAAGCGTGACGCTCCGATACATTTGATTTGCTCATCTGATTCTTTGGATTT TGT T TTTTCCTAATAGTGTTGAAGTAACGTCAGAAGTGTTATGGCACATCATGGAACATCGTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AL693185             [                                                                                                                                                                                                                                                                                  ccncggGTTATGAATTAATTTTAAACCAAAGCATG CATTTTGCTGTATAATCAGATACAATATGTTGTTTTTTTAAAGAAGCACATTGAAATCAGATGTAGGAGAGTAAAATATAATGTTTGGAAGGCAGTTGTTTAAGCGTGACGCTCCGATACATTTGATTTGCTCATCTGATTCTTTGGATTTATGTATATTTTCCTAATAGTGTTGAAGTAACGTCAGAAGTGTTATAGCACATCATGGAACATCGTTCATAGAACATGAAGTGAATAANTGGCTTAACAGGATTTCGGGCAGTTTATTCATAAAACACGATATAGCCTTATTGTAGCAGTATTTGATTCAATTTTATTCAACTTATGCCGCTCAATTTACAAGAATTTCCAAGCTCGCTAAAACACATCCTCTCTTTGCTATATCCTTGCTATGCACTTGGTTCAACAAATGCTAGTNTAGGAATTAGTTTGTTCAAAATCGAATATTTACACATTATAAATTGCAATCACCCAGGATCCAAACATTTGCTAGNTTNAACAAAACTAAAACCATAAATTCCTCTCTTGAATACAGTCAAAGCAAACCATCACCAGCAGTGCTTGCTCGTATGCGTAATGCATACATTTTTAGCTTAAACAAATTTAAAACAAACACTATTCTGCAAGTCGAACTAACCAATT                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BM624711             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccgGCGTGACGCTCCGATACATTTGATTTGCTCATCTGATTCTTTGGATTT TGT T TTTTCCTAATAGTGTTGAAGTAACGTCAGAAGTGTTATGGCACATCATGGAACATCGTTCATAGAACATGAAGTGAATAAATGGCTTAACAGGATTTCGGGCAGCTTATTCACAAATCACGATATAGCCTTATTGTAGCAGTATTTGATT AATTTTATTCAACTTATGCCGCTCAATTTACAAGAATTTCCAAGCTCGCTAAAACACATCCTCTCTTTGCTATATCCTTGCTATGCACTTGGTTCAACAAATGCTAGT TAGGAATTAGTTTTTTCAAAATCGAATATTTA AAATTATAAATTGCAATCACCCAGCATCCAAACATTTGCTAG TTTAAAAAAACTAAAAACATAAATTCCTCTCTTGAATACA TCAAA CAAACCATCACCAGCAGTGCTTGCTCGTATGC TAATGCATACATTTTTAGCTTAAACAAATT  AAA AAA ACTATTCTG AAGTCGAACTA  CAATTAGGATTCAACAATGACCTTAAATCGAATCATGTAACTCCATGAATTACATAATTACAATAACAACCAACCAATAGCGCGTGATAAGATGACCATGCAACGGGATCGTGTAAACTACATTCAAATGCTGTGTGG]


>consensus_3743#0 TACTAATATTTTAACAAGTCAATGCTACAGATCTGCGCTACCTGTGTAGCCAAATTGGTT AGGTATTAGGAACACAAATGCCTTCATAGAGAATAGTGAATGCTTTTACCCGCTACACAT TATCGGTTAANTTGAACGATGGTTTAAAATTTTACCTTTACATTGCATAATGTGCATTGA AAAGTTGTTCTTGTCAATGACGTNGTTGCGCCTTAGTCTTCTTTTAGTGACAGAACTCTT ACACTCGCAATGGGATCGAGAGGCTTGTAATAGACGTAATGTTTTGAATTAATTTTAAAC CAAAGATTGCCATTTTGCTGTATAATCAGATACAATATGTTGTTTTTTAGAGAAGCACAT TGAAATCAGATGTAGGAGAGTAAAATATAATGTTTGGAAGGCAGTTGTTTAAGCGTGACG CTCCGATACATTTGATTTGCTCATCTGATTCTTTGGATTTTGTTTTTTCCTAATAGTGTT GAAGTAACGTCAGAAGTGTTATGGCACATCATGGAACATCGTTCATAGAACATGAAGTGA ATAANTGGCTTAACAGGATTTCGGGCAGTTTATTCATAAAACACGATATAGCCTTATTGT AGCAGTATTTGATTCAATTTTATTCAACTTATGCCGCTCAATTTACAAGAATTTCCAAGC TCGCTAAAACACATCCTCTCTTTGCTATATCCTTGCTATGCACTTGGTTCAACAAATGCT AGTNTAGGAATTAGTTTGTTCAAAATCGAATATTTACACATTATAAATTGCAATCACCCA GGATCCAAACATTTGCTAGNTTNAACAAAACTAAAACCATAAATTCCTCTCTTGAATACA GTCAAAGCAAACCATCACCAGCAGTGCTTGCTCGTATGCGTAATGCATACATTTTTAGCT TAAACAAATTTAAAACAAACACTATTCTGCAAGTCGAACTAACCAATTAGGATTCAACAA TGACCTTAAATCGAATCATGTAACTCCATGAATTACATAATTACAATAACAACCAACCAA TAGCGCGTGATAAGATGACCATGCAACGGGATCGTGTAAACTACATTCAAATGCTGTGTG G



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)