These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_3769#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 755 fasta sequence [CCGGGCCCTGCGCGTGGTGATCGGATTTGCCTCGATGTCGGTCGCGGTGGTCAGCTTCGTGCTGGTGGTCGAGCTGGTAAGCGGCCGGTACCGTACGATCATCGGCATCCTCAACATACTTCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCGCACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTGCCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCTGGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCAGGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGTATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCATACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAACACGGTCATTTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGCTGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCATCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCGTCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATA] [+] EMBL BM606295 [CCGGGCCCTGCGCGTGGTGATCGGATTTGCCTCGATGTCGGTCGCGGTGGTCAGCTTCGTGCTGGTGGTCGAGCTGGTAAGCGGCCGGTACCGTACGATCATCGGCATCCTCAACATACTTCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCGCACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTGCCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCTGGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCAGGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGTATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCATACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAACACGGTCATTTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGCTGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCATCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGG ] [+] EMBL BM652421 [ ccgCAGCTTCGTGCTGGTGGTCGAGCTGGTAAGCGGCCGGTACCGTACGATCATCGGCATCCTCAACATACTTCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCGCACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTGCCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCTGGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCAGGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGTATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCATACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAACACGGTCA TTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGCTGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCATCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCGTCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATA] consensusID : consensus_3769#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 671 fasta sequence [CCGCGGACGCGTGGGTTCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCGCACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTGCCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCTGGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCAGGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGTATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCATACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAACACGGTCATTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGCTGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCATCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCGTCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATACCGACGTTTACCGCCTACCAG] [+] EMBL BM650723 [CCGCGGACGCGTGGGTTCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCGCACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTGCCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCTGGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCAGGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGTATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCATACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAACACGGTCATTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGCTGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCATCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCGTCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATACCGACGTTTACCGCCTACCAG] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_3769#0 CCGGGCCCTGCGCGTGGTGATCGGATTTGCCTCGATGTCGGTCGCGGTGGTCAGCTTCGT 60 consensus_3769#1 ------------------------------------------------------------ consensus_3769#0 GCTGGTGGTCGAGCTGGTAAGCGGCCGGTACCGTACGATCATCGGCATCCTCAACATACT 120 consensus_3769#1 ------------------------------------------CCGCGGACGCGTGGG--T 16 * ** * * * consensus_3769#0 TCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCG 180 consensus_3769#1 TCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCG 76 ************************************************************ consensus_3769#0 CACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTG 240 consensus_3769#1 CACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTG 136 ************************************************************ consensus_3769#0 CCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCT 300 consensus_3769#1 CCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCT 196 ************************************************************ consensus_3769#0 GGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCA 360 consensus_3769#1 GGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCA 256 ************************************************************ consensus_3769#0 GGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGT 420 consensus_3769#1 GGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGT 316 ************************************************************ consensus_3769#0 ATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCAT 480 consensus_3769#1 ATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCAT 376 ************************************************************ consensus_3769#0 ACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAA 540 consensus_3769#1 ACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAA 436 ************************************************************ consensus_3769#0 CACGGTCATTTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGC 600 consensus_3769#1 CACGGTCATT-GCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGC 495 ********** ************************************************* consensus_3769#0 TGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCA 660 consensus_3769#1 TGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCA 555 ************************************************************ consensus_3769#0 TCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCG 720 consensus_3769#1 TCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCG 615 ************************************************************ consensus_3769#0 TCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATA--------------------- 755 consensus_3769#1 TCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATACCGACGTTTACCGCCTACCAG 671 *********************************** |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||